Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsNaBo_07g0010370 OGI:07032560 | 16/16 NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr07:11018304-11030602
Gene Symbol ABCG17, OsABCG17
DNA seq

tacttTGtggtggtgataacatggcagcgtcgccgctgccgaGgtgggctccgacgccgagcccgacgaggccactgagaacgccaggaaccccgagcgccggcgccggcgccgcctcgtcgtcatcgtcatcgtcatcgtcgtggcgcagctgtgtgccgttactcaccaccttcagttccgtcttcggatcatcagctgcgcggcgcggtggtggtctctccggcggggagccaccgccggcgctgcccgacgccggtcgccatgacatcgtcggcggcattgcgcctctcgacggcgtggaagccgccgtcgaacggcgccggaaggacgagatgatgatgagcgccacgacggcgtgtagccgtggggtgttcctgacgtgggacgatctgtccgtgacggcgccggcggctgccgccggctgcggcggccacggccgccgcgccgtgatactcgacgggctcagcggctacgcgcgccccggcgaggtgctggctctcatggggccttccggctgtggcaagactaccctgcttgacgccttagctggtaattactgataacttacttctaaagcAacttttattcaacagTCAtatataaacctaaataacttgtgtgttcattAaaaaaaagtaaacttgttttcttcacatgctgtgttAattgatgcgccgagtattatgcatGggccgatatactgttggaTgtgtgtccatgtttgtgcatgcgctatgtcttgtatataTtccgtggattattatagactagataatctatattcatgtaggagtgacaattaattggaatgggcaagtggacaaaaACcaatttaattaaagaaaaacAaaaacaatGcacaaatgtaccaagcaatgcatctgaccgttggattaaatttgtatgctgtctggacctgcatcaaaatAaagcttgtgacAcacatattatcatcaccaagaaGAGctgctctGgagccatcagccatggagatggtGGtAaaaaaattaagtctggtagctaaaaaaaaaaaaagtaaactggcttatgtgcgtgtgtactgtgttaggtcggagcggaaaaatataaggcctgaaataaaattcAgtgtgtccacagtacaaaaattactgtgattttaattacAagatttctagaaaatacatctgcaccaagctttttgagccaaattgAaaaaaacacacatataaacaattgcAtatgtatagtttttagtacatgtttaagtgcagaagattaagataattaccttagcgcagttggcaggcaaccgtcgagcagaCccccccttccAcccgcccAcacttaactcattaatgcactgacttttcTtcttaattaatacAattgatttgtgtctcctttgtggtatatccaacattttatgttttaaattaaaatatttcaattatcacttaattaaattgaaagttgtatttgcaaTtttctgaaaataccAacacaaatttgattctgcaaactacgtacaacacgtacgaccataTgaagtactGgggtacaatacattaTggtttatagcacttgttatatatagtatctgccaaaaggtcccccatcgggtcgtacAaaagtgatcttgacgatatcgacagttgatgattaattaatccctccTtccaaaagtgtaagattaacttttttttttgtcatccAagatcctgtttagatgggactaaaacttttaattccctatcacattaaatgtttgggcactaattataaatattaaacgtagactattAataaAaCAcatccataatcttggactaattcgcaagacgaatctattgagtctaattaatccatgattagcctatgtgatgctacagtaaacattctctaaTtatgaattaattaggcttaaaaaaTttgtctcgcaaattagctttcatttatgtAattagttttgtAagtagtctatatttaatactctaaattagtgtctaaatacaaagactaaagttaagtccctggatctaaacaccacctaagactttggagaaattaactaatccacatgtAaaaaacccaaaaataatacgcaaagatgtaactaatgggtattaagatgcttacttgatttcgataaacaatatatttaatttagcacaagactaacaatataactctatctcacttcgAaaagcaaaaaatAaaatatacttaacacttttggatgaagggagtaatacactgcacAaacacagcagaggctgtaatatgtgtgagAaatttgccatgcatgtgacatcgttactttgtagcatGAgttttaaatttagaatatttattttaaacatttcagtacgtgcagctcacagattgctgaaatagataatatatGgagacaaATatattgtattcttgaaaggttgttgtcacggttaaatgcgaaaagctatctcacttcgaaaagcaaaaaataaaatatacttaacacttttggatgaagggagtaatacactgcAcaaacacagcagaggctgtaatatgtgtgagaaatttgccatgcAtgtgacatcgttactttgtagcatgagTtttaaatttagaatattattttAaacatttcagtacgTgcagctcacaGattgctgaaatagataatatatggagacaaatatattgtattcttgaaaggTtgttgtcacggttaaatgcgaaaaagctaccgtgtgatcgatcgtgcgcagcgatcaggctccctcctcacaTtgctcccttttttttttaccatattacctattttagtaaggttatacAcctaaagtttatatactcaaaaTttatatacctaaagcatacacacctaaaatttgtatacctaacatctatatacctaaagtttacacaaaaaagtgtatatacctaaagtttacacatttaaagtttatatgttgaaagtttaaatatccgatcaagattatggattttgactcAaattaatgtttgacATatAaatgttttatgcgatttattttagtttgtaattttAtcgctgggcccacatggagcggcaaccacgtagcagggaagacgcgtagagattggaggcaagcggagcgatcgtgtgcgtgggcttttttctgttttaCcaTttcctgattgtgcatgcgtccatcccacaatcactcgcgtatcaggaggacctggttatatgcacgttctttattttcctgaaaactactttctaaaatgccacgcatgcccaagacgcgtgccgtgcgtttgagtagacttgacattcttctggctacctttggtatcgtattgtagctgatgcctggttgaactatcgtgctatgatcaattcaccatcttaactaatttcgttgtcactaccggagaactgatctttgctccAaTggaagatcgttagtcctggttgataacatcaacccatactaaaaattgatctttaatctcagttgatgataccaacccggactaaagatattttttAgtcccggttaatgttattAacccagacaaaagatgtctccatgattaattTAaaaagaaagcatctctaTccaagtcagatgtgTAtagtaggaggcatggtaacgcgcgtgagggttaagatgagagatcttaaattcgaatcccacatcccccacattttttttgacttggtatgcatatttagtctcgtttatttcaatcgagattaaagatggattgtatgtcctggttgcacaaccgagactaaaaatggttgcaaaccgggactaaagtccctttctccggcagtgtgtgttcattaattagttagctgtgaagttaatttaggtgcatatatacagtaaaaataatatgatcagactttgtcattttctgtcttAaaaTtttttatgcataagtggtccaggctagatatagtAattgtaagtactatgcttgttcaagggagagaggacaatattcaattggattactgttGgaggcatgtaggattgctatcaaccaaccgtttcaatgttaagctgttatggatagctatatagttaagagtattgtctggacaagataataatagtacctattttggcgtaattaagtacattttgaggttggtacgtatggaaatatacatatttccAacaatatcgatgtagctgtctagctacaatctaattataagctttaagttcagtaaacagtggccaatcaacttagtcttattctatattctGAttttttcattacacaaaaaagaattAaaattttactactacacatactccctctcatattAacacaagggcaggaaacagcaatccatgttcaacatccgcgtgagcatacgagaagaccAtgcatgcagccatgctcggtatctgatcAaatacgggtttcagaagtacgtatggcatgcatagaacaagagggactgtccatacttgccaatcactccacaggctgcaggctacagcctgcacgagatggatggagcctccgggctgcagctatctcctctccttttcccagTttgtgagtagagatgttgtattgtgcAaaaactttcaagctttcacgctgcagttactacaaacGgggaaaaggaaataTttgtttatatacataagcgctactcagaaagagtattgttttagttttaaaattgtttctcagaaagtgtgtttttgggtgaggtctactaattgacatgtttaatacttcatatcctttttcttctcgttttaaccatcgaaccagtacgttgtactccctgaacccaacataaccaaaacacacacaaaTttttttgaataaaaaacacatacaaaATtAaaaggattatgtatgcagacttaattagtataattgagtatcagcatcaacgaattaatgttgtaagcattaacactaaTtaaatatttggaccacttcctcttttgctttttgaaatgtggccaaggttaccaccaagtgtttagatttggcatatcaga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Function ABC transporter G family member 11 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q8RXN0]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.0 0.000000

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_07g0288700 RBH 0.255669 0.000000 2.176157
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os07g18874 RBH 0.171590 0.000000 0.451784
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os07g0288700 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_07g0010700 RBH 0.000000 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_07g0010700 RBH 0.180269 0.0 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_07g0010660 RBH 0.188432 0.0 1.306472
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_07g0010520 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_07g0010640 RBH 5.119218 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_07G0198900 RBH 2.089345 0.0039985 0.006461
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_07g0011100 RBH 0.141940 0.0 0.000000
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_07G0199400 RBH 2.4887125 0 0
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_07g0010570 RBH 0.173345 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_07g0010640 RBH 0.326267 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_07g0010580 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_07g0010880 RBH 0.077779 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_07g0010620 RBH 0.052826 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_07G010640 RBH 0.066322 0.0 0.000000
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
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