Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
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Gene Symbol CCD1, OsCCD1, -
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Function Carotenoid 9,10(9',10')-cleavage dioxygenase 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:O65572]

Transcripts

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
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Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
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Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os08g28400 RBH 0.577604 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os08g0371200 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_08g0013930 RBH 0.0 0.0 0.088881
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_08g0013830 RBH 0.083473 0.0 0.000000
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_08g0013800 RBH 0.0 0.0 0.411752
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_08g0014100 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_08g0013780 RBH 0.647170 0.0 2.059794
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_08G0270600 RBH 3.780759 0.0529615 0.004473
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_08g0013820 RBH 0.744799 0.082936 0.602493
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_08G0293900 RBH 0.3413645 0.999207 1.032702
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_08g0013320 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_08g0013410 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_08g0013350 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_08g0014110 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_08g0013450 RBH 0.140231 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_08G013540 RBH 0.000000 0.0 8.223528
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_08g0013610 RBH 0.0 0.0 0.0
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