Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
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Function Putative protease Do-like 14 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q3E6S8]

Transcripts

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ATGCCACCCAAACTGAGGTCGTCGAAGGGGGTGGCGCCATCCCCTTCCACCGGCGAGGGTGGAGAAAGCCACACATCGAAAAAGAATCCCGCTCCGGCTACGGCTCCCACCGCCGGAAGTGTTACTCGATCTAGAGCGAGGGATACTACTGAGCGCGCTAGAGCTAGTGGCGGGGGCACGGCACTGGATCCGAAGAAGAGAAAGAGGACAGAAGAGTCAGCGGCGTCATCAGCAGCGGCGGCAGGTCCGGTTCCGAAGAAGATGACCACCGCCGGTAGTACGACCTTGGCCTCCCGGCCGCTCCCTCTTCGCTACCCGCCTTATCCCACCTTACCACCGGGGACTCGTCCTACCAGCAGACAATATTTGGATCCCGTCCTTGACAGAAAATATTTGGATTCCGTTCTTGAGTGGGCCAAGGAGCGCCGCCGGATCGCCAAACTCTCCAAGAAAGCTCAATGTAAAGATATCCCCACTCTCAGGCATTCGCCCATGGATCCCATCACTGCAGATGCCGTCGTCACATCACAAGACAAGGCCATGGTGCTGCGTGTGGCTCGCTCCGTTGTCAGTGTTTCATCCACAATGCCTGATGGGGGTGGATTGATTTCCCGGTGCACTGGCGTCGTAATCGGTTGGGATGGGGCTAACAAACGTGCCAAGATCCTCACTGCTGCTTCTGTTGTTTGTGACTTCCATGGTGAATTGCATAACCCAGCACTCAAGCTATCCGTCAGTATGCCAAATAAGACAACAACAGAAGGAAGGTTGTTGTTCTACAATGTGCACTATGGTATTGCTCTTTTGGAAGTCATGGGAGACTACAAGTTGGAGGTCCCTTCTTTTGGATCGGGCACAAACTACGGTCAGGTCATATTTGCATTGGGTAGGGGTGAAAACATGTCTTTAATGGTTAGCCATGGAACAATTTCATGGACAGATTACCCTGTGTTATTGAGGAACCACAATATGTTTCTGAGCTGTGATATTCCTGAGGGTGGTTCAGGAGGGCCGGTGGTTGACCATGGTGGCAATATGATTGGGATTGCATTTGTAGAAAATCCGGGTCCGGTCTTTATCTCTATCAAGACAATCATGACTTGCATGGAGATGTGGGATCAGTTTAGCCGTGTTGCTCGCCCCTTGCTTGGCATGCAATTGAAGTCAGTGGAACTACTGGATGTCTCCATTCAGGAGGAACTCTGTCGTGACTATAATATCACCAGTGGTTTCATTGTGAGTCAGGTGCTCGTTGATTCTACTGCTGAAAAGCTTGGTATTAGACGAGGGGACGTGATTGATTTTCAGGATATTGATTGTTCTACTTTATCCCAGTTAGAAGACCACCTCCTTTCTCTTGGTTGGGGATACCTGAAAGGGATGCATTTGACAGTCGATCTGAAGGTTGAAGTTCATAATCTCTTCGACTCATATAGGGAAAGTATTACTTTCCCTGTACAGTTCACTGATGCTTCTAAGCAGGTAAACTAG

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Protein seq

MPPKLRSSKGVAPSPSTGEGGESHTSKKNPAPATAPTAGSVTRSRARDTTERARASGGGTALDPKKRKRTEESAASSAAAAGPVPKKMTTAGSTTLASRPLPLRYPPYPTLPPGTRPTSRQYLDPVLDRKYLDSVLEWAKERRRIAKLSKKAQCKDIPTLRHSPMDPITADAVVTSQDKAMVLRVARSVVSVSSTMPDGGGLISRCTGVVIGWDGANKRAKILTAASVVCDFHGELHNPALKLSVSMPNKTTTEGRLLFYNVHYGIALLEVMGDYKLEVPSFGSGTNYGQVIFALGRGENMSLMVSHGTISWTDYPVLLRNHNMFLSCDIPEGGSGGPVVDHGGNMIGIAFVENPGPVFISIKTIMTCMEMWDQFSRVARPLLGMQLKSVELLDVSIQEELCRDYNITSGFIVSQVLVDSTAEKLGIRRGDVIDFQDIDCSTLSQLEDHLLSLGWGYLKGMHLTVDLKVEVHNLFDSYRESITFPVQFTDASKQVN

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 7.7332645 15.364153 22.5123485

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_08g0144400 RBH 4.491756 5.134789 7.379937
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os08g04920 RBH 2.923445 3.783135 1.747743
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os08g0144400 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_08g0003040 RBH 0.806269 17.166710 6.708819
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_08g0003120 RBH 0.174686 4.642792 4.593442
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_08g0003090 RBH 2.827682 5.788842 17.358896
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_08g0003080 RBH 0.375487 0.588212 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_08g0002870 RBH 9.745584 23.033821 28.667522
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_08G0037300 RBH 6.3937115 19.448796 13.4231505
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_08g0002750 RBH 0.700337 0.558438 2.445552
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU NA NA NA NA NA
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_08g0002880 RBH 0.333406 0.457194 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_08g0002910 RBH 1.330068 14.809369 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_08g0002720 RBH 10.013127 26.576918 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_08g0002920 RBH 1.328328 1.888158 2.134171
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_08g0002840 RBH 0.259912 8.689510 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_08G002870 RBH 0.479854 6.192564 2.351467
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_08g0002730 RBH 1.610551 7.524541 9.967426
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