Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsZS97_04G0507000 OGI:04093890 | 16/16 Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU Chr04:33676499-33686155
Gene Symbol -
DNA seq

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Function Putative disease resistance protein RGA1 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XA42]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsZS97_04G0507000 OsZS97_04T0507000.1 Chr04 33676499 33686155 + makerRMon
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Protein seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.2745435 0.2969485 0.9896195

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_04g0626500 RBH 1.449855 1.839052 2.533673
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os04g53496 RBH 0.332108 0.119212 0.141505
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os04g0626500 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_04g0027380 RBH 0.155781 1.581032 1.468144
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_04g0028120 RBH 0.000000 0.000000 0.664531
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_04g0027890 RBH 0.369363 1.710174 1.452925
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_04g0027670 RBH 0.015382 0.066013 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_04g0027860 RBH 0.381253 3.404730 2.750773
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_04G0503000 RBH 1.1102425 2.785596 3.067995
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_04g0026620 RBH 0.066260 0.133214 0.369819
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_04G0501000 SBH 1.7972415 28.273736 8.250045
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_04g0027030 RBH 0.000000 0.258998 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_04g0026890 RBH 0.093515 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_04g0026930 RBH 0.0 7.217812 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_04g0027380 RBH 0.054452 0.199891 0.000000
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_04g0027550 RBH 0.406676 3.068031 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_04G026800 RBH 0.074867 0.877226 0.575971
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_04g0026740 RBH 0.721525 4.148806 0.973180
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