Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsZS97_10G0222000 | OGI:10040510 | 16/16 | Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | Chr10:14208045-14228298 | ||||||||
Gene Symbol | - | ||||||||||
DNA seq | 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Function | Ent-kaurenoic acid oxidase 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9AXH9] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsZS97_10G0222000 | OsZS97_10T0222000.1 | Chr10 | 14208045 | 14228298 | - | makerRMon | ||
CDS seq | ATGAGTGGCGCAACGGCGGACTGGGCATGGTGGCTCGGCCTCGTCGCCGGCGCCGTCCCGCTGCTCGCCCTCGCCGTCTGGCACTGCACCGACGCCTTCCACAGCGCCGCCTTCGCGTTCCGCCGCCGCGGGACACGCGCGAGGCTCCCCCCGGGCCACATGGGCCTGCCGTTCGTCGGCGAGACCCTCGCCCTGATCTGGTACTTCAACCTCGCCCGCCGCCCCGACGCCTTCATCGAGGCCAAGAGGCGGCGCTACTGCTACGGCGACGGCGACGACGACGGCGGCATCTACCGGACGCACCTGTTCGGCTCGCCCGCGGTGCTCGTCTGCTCGCCGGCGTCCAACGGGTTCGTGTTCCGGTCGGCGCCGCCCGGCAGCTTCGGCGTCGGGTGGCCGGTGCCGGAGCTCGTCGGCGCCTCGTCCCTGGTGAACGTGCACGGCGGCCGGCACGCCAGGCTGCGCAGGTTCGTCCTCGGCGCCATCAACAGGCCGGGCTCACTCCGGACCATCGCGCGGGTGGCGCAGCCGCGCGTGGCGGCGGCGCTGCGGTCGTGGGCGGCCAAGGGCACCATCACCGCCGCCACCGAGATGAAGAATGTGACGTTTGAGAATATATGCAAGATATTCGTGAGTATGGAGCCGTCGCCTCTAACCGAAAAGATCCACGGATGGTTCACCGGTTTGGTTGCTGGGTTCAGGTCGTTACCACTGGACATGCCAGGAACAGCGCTCCACCACGCTCGAAAGTGCCGGAGAAAGCTGAACTCGGTGTTCAGGGAGGAGCTCGAGAGGAGGAAGGTGAAGATGGTGACCGGAGAAGGAGGCGACGACGACGGTGACCTGATGAGCGGGCTGATGCACGTGGAGGATGAGCAAGGTAGACGACTCGACGACGATGAGGTCGTGGATAACATAGTCTCCCTTGTCATCGCGGGCTATGAGTCAACTGCTAGTGCCATCATGTGGGCGACCTACCATCTCGCAAAATCGCCCAGTGCCCTTGCCAAGCTAAGAGAGGAAAATTTGGCTATAGCCAAAGAGAAAAATGGTGATGGTTTTATCACTCTCGAGGATGTCTCCAAGATGAAGTACACTGCCAAGGTAGTAGAAGAAACAATCCGATTGGCCAACATAGCTCCGATGGCTCACCGCGTGGCACTCAGAGATGTTGAATACCGAGGGTATACAATACCAAAAGGGTGGAAAGTTATTGTGTGGATCCGATCACTACATGTCGACCCAGCACACTACGACAATCCGTTAAGTTTCAACCCGGATAGATGGGATAAATCAGCGGAGCTAGGCACGTACCAGGTGTTCGGTGGCGGCGAGAGGATCTGCGCCGGCAACATGCTGGCAAGGCTGCAGCTCACCATCATGCTCCATCATCTCTCTTGTGGTTACAAATGGGAGTTGCTGAATCCTGACGCAGGGATTGTTTACCTTCCGCACCCAAGGCCAACAGATGGGGCAACGCCAGTAGTGGCCGTGGGCGCCACGGACTGGGCGTGGCGGCTCGGCGCCCTCGTCGCCGGCGCCGTCCCGCTGCTCGCGCTCGCCGTCTGGCACTGCACCGACGCCTTCCACTGTGCCGCCTTCGCGTTCCGCCGCCGCGGGACACGACGCGCGAGACGGCTCCCGCCGGGCCACATGGGCCTGCCGTTCGTCGGCGAGACCCTCGCCCTGCTCTGGTACTTCAACCTCGCCCGCCGCCCCGACGCCTTCATCGAGGCCAAGAGGCGGCGCTACTGCTACGGCGACGGCGACGACGACGCCGGCATCTACCGGACGCACCTGTTCGGCTCGCCCGCGGTGCTAGTCTGCTCGCCGGCGTCCAACGGGTTCGTGTTCCGGTCGGCGCCGCCCGGCAGCTTCGACGTCGGTTGGCCGGACCCGGAGCTCGTCGGCGTCTCGTCGATCGTGAACGTGCACGGCGGCCGGCACGCCAGGCTGCGCAGGTTCGTCCTCGGCGCCATCAACAGCCCAAACTCCCTCCGGTCCTTCGCGGAGGTCGTCCAGCCGCGCGTGGCGGCGGCGCTGCGGTCGTGGGCGGCCAAGGGCACCATCACCGCCGCCACCGAGATGAAGAAAGTGACGTTCGAGAACATATGCAGGATGTTCGTGAGCATGGAGCCGTCTCCGGCGACTGCCAAGATCGACGAGTGGTTCGCCGGATTGGTTGCCGGGTTCAGGGCGCTACAGTTGGACATCCCAGGAACCGCGTTCCACCACGCTCGAAAGTGCCGTAGGAAGCTGAACTCGGTGTTCAGGGAGGAGGTCAAGAGGAGGAAGTTGAAGGCGAAGTTAGAGGAGCACGACGATGTTATGAGCGGGCTGATGCGGATGGAGGATGAGCAGGGTCGGCGGCTGGGCGACGACGAGGTGGTGGATAGCATAGTCTCCCTTGTCTTGGGAGGCTACGAGTCCACCTCCAGCGCCATCATGTGGGCAACCTACCACCTCGCAAAATTGCCCGCTGTCCTTGCCAAGTTAAGAGAAGAGAATTTGGCCATAGCAAAAGAAAAGAATGGAGCCAGCTTCATTACTCTAGATGACATCTCCAAGATGAAGTACACAGCCAAGGTAGTGGAAGAAACAATTCGGTTGGCCAACATATCTCCGATGCTTTACCGGGTGGCACTCAGAGATGTCGAGTACCGAGGTTATACAATACCAGAGGGGTGGAAAGTAATTGTGTGGATCCGATCACTACATGTTGACCCTAAATATTACGATGATCCGTTGAGCTTCAACCCCGACAGATGGGATAAAGCAGCGAAGCCAGGCACGTACCAGGTGTTCGGTGGCGGCGAGAGGATCTGCGCCGGCAACATGCTGGCAAGGCTGCAGCTCACCATCATGCTCCATCATCTCTCTTGTGGTTACAAATGGGAGTTGTTGAATCCTGATGCAGGGGTTGTTTACCTTCCACGCCCAAGGCCAACAAATGGGGCTGCCATGTCCTTTAGTAAACTCTGA
More
|
|||||||
Protein seq | MSGATADWAWWLGLVAGAVPLLALAVWHCTDAFHSAAFAFRRRGTRARLPPGHMGLPFVGETLALIWYFNLARRPDAFIEAKRRRYCYGDGDDDGGIYRTHLFGSPAVLVCSPASNGFVFRSAPPGSFGVGWPVPELVGASSLVNVHGGRHARLRRFVLGAINRPGSLRTIARVAQPRVAAALRSWAAKGTITAATEMKNVTFENICKIFVSMEPSPLTEKIHGWFTGLVAGFRSLPLDMPGTALHHARKCRRKLNSVFREELERRKVKMVTGEGGDDDGDLMSGLMHVEDEQGRRLDDDEVVDNIVSLVIAGYESTASAIMWATYHLAKSPSALAKLREENLAIAKEKNGDGFITLEDVSKMKYTAKVVEETIRLANIAPMAHRVALRDVEYRGYTIPKGWKVIVWIRSLHVDPAHYDNPLSFNPDRWDKSAELGTYQVFGGGERICAGNMLARLQLTIMLHHLSCGYKWELLNPDAGIVYLPHPRPTDGATPVVAVGATDWAWRLGALVAGAVPLLALAVWHCTDAFHCAAFAFRRRGTRRARRLPPGHMGLPFVGETLALLWYFNLARRPDAFIEAKRRRYCYGDGDDDAGIYRTHLFGSPAVLVCSPASNGFVFRSAPPGSFDVGWPDPELVGVSSIVNVHGGRHARLRRFVLGAINSPNSLRSFAEVVQPRVAAALRSWAAKGTITAATEMKKVTFENICRMFVSMEPSPATAKIDEWFAGLVAGFRALQLDIPGTAFHHARKCRRKLNSVFREEVKRRKLKAKLEEHDDVMSGLMRMEDEQGRRLGDDEVVDSIVSLVLGGYESTSSAIMWATYHLAKLPAVLAKLREENLAIAKEKNGASFITLDDISKMKYTAKVVEETIRLANISPMLYRVALRDVEYRGYTIPEGWKVIVWIRSLHVDPKYYDDPLSFNPDRWDKAAKPGTYQVFGGGERICAGNMLARLQLTIMLHHLSCGYKWELLNPDAGVVYLPRPRPTNGAAMSFSKL
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|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 4.0544365 | 0.772636 | 0.411052 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_10g0378100 | RBH | 4.481274 | 3.736843 | 11.340110 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os10g23160 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os10g0378000 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_10g0008850 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_10g0008930 | RBH | 1.319703 | 0.0 | 6.093522 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_10g0008780 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_10g0009180 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_10g0008930 | RBH | 1.993182 | 0.0 | 0.000000 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_10G0208200 | RBH | 3.077222 | 0.5732475 | 0.021308 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_10g0008910 | RBH | 0.328748 | 0.0 | 1.347400 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | NA | NA | NA | NA | NA |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_10g0008710 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_10g0008700 | RBH | 0.361216 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_10g0009110 | RBH | 5.630384 | 0.0 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_10g0008690 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_10g0009240 | RBH | 0.120135 | 0.0 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_10G008970 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.0 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_10g0008980 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |