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| Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g51810 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9FZB8] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsZS97_01G0566400 | OsZS97_01T0566400.1 | Chr01 | 35989951 | 36008444 | - | makerRMon | ||
| CDS seq | ATGGCACAATACATCGCAGATGCTACAAATGAACAAGAAAAAACGTTGAGAAGCTTCCCTGATGGCCAACGGAACTGTTATACATTACCAACCAACAGTAGCAAGAAGTATCTCATCAGAGCCACCTTCACTTATGGAAACTACGATGGGCTCAACTCGTCAGAGAAGGGTTCTCTGTTTCTCTTTGGACTCCACATCGGCGTCAACTTCTGGGCAACGGTGAACTTGACAAACTGGGGTTCATCAGATACGATGTATAAAGAGGTGATCACAGTTGCTCCAGACAAATTCATATCCGTCTGTCTGATAAACTTGGGATCAGGAACTCCCTTCGTATCTACATTAGACTTGAGGGAATTGGATGGTGCAATGTTCCCATTTCTGAATCTTTCTGTTTCAATCAGCCATTTGGCTCGACAAAGATATGGCTCGGTCGATGATTACATCACGAGATATCCAACTGATCCCTTCGATCGTTTCTGGGAGGCAGCCCTACGCTACAAATTTCCCTTCCTCAACATGACCACCAACCAAGACGTGACAAAGCTTCCTGGAAATGACGACTTTCAGGTGCCGATGCCCATCCTTCAGAAGGCCTCAACCATAAGCAGCAATTTCTCAGAGTTTAACGTCAGCGTGATATTTCCGGACAACATGAAAAACATCGACAACATCAACAACATCGACTACAGGAGCTTGGAGCTGCTACCAATCTTCCACTTTGCCGATATTGGAGGCAACAACCAGAATAGAACGTTTGATATCTATAACGATGGAAACCTGATGTTTCCCAACTACATACCACCCCTGTTCCGAGCGGAGAGCACATATCAGAGTGGTAAGTTCTTGCGCAAGAGGGGCCTCAACTTCACCCTGCGCAAGACGCCCAGCTCGGAGCTCCAGCCGCTCATCAACGCATTCGAGGTGTACTCGCTTGTTCATACAGACAACCTCACCACTTCTCCAGACGACGTTGATTACATGAAAGAAGTGAAGAAGTACTACAGTTACACAAGAAACTGGAATGGAGATCCATGCTCCCCAAGAGAGTATTCCTGGCAAGGTCTGGCTTGCGACTACGCTAATGGAAACAAAAATCCAAGGATCACCCGAATTAATCTGTCAGCCAGCGGATTAATAGGTGGATTACACATAGCATTCATGAAAATGGCATCACTGGAGAACTTGGATTTATCGCACAACAACTTGACAGGCGCAATTCCAGACTATCAACTCAATTCACTCAGAGTGCTCAACCTATCAAATAACCAACTTGATGGACCAATCCCGGATTCTATTCTTCAAAGGTTTAAGGCAGGACAGCTTGAATTGAGACTAGAAGGCAATCCCATATGCTCAAAAGTCAAAGATAGGTACTGCGCAAATAAGAACAGCACACCTATCTTGCTCATCGCAGTGATAGTTCCTGTGGTATCCCTCCTACTCCTTGTACTGGTTTGTATCCTCTGGAGGCTGTGCTGGAAAGGAAAATCAGCAGAACAAGAAGATTATTCTATTTATGAAGAGGAAGCTCCATTACATATCGACATCAAACGGTTCACATATGCAGAGCTGAAGCTCATAACTAACAACTTCCAATCAATCATTGGAAAAGGAGGTTTTGGCACTGTTTATCATGGCATACTGGAAAATAACGATGAAGTAGCTGTTAAGGTGCTTGTGGAGACATCTATAGCAGAGTCAAAAGACTTCCTCCCTGAGGTGCAAACCTTGTCCAAAGTTCATCATAAGAATCTTGTCACTTTGGTGGGATATTGCCAAAACAGGAAGTGCCTTGCGCTTGTTTATGATTTCATGCCTAGAGGAAATCTTCAGCTGTCATGTAGTTTGAATTGGGAAGAACGACTTCACATTGCACTTGATGCTGCACAAGGACTGGAGTATCTACATGAATCATGCAGCCCGTCAATAGTTCACAGAGATGTGAAGACACCCAACATCCTTCTGGACAAGAATCTGGTGGCCAAGATATCTGATTTTGGGCTTTCACGGGCTTTTAATGCAGCTCACACGCATATATCTACTGTTGTTGCCGGCACCCTTGGTTACCTTGACCCTGAGTATCATGCTACTTTCCAACTTACCGTTAAGACAGACGTTTACAGTTTTGGAATTGTCCTCTTGGAGATTGTCACTGGTCAACCCCCAGTATTTATGGATCCCCAAACCGTCCACTTGCCAAATTGGGTGCGGCAAAAGATTGATAAGGGAAGCATCCACGATGTTGTGGACAAGAAACTGTTAGATCAATACGATGCCACTCACCTGCAAACTGTGATAGACCTTGCAATGAACTGCCTTGAAAACACATCAATTGACAGGCCAAGCATGACTGAGGTTGTTTCTGTGCTTAAGGTGTTGTTTACGGTGGCTATTTCAAGTGAGAAACGATCGGTTACATCAACCCCTCAAGAGAAGAACGTCATGGATGCAGACATTCCACGGCAGTTCCACTTGATGATTTCTGGAGCTACAACAACAAGCTACGACAACGAGGGCAGTTCCTCACAGTCTGGTCCTACCGGTGGGATGTCAGAAATAAGCTACATTTCTGGACGGCCCCGTCGTCCAATGCTAAAACAGAAGGATTTGATGGTGATCAGCTACAGCTGCTCGGCTGGTACCAAGCTGACATGGATATTGTCGTTGCTGCTCATCCTGGTCGCGGCGACACAAGTCCATGGCGTGTCTCCTCCTGGGTTTTTAAACGTCGACTGCGGATTGACAAATCGTAGTACTTACAATGACACCGACACAACTTTGACGTACGTTTCTGACAGAGAATTTGTCGAGAGCGGCAAGAGCTACGATATTATGGCACAATACATGGCAGATGCTACAAATGAACAAGAAAAAACGTTGAGAAGCTTCCCTGATGGCCAACGGAACTGTTATACATTACCAACCAACAGTAGCAAGAAGTATCTCATCAGAGCCACCTTCACTTATGGAAACTACGATGGGCTCAACTCGTCAGAGAAGGGTTCTTTGTTTATCTTTGGACTCCATATCGGTGTCAACTTCTGGACGACGGTAAACTTGACAAAGTGGGATCCATCGAGCACGGTATGGAAAGAGGTGATCACGGTTGCTCCGGACAAGTCCGTATCTGTCTGTCTGATAAACATGGGATCAGGAACTCCCTTCATATCTACACTAGATCTTAGGCCCTTGCAAGACACAATGTATCCCTTCGTGAATGCCTCAACGTCCGTCAGCTATTTTTCTCGGATAAGATTTGGATCGGTTGATGAATACATCACAAGATTCCCAACGGATCAGTATGATCGCTTCTGGGAGGGCTGGGTCTTTACCATGCACACCTTTCCATGGGTTAATAAGAGTAGCAACGGCAAGGTGGCTGAACTTCCTAATATTGACACCTTTGGGCTTCCTCCAGCCATTCTGGGAAGCGCTTCAACCATAAACGGAAACTACTCTTGGCTCAACATCAGCGTTAGTGCCAGTAACTCTCTCGCAACAGACCTAGAGCTTCTTCCAGTCTTTCACTTTGTTGAACTCGGCAATAATGGTTCAAAGAGAATTTTTGACATCTACAATGTCGATGAACCGCAAGCACTGTTCTCCAACTTCAGCCCACCGTCATTCCTGAGCTCCATGTTCCACAACTGGTTCTTGCGCAAAGGCAGAAGGGCATATTTTCAGCTTCGCAAGACCCCAGACTCACAGCTACCACCTCTTATTAACGCATATGAGGTGTACTCCCGTGTCCAGGTGGAGAACTTCACCACTGCTTCAAGTGATGTTGACTCCATGAAAACAATCAAAGAGAAGTACATGGTAATCAAAAACTGGAACGGGGATCCATGCTCACCAAGAGAGTACATCTGGAATGGTTTGACTTGCACCTACCCTAATGGTGGCCAGAACCCAAGGATTGTTGAAATAAATCTATCTGGCAGCGGTCTGCAAGGAGAGTTAGAAATATCATTCATGAAAATGTCATCACTGAAGAAATTGGATTTATCACACAACAACCTGACAGGCACCATTCCAGACTATCAAGTAAATTCCCTCACTGTTATTGACTTGTCTAATAACCAGCTCAATGGATCCATCCCTGATTCTATTCTTCAAAGATACAAAGCCGGTTTGCTTGAGCTAAGACTAGAAGGCAATCCCATATGCTCCAAAGTCAGAGCTAGCTACTGTGGAAATAAGAAGAACACACGCACACGTATTTTGCTCATCAGTGTGTTAGTTCCTGTGACATCTCTCCTAGTGGTGCTGTTCATATTCTGGAGGTTATGCTGGAAAGGGAAGTCAAGAAAATCAGAAGAAGAAGATTATGATATGTATGAAGAGGAGACTCCCCTACATATCGACATCAGAAGGTTCACATATGCAGAGCTGAAGCTCATAACTAACAATTTCCAATCAATCATTGGAAAAGGAGGTTTTGGTACTGTTTATCATGGCATACTGGAAAATAATGATGAAGTAGCTGTTAAGGTTCTTGTGGAGACATCCATAGCAGAGTCAAAAGACTTTCTCCCTGAGGTACAAACCTTGTCAAAAGTTCATCACAAGAATCTTGTCGCTTTGGTAGGGTATTGCCAAAACAAGAAGTGCCTTGCACTTGTTTATGATTTCATGCCTAGAGGAAATCTTCAACAGCTTTTAAGAGGAGGATATGACAGTTTGAATTGGGAAGAGCGACTTCACATTGCACTTGATGCTGCACAAGGTCTGGAATACCTTCATGAATCATGCACCCCATCAATAGTTCACAGAGATGTGAAGACACCCAACATCCTTCTGGACAAGAATCTGGTGGCCAAGATATCTGATTTTGGGCTTTCACGGGCTTTTAATGCTGCTCACACGCATATATCTACTGTTGCTGCTGGCACTCTTGGTTACCTTGACCCTGAGTACCATGCCACTTTCCAGCTTACTGTTAAGACAGACGTTTACAGTTTTGGAATCGTCCTCTTGGAGATTGTGACTGGTCAACC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| Protein seq | MAQYIADATNEQEKTLRSFPDGQRNCYTLPTNSSKKYLIRATFTYGNYDGLNSSEKGSLFLFGLHIGVNFWATVNLTNWGSSDTMYKEVITVAPDKFISVCLINLGSGTPFVSTLDLRELDGAMFPFLNLSVSISHLARQRYGSVDDYITRYPTDPFDRFWEAALRYKFPFLNMTTNQDVTKLPGNDDFQVPMPILQKASTISSNFSEFNVSVIFPDNMKNIDNINNIDYRSLELLPIFHFADIGGNNQNRTFDIYNDGNLMFPNYIPPLFRAESTYQSGKFLRKRGLNFTLRKTPSSELQPLINAFEVYSLVHTDNLTTSPDDVDYMKEVKKYYSYTRNWNGDPCSPREYSWQGLACDYANGNKNPRITRINLSASGLIGGLHIAFMKMASLENLDLSHNNLTGAIPDYQLNSLRVLNLSNNQLDGPIPDSILQRFKAGQLELRLEGNPICSKVKDRYCANKNSTPILLIAVIVPVVSLLLLVLVCILWRLCWKGKSAEQEDYSIYEEEAPLHIDIKRFTYAELKLITNNFQSIIGKGGFGTVYHGILENNDEVAVKVLVETSIAESKDFLPEVQTLSKVHHKNLVTLVGYCQNRKCLALVYDFMPRGNLQLSCSLNWEERLHIALDAAQGLEYLHESCSPSIVHRDVKTPNILLDKNLVAKISDFGLSRAFNAAHTHISTVVAGTLGYLDPEYHATFQLTVKTDVYSFGIVLLEIVTGQPPVFMDPQTVHLPNWVRQKIDKGSIHDVVDKKLLDQYDATHLQTVIDLAMNCLENTSIDRPSMTEVVSVLKVLFTVAISSEKRSVTSTPQEKNVMDADIPRQFHLMISGATTTSYDNEGSSSQSGPTGGMSEISYISGRPRRPMLKQKDLMVISYSCSAGTKLTWILSLLLILVAATQVHGVSPPGFLNVDCGLTNRSTYNDTDTTLTYVSDREFVESGKSYDIMAQYMADATNEQEKTLRSFPDGQRNCYTLPTNSSKKYLIRATFTYGNYDGLNSSEKGSLFIFGLHIGVNFWTTVNLTKWDPSSTVWKEVITVAPDKSVSVCLINMGSGTPFISTLDLRPLQDTMYPFVNASTSVSYFSRIRFGSVDEYITRFPTDQYDRFWEGWVFTMHTFPWVNKSSNGKVAELPNIDTFGLPPAILGSASTINGNYSWLNISVSASNSLATDLELLPVFHFVELGNNGSKRIFDIYNVDEPQALFSNFSPPSFLSSMFHNWFLRKGRRAYFQLRKTPDSQLPPLINAYEVYSRVQVENFTTASSDVDSMKTIKEKYMVIKNWNGDPCSPREYIWNGLTCTYPNGGQNPRIVEINLSGSGLQGELEISFMKMSSLKKLDLSHNNLTGTIPDYQVNSLTVIDLSNNQLNGSIPDSILQRYKAGLLELRLEGNPICSKVRASYCGNKKNTRTRILLISVLVPVTSLLVVLFIFWRLCWKGKSRKSEEEDYDMYEEETPLHIDIRRFTYAELKLITNNFQSIIGKGGFGTVYHGILENNDEVAVKVLVETSIAESKDFLPEVQTLSKVHHKNLVALVGYCQNKKCLALVYDFMPRGNLQQLLRGGYDSLNWEERLHIALDAAQGLEYLHESCTPSIVHRDVKTPNILLDKNLVAKISDFGLSRAFNAAHTHISTVAAGTLGYLDPEYHATFQLTVKTDVYSFGIVLLEIVTGQPPVFMDPQTVHLPNWVRQKIANGSVHDVVDKKLLDQYDATHLQTVIDLAMNCLENASIDRPSMTEVVSVLKVCLPISSERQSATSTPRKKNVMDAEIPRQFQLMISGASTTSYEGSSFQSGYTGGVSEISHISGR
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|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.0806975 | 1.7962985 | 1.4860645 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_01g0811001 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os01g59580 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.055898 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os01g0811001 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_01g0037580 | SBH | 0.0 | 0.000000 | 0.486313 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_01g0037050 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.168354 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_01g0037460 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_01g0036850 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_01g0036560 | RBH | 0.0 | 2.403229 | 0.563428 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_01G0570000 | RBH | 0.593437 | 14.7712325 | 3.906639 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_01g0036230 | SBH | 0.020083 | 2.717001 | 0.266008 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_05G0362200 | SBH | 0.008404 | 0 | 0.0182515 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_01g0036370 | SBH | 0.028537 | 0.015554 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_01g0036490 | SBH | 0.050741 | 5.263038 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_01g0036740 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_01g0036800 | RBH | 0.076859 | 0.748156 | 0.240195 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_01g0036580 | SBH | 0.0 | 19.080910 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_01G037070 | RBH | 0.0 | 4.607636 | 0.846809 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_01g0036780 | SBH | 0.0 | 0.000000 | 0.000000 |
