Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
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Function Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1 homolog [UniProtKB/Swiss-Prot:Q8H0T9]

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsZS97_01G0542200 OsZS97_01T0542200.3 Chr01 34584765 34592655 + makerRMon
CDS seq

ATGGACCCCGAGAAGCGCGGCTACAGGCTCCAGGAATTTGTCGCACATGATGCTGAAGTGAGGTCCTTGTCTATCGGCAAGAAGTCAAGCCGTGTGTTTATCACTGGCGGCAGCGACCGCAAGGTTAACCTGTGGGCCATTGGCAAACAGACACCACTTCTGAGCTTATCAGGCCACACTGGCTCAGTTGAGGCTGTTGAGTTTGATACAGCAGAGGTGCTTGTGCTTGCTGGTTCTTCAAATGGTTCCATCAAGCTCTGGGACTTGGAAGAGGCTAAAGTTGTGCGGTCTCTTACTGGGCACAGATCAAGTTGCACCTCTGTTGAATTCCATCCATTTGGCGAGTTTTTTGCATCTGGTTCTTCAGATACAGATCTTAAGATCTGGGATATAAAGAAAAAAGGATGCATTCACACATATAAGGGTCACAGAGGAGCAATTAGAACAATCAGATTTACACCTGATGGACGATGGGTTGTCACCGGCGGAGAAGATAATATTGTAAAAGTGTGGGACTTGACAGCTGGAAAGCTTCTACATGACTTCAAGTTCCATAGTGGGCAAATCCGGTGTATTGATTTTCATCCGCAAGAATTTTTGCTTGCAACAGGCTCAGCTGATCGAACAGTTAAGTTTTGGGATCTTGAAACTTTTGAATTGATTGGTTCTGCTGGACCCGAGGCTACTGGTGTTCGCTCTACGGTCTTTCACCCAGATGGAAAAACCCTATTCTGTGGGTTAGACCAAAGCCTAAAGGTATTCTCTTGGGAGCCAGTAAGATGTCATGACGTTGTTGACATGGGATGGAGCAATTTGGCTGACCTTAGTATTTATGAAGGAAAACTCTTGGGATGCTCCTACCACGAATGCCGAGTTGGTGTTTGGGTTGCTGATATATCGCTCATTGGGCCCTATGCTCTTGGTGTTTTGCCCAAAGCAAATTTCTTTGCTGAGCTGGTACATTCTTTAGACGACAATCCTTCGAAAACGATTGATACCACTGCCAAGTCCATTCCTGCTCTAGCAACGACACATCCAAAAAATCTGTACAAGGTCAAGGAAACAGGGACTGTAGCTGAAAGTGGAATTCGTGGCTCAAATTTGACTCCAGCAAGTATGGATAAAACCAAGAGAGATAAGAGTGGTGCAACTCCTCGAAGACCTGATTCTTCTTTCAAATCATCTATTCAGAGCTCTACTCCAATGAGGCGCATGAAAGCTGCTGATAGTCCATACACAAATAGAAAAACAGTGGAGCGCAATTTTGCACAGAGGGATGCCTCGCTAGCATCCCGTACGGGAACAGCTAATAATTCTTCAACTGTTAAAAAAGGCCATCTTGCTGAGTCAGTATCTGTAAAAGATATTTACACTACACCACAGACTGTTTCTGTGCCTGTCGTTATGCCTAGAGACATTTTAGAGGACAAAACAGCAGGCAGCATTAGTGGAGGAATCAGAGGGAGAGCTGCAGTTGCAGATGATTTCCATGCTCCTGTTCATTCAAGGAAACTTTCAGTTAATAGTTTTGTGGGTGATAGTGTTAACTCAACAAAATCCATGCTAACTGATCCTGATGTTTGCTCTGAGGGTTTCTCTGGCTTAAAATTCTCTTTTGGACTAACTCCATATTACAAGAAAGAAGAATATGATAATGTGGATAAAGTTGATAGTATGGATAAAGGTGATAATACACAAATGACAGAAAAATTGGACAGAACAGTGTCGTTGGAGCATCAACTTCAGTCAAATGATACCTCTGAGCCACCATGTTCTACTACAGAAACAACCAAGGTCAAATATGTCAGAGGAGTTGCTGTGCCATTAGGAAAAACAAAGTCTCTTGTTGAGAGATGGGAAAAGAGAGAGGCTACTAATGTTGAGTGCTCACCACCAACTGGTTCTTGTGGTGACCGTGCAGTGAGATCTGATGGTCCTTCCTCCTTTTCAGCAGAACCAAGTCAGGCATATGAGAAGGACTTGTCAACAATTGATGAGGCGATGATTCCAATCAATTTGATGCAGAACCATGATGAATTTATAAATGCCGTAAAATCTCGGCTGACAAAGTTAGAGATGATGCGTCATGTCTTTGACCAAAATGGTATCAAAGGAGCGATTGCTGCAGTGGCAAAGTTGCCTGACAATGCTGTTCTAGCTGATGTTGTTAGTACTCTGAAGGGGAAACTTGATCTCTTCAACCTAGACATTTTCTTAAGCTTTCTGCCTGTTCTTGCGGGGTTACTGACCAGCAAGGCTGAAAGGTGA

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Protein seq

MDPEKRGYRLQEFVAHDAEVRSLSIGKKSSRVFITGGSDRKVNLWAIGKQTPLLSLSGHTGSVEAVEFDTAEVLVLAGSSNGSIKLWDLEEAKVVRSLTGHRSSCTSVEFHPFGEFFASGSSDTDLKIWDIKKKGCIHTYKGHRGAIRTIRFTPDGRWVVTGGEDNIVKVWDLTAGKLLHDFKFHSGQIRCIDFHPQEFLLATGSADRTVKFWDLETFELIGSAGPEATGVRSTVFHPDGKTLFCGLDQSLKVFSWEPVRCHDVVDMGWSNLADLSIYEGKLLGCSYHECRVGVWVADISLIGPYALGVLPKANFFAELVHSLDDNPSKTIDTTAKSIPALATTHPKNLYKVKETGTVAESGIRGSNLTPASMDKTKRDKSGATPRRPDSSFKSSIQSSTPMRRMKAADSPYTNRKTVERNFAQRDASLASRTGTANNSSTVKKGHLAESVSVKDIYTTPQTVSVPVVMPRDILEDKTAGSISGGIRGRAAVADDFHAPVHSRKLSVNSFVGDSVNSTKSMLTDPDVCSEGFSGLKFSFGLTPYYKKEEYDNVDKVDSMDKGDNTQMTEKLDRTVSLEHQLQSNDTSEPPCSTTETTKVKYVRGVAVPLGKTKSLVERWEKREATNVECSPPTGSCGDRAVRSDGPSSFSAEPSQAYEKDLSTIDEAMIPINLMQNHDEFINAVKSRLTKLEMMRHVFDQNGIKGAIAAVAKLPDNAVLADVVSTLKGKLDLFNLDIFLSFLPVLAGLLTSKAER

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 11.889932 11.8082225 28.4764375

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_01g0780400 RBH 2.716963 2.210210 6.450016
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os01g57210 RBH 1.674319 1.229730 1.511944
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os01g0780400 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_01g0035850 RBH 0.611585 10.239805 8.657667
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_01g0035350 RBH 0.302860 3.178555 1.783437
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_01g0035720 RBH 0.456811 18.111542 12.490051
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_01g0035120 RBH 0.395425 0.365364 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_01g0034840 RBH 6.425249 20.029707 22.861834
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_01G0546400 RBH 11.416936 22.3018055 32.0632255
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_01g0034570 RBH 0.119118 0.915994 1.230627
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU NA NA NA NA NA
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_01g0034700 RBH 0.232354 0.191884 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_01g0034770 RBH 0.454174 14.076297 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_01g0035000 RBH 4.082310 7.885533 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_01g0035100 RBH 0.915610 1.668587 0.925793
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_01g0034900 RBH 0.117624 5.665008 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_01G035360 RBH 0.206980 4.014700 2.696033
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_01g0035020 RBH 1.173600 21.388336 8.667503
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