Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsZS97_11G0111000 OGI:11019720 | 16/16 Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU Chr11:7058675-7065293
Gene Symbol Os11gRGA5, RGA5, RGA5-A, RGA5-B, Pi5
DNA seq

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Function Disease resistance protein RGA5 [UniProtKB/Swiss-Prot:F7J0N2]

Transcripts

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsZS97_11G0111000 OsZS97_11T0111000.7 Chr11 7058675 7064380 + makerRMon
CDS seq

ATGAGTTCTTCTTCCCTTGGCGCCATGGATGCTCCGGCGAGCTTTTCCCTAGGTGCCATGGGCCCTCTCCTCAGGAAGCTCGATTCGCTTCTGGTGGCTCCCGAAATCCGGCTGCCTAAGCCATTGAAGGAGGGAATCGAGCTGCTCAAGGAAGATCTAGAAGAGATAGGCGTCTCCCTGGTGGAGCACTCCGTGGTCGATTCACCAACCCACAAGGCAAGATTCTGGATGGATGAGGTGCGTGACCTCTCCTACCACATCGAGGACTGCATCGACACCATGTTTTCGATGCGCTCCGGCGGCGACGACGGCAAGCCCAGATCCGAGCGCCGCCACAAGGTTGGCCGTGCGAAGATCGACGGTTTCTCCAAGAAGCCCAAGCCGTGCACAAGGATGGCTAGGATCGCGGAGCTCAGGGCTCTGGTGCGGGAGGCGAGCGAGCGGCTCGAAAGGTACCAGCTTGGTGACGTCTGCGGCTCGAGCTCTCCCGTTGTGTTCACCGCGGATGGTCGGGCTCGACCTCTCCACCATGGGGTTTCTGCTAATCTTGTTGGCGTCGATGAGTTCAAGACGAAGCTGAACAGGTGGCTCAGCGACGAGGAGGGGCCGCACCTGAAGGTTGCTGCCATTGTTGGACCTGCAGGGATTGGTAAGACGGCACTTGCTACAGAGTTGTACCGTGACCATAGATGGCAATTCGAGTGCCGAGCTTTCGTCCGGGCGTCGCGAAAGCCTGACATGCAGCGGCTTCTTGGGGGTATTCTCTCTCAAGTTCAGCGTCGCCAACGATCGTCTGATGCCTACGCTGACAGCACGGTGCAGAGCCTCATTGATAATCTCCGGGAGCATCTCCAAGATAGGAGGTACCTTATTATAATTGATGGTTTGTGGGAGACGGCAGTATGGAATATTGCTAACAGTGCTTTTCCAGATGTTAACAGTTTCAGTAGAATATTAATAACTGCGGATATCGAACAGGTAGCTCTGGAATGCTGCGGTTACAAGTATGATTATATTATGAGGATGGAACCTCTTGGCAGCCTTGATTCCAAAAAAGTTTTCTTCAATAAAGTTTTTGGCTCCGAAGATCAATGTCCTCCTGAGTTGAAGGAGGTGTCAAACACAATCCTAGAAAAATGTGGTGGTTTGCCACTTGCAATCATCAGCATAGCAGGTCTTCTAGGAAGCCAACCGGAAAATCCAGTGCTATGGGACTATGTAACGAAATATCTATGTTCCAGTTTGGGTACAAATCCTACTTTGAAAGACATGGTGAAAGAAACGCTAAACCTTAGCTACAACAGTCTTCCTCATCCGTTCAAAACATGTCTGCTATATCTTGGTATGTATCCTGATGGGCACATAATGTTGAAGGCTGATTTGATGAAGCAATGGTCAGCTGAAGGTTTTGTCTCTGCCAATGAAGCAAAAGACACAGAAGAAATTGTAGATAAATACTTTGATGAGCTTGTCAACAGGGGAATTCTAGAACCTGTTGAGATTAACAAGAATGGCAAGGTGTTGTCCTGTACCCTGCACCACGCTGTACATGACCTTGTCATGCCCAAATTCAACGATGACAAATTTACTATGTCAGTAGATTACTCTCAGACTATTACAGGACCTTCTACCATGGTTCGTCGTTTGTCCCTTCATTTCAGCAGTACCAGATACGCGACAAAACCTGCAGGAATAATATTGTCACGAGTTCGATCACTTGCCTTTTTTGGCCTCCTCAATTGTATGCCTTGTATTGGGGAATTTAAGTTACTGCGAGTTCTAATCCTAGAATTTTGGGGCAGTCATGGTGAGCAAAGGAGTTTAAACCTAATACCAGTATGTAGATTATTTCAGCTGAGATATTTGAAAACTTCAGGTGATGTAGTTGTTCAGTTACCAGCTCAGATAAGTGGGCTACAGTACTTGGAAACACTGGAAATAGACGCAAGAGTGTCAGCTGTTCCATTTGATCTTGTTCATCTCCCGAACCTACTGCATCTCCAACTTCAAGATGAGACAAAATTACCTGATGGGATTGGCTGCATGAGATCTTTGCGTACACTACAGTACTTTGACCTTGGTAACAACTCTGTAGACAACTTACGGGGTCTTGGAGAGCTGACAAACCTGCAGGATCTTCATCTCAGCTATTCTGCACCGTCATCTAATGAGGGTTTGATGATAAATCTGAATGCTATAACCTCTTCACTTAGCAGACTTAGTAACCTCAAATCTCTGATTCTATCACCAGGTGCTATAAGCATGGTTATTTTCTTTGATATATCAAGCATCATATCTGTGGTTCCTGTATTTCTTCAGAGACTTGAGCTGTTGCCACCCATCTGCATCTTTTGCAGACTTCCCAAGTCGATTGGACAACTTCACAAACTCTGCATTTTGAAAGTTTCCGTTAGAGAACTTCTGACAACTGATATTGATAACCTCACAGGATTACCTTCCCTCACAGTTCTCTCATTATATGCTCAGACAGCTCCAGAGGGAAGGTTTATCTTCAAAGACGGGACTCTCCCAGTTCTCAAGTATTTCAAATTTGGATGTGGTGAACTCTGCCTTGCTTTTATGGCTGGAGCAATGCCCAATCTCCAGAGGCTCAAATTAGTTTTCAACATCCGTAAAAGTGAGAAGTACCGCCATACGCTTTTTGGGATTGAGCACCTTGTAAGCCTCCAGGATATTGCCACACGAATTGGGGTTGACACCAGCACCGGCGAATCTGATAGAAGGGCTGCAGAGTCAGCATTCAAGGAAACTGTCAACAAGCATCCAAGGTGTCTTAGGTCCAGCTTGCAGTGGGTGGTTTCCACTGAGGAAGAAAGTCATCCTTTGGAGAAACAACATCATAAGAGAGAAAAAGGCTCATCAGCTGGACATGGGGTTTTAGAGAAAGAATCAGTGGAAGATAGCGAGAAGAACACTGATAGAGTGCAAACATTATTGTCACCCCAACTGTCAAACATGGAGAGTGTGGTGGAAAGTGCATTAACGGGGCAACGAACTAAGGTGAGTTCCTCAAGCTGA

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Protein seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 11.163192 12.880398 7.240871

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0225300 RBH 2.019053 1.250956 4.432347
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g11810 RBH 0.704885 0.507252 0.672848
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0225300 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0007970 RBH 0.462562 5.735374 2.408226
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0007980 RBH 0.297682 4.919609 1.817719
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0007850 RBH 0.666380 3.643716 4.156754
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0007750 RBH 0.266105 0.292467 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0007770 RBH 22.293795 17.082457 21.002594
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0104800 RBH 9.8728925 17.3811525 9.2154185
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0007760 RBH 1.028826 0.606468 2.400014
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0110900 SBH 8.599647 14.278709 6.833309
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0007930 RBH 0.395772 0.000000 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0007860 RBH 0.322153 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0007830 RBH 15.697803 27.759771 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0007850 RBH 0.619932 0.0 1.388970
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0007890 RBH 1.034561 7.104585 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G007940 RBH 0.421739 2.155976 1.788703
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0007750 RBH 0.327408 12.925796 3.389852
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