Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsPr106_07g0010640 | OGI:07032560 | 16/16 | PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr07:11783309-11795149 | ||||||||
| Gene Symbol | ABCG17, OsABCG17 | ||||||||||
| DNA seq | tttgtggtggtgataacatggcagcgtcgccgctgccgaggtgggctccgacgccgagcccgacgaggccactgagaacgccaggaaccccgagcgccggcgccggcgccgcctcgtcgtcatcgtcatcgtcatcgtcgtggcgcagctgtgtgccgttactcaccaccttcagttccgtcttcggatcatcagctgcgcggcgcggtggtggtctctccggcggggagccaccgccggcgctgcccgacgccggtcgccatgacatcgtcggcggcattgcgcctctcgacggcgtggaagccgccgtcgaacggcgccggaaggacgagatgatgatgagcgccacgacggcgtgtagccgtggggtgttcctgacgtgggacgatctgtccgtgacggcgccggcagctgccgccggctgcggcggccacggccgccgcgccgtgatactcgacgggctcagcggctacgcgcgccccggcgaggtgctggctctcatggggccttccggctgtggcaagactaccctgcttgacgccttagctggtaattactgataacttacttctaaagcaacttttattcaacagtcatatataaacctaaataacttgtgtgttcattaaaaaaaagtaaacttgttttcttcacatgctgtgttaattgatgcgccgagtattatgcatgggccgatatactgttggatgtgtgtccatgtttgtgcatgcgctatgtcttgtatatattccgtggattattatagactagataatctatattcatgtaggagtgacaattaattggaatgggcaagtggacaaaaacaaatttaattaaagaaaaacaaaaacaatgcacaaatgtaccaagcaatgcatctgaccgttggattaaatttgtatgctgtctggacctgcatcaaaataaagcatgtgacacacatattatcatcaccaagaagagctgctctggagccatcagccatggagatggtggtaaaaaaattaagtctggtagctaataaaaaaaaaagtaaactggcttatgtgcgtgtgtactgtgttaggtcggagcggaaaaatataaggcctgaaataaaattcagtgtgtccacagtacaaaaattactgtgattttaattacaagatttctagaaaatacatctgcaccaagctttttgagccaaattgaaaaaaacacacatataaacaattgcatatgtatagtttttagtacatgtttaagtgcagaagattaagataattaccttagcgcagttggcaggcaaccgtcgagcagaccgccccttccacccgcccacacttaactcattaatgcactgacttttcttcttaattaatacaattgatttgtgtctcctttgtggttaatccaacattttatgttttaaattaaaatatttcaattatcacttaattaaattgaaagttgtatttgcaattttctgaaaataccaacacaaatttgattctgcaaactacgtacaacacgtacgaccatatcaagtactggggtacaatacgttatggtttatagcacttgttatatatagtatctgccaaaaggtcccccatcgggtcgtacaaaagtgatcttgacgatatcgacagttgatgattaattaatccctccttccaaaagtgtaagattaactttttttttatccaagaccctatttagatgggactaaaacttttaattccctatcacattaaatgtttggacactaattataaatattaaacgtagactattaataaaacacatctataatcttggactaattcgcgagacgaatctattgagtctaattaatccataattagcctatgtgatgctacagtaaacattctctaattatgaattaattaggcttaaaaaatttgtctcgcaaattagctttcatttatgtaattagttttgtaggtactctatatttaatactctaaattagtgtctaaatacaaagactaaagttaagtccctgaatctaaacaccacctaagactttggagaaattaactaatccacatgtaaaaaacccaaaaataatactcaaagatgtaactaatgacccattaagatgcttacttgatttcgataaacaatatatttaatttagcacaagactaacaatataactctatctcacttcgaaaagcaaaaaataaaatatacttaacacttttggatgaagggagtaatacactgcacaaacacagcagaggctgtaatatgtgtgagaaatttgccatgcatgtgacatcgttactttgtagcatgagttttaaatttagaatatttattttaaacatttcagtacgtgcagctcacagattgctgaaatagataatatatggagacaaatatattgtattcttgaaaggttgttgtcacggttaaatgtgaaaaagctaccgtgcgatcggtcgtgcgcagcgatcaggctccctcctcacattgctccctttttttttaccatattacctattttggtaaggttatacacctaaagtttgtatactcaaaatttatatacctaaagtatacacacctaaaatttgtatacctaacatctatatacctaaagtttacaaaaaaagtgtatgtacctaaagtttacacatttaaagtttatatgttaaaagtttaaatatccgatcaagattatggattttgactcaaatgaatgtttgacatataaatgttttatgcgatttattttagtttgtaattttatcgctgggcccacatggagcggcaaccacgtagcagggaagacgcgtagagattggaggcaagcggagcgatcgtgtgcgtgggcttttttctgttttaccatttcctgattgtgcatgcgtccatcccacaatcactcgcgtatcaggaggacctggttatatgcacgttctttattttcctgaaaactactttctaaaatgccacgcatgcccaagacgcgtgccgtgcgtttgagtagacttgacattcttctggctacctgtggtatcgtactgtagctgatgcctggttgaactatcgtgctatgatcaattcaccatcttaactaatttcgttgtcactaccggagaactgatctttgctccaatggaagatctttagtcctggttgataacatcaacccatactaaaaattgatctttagtctcagttgatgataccaatccggactaaagatattttttagtcccggttaatgttattaacccagacaaaagatgtctccatggttagtttaaaaagaaagcatctctacccaagtcagatgtgtgtagtaggaggcatggtaatgcgcgtgagggttgagataagagatcttaaatttgaatcccacatcccccacttttttttttgacttggtatgcatctttagtctcgtttatttcaatcgagactaaagatggattgtgcgtcctagttgcacaaccgagactaaaaatggttgcaaaccgggactaaagtccctttctccggcattgtgtgttcattaattagttagctgtgaagttaatttaggtgcatatatacagtaaaaataatatgatcagactttgtcattttctgtcttaaaattttttatgcataagtggtccaggctagatatagtaattgtaagtactatgcttgttcaagggagagaggacaatattcaattggattactgttggaggcatgtaggattgctatcaacgaaccgtttcaatgttaagctgttatggatagctatatagttaagagtattgtctggacaagataataatagtacctattttggcgtaattaagtacattttgaggttggtacgtatggaaatatacatatttccaacaatatcgatgtagctgtctagctacaatctaattataagctttaagttcagtaaacagtggccaatcaacttagtcttattctatattctgattttttcattacacaaaaaagaattaaaattttactactacacatactccctctcatattaacacaagggcaggaaacagcaatccatgttcaacatccgcgtgagcatacgagaagaccatgcatgcagccatgctcggtatctgatcaaatacgggtttcagaagtacgtatggcatgcatagaacaagagggactgtccatacttgccaatcactccacaggctgcaggctacagcctgcacgagatggatggagcctccgggctgcagctatctcctctccttttcccagtttgtgagtagagatgttgtattgtgcaaaaactttcaagctttcacgctgcagttactacaaacggggaaaaggaaatatttgtttatatacataagcgctactcagaaagagtattgttttagttttaaaattgtttctcagaaagtgtgtttttgggtgaggtctactaattgacatgtttaatacttcatatcctttttcttctcgttttaaccatcgaaccagtacgttgtactccctgaacccaacataaccaaaacacacacaaatttttttgaataaaaaacacatacaaaattaaaaggattatgtatgcagacttaattagtataattgagtatcagcatcaacgaattaatgttgtaagcattaacattaattaaatatttggaccacttcctcttttgctttttgaaatgtggccaaggttaccaccaagtgtttagatttggcatatcagatgagaaacttcagatccttaaaatacatttcatttcatatagatgactgttacgtgcaggttactttctgggttgttgattaatttaatgcttgccctcctagtagattagacattttaacacgtatctatatatatgttacaggaagattaattaaacagcccatgcatatatataaacacgataatgcatctgattaattagtcatcactcatttgcacagggaggctgagccccaacatgaaaatgagaggagacatcctgatcaatggcctg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| Protein seq | MAASPLPRWAPTPSPTRPLRTPGTPSAGAGAASSSSSSSSSWRSCVPLLTTFSSVFGSSAARRGGGLSGGEPPPALPDAGRHDIVGGIAPLDGVEAAVERRRKDEMMMSATTACSRGVFLTWDDLSVTAPAAAAGCGGHGRRAVILDGLSGYARPGEVLALMGPSGCGKTTLLDALAGRLSPNMKMRGDILINGLREKLSFGTSAYVTQENVLMATLTVTEAVHYSAQLQLPDSMPAEDKRARADRAIRQMGLGAVAGVRIGGRVCKGISGGQRKRVSICVELLASPALLFLDEPTSGLDSAASYHVMSRIAGLARRDGMTVVAAVHQPSTEMFELFHGLCLLATGRTVYFGAASDAIEFFESNGFPCPLRRNPSDHFLRMINKDFEGASPIPQRQATFLTKTYARASMLMFTSTLLTMMAIGGFPSFVEDMKIFRKERMSGHYGATEFVISNTLSSIPYLGLISIIPGAIAYYLTGLQRGIDHFIYFAAVLWACTMLVEGLMMIVAAVVPDFLLGIITGSGVQGVLMLNAGFFRLPSDLPKPVWKYPTYFISYHKYATQGLYKNELLGLVFEDIGGGGLTISGEYILKNYLQVELSYSKWVDLAILVAMIIIYRISEIVKPRMLHFLCASKV |
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| Function | ABC transporter G family member 11 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q8RXN0] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsPr106_07g0010640 | OsPr106_07g0010640.01 | Chr07 | 11783309 | 11795149 | + | NAM | ||
| CDS seq | atggcagcgtcgccgctgccgaggtgggctccgacgccgagcccgacgaggccactgagaacgccaggaaccccgagcgccggcgccggcgccgcctcgtcgtcatcgtcatcgtcatcgtcgtggcgcagctgtgtgccgttactcaccaccttcagttccgtcttcggatcatcagctgcgcggcgcggtggtggtctctccggcggggagccaccgccggcgctgcccgacgccggtcgccatgacatcgtcggcggcattgcgcctctcgacggcgtggaagccgccgtcgaacggcgccggaaggacgagatgatgatgagcgccacgacggcgtgtagccgtggggtgttcctgacgtgggacgatctgtccgtgacggcgccggcagctgccgccggctgcggcggccacggccgccgcgccgtgatactcgacgggctcagcggctacgcgcgccccggcgaggtgctggctctcatggggccttccggctgtggcaagactaccctgcttgacgccttagctgggaggctgagccccaacatgaaaatgagaggagacatcctgatcaatggcctgcgagagaaactttcgtttggaacatccgcctacgtgacccaagaaaacgtgctgatggcgacgctcacggtgacggaggccgtccactactcggcgcagctgcagctgccggactcgatgccggcggaagacaagcgggcccgcgccgaccgcgccatccgccagatggggctcggcgcggtcgccggcgtccggatcggcggccgggtgtgcaagggcatcagcggcgggcagcggaagcgggtgagcatctgcgtcgagctgctggcgtcgcccgcgctgctgttcctcgacgagccgacgagcgggctcgacagcgcggcgtcgtaccacgtcatgagccgcatcgccggcctcgccaggagggacgggatgacggtcgtcgccgcagtgcaccagcccagcacggagatgttcgagctcttccatggcctctgcctcctggccactgggaggacggtgtattttggagcagcttcagatgcaatcgagttcttcgaatctaatggcttcccatgtcccttgaggaggaatccttctgatcacttcctgagaatgattaacaaagactttgagggtgcctctccaattcctcaaaggcaggcaacattcttgaccaaaacatatgcaagagcttccatgctaatgtttacatcaaccctattaacaatgatggcaattggaggttttccatcttttgttgaagatatgaagatatttcgaaaagaacggatgagtgggcattatggtgcaacagaatttgtgatatccaacacactctcctcaattccatacctaggcctcatctccataattccaggggcaatagcctattacctgacagggcttcaaagaggaatagaccacttcatctactttgctgcagttttgtgggcctgcacaatgctggtagaaggattgatgatgattgttgcagcagttgtgccagattttctgctagggataatcactggctctggtgtacaaggtgtactgatgctcaacgctggtttcttcagactcccaagtgatctgccaaaaccagtttggaagtacccaacatacttcatctcctaccacaagtatgcaacgcagggactgtacaagaatgagctgttgggcttggtctttgaagatattggcggtggcgggctcacgattagtggcgaatacatcctaaagaattacttacaggtggaattaagctactctaagtgggtggatcttgcgatattagttgcaatgatcataatttacaggatttccgagattgtgaagccaaggatgcttcactttctctgtgcttcaaaggtatag
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| Protein seq | MAASPLPRWAPTPSPTRPLRTPGTPSAGAGAASSSSSSSSSWRSCVPLLTTFSSVFGSSAARRGGGLSGGEPPPALPDAGRHDIVGGIAPLDGVEAAVERRRKDEMMMSATTACSRGVFLTWDDLSVTAPAAAAGCGGHGRRAVILDGLSGYARPGEVLALMGPSGCGKTTLLDALAGRLSPNMKMRGDILINGLREKLSFGTSAYVTQENVLMATLTVTEAVHYSAQLQLPDSMPAEDKRARADRAIRQMGLGAVAGVRIGGRVCKGISGGQRKRVSICVELLASPALLFLDEPTSGLDSAASYHVMSRIAGLARRDGMTVVAAVHQPSTEMFELFHGLCLLATGRTVYFGAASDAIEFFESNGFPCPLRRNPSDHFLRMINKDFEGASPIPQRQATFLTKTYARASMLMFTSTLLTMMAIGGFPSFVEDMKIFRKERMSGHYGATEFVISNTLSSIPYLGLISIIPGAIAYYLTGLQRGIDHFIYFAAVLWACTMLVEGLMMIVAAVVPDFLLGIITGSGVQGVLMLNAGFFRLPSDLPKPVWKYPTYFISYHKYATQGLYKNELLGLVFEDIGGGGLTISGEYILKNYLQVELSYSKWVDLAILVAMIIIYRISEIVKPRMLHFLCASKV
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsPr106_07g0010640 | OsPr106_07g0010640.02 | Chr07 | 11783497 | 11795149 | + | NAM | ||
| CDS seq | atgatgatgagcgccacgacggcgtgtagccgtggggtgttcctgacgtgggacgatctgtccgtgacggcgccggcagctgccgccggctgcggcggccacggccgccgcgccgtgatactcgacgggctcagcggctacgcgcgccccggcgaggtgctggctctcatggggccttccggctgtggcaagactaccctgcttgacgccttagctgggaggctgagccccaacatgaaaatgagaggagacatcctgatcaatggcctgcgagagaaactttcgtttggaacatccgcctacgtgacccaagaaaacgtgctgatggcgacgctcacggtgacggaggccgtccactactcggcgcagctgcagctgccggactcgatgccggcggaagacaagcgggcccgcgccgaccgcgccatccgccagatggggctcggcgcggtcgccggcgtccggatcggcggccgggtgtgcaagggcatcagcggcgggcagcggaagcgggtgagcatctgcgtcgagctgctggcgtcgcccgcgctgctgttcctcgacgagccgacgagcgggctcgacagcgcggcgtcgtaccacgtcatgagccgcatcgccggcctcgccaggagggacgggatgacggtcgtcgccgcagtgcaccagcccagcacggagatgttcgagctcttccatggcctctgcctcctggccactgggaggacggtgtattttggagcagcttcagatgcaatcgagttcttcgaatctaatggcttcccatgtcccttgaggaggaatccttctgatcacttcctgagaatgattaacaaagactttgaggaatctgaagaaggatctaccattatttctccacgtgctgccgaagtgatccaaaaactaatgggttctttcaaatcttgtggtaccttaaggacagaaaaggaagcatgtgcaatgattaatcagggtgcctctccaattcctcaaaggcaggcaacattcttgaccaaaacatatgcaagagcttccatgctaatgtttacatcaaccctattaacaatgatggcaattggaggttttccatcttttgttgaagatatgaagatatttcgaaaagaacggatgagtgggcattatggtgcaacagaatttgtgatatccaacacactctcctcaattccatacctaggcctcatctccataattccaggggcaatagcctattacctgacagggcttcaaagaggaatagaccacttcatctactttgctgcagttttgtgggcctgcacaatgctggtagaaggattgatgatgattgttgcagcagttgtgccagattttctgctagggataatcactggctctggtgtacaaggtgtactgatgctcaacgctggtttcttcagactcccaagtgatctgccaaaaccagtttggaagtacccaacatacttcatctcctaccacaagtatgcaacgcagggactgtacaagaatgagctgttgggcttggtctttgaagatattggcggtggcgggctcacgattagtggcgaatacatcctaaagaattacttacaggtggaattaagctactctaagtgggtggatcttgcgatattagttgcaatgatcataatttacaggatttccgagattgtgaagccaaggatgcttcactttctctgtgcttcaaaggtatag
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| Protein seq | MMMSATTACSRGVFLTWDDLSVTAPAAAAGCGGHGRRAVILDGLSGYARPGEVLALMGPSGCGKTTLLDALAGRLSPNMKMRGDILINGLREKLSFGTSAYVTQENVLMATLTVTEAVHYSAQLQLPDSMPAEDKRARADRAIRQMGLGAVAGVRIGGRVCKGISGGQRKRVSICVELLASPALLFLDEPTSGLDSAASYHVMSRIAGLARRDGMTVVAAVHQPSTEMFELFHGLCLLATGRTVYFGAASDAIEFFESNGFPCPLRRNPSDHFLRMINKDFEESEEGSTIISPRAAEVIQKLMGSFKSCGTLRTEKEACAMINQGASPIPQRQATFLTKTYARASMLMFTSTLLTMMAIGGFPSFVEDMKIFRKERMSGHYGATEFVISNTLSSIPYLGLISIIPGAIAYYLTGLQRGIDHFIYFAAVLWACTMLVEGLMMIVAAVVPDFLLGIITGSGVQGVLMLNAGFFRLPSDLPKPVWKYPTYFISYHKYATQGLYKNELLGLVFEDIGGGGLTISGEYILKNYLQVELSYSKWVDLAILVAMIIIYRISEIVKPRMLHFLCASKV
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
| SE | Chr07 | 11793747 | 11794105 | + | OsPr106_07g0010640.02 | OsPr106_07g0010640.02,OsPr106_07g0010640.01 | All |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 5.119218 | 0.0 | 0.0 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_07g0288700 | RBH | 0.255669 | 0.000000 | 2.176157 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os07g18874 | RBH | 0.171590 | 0.000000 | 0.451784 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os07g0288700 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_07g0010700 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_07g0010700 | RBH | 0.180269 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_07g0010660 | RBH | 0.188432 | 0.0 | 1.306472 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_07g0010520 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_07G0198900 | RBH | 2.089345 | 0.0039985 | 0.006461 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_07g0011100 | RBH | 0.141940 | 0.0 | 0.000000 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_07G0199400 | RBH | 2.4887125 | 0 | 0 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_07g0010570 | RBH | 0.173345 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_07g0010640 | RBH | 0.326267 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_07g0010580 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_07g0010880 | RBH | 0.077779 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_07g0010620 | RBH | 0.052826 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_07G010640 | RBH | 0.066322 | 0.0 | 0.000000 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_07g0010370 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
