Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsPr106_08g0007230 OGI:08020990 | 16/16 PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr08:7551057-7572756
Gene Symbol -
DNA seq

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Function Protein FORGETTER 1 [UniProtKB/Swiss-Prot:F4IF36]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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atggccggcggcggcggcggcggcggctccccctcgccggtagccgcctcggcggcccccgtgcaggtgcgctgcgccggatgccgcggcgtcctcgccgtggcccccggcatgaccgagttcatctgccccaagtgccgcatggcgcagcgcctcccccccgagctcatgcccccttccccgcccaaggcctcccctactccgccgcctcagccacagcctcatcctcagcttcagccgccgcctcctcctgctcctctccctcccccttcccgccgctccgcgccgcgagcgcagggcgtggaccccacgaagatccagctgccgtgcgcgcgctgcaaggccatcctcaatgtgccccatggcctcgctcgcttccgctgcccccagtgcgacgtcgacctcgccgtcgacctctccaaactccgcaatttcctcgccacggccggtccaggcttcgCccctccgcttccgcttccgccgccgccaccaccgccgatgccgcccatcccgctgccgcacatgcccttcctcccgatgatgccacatgttccggtgccgatgccgccgatggcatcgcccgctgaattgcccgagGAgattaatgaggttgcagttgatgttgagcgtgaggaagatgaaggtggtactgtcggggaaacttttatggattacaggcctcccaagctatctcttggtcttcctcatccagaccctgtggtagaaacttcatctttgtctgcagtgcaacctcctgaacctacatatgacttgactattatggatgaattggatgagaccaaggtgttatcttgcttacaaattgaaacgatagtgtatgcttctcagaggcacctttatcatctgcctactggtgctagagcaggtttctttattggcgatggagctggtgttggtaaaggccgaacgattgctggattgatctgggaaaattggaaacagggaaggcataaggcattgtggatttccattggttcagatctgaaatatgatgctcgcagagatttggatgatgttggtgcaaaatatgtggaaggcagggtcagggtcgccttacaaccattgttagtgctgtcaataaactggcctcggcttcagctcaatacaaaacttagtgttctagggatcctagtgcatgcttcgtggaggcaggctctgagcccagatcaagtgcatgctttaaataagctaccatattctaagatagactctaaggccgttggaatcacaactggagttatttttgtaacttatagcagcttgatagcatcctctgagaaaggccgttcccgtttgcagcaattgatagagtggtgtgggtctgagttcgatggtcttctggtgtttgatgaggtaaagaagactctggaaatgttacctgaagctcgggtggtttactgctcagcaactggtgcatcagagcctcgaaatctgggtTAtatggttcgccttggtctctggggagatggaacatcatttcagaattttcagaaatttctaggtgctcttgagaaaggtggtgtgggtgctcttgaacttgttgctatggacatgaaagccaggggtatgtatgtttgcagaacgctaagttataagggtgctgcttttgctaccgtggaagctcctctagaggaaagaatgatgaatatgtataggaaagcagctgaattttgggccgagttgcgtgttgaactcctttcagcaattgaatattatgcagaagacaagggtaattcatctcagatttggcggttatactgggccagccatcagggtgttgaaatggaagactttgtttctggtccaagggagttgcttcttaagctggtagatgacaattatcctttgcctccgaaacctgattgctttcaacaagtaggtgatgaaaaagttgcagaggttcagcgtaagcggcactatggacctgatgtatgctttaaaggacgagctaggaaactcgcaaaaatggaagatgaaagtgatgatggaactgatgaatattctctacttaattcatggattgatatcctcggcaaggaagaactccctgaggtcgccaaggactcgagcgtgacatcgggcaggtcccgcgtgttgagccgcgacgcgagtaggggctcacggaggagacagagaagctgcagcacaatggcggggtgcgatgtggcagcggacgcagtgaggaaggagttgagcatcagcggcgacggcggattggagagtgttgatgggaaggacaacaagcagcgagtgagggatccgacgctgctcgtcgatcgggctggctcggcgacggggagacgcaggggcagcggacttactctcatcggcaaggcggacccaggggacgggcttggcaacgacgatgtgcgtcaccttcggctggaagcagagtcagaccatgaatcaacagagtctgaagaggaattcaatatgtgtcagatctgcaacactgaggaggagaagacgatgttgctccattgtactggttgcgccgcacatgttcaccctggttgtctgattcctccttggactggtatgcTAGcagatgattggtcatgttattcatgcaaggagaaagtagagaattacttcaaagagagagatgcttacataactgaactctccaagaggtatgacactgcagtggaaagaaagtcgaatattttgcagattattcgttccttggatttgcctaacaatcctctagatgatatcattgatcagctaggtggtccttacaatgttgcagaaataactggacgtcgtgaagtagcattggatatgattaatattcatgaaaagcagcagttcatggatggagaaaagcttgttgcaataatatcagaagcaggatcagctggtgtttctctacatgctgatcgaagggcgaaaaatcagttgaaagtggctaatacaaggcttctttttacaaatcttggaggtgaaaagcgatttgcatctattgtggcaaagagactggagtctcttggagctttgacacaaggagaccgaagagctggaccatcacttagtgctttcaactatgacagcacttatggaaagaaagccttgatgatgatgtacagaggaatactggaacaggatggtcttccagttttgccttcaggatgttctgaggatcaagctagcctccaaggattcatcactaaagcaaaagctgctttggtgtcagttggaattatcagggatgcgctaatgtgcaatggaaaaaatggaggaaagcttactggtaggatttttgattctgatctgcatgacataggccgtttcctcaatcgcattctaggcttggctccagacattcagaacaggcaaactgttcatgttgatagcttgtctggtgcttctacagtgttatttactttcacaatcgaccgtggatttacttgggagactctacaatttgacaactgcaccttctttatctatacatatgttaagtcggcaaatgcaatacttgaagaaaggcagaaagatggagctggttcttcagatgttggattttatgaatccagaagagaatggatgggtcgaaggcattacatgctagcatttgaaggggaaatgcctttggttgaacttaaaagcaagtacaggaaggtttcatcaattgacaaaattggcaatggttggcaggaagagtatgatgcatcatccaagcagtgtatgcatggacccaaatgcaaacttggaagctattgtacagtaggcagaaggttacaggaaatcaatattttgggtggtctaatacttcctgtctggggcatagtagAaaaggccctagctaagcaggttcgacaaattcacaagaggatacgtgtcgctcgcttggagacaaatgataatgagcggattgttggacttatgattccaaattcagctgtggaatcagtattagaaggtctgcaatgggtgcaggatattgacgattga

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Protein seq

MAGGGGGGGSPSPVAASAAPVQVRCAGCRGVLAVAPGMTEFICPKCRMAQRLPPELMPPSPPKASPTPPPQPQPHPQLQPPPPPAPLPPPSRRSAPRAQGVDPTKIQLPCARCKAILNVPHGLARFRCPQCDVDLAVDLSKLRNFLATAGPGFAPPLPLPPPPPPPMPPIPLPHMPFLPMMPHVPVPMPPMASPAELPEEINEVAVDVEREEDEGGTVGETFMDYRPPKLSLGLPHPDPVVETSSLSAVQPPEPTYDLTIMDELDETKVLSCLQIETIVYASQRHLYHLPTGARAGFFIGDGAGVGKGRTIAGLIWENWKQGRHKALWISIGSDLKYDARRDLDDVGAKYVEGRVRVALQPLLVLSINWPRLQLNTKLSVLGILVHASWRQALSPDQVHALNKLPYSKIDSKAVGITTGVIFVTYSSLIASSEKGRSRLQQLIEWCGSEFDGLLVFDEVKKTLEMLPEARVVYCSATGASEPRNLGYMVRLGLWGDGTSFQNFQKFLGALEKGGVGALELVAMDMKARGMYVCRTLSYKGAAFATVEAPLEERMMNMYRKAAEFWAELRVELLSAIEYYAEDKGNSSQIWRLYWASHQGVEMEDFVSGPRELLLKLVDDNYPLPPKPDCFQQVGDEKVAEVQRKRHYGPDVCFKGRARKLAKMEDESDDGTDEYSLLNSWIDILGKEELPEVAKDSSVTSGRSRVLSRDASRGSRRRQRSCSTMAGCDVAADAVRKELSISGDGGLESVDGKDNKQRVRDPTLLVDRAGSATGRRRGSGLTLIGKADPGDGLGNDDVRHLRLEAESDHESTESEEEFNMCQICNTEEEKTMLLHCTGCAAHVHPGCLIPPWTGMLADDWSCYSCKEKVENYFKERDAYITELSKRYDTAVERKSNILQIIRSLDLPNNPLDDIIDQLGGPYNVAEITGRREVALDMINIHEKQQFMDGEKLVAIISEAGSAGVSLHADRRAKNQLKVANTRLLFTNLGGEKRFASIVAKRLESLGALTQGDRRAGPSLSAFNYDSTYGKKALMMMYRGILEQDGLPVLPSGCSEDQASLQGFITKAKAALVSVGIIRDALMCNGKNGGKLTGRIFDSDLHDIGRFLNRILGLAPDIQNRQTVHVDSLSGASTVLFTFTIDRGFTWETLQFDNCTFFIYTYVKSANAILEERQKDGAGSSDVGFYESRREWMGRRHYMLAFEGEMPLVELKSKYRKVSSIDKIGNGWQEEYDASSKQCMHGPKCKLGSYCTVGRRLQEINILGGLILPVWGIVEKALAKQVRQIHKRIRVARLETNDNERIVGLMIPNSAVESVLEGLQWVQDIDD

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
A3 Chr08 7564325 7564722 + OsPr106_08g0007230.02,OsPr106_08g0007230.03 OsPr106_08g0007230.01,OsPr106_08g0007230.02,OsPr106_08g0007230.03 All
A5 Chr08 7564797 7564984 + OsPr106_08g0007230.01 OsPr106_08g0007230.02,OsPr106_08g0007230.01,OsPr106_08g0007230.03 All
MX Chr08 7566936 7567377 + OsPr106_08g0007230.03 OsPr106_08g0007230.01,OsPr106_08g0007230.02,OsPr106_08g0007230.03 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 6.176594 11.002342 13.338172

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_08g0223700 RBH 1.396142 1.888281 1.294322
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os08g12680 RBH 1.830850 1.628692 0.758261
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os08g0223700 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_08g0007270 RBH 0.727894 5.833415 5.371536
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_08g0007340 RBH 0.440297 3.591059 4.402268
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_08g0007440 RBH 1.731028 2.838061 9.524438
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_08g0007420 RBH 0.200588 0.198152 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_04g0026560 SBH 6.881021 15.412815 17.182211
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_08G0119100 RBH 4.479293 12.385451 10.8123125
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_08g0007190 RBH 0.390952 0.451234 2.725573
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_08G0111800 RBH 6.8872145 17.1067885 19.957277
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_08g0006880 RBH 0.084476 0.444869 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_08g0006960 RBH 0.387085 2.801733 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_08g0006820 RBH 1.755230 7.057676 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_08g0007450 RBH 1.036679 0.837013 1.044951
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_08g0006910 RBH 0.143040 2.105605 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_08G007210 RBH 0.935821 6.806540 4.372150
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_08g0007050 RBH 1.605796 19.489693 8.889218
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