Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
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Gene Symbol -
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Protein seq

MDSGIIGSTIGIFMQVIFDKYLSSKLEQWADRANLGGEFQNLCRQLDMAKAILMTLKGSPVMEEGIWQLVWDLKSSAYDAEDVLDELDYFRLMEIVDNRSENKLAASIGLSIPKALRNTFDQPGSSLFPPFKKARPTFDYVSCDWDSVSCKMKSISDRLQRATAHIERVAQFKKLVADDMQQPKFPNSRQTSSLLTEPEVYGRDEEKNTIVKILLETKFSNIQNRYKSFLVLPVVGIGGVGKTTLVQYVYNDLATITCFEVRAWACVSGFLDVKQVTIDILQSIDEEGHNQFISSLSLNNIQTMLVKKLKKRKFLIVLDDVWSCSNWELLCAPLSSGTPGSKIIITTRHHNIANTVGTIPSVILGGLQDSPFWSFFKQNAFGDANMVDNLNLIGRKIASKLNGIPLAAKTIGKLLHKQLTTEHWMSILDSNLWELRQGPEDIMPVLFLSYQHLPANIQRCFVFCSAFPKDYSFCEEELIFSWMAHGFIQCMRRDKTLEDTAREYLYELASASFFQVSSNDNLYRMHDLLHDLASSLSKDECFTTSDNLPEGIPDVVRHLYFLSPDHAKFFRHKFSLIEYGSLNNESLPERRPPGRPLELNNLRTIWFMDSPTISLSDASDDGFWNMSINYRRIINLRMLCLHHINCEALPVTIGDLIHLRYLDLRFSDIAELPESVRKLCHLQVLDVRSCKNLVKLPTGVNNLISIRHLLVDASSKLLAGYAGISYIGKLTSLQELDCFNVGKGNGFSIEQLKELREMGQSLAIGDLENVRNKEEASNSGVREKYRLVELNLLWNSNLKSRSSDVEISVLEGLQPHPNLRHLKIINYRGSTSPTWLATDLHTKYLESLYLHDCSGWEMLPPLGQLPYLRRLHFTGMGSILSIGPELYGSGSLMGFPCLEELHFENTLEWRSWCGVEKECFFPKLLTLTIMDCPSLQMLPVEQWSDQVNYKWFPCLEMLDIQNCPSLDQLPPLPHSSTLSRISLKNAGIISLMELNDEEIVISGISDLVLERQLFLPFHNLRSLKSFSIPGCDNFMVLPLKGQGKHDISEVSTTMDDSGSSLSNISELKICGSGISEDVLHEILSNVGILDCLSIKDCPQVTSLELNPMVRLDYLIIEDCLELTTLKCMKTLIHLTELTVLRSPKFMEGWKNLVVEAEGSHLRITASLKRLHIDDLSFLTMPICRTLGYLQYLMIDTDQQTICLTPEQEQAFGTLTSLKTLVFSECSYLRSLPATLHQISSLKSLHLSSCESIDSLPHLGLPGSLERLFIAGCDLLRDKCVEGGIDQHKIAHVRETILA

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 2.3483575 3.996258 10.839018

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_01g0178900 RBH 0.402528 0.547444 1.867745
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os01g08370 RBH 0.277496 0.361113 0.471537
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os01g0178900 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_01g0005790 RBH 0.115284 0.442671 1.166196
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_01g0005470 RBH 0.0 0.000000 0.469843
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_01g0005760 RBH 0.471271 3.594158 2.696963
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_01g0005400 RBH 0.024659 0.048899 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_01g0005600 RBH 0.928512 3.169004 5.914983
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_01G0071900 RBH 1.620842 4.7346645 6.0807635
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_01g0005550 RBH 0.037123 0.085704 0.422154
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU NA NA NA NA NA
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_01g0005360 RBH 0.114584 0.097943 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_01g0005550 RBH 0.084095 2.783346 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_01g0005610 RBH 0.0 5.822258 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_01g0005550 RBH 0.212455 0.384857 0.265165
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N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_01G005570 RBH 0.360821 0.711224 1.046217
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_01g0005450 RBH 0.109554 0.000000 0.666239
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