Rice Gene Index (RGI): a comprehensive pan-genome database for comparative and functional genomics of Asian rice.

Basic Info

Gene ID		OGI # \| Score			Accession \| Assembly \| Annotation			Location		Links
OsZS97_01G0236800		OGI:01044100 \| 16/16			Zhenshan 97 \| ZS97RS3 \| HZAU			Chr01:14623686-14628438		Homologues MicroCollinearity RGI-JBrowse
Gene Symbol		-
DNA seq		ATGGGGCGCGGCGGCGGCGAGGGGTCGGAGGAGAGGGAGAGGGAGAGGGAGTGGGAGGAGGCGGCGGAGGCGGTGGCGTACGACTCCTGCACCTGGCCGCCGCCGGTGGTGGCGGTGTGCGGCCCCGGGAACAGCGGCAAGTCCGCCTTCTCCCGCCTCCTCCTCAACACCCTCGTGGGGAGGTGAGTGAGACTTGACAGTGCCCGCGATTCTACTAGAATGGCTCTGTTTTCCTGAATTTACTCTGCTGGACAAGTCCCCCACTAAAAACTTTCTAATGAATTGATGATCGTTCTTCTGTTTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACTAGACGTGTGAATATTAGTTAGTACTGCTGTCTGTGGACTGTGGTTGGATGATGAGCAAATAGATAGTACAATCAAGTACTACAATGTGGCTAATCTGTCGACAGTTTTCCCCTGTTTAAGCTTGTTTTGATTTATGTATGTTTGCTTTGGTCAGCATTGGTGTTAACTATCTTCTTTCACTTAATTAAAATATAAGGAGTGAGAAATTTTAACAATGTTGGCTTGTAATTTACTTAATCTGATGTTAATAATTAGTAGTGCAAGCACTACAATTTTCTGTGACTCTTTTTACTTATTGCGGCGTTTTGCTTCATTCGGAATTCAGTTTGCTATTACATTATTCAGAATTTTTTTTTCTTTGCTATAGGTATAAGAAGGTGGCCTACCTGGATACTGATGTTGGCCAACCAGAGTTCACACCTCCTGGGTTTGTATCGATTCATGTACTTGAGGAACAGGCTGAAGGTGTCACATTTATGTTCCTTTCAATCTTCCCTGAGTTTTCTTCTCATTTCTGTGTAACTGGCTAAAAAGAGTAAATTTCACAAAACTACATTTCACAAAACTACAGATACTATGACCAAATTATCACAAAACTACATATTTAACTCGATGTATCACAAAACTACACATTTAACACCAAATTTATCACAAAACTACACATTTAAGATGAAGTGTCACAAAACTACATATTTAGTAACTAAATTATCACAAAACTACAGGTTTAGAATCAATTTAAGCACAAAGTAATGATGTTTATAGCTCCACCATAACAATGGTGCTAGGGATTTAAACTCTAAAGTTGTAGTTTTGTGATAAATTCAATATTGAATATGCATTTTTATGATACTTAATCTAAAATATGTAGTTTTGTGATAAATTTGGTGCTAAATATGTAGTTTTGTGATACAACTCCTTAAATCTGTAGTTTTGTGATAATTTGGTCAAAATACTTGTAGTTTTGTGAAATTTACTCAAAAAGACTAAAAATTTTGTTGGTTTGTGATCATTGCAGATTTTAAAATGTTGTACCTGCGGACACCAAAGAGGTAAGCAGCAGTGTTATTATCTTCAGTTTTTCAGTGTGCGATGATGTGTGTGGTCTTTTGGCATTCCTCTGCTTAACTGCTTTAATGCATATCAATATCTGCATGCGATAAATTTATTTCAATTATTAAAATACTTCCCTGATTTCTTCATCAAATCATTGATTTGTTGTCCAATAATCCATAATAAGTCATTTCTGTTTCTCAAAATATCAAAGTTAAGTTAATATAGCTTTCTAAAGTCCAGTTTGGAGCTAAATACACAAATACGCAAGAGATGCCTGTTCAGTTTGAAGTATCCACGTAGTCAATACTTTCATACACTTGTAATTTCAATAGTAATAAATATAAGTCTGAACATGATCATAATAAAGCTAAGTATGAAATAGGCATCTTAAGCATCATACTTGTTCAAGTTAATATATCTCTGATTTTTGTGTACTCAATTCACTTCCCAATCATGTTTGAGAAAGTGAAATTGATTATCTTCTTGGAGTGGCCTAAGACATTCATGTTGCGCATATTTTAGGTGCTTCTTTTTCGGTGATTGCTCTGCAAAGAAGAATCCAAAACTTCTCTTGAGCTACATATTTAGCCTTTATGATTATTTCCTCAAAGAACTCTATCGCTTTGAAGACACCGATAACCCTAACAAATCAGCAATACCACTTGTTATTAACACTTCTGGATGGGTGAAAGGTGATGTTTAATTTCTCCATTTTATTGTTCATCCCATCCAAGTTATTAGTTATTACTGTTAATAACAATGGTTGATTTGGCTAAATGATTGGGTCACTTTTATTGAATTTGAATGTATTGCTTATTTTTGCAAATGTATTGATTTTCTACTATATTTAGGTACTGGCCTGCATATGCTGACTGAGATGTTGAAATATGCATCTCCAACTCATGTTATTCGGCTAAGAACATCAGTAGAGGGAAAAAATTTACCTGCTGGGATGTTTTGGTTAGATGAACCTGAAGGAGACCCGGCCATTAATTTAGTTGAAATTCGTGCTGCACAACACTCTCCTCGTCAGTAAGTGTCTATTGCAATGAAATTAATAAGTTTATATTTCTTTCAAGTATTAATGGATATATGGCTTTTGAGTGCAGTCTATTAGTAAAGAAAGAGGCAAGGATCATTCGTGATCTAAGGATAATTGCATACTTCAGGCAGTGCTTACCCATGGAGTTTCCTGTTTTCTCTTACAATGATTTAATTCAAGGCTTTGCTTCTATTGAACCGTTTCAGCTTCCTTTGTCAAAACTTCAGGTTATTGATCTGCACAGCCAGGTGAAATCTTTGGACCTATCTACATTTTCAACACTACTATAATCAAGAAATTTTTTTTAGAAGAATCATGCGTTATTCAGATTATACGATGTAGTGATGTTTTTACTAATCCTTTATTTCCTATGTTCGAAATACTACAAATTAGTATTTGCCAGCAACAAAAATAATGGCATTTTGTATATATAGATTTTTAGAAAGCTAATTTCACATTCAGTGCTTCACAGGAAAATGAAAACAAAATGCATATTATAGCTTATTCCCCGTTTACCTAGTCAAGTAGTCAATGGATGTCATTCTAAAAGTTGTAAAGTTAAGTTTGTATGAGTATTTGATTCCGCTATTTGTGCAGGCAGCACTGTCAGTCACATATATAGTCATCAAATTGTCATCTTGAACAATAATTTTGTATGCAAGGACTGGAGTTTAGCAAAACGAAATATGTCATGTTTACAACTGGTTACCAACTTATAGCTCAGATAAGAATTGCTTATGACATGCTTACTGTAATAATCCAGTATGCTGCGATAAAGTCGACGCTGTTTGGAGTATCGCTCCTGGCAGCAATTTTCTTGAGGTTTTGTATTAAATTACTGATGTAGGGTCTAAGTTTTGCTTCTCTGTAGGTGTCTGATTATACAGTGCATCACTTCTTGAAAGGTACTATTGTTGGCATTGCAACAAGTGCATCTGTACCTTTGTCAAATCAGTGTTCCACACCTTGTTGCATTGGACTAGGTATGTTCAGTTTAAATATTGATTTATGATTTTGATAGCCTTCCATTTAGTTCAACTGTGTTGAAATGAATTGGTCAGATGTTGACTATTTTTTTTGCATGCCATTTTTCTTGACTTGCAATTTAGGTTTCATCAAAGCCATAGATGTTTCACGAGATTGTATTCATTTGATCACTCCTGTTTCTCGTCAGCTTTTGGAAAATGCCGATATCTTTTTCCGCAGTAGTTTTACAGTCCCTACATGTCTGTTCCAGGTAATAGTTAATTGAGATTCTGCCCACTAATGTGATTTGTTCTTTCTGCAAACCAAAGCTCTAGCTAAATTTTCCAGCGGTTGAAATGTGAGATATATAGAACCACATGCATCAGTATTGGTATGATTGTTATAAAAAAACAGTGTTGGTTCAATGCAAAAATACATTTATTCTTGTCTTTGCTCATTCTACCATAACGTATAGTGCAATACATTCATTTTTTTCTACCACGGTTTATTGTGAAATTTGGATGCTTAACAGTGTCAGTGGCGCAATATATTGCATGGCCAATTATGTAAATAATTTTCACTTCATTGGTCCCAAGAAAATTTGTGAAAAATATATCTGGGTGCTTTGGGTGCAAGAACTCACTGTGAATCATTCACGAAGTGCCCAGCATTAGTTCTTCTCTTACATCGAGTACATTCTAGTATGCTGGTATTATCACCTAGATAGTACAGTACACATTAGATGGGTTGTACGGAAAATTTGAAATTAATGTTATTTATTTATTTAGTTTCATGAATCATATGATACCACCAGTAAAGACGCAATTGTCGATTGAAATTGATCATAGTGCACACATGCTGGCCAGCTGCAATGAACTAGTGTCTATATTTGTACAGTTTGATAAATTAGTTACTTAATCTTGCCGTTTTGCTGCTCCCTCGTATTTTGCCTCTTACTGTCTAACTGATACATGTGATTGCAGGTGGTATCTGATACTGCAAGTGATATAGCGGACAGGCTAAGGGAGCTCAATTGTCATGGATAAACAAAATACAGCAAAAGTCGGACCTGTAGCGTGTACTGAACCCTGAACCTCGTAATATATTAGCTGCGGCCCTGAAAAACTTCTGATAGTTCCAATGGATGATGCATAATACTGTGTACCTATAATTAAGTTATGACTTATGAACATTTATGGTTAATGTATTTAGCTCAATTATGCTATAGTTGCATGCCGATATACTCTACACCTAACTCAATTGATAGTTTGATACTACTAGTTCTCTATAGTATACCAACATTTTAATTAGAGGATTTCTGCGCTATCATGTGTTTTACGTTTCAGACGAAGGAAGACCGTAC More
CDS seq		ATGGGGCGCGGCGGCGGCGAGGGGTCGGAGGAGAGGGAGAGGGAGAGGGAGTGGGAGGAGGCGGCGGAGGCGGTGGCGTACGACTCCTGCACCTGGCCGCCGCCGGTGGTGGCGGTGTGCGGCCCCGGGAACAGCGGCAAGTCCGCCTTCTCCCGCCTCCTCCTCAACACCCTCGTGGGGAGGTATAAGAAGGTGGCCTACCTGGATACTGATGTTGGCCAACCAGAGTTCACACCTCCTGGGTTTGTATCGATTCATGTACTTGAGGAACAGGCTGAAGATTTTAAAATGTTGTACCTGCGGACACCAAAGAGGTGCTTCTTTTTCGGTGATTGCTCTGCAAAGAAGAATCCAAAACTTCTCTTGAGCTACATATTTAGCCTTTATGATTATTTCCTCAAAGAACTCTATCGCTTTGAAGACACCGATAACCCTAACAAATCAGCAATACCACTTGTTATTAACACTTCTGGATGGGTGAAAGGTACTGGCCTGCATATGCTGACTGAGATGTTGAAATATGCATCTCCAACTCATGTTATTCGGCTAAGAACATCAGTAGAGGGAAAAAATTTACCTGCTGGGATGTTTTGGTTAGATGAACCTGAAGGAGACCCGGCCATTAATTTAGTTGAAATTCGTGCTGCACAACACTCTCCTCGTCATCTATTAGTAAAGAAAGAGGCAAGGATCATTCGTGATCTAAGGATAATTGCATACTTCAGGCAGTGCTTACCCATGGAGTTTCCTGTTTTCTCTTACAATGATTTAATTCAAGGCTTTGCTTCTATTGAACCGTTTCAGCTTCCTTTGTCAAAACTTCAGGTTATTGATCTGCACAGCCAGGTGTCTGATTATACAGTGCATCACTTCTTGAAAGGTACTATTGTTGGCATTGCAACAAGTGCATCTGTACCTTTGTCAAATCAGTGTTCCACACCTTGTTGCATTGGACTAGGTTTCATCAAAGCCATAGATGTTTCACGAGATTGTATTCATTTGATCACTCCTGTTTCTCGTCAGCTTTTGGAAAATGCCGATATCTTTTTCCGCAGTAGTTTTACAGTCCCTACATGTCTGTTCCAGGTGGTATCTGATACTGCAAGTGATATAGCGGACAGGCTAAGGGAGCTCAATTGTCATGGATAA More
Protein seq		MGRGGGEGSEEREREREWEEAAEAVAYDSCTWPPPVVAVCGPGNSGKSAFSRLLLNTLVGRYKKVAYLDTDVGQPEFTPPGFVSIHVLEEQAEDFKMLYLRTPKRCFFFGDCSAKKNPKLLLSYIFSLYDYFLKELYRFEDTDNPNKSAIPLVINTSGWVKGTGLHMLTEMLKYASPTHVIRLRTSVEGKNLPAGMFWLDEPEGDPAINLVEIRAAQHSPRHLLVKKEARIIRDLRIIAYFRQCLPMEFPVFSYNDLIQGFASIEPFQLPLSKLQVIDLHSQVSDYTVHHFLKGTIVGIATSASVPLSNQCSTPCCIGLGFIKAIDVSRDCIHLITPVSRQLLENADIFFRSSFTVPTCLFQVVSDTASDIADRLRELNCHG
Function		Polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase NOL9 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q8VYP6]

Transcripts

Gene	Transcript	Chromosome	Start	End	Strand	Source
OsZS97_01G0236800	OsZS97_01T0236800.1	Chr01	14623686	14628438	+	makerRMon
CDS seq	ATGGGGCGCGGCGGCGGCGAGGGGTCGGAGGAGAGGGAGAGGGAGAGGGAGTGGGAGGAGGCGGCGGAGGCGGTGGCGTACGACTCCTGCACCTGGCCGCCGCCGGTGGTGGCGGTGTGCGGCCCCGGGAACAGCGGCAAGTCCGCCTTCTCCCGCCTCCTCCTCAACACCCTCGTGGGGAGGTATAAGAAGGTGGCCTACCTGGATACTGATGTTGGCCAACCAGAGTTCACACCTCCTGGGTTTGTATCGATTCATGTACTTGAGGAACAGGCTGAAGATTTTAAAATGTTGTACCTGCGGACACCAAAGAGGTGCTTCTTTTTCGGTGATTGCTCTGCAAAGAAGAATCCAAAACTTCTCTTGAGCTACATATTTAGCCTTTATGATTATTTCCTCAAAGAACTCTATCGCTTTGAAGACACCGATAACCCTAACAAATCAGCAATACCACTTGTTATTAACACTTCTGGATGGGTGAAAGGTACTGGCCTGCATATGCTGACTGAGATGTTGAAATATGCATCTCCAACTCATGTTATTCGGCTAAGAACATCAGTAGAGGGAAAAAATTTACCTGCTGGGATGTTTTGGTTAGATGAACCTGAAGGAGACCCGGCCATTAATTTAGTTGAAATTCGTGCTGCACAACACTCTCCTCGTCATCTATTAGTAAAGAAAGAGGCAAGGATCATTCGTGATCTAAGGATAATTGCATACTTCAGGCAGTGCTTACCCATGGAGTTTCCTGTTTTCTCTTACAATGATTTAATTCAAGGCTTTGCTTCTATTGAACCGTTTCAGCTTCCTTTGTCAAAACTTCAGGTTATTGATCTGCACAGCCAGGTGTCTGATTATACAGTGCATCACTTCTTGAAAGGTACTATTGTTGGCATTGCAACAAGTGCATCTGTACCTTTGTCAAATCAGTGTTCCACACCTTGTTGCATTGGACTAGGTTTCATCAAAGCCATAGATGTTTCACGAGATTGTATTCATTTGATCACTCCTGTTTCTCGTCAGCTTTTGGAAAATGCCGATATCTTTTTCCGCAGTAGTTTTACAGTCCCTACATGTCTGTTCCAGGTGGTATCTGATACTGCAAGTGATATAGCGGACAGGCTAAGGGAGCTCAATTGTCATGGATAA More
Protein seq	MGRGGGEGSEEREREREWEEAAEAVAYDSCTWPPPVVAVCGPGNSGKSAFSRLLLNTLVGRYKKVAYLDTDVGQPEFTPPGFVSIHVLEEQAEDFKMLYLRTPKRCFFFGDCSAKKNPKLLLSYIFSLYDYFLKELYRFEDTDNPNKSAIPLVINTSGWVKGTGLHMLTEMLKYASPTHVIRLRTSVEGKNLPAGMFWLDEPEGDPAINLVEIRAAQHSPRHLLVKKEARIIRDLRIIAYFRQCLPMEFPVFSYNDLIQGFASIEPFQLPLSKLQVIDLHSQVSDYTVHHFLKGTIVGIATSASVPLSNQCSTPCCIGLGFIKAIDVSRDCIHLITPVSRQLLENADIFFRSSFTVPTCLFQVVSDTASDIADRLRELNCHG More

Gene	Transcript	Chromosome	Start	End	Strand	Source
OsZS97_01G0236800	OsZS97_01T0236800.2	Chr01	14623686	14628438	+	makerRMon
CDS seq	ATGGGGCGCGGCGGCGGCGAGGGGTCGGAGGAGAGGGAGAGGGAGAGGGAGTGGGAGGAGGCGGCGGAGGCGGTGGCGTACGACTCCTGCACCTGGCCGCCGCCGGTGGTGGCGGTGTGCGGCCCCGGGAACAGCGGCAAGTCCGCCTTCTCCCGCCTCCTCCTCAACACCCTCGTGGGGAGGTATAAGAAGGTGGCCTACCTGGATACTGATGTTGGCCAACCAGAGTTCACACCTCCTGGGTTTGTATCGATTCATGTACTTGAGGAACAGGCTGAAGATTTTAAAATGTTGTACCTGCGGACACCAAAGAGGTGCTTCTTTTTCGGTGATTGCTCTGCAAAGAAGAATCCAAAACTTCTCTTGAGCTACATATTTAGCCTTTATGATTATTTCCTCAAAGAACTCTATCGCTTTGAAGACACCGATAACCCTAACAAATCAGCAATACCACTTGTTATTAACACTTCTGGATGGGTGAAAGGTACTGGCCTGCATATGCTGACTGAGATGTTGAAATATGCATCTCCAACTCATGTTATTCGGCTAAGAACATCAGTAGAGGGAAAAAATTTACCTGCTGGGATGTTTTGGTTAGATGAACCTGAAGGAGACCCGGCCATTAATTTAGTTGAAATTCGTGCTGCACAACACTCTCCTCGTCATCTATTAGTAAAGAAAGAGGCAAGGATCATTCGTGATCTAAGGATAATTGCATACTTCAGGCAGTGCTTACCCATGGAGTTTCCTGTTTTCTCTTACAATGATTTAATTCAAGGCTTTGCTTCTATTGAACCGTTTCAGCTTCCTTTGTCAAAACTTCAGGTTATTGATCTGCACAGCCAGGTGTCTGATTATACAGTGCATCACTTCTTGAAAGGTACTATTGTTGGCATTGCAACAAGTGCATCTGTACCTTTGTCAAATCAGTGTTCCACACCTTGTTGCATTGGACTAGGTGGTATCTGA More
Protein seq	MGRGGGEGSEEREREREWEEAAEAVAYDSCTWPPPVVAVCGPGNSGKSAFSRLLLNTLVGRYKKVAYLDTDVGQPEFTPPGFVSIHVLEEQAEDFKMLYLRTPKRCFFFGDCSAKKNPKLLLSYIFSLYDYFLKELYRFEDTDNPNKSAIPLVINTSGWVKGTGLHMLTEMLKYASPTHVIRLRTSVEGKNLPAGMFWLDEPEGDPAINLVEIRAAQHSPRHLLVKKEARIIRDLRIIAYFRQCLPMEFPVFSYNDLIQGFASIEPFQLPLSKLQVIDLHSQVSDYTVHHFLKGTIVGIATSASVPLSNQCSTPCCIGLGGI More

Gene	Transcript	Chromosome	Start	End	Strand	Source
OsZS97_01G0236800	OsZS97_01T0236800.3	Chr01	14623686	14627797	+	makerRMon
CDS seq	ATGGGGCGCGGCGGCGGCGAGGGGTCGGAGGAGAGGGAGAGGGAGAGGGAGTGGGAGGAGGCGGCGGAGGCGGTGGCGTACGACTCCTGCACCTGGCCGCCGCCGGTGGTGGCGGTGTGCGGCCCCGGGAACAGCGGCAAGTCCGCCTTCTCCCGCCTCCTCCTCAACACCCTCGTGGGGAGGTATAAGAAGGTGGCCTACCTGGATACTGATGTTGGCCAACCAGAGTTCACACCTCCTGGGTTTGTATCGATTCATGTACTTGAGGAACAGGCTGAAGATTTTAAAATGTTGTACCTGCGGACACCAAAGAGGTGCTTCTTTTTCGGTGATTGCTCTGCAAAGAAGAATCCAAAACTTCTCTTGAGCTACATATTTAGCCTTTATGATTATTTCCTCAAAGAACTCTATCGCTTTGAAGACACCGATAACCCTAACAAATCAGCAATACCACTTGTTATTAACACTTCTGGATGGGTGAAAGGTACTGGCCTGCATATGCTGACTGAGATGTTGAAATATGCATCTCCAACTCATGTTATTCGGCTAAGAACATCAGTAGAGGGAAAAAATTTACCTGCTGGGATGTTTTGGTTAGATGAACCTGAAGGAGACCCGGCCATTAATTTAGTTGAAATTCGTGCTGCACAACACTCTCCTCGTCATCTATTAGTAAAGAAAGAGGCAAGGATCATTCGTGATCTAAGGATAATTGCATACTTCAGGCAGTGCTTACCCATGGAGTTTCCTGTTTTCTCTTACAATGATTTAATTCAAGGCTTTGCTTCTATTGAACCGTTTCAGCTTCCTTTGTCAAAACTTCAGGTTATTGATCTGCACAGCCAGGTGTCTGATTATACAGTGCATCACTTCTTGAAAGGTACTATTGTTGGCATTGCAACAAGTGCATCTGTACCTTTGTCAAATCAGTGTTCCACACCTTGTTGCATTGGACTAGGTTTCATCAAAGCCATAGATGTTTCACGAGATTGTATTCATTTGATCACTCCTGTTTCTCGTCAGCTTTTGGAAAATGCCGATATCTTTTTCCGCAGTAGTTTTACAGTCCCTACATGTCTGTTCCAGGTAATAGTTAATTGA More
Protein seq	MGRGGGEGSEEREREREWEEAAEAVAYDSCTWPPPVVAVCGPGNSGKSAFSRLLLNTLVGRYKKVAYLDTDVGQPEFTPPGFVSIHVLEEQAEDFKMLYLRTPKRCFFFGDCSAKKNPKLLLSYIFSLYDYFLKELYRFEDTDNPNKSAIPLVINTSGWVKGTGLHMLTEMLKYASPTHVIRLRTSVEGKNLPAGMFWLDEPEGDPAINLVEIRAAQHSPRHLLVKKEARIIRDLRIIAYFRQCLPMEFPVFSYNDLIQGFASIEPFQLPLSKLQVIDLHSQVSDYTVHHFLKGTIVGIATSASVPLSNQCSTPCCIGLGFIKAIDVSRDCIHLITPVSRQLLENADIFFRSSFTVPTCLFQVIVN More

Gene	Transcript	Chromosome	Start	End	Strand	Source
OsZS97_01G0236800	OsZS97_01T0236800.4	Chr01	14623686	14628438	+	makerRMon
CDS seq	ATGGGGCGCGGCGGCGGCGAGGGGTCGGAGGAGAGGGAGAGGGAGAGGGAGTGGGAGGAGGCGGCGGAGGCGGTGGCGTACGACTCCTGCACCTGGCCGCCGCCGGTGGTGGCGGTGTGCGGCCCCGGGAACAGCGGCAAGTCCGCCTTCTCCCGCCTCCTCCTCAACACCCTCGTGGGGAGGTATAAGAAGGTGGCCTACCTGGATACTGATGTTGGCCAACCAGAGTTCACACCTCCTGGGTTTGTATCGATTCATGTACTTGAGGAACAGGCTGAAGATTTTAAAATGTTGTACCTGCGGACACCAAAGAGGTGCTTCTTTTTCGGTGATTGCTCTGCAAAGAAGAATCCAAAACTTCTCTTGAGCTACATATTTAGCCTTTATGATTATTTCCTCAAAGAACTCTATCGCTTTGAAGACACCGATAACCCTAACAAATCAGCAATACCACTTGTTATTAACACTTCTGGATGGGTGAAAGGTACTGGCCTGCATATGCTGACTGAGATGTTGAAATATGCATCTCCAACTCATGTTATTCGGCTAAGAACATCAGTAGAGGGAAAAAATTTACCTGCTGGGATGTTTTGGTTAGATGAACCTGAAGGAGACCCGGCCATTAATTTAGTTGAAATTCGTGCTGCACAACACTCTCCTCGTCATCTATTAGTAAAGAAAGAGGCAAGGATCATTCGTGATCTAAGGATAATTGCATACTTCAGGCAGTGCTTACCCATGGAGTTTCCTGTTTTCTCTTACAATGATTTAATTCAAGGCTTTGCTTCTATTGAACCGTTTCAGCTTCCTTTGTCAAAACTTCAGGTTATTGATCTGCACAGCCAGGTGAAATCTTTGGACCTATCTACATTTTCAACACTACTATAA More
Protein seq	MGRGGGEGSEEREREREWEEAAEAVAYDSCTWPPPVVAVCGPGNSGKSAFSRLLLNTLVGRYKKVAYLDTDVGQPEFTPPGFVSIHVLEEQAEDFKMLYLRTPKRCFFFGDCSAKKNPKLLLSYIFSLYDYFLKELYRFEDTDNPNKSAIPLVINTSGWVKGTGLHMLTEMLKYASPTHVIRLRTSVEGKNLPAGMFWLDEPEGDPAINLVEIRAAQHSPRHLLVKKEARIIRDLRIIAYFRQCLPMEFPVFSYNDLIQGFASIEPFQLPLSKLQVIDLHSQVKSLDLSTFSTLL More

Event Type

Chromosome

Start

End

Strand

Alternative mRNAs

Total mRNAs

Source

Expression

	Leaf	Root	Panicle
FPKM	0.2305385	0.583738	2.5638255

Homologues

Genome & Annotation	Homologs	Type	Expression(FPKM)
Genome & Annotation	Homologs	Type	Leaf	Root	Panicle
Nipponbare \| IRGSP 1.0 \| Gramene(+IsoSeq)	OsNip_01g0354700	RBH	0.775381	0.568518	1.083954
Nipponbare \| IRGSP 1.0 \| MSU	LOC_Os01g25240	RBH	0.419645	0.142831	0.130285
Nipponbare \| IRGSP 1.0 \| RAP-db	Os01g0354700	RBH	None	None	None
Azucena \| AzucenaRS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsAzu_01g0016510	RBH	0.316853	0.0	0.998854
KETAN NANGKA \| Os128077RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsKeNa_01g0016150	RBH	0.000000	0.000000	0.445538
CHAO MEO \| Os132278RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsCMeo_01g0016390	RBH	0.0	0.000000	3.889923
ARC 10497 \| Os117425RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsARC_01g0015840	RBH	0.066215	0.000000	None
PR 106 \| Os127742RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsPr106_01g0015840	RBH	0.000000	0.0	0.000000
Minghui 63 \| MH63RS3 \| HZAU	OsMH63_01G0241600	RBH	0.591031	1.228484	2.259106
IR 64 \| OsIR64RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsIR64_01g0015940	RBH	0.0	0.294574	0.168906
Zhenshan 97 \| ZS97RS3 \| HZAU	NA	NA	NA	NA	NA
LIMA \| Os127564RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsLima_01g0015840	RBH	0.000000	0.0	None
KHAO YAI GUANG \| Os127518RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsKYG_01g0015810	RBH	0.000000	0.0	None
GOBOL SAIL \| Os132424RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsGoSa_01g0016040	RBH	2.181235	0.0	None
LIU XU \| Os125827RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsLiXu_01g0015900	RBH	0.000000	0.0	0.261999
LARHA MUGAD \| Os125619RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsLaMu_01g0015710	RBH	0.000000	0.000000	None
N22 \| OsN22RS2 \| Gramene(+IsoSeq)	OsN22_01G016140	RBH	0.0	0.0	0.818410
NATEL BORO \| Os127652RS1 \| Gramene(+IsoSeq)	OsNaBo_01g0015920	RBH	0.242853	3.305326	2.839135

Custom TreePlot

Powered by

© 2021- Rice Gene Index @Zhang Lab. All Rights Reserved.

National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement

Huazhong Agricultural University

Any comments and suggestions, please contact us.