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Transcripts
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|||||||
| Protein seq | MVNVGVSFVSLLNAVAWHCQLPLVSYLWEIDGNGMLLAGVELALPSEDMAGQIVSKFFWVCASTQTSDSHEMGAHQAVRFLQARYGFIVHDYNLQMLLSYRRIAASTVDAAVTASACLARFQSRYAPTDLSCAGVAPLFGGVNPVVSRGPNGSPNAGIDVEQSVPEQALASDVHVRSQVAFVAGTGPLTQNSITTASRKRTLLDVPRHTAAANREKRRLKRSGSQPDHLLLMLANNAALCPERSYYGGPSHECPYCGAVFWYQERVKRDSAVSQRRIVYNLCCRGGKISLPELKYPPDMLAKLLKFDGDAQSKRFLRQIRSYNSLFAFTSLGADVEKSINNGTAPYVFKINGVVHHRIGSLLPQRGAKPKFAQLYIYDTENETANRINIFDRENSNDEPDPSIVTGLGAMLDQHNDLVKSFRYARDRLNEHGNEQIALRLLGCNAKDEVQYNLPTSGEIAGIIVGDSSNDAYTYDVVVQSSDNRLRQVSALHPSYMALQYPLLFPYGERGFHLGIKYTDFPSIAGTSRRYVTMLEYYRYRFHYRLNKPNPYTCCGRLSDSICVDAYSTVEGSRLKFIHDHQPELRSECVQGIVDAIDHGLESGDSVGKKYVLPSSFTGGRRYMVQNYQDAMAVCRVFGSPDLFVTFTCNSKWQEIYDALVFEPGQVPSDRSDMIVRVFSMKVDEFISDIKEGRTFGPVLAVLYTVEFQKRGLPHIHCIVWRAAADAEFSATAVDSLICAEIPDVFSDPLGYALVDEFMIHGPCGDKNKSCVCMKNGHCSKHFPKGFQEETTMDEFGFTVYRRRNDGRYVVKNGIKLDNRWVVPYNMKLLKKYQAHINVESCNKSNMIKYLFKYITKGGDRTKLYFETTGNTPNKTVDGTVLPPNEIDEYINARFLSTCEAFWRAFEFDIHYRVPAVERLPIHLPNMNFVQYKKGTDLKKLLDSPAAKKTMLTEWFECNKKHPNARTLTYCDFPKQWTWDNSARCWRPRTPVEKIGRIYYVSPAAGELYYLRMLLMTVKGAKSYADVRTFEGTVYPTFRQACESRGLLENDNDWHLLFDEAIVSASSLQLRQLFVTVVMFCSVGNVRSLFDKYWLYFTDDIQHHLRTALSNPAYVVPHDRLLSLLIKELHSAFANSGGNIDDYDLPRSTIHSDDEFGNRMVNEELALDTAALAAHASLMIPRLNSEQQKFFDTIVSRVSESRPGFFFVYGHGGTGKTFLWNVLISKIRSEGNIVLAVASSGVASLLLPRGHTAHSRFKIPIDIDENSICSIKRGTMLAELIQKTSLIIWDEAPMTHRRCFEALDRTLRDLLSEHNPSNSVLPFGGKFVVLGGDFRQILPVIKKGTRNSIVDASITNSPLWQHVVLLKLTVNMRLFQSGLSEGRRHDLEQFARWVLALGDGMLPVSKRIDESEATWIDIPDDLLIRASDDKIYSIVNEVFPCYVHRYTDSSYLASRAIVCPNNSTVDEINDYMVAMIPGEMKEYLSCDTISKTSEHIPDFDILYPTEFLNSINANNFPTHRLALKKGATVMLLRNLNQSLGLCNGTRLLVLSLGHRLLECVILTGSNVGERAFIPRIVLSTTSSKWPFVLQRRQFPVRVCYAMTINKSQGQTLSRVGVYLKKAVFTHGQLYVAVSRSTSRDGLRILIKDDDGACSSKTRNVVYHEVLEAVRLMLCYRVLVQKCFSMFSGSFAMAYSMLSKLELGADNPRICVRVSRLWEFANPNDETQLLHLGLVLIDQEGTSIAAQIYPPCDLQFREIITEGKVYYLEYYRVREWSRRYRPVNNSLSICFTRWTKVEQVADPAADFPLYTYSLTPYGGLRQRVDRKEEFTGDISLSGNSACKWYINVNTPEVNSFKESIQGKYEPIKMIELPAVGAVRTGAEQKSIAQIKDLNPFMFRKNEFMVTVVIKKIDTESSWWYPACDTCKRTAKPYGKSYRCGNTSCPAVVSASPRIKLSLIAGDDTGDTKFVLFGRTAQRIIGRPVEMLIQNNPAGIEFIPKEITDLLEKEFTWNVAFTENTLSSSTVSFQVNLIVRGPDNPCSSALQSPSASQASSAVPSQALSPGLSHGLSIGQCSAAADPSIGFADPTAGIDSPLAASIKHKKPETEYQSKPPAELPQDEAEDDDNLPLSQIVADDATKHSTSKSYKKRARPSPGIGAAKKLFKDNGDGVADGRIPPYSCLLKQQCVPCSRHGAYNVSHCVVLILFFHHSSALLAESHRLNLKNSCSRKNNSFPTIVSTGMQFDWSAELGVGQPQRPSSYGTNRPLLATKFSRRKEISHMLADIIYTRAVVVKVSGAGNPTTTRISAMISAVCRCQIDDFALLPFRPKMFIAIFMDADLQEELSERAFKKVSFTFKATRLTFEPFKMNLGSTVNPLRQRVILALEGVPPESWNKEAISELMDSCCFVEELYGEHHIQELSIFKLAAWTTDCDLIPKVISWNIETKEGRRGSANISWMHNAALSVVLVHIEKLFDYTDEDSGSDSDGEVLREYEQQRPRVPVVKTFSWVPLKIDLNNGPVEGGTPAIAPRRLPLEVRRRCRLP
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|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0 | 0.0061825 | 0.002568 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
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| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os01g14200 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | NA | NA | NA | NA | NA |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_01g0008510 | SBH | 1.676330 | 6.431366 | 11.350247 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_01g0008891 | SBH | 1.944198 | 0.000000 | 9.912401 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_01g0002580 | SBH | 1.277327 | 0.950951 | 0.636145 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_01G0131400 | RBH | 0.0018745 | 0.0067045 | 0 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_12G0207300 | RBH | 0.0361615 | 0 | 0.1076625 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_01g0002560 | SBH | 0.075790 | 0.585201 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_01g0002590 | SBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.017706 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_01g0010110 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_01G008510 | SBH | 1.035707 | 0.489945 | 5.344918 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_01g0008371 | SBH | 9.490953 | 35.493488 | 11.785679 |
