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Function Cationic peroxidase SPC4 [UniProtKB/Swiss-Prot:P84516]

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsZS97_01G0697500 OsZS97_01T0697500-mRNA-1 Chr01 43967677 43983698 + makerRMon
CDS seq

ATGAAGAACTCGGAGCTTGCATGTAGCACGTTTTACTCGGGGACTAGTGCTACTGCCGGCATGCTGCTGCTCGCCGCCGCGGCTGCGCTGGTGTGCAGCTCGGCGGCGGCGAGGATGCCGCCGTTGGCGAAGGGGTTGTCGTTGGGCTACTACGACGCGAGTTGCCCGCAGGCGGAGGCCGTCGTGTTCGAGTTCCTGCAGGACGCCATCGCCAAGGACGTCGGCCTCGCCGCGGCGCTGATCCGGCTCCACTTCCACGACTGCTTCGTCCAGGGCTGCGACGCCTCCATCCTGCTCGACAGCACACCCACCGAGAAGAGCGAGAAGTTGGCGCCGCCGAACAAGACCCTCCGCAAGTCGGCGTTCGACGCCATCGACGATCTCCGCGACCTGCTCGACAGGGAATGCGGCGACACCGTCGTGTCCTGCTCCGACATCGTCACCCTCGCCGCCCGCGACTCCGTCCTCCTCGCCGGTGGCCCGTGGTACGATGTTCCCCTCGGCCGCCACGACGGCTCCAGTTTCGCGTCTGAGGACGCCGTCCTGAGCGCGCTCCCGTCGCCGGACTCCAACGTCACCACGCTCCTCGAAGCGCTGGGCAAGCTCAAGCTCGACGCCCACGACCTCGTCGCCCTCTCCGGCGCGCACACCGTCGGCATCGCGCACTGCACTTCCTTCGACAAGCGCCTCTTCCCTCAAGTCGACCCCACCATGGACAAGTGGTTCGCCGGCCACCTCAAGGTCACCTGCCCGGTGCTGAACACCAACGACACCACCGTCAACGACATCCGGACGCCCAACACCTTCGACAACAAGTACTACGTCGACCTGCAAAACCGCCAGGGCCTCTTCACCTCCGACCAGGGCCTCTTCTTCAACGCAACCACCAAGCCGATCGTCACCAAGTTCGCCGTCGACCAGTCGGCCTTCTTCGACCAGTACGTCTACTCCGTCGTCAAGATGGGCATGATCGAGGTGCTCACCGGCTCGCAGGGGCAGATCCGCAAGCGCTGTTCGGTGTCCAACGCCGCCGCCGCCGGCGACCGTGCTTGGTCCGTCGTGGAGACCGTCGCTGAGGCCGCCGAGAGCTTGTACGAGCTTACACTTAGAGCAGTAGAAATACAATTACGGGAGGAAATGGCTTCTGCGACGACGCTGGTAATGCTGGTAGCTGCCGTCGCTTGCCTGTGCGCTCCGGCGGCTGCCGGCGACGGCAACGCCGACGCGACGCGGCAGCCGCCGGTGGTGAGTGGCCTGTCGTTCGACTTCTACAGGAAGAGCTGCCCCAAGGCGGAGTCCGTCGTGAGGAAGTTCGTCAGGGACGCCGTCCGCAAGGACATCGGCCTCGCCGCCGGCCTGCTCCGGCTCCACTTCCACGACTGCTTCGTGCAGGGCTGCGACGCCTCCGTGCTGCTCGACGGCTCCGCCACCGGCCCCGGCGAGCGGCAGGCGCCGCCCAACCTCACGCTGCGCCCGTCGGCGTTCAAGGCCGTCAACGACATCCGCGACCGCCTCGAGAAGGCGTGCGGCGCCTCCGTCGTCTCCTGCTCCGACATCCTCGCTCTCGCCGCCCGCGACTCTGTCGTCGCGTCAGGAGGGCCGGAGTACAAGGTGCCACTGGGGCGGCGAGACAGCGCCGAGTTCGCGTCGCAGCAGGACGTGCTGAGCGGGCTGCCGCCGCCGACCGCCGCCGTGCCGGCGCTGCTGGACGCCCTGGCCAAGATCAAGCTCGACGCCACCGACCTGGTGGCGCTCTCCGGCGGCCACACCGTGGGCCTCGCGCACTGCAGCTCCTTCGAGGGCCGCCTCTTCCCGCGCCGGGACCCGGCCATGAACGCCACCTTCGCCGGCCGGCTCCGGCGAACCTGCCCGGCGGCGGGCACCGACCGCCGGACGCCGAACGACGTCCGGACGCCCAACGTGTTCGACAACATGTACTACGTCAACCTTGTCAACCGGGAGGGGCTCTTCACCTCCGACCAGGACCTCTTCGCCGACGCCGCCACCAAGCCCATCGTCGAAAAGTTCGCCGCCGACGAGAAGGCATTCTTCGACCAGTTCGCCGTGTCCATGGTGAAGATGGGGCAGATCAGCGTGCTCACCGGCTCGCAGGGCCAGGTTCGCCGGAACTGCTCAGCCAGAAACCCCGGCACCGTCGCCGCCGGCGACCTCCCGTGGTCCGTCCTCGAGGTTGCAGACAGCTTCGTTTTCTAG

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Protein seq

MKNSELACSTFYSGTSATAGMLLLAAAAALVCSSAAARMPPLAKGLSLGYYDASCPQAEAVVFEFLQDAIAKDVGLAAALIRLHFHDCFVQGCDASILLDSTPTEKSEKLAPPNKTLRKSAFDAIDDLRDLLDRECGDTVVSCSDIVTLAARDSVLLAGGPWYDVPLGRHDGSSFASEDAVLSALPSPDSNVTTLLEALGKLKLDAHDLVALSGAHTVGIAHCTSFDKRLFPQVDPTMDKWFAGHLKVTCPVLNTNDTTVNDIRTPNTFDNKYYVDLQNRQGLFTSDQGLFFNATTKPIVTKFAVDQSAFFDQYVYSVVKMGMIEVLTGSQGQIRKRCSVSNAAAAGDRAWSVVETVAEAAESLYELTLRAVEIQLREEMASATTLVMLVAAVACLCAPAAAGDGNADATRQPPVVSGLSFDFYRKSCPKAESVVRKFVRDAVRKDIGLAAGLLRLHFHDCFVQGCDASVLLDGSATGPGERQAPPNLTLRPSAFKAVNDIRDRLEKACGASVVSCSDILALAARDSVVASGGPEYKVPLGRRDSAEFASQQDVLSGLPPPTAAVPALLDALAKIKLDATDLVALSGGHTVGLAHCSSFEGRLFPRRDPAMNATFAGRLRRTCPAAGTDRRTPNDVRTPNVFDNMYYVNLVNREGLFTSDQDLFADAATKPIVEKFAADEKAFFDQFAVSMVKMGQISVLTGSQGQVRRNCSARNPGTVAAGDLPWSVLEVADSFVF

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0 0 0

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_01g0963000 SBH 1.568209 1.160681 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os01g73220 RBH 0.129798 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os01g0963000 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_01g0047970 RBH 0.000000 0.0 1.840126
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_01g0047450 RBH 0.0 0.0 0.444657
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_01g0047940 RBH 0.0 0.0 0.000000
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_01g0047350 RBH 0.000000 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_01g0046970 RBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_01G0698100 RBH 0.2840605 0.193113 0.3553075
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_01g0046420 RBH 0.0 0.0 0.191821
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_01G0697600 RBH 0.605342 4.916701 0.188315
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_01g0046990 RBH 0.099767 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_01g0046870 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_01g0047180 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_01g0047140 RBH 0.315611 0.000000 0.157462
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_01g0046900 RBH 0.077370 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_01G047210 RBH 0.0 0.000000 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_01g0046960 RBH 0.0 0.0 0.0
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