Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsZS97_04G0210100 | OGI:04041790 | 16/16 | Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | Chr04:13840085-13851533 | ||||||||
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| Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g56130 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGH2] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsZS97_04G0210100 | OsZS97_04T0210100-mRNA-1 | Chr04 | 13840085 | 13851533 | - | makerRMon | ||
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| OsZS97_04G0210100 | OsZS97_04T0210100-mRNA-2 | Chr04 | 13840085 | 13851533 | - | makerRMon | ||
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| OsZS97_04G0210100 | OsZS97_04T0210100-mRNA-3 | Chr04 | 13840085 | 13851533 | - | makerRMon | ||
| CDS seq | ATGCGTTCTTCCAGAGGTTTCATTCGCCATTCCGTGTGGTGTCTGGTGTTTGTATGGTCATGGCGGGTTGCAGCAGCTCAGGATCAACAAGCACCAAAAACTGATCCAGTCGAAGCGGTGGCCCTGAACACGATCATGAGGAGATGGGGCAAGGAGGCATCATCGGAGTGGAATGTTAGCGGTGATCTCTGCAGCGGTTTCGCCGCTGACAAAAACGACTGGGATTACTATCCCAACATCAACCCATTCATCAAATGCGATTGCACTTTCAGCAACAACACACTATGCCACATTACAAAACTGGACTTGAACTATAATTACTTGACTGGTTTCATTCCATCATTCATCGGAAAATTCACTTCAATGAAATACTTGGCATTGGGTTTCAATCCACTATCTGGACCACTTCCAAAGGAACTTGGAAACCTCACCAATCTTATTTCATTGGGCATTAGCTTAAACAATTTCACAGGTGGCCTTCCTGAAGAACTAGGCAACTTGACCAAACTTAAGCAATTGTACATTGATAGTTCTGGATTCAGTGGTCCGTTCCCTTCAACGTTCTCAAAACTTCAGAACCTGCAGATCCTTCTAGCATCAGACAATGGATTCACAGGGAAAATACCTGATTATTTAGGTAGCATGACTAATTTGGAAGAAATGCGGATTGGAGATATTGTAAATGGGATCTCTCCATTGGCTCTTATCAGTAATCTGACTTCTCTGAACACCCTAATATTGAGGAACTGCAAGATATATGGTGATCTCGGAGCAGTAGATTTTTCTATGTTTGAAAAGTTAAGCTTGCTGGACCTAAGTTTTAACAATATCACAGGGAAAGTTTCTCAATCCATCCTGAATTTGGGAAATCTACAGTTCTTGTTTCTTGGGAACAATAACCTTGCAGGAAGGTTGCCTGATGGTATAAGCTCTTCCTTAAAAGCGATAGATTTTTCGTACAATCAACTCACCGGGAGCATTCCTTCTTGGGCTAGCCAAAACAATTTACAGTTGAATTTGGTGGCAAACAACTTTTTACTCGGTAGCACCAGTAACAGTAATACAGCAACGAGAGGATCAGATAATACCATTTATGAAGCAGATCCTGCAAATCTTGGAGCTGCAACATATTATGTTACTGGTCAAACAAGATGGGGTGTCAGCAGTATAGGACACTACTTCCGGGCCACAGATGCAAAGAACATTATATATAGTTCCCAAAATTTTAACAATGTAGTTGATTCAAAGTTGTTTGAAACTGGAAGGGTGTCGCCATCATCTCTGAGGTATTACGGCCTTGGACTTGAAAATGGAAATTACACAGTTCTGCTTCGATTTGCAGAAATTGCTTTTCCGGACTCACAGACTTGGCTAAGCTTAGGGAGAAGAGTTTTTGACATATATATTCAGGGTGCTTTGAAAGAAAAGGATTTTGATATAAGGAAGACGGCAGGTGGAAAGTCTTTTAGCGTTGTTAATAGGAGTTTCATGGTAACTGTGTCTAAAAATTTTCTCGAGATCCATCTATTCTGGGCTGGTAAGGGCGGGGGAATCTATGGGCCAATGATCTCAGCATTGAGTGTCACTCCAAATTTTACTCCTACTGTGCGAAATGGCATACCAAAAAGCGAAAGTAAAGTAGGTATAATTGCCGGAATATCTATTGGTGCAATAGTTTTAGTATTAGCAGCATTATTTGGAGTGTTTACGCTGTTAAAGAAGCGGAGGGCATTGGCATATCAAAAAGAAGAACTGTACTATTTGGTTGGACAACCTGATGTTTTCAATTATGCTGAGCTCAAGCTAGCCACCAACAATTTCAGTTCTCAAAATATCCTAGGGGAAGGTGGATTTGGGCCGGTGTATAAGCAATATTTTGTCCATGCTCAAAATATACATGTAACAAATTTGGCAGGTAAAACACCCTTGTTGGTTTATGAATACCTTGAAAATGGAAGCTTGGATCAAGCAATCTTTGGTGACAGTAGCTTAAACCTAGACTGGGTAACACGCTTCGAAATCATTTTAGGCATAGCAAGTGGTCTAACTTATCTTCATGAGGAGTCAAGTGTGCGCATTGTGCACAGGGACATCAAAGCCAGCAATGTCTTACTTGACACTGACCTCACCCCAAAGATCTCTGATTTTGGACTTGCCAAACTCTATGATGAGAAGCAAACTCATGTGAGCACTAGAATTGCAGGCACATTGGGCTATCTAGCTCCAGAGTATGCAATGAGAGGCCATTTGTCAGAAAAGGCTGATGTTTTTGCATTTGGAGTGGTCATGCTGGAGACTGTCGCTGGGCGACCGAACACCAACAATTCCCTGGAGGAAAACAAGATCTATCTCCTTGAATGGGCATGGGGCATGTATGACAAGGATCAGGCGCTCGAAATTGTTGACCCAACTATCAAGGATTTTGATAAGGATGAAGCTTTTAGAGTCATCAATGTTGCACTTCTCTGCACTCAGGGCTCACCGCACCAGCGACCACCAATGTCGAGGGTCGTGGCAATGTTGACTAGAGATGTCGATGCGCCTAAAGTGGTCACGAAGCCAAGCTACATCACTGAGTGGCAGCTCAGGGGTGGTGGCAACAACGGTAATGACTTCTTCTCATGCACAGGCTAG
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| Protein seq | MRSSRGFIRHSVWCLVFVWSWRVAAAQDQQAPKTDPVEAVALNTIMRRWGKEASSEWNVSGDLCSGFAADKNDWDYYPNINPFIKCDCTFSNNTLCHITKLDLNYNYLTGFIPSFIGKFTSMKYLALGFNPLSGPLPKELGNLTNLISLGISLNNFTGGLPEELGNLTKLKQLYIDSSGFSGPFPSTFSKLQNLQILLASDNGFTGKIPDYLGSMTNLEEMRIGDIVNGISPLALISNLTSLNTLILRNCKIYGDLGAVDFSMFEKLSLLDLSFNNITGKVSQSILNLGNLQFLFLGNNNLAGRLPDGISSSLKAIDFSYNQLTGSIPSWASQNNLQLNLVANNFLLGSTSNSNTATRGSDNTIYEADPANLGAATYYVTGQTRWGVSSIGHYFRATDAKNIIYSSQNFNNVVDSKLFETGRVSPSSLRYYGLGLENGNYTVLLRFAEIAFPDSQTWLSLGRRVFDIYIQGALKEKDFDIRKTAGGKSFSVVNRSFMVTVSKNFLEIHLFWAGKGGGIYGPMISALSVTPNFTPTVRNGIPKSESKVGIIAGISIGAIVLVLAALFGVFTLLKKRRALAYQKEELYYLVGQPDVFNYAELKLATNNFSSQNILGEGGFGPVYKQYFVHAQNIHVTNLAGKTPLLVYEYLENGSLDQAIFGDSSLNLDWVTRFEIILGIASGLTYLHEESSVRIVHRDIKASNVLLDTDLTPKISDFGLAKLYDEKQTHVSTRIAGTLGYLAPEYAMRGHLSEKADVFAFGVVMLETVAGRPNTNNSLEENKIYLLEWAWGMYDKDQALEIVDPTIKDFDKDEAFRVINVALLCTQGSPHQRPPMSRVVAMLTRDVDAPKVVTKPSYITEWQLRGGGNNGNDFFSCTG
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.0147545 | 0.879504 | 0.2396305 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_04g0291900 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os04g22470 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os04g0291900 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_04g0006740 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_04g0007350 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_04g0007130 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_04g0006770 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_04g0007100 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_04G0203200 | RBH | 0.0047105 | 0 | 0.4323295 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_04g0006880 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_04G0208300 | RBH | 0.736312 | 0.336153 | 0.015034 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_04g0006630 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_04g0006970 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_04g0006950 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_04g0006840 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_04g0007120 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_04G006760 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_04g0006890 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
