Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsPr106_04g0001180 OGI:04005190 | 16/16 PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr04:1603498-1612874
Gene Symbol OsSLPP1, SLPP1, OsSub37, SUB37, OsSub38, SUB38
DNA seq

atggtgtagatggtacaccccaagtgaacgcacaccaactgtgcaacgaattgcgcagctaacaaggcaaaccgtcgattggccaactttatctaattgagaaatttattattgatgatgttgtcttgctttctgtgaaatatttattcatgatgttatcttgcatccagtttgggttctaaaaacaaataaactagtttgtggatgaggaaacgtgggaaaatatacagtgcaaaccacatatgtagttaaaacttggaaactaccgttggatcgagaaatggatgttcgagatttatccacatcaccatgagttaaaatttaactcccagtaaaattttaacttatgagtgaatctgcgagttaagttttaactcatggtgacgtggataaatctcggacattcatttctcgattcaacggtagttttcaagtttccactatatatatggtttgcactacatattttcccaggaaacgtaagatttaatcaccatgtacatcgtgtctctgatttgataacctggtaaacattataaacaaatatgaatcaaggttgcgcgtgtatcacatgatttccaaagattctgttatatggaagcacttgtcatgttaatgcttcattcgaatgtacagagctacctgaggtacgcagcataaaaccaagcagagtgcacccattacatacaactcatagccaggatttccttggattagactacaccaagccaactggtctactccatgatgcaaagtacggagacggcatcatcattggaataattgactcaggtatctccttttatttctcacgtttaatttggcatttatttcatgattttatactcagtacctcgagtaatctaatctcatgtttgcactatgcgtgatagggtcctgaaaatgaatatcaaatcaaataagcagtgctggtccatttgcaaacagaatgcatgcatttccatgtcaagtttaaatataacctcacacattggctaattattgctcctgtgtgttccaaagacgcttgaaatactgttctgctaaagccacttgatgatgtacctctgtgaaaatgaaatttgcttttacatacactagggaaatggaaagtgtgtgctgaacaaggtgctagtgattaaaccttctgcgctttatggttcaaagttgagagtactctaaatagaaccaaaatggtgaataaatatgagcactgattcctactgtgctatgtcaggtatctggcctgagtctgcaagcttcagcgaccatggcctaagccctattccttccaaatggaaaggccaatgtcaagctggcgaagccttcaggtcaaaccagtgcaaccggaagattattggggctcgatggtatgacaaacatttgagcgcagaggatctgaaaggagagtataggtcggccagggacgcgcatggccatgggacacatgtggcatccactgcagctggtgccctggtaccaaacattagcttccatgggctagctgctggttatgccaggggcgtcgcgccccgcgcacggcttgcagtctacaaggcgtgctggggactgggggcaagctgtcatgatgcgggcatcatcaaagcgtttgatgatgccatacatgatggcgtcgatgtactatccctttctattggtaagagcggcggtgagttctttagcagcttccacgctgtgaggaatggcattactgtcattttcgcggcagggaacgagggccctgctcctcggactgttacaaatgcattaccctgggttataacggttgcatcagccacgatagaccgtgttttccctactgttatcacacttgccaatggcagcagcagcattgtggtacacgctaagtttcacctctctatttgttctttttagtttgcttgccttaaatagttaaatgctgaactatgactcgctgactcgttgttcacatcaaccgtagggtcagtccttgttctatcagccaaaggataacaacaactggtatgagattcatcactctaggtatgatgggcacataatttcttcttattaatgaattaacaattcatcgtgctacactaattcctcaaaatgtctgcatcttatggtcgcagctgtctaattaggaatggggagaaaattaatgcctcccttgcttctgggaagattgtgttttgctacagtcctctttctgtgagcataacttcaccatttggctatgtgtcccacgctgtgaaagctgccaaggaggctggagcgaaggggatcattattgccacatatggtcttgatattcttgactactttgaaaagtgtggtgccatgccgtgcattttcgtggactttgatgctgtaggacaaataaattcatctggtgatgaaaacactacacctttagttaagattgctccagcgcgtacttgggttggaggtgaagttcttgccccaaaaatctcaacattctcctccagaggacccagcccacttttaccacaattcctcaaggtacatcttagcttgatccattaccaggagctattaatatgatgatgatctctctttgacctaactcttctaactgatagttgatctacaacttgttttggtgttcagtgcataaatagtccatggcctagcaacagtatagttataacctttttctccaggactactttgacagaatattaaggaagcacttatcatggactgcactgtccactgagactgtaaaatataaggaactaaaaaaggatgatttaatgatgaacatatattagcatgaataggtaaaatataaaagattgaatatgtaagatcctttctcaaagcatatacgtactcggtctgagaaaacatactcaaccagtgaaccatcaaatagatagcttcatcacaaatagcttaatcatttatttgtatcttgttggagatatcatttacctcacctatacttctgcatttaaacagcctgatgttgcggcgcctggatctaatatcttggccgctgtgaaagattcgtacaagttccagtcaggcacttctatggcatgcccacatgtgtcaggtgtcgccgcattactcaaagcattgcatccagattggtctcctgctattatcaaatcagcactagtgactacaggtgatacaacttatctatatcttatccccgacaaaatgcttcttccaatatctaatacatcacagatcaacttatttctctatattttgaacatgtcccagcaagcaatgacagatatggtcttccaatattggctaatgggctaccgcaaaagatagctgatccgttggactatggtggcggctttattgatccaaataaagctactgatcctggactagcatacgatgttgacccaaaagactatgacttagtcgttaattgtgaatctgccaactcaagctgtgaatctatatttcaaaatctgaatcttccatcaattgcgatcccgaatctgacaatgccaacaacggtgctgagaacagtgacaaatgtaggccaagctaatgccgtttacaaggctgttgtccaatgccctcctggtgtgcagatatccgtggagccatctgttttacaattcaagcaaggaaagaagaagcagagcttcaaggtcaccttcagcatgatacacaaggttcagggaagctacctatttggaagcctagcatggtgtgatggtgccgctcactatgtcaggatcccaattgccattcgaccagttgtatctgagaattatgcagatctctgatgaagcataggactacaggattttcagagattcgatcagttgaggatggcttatcctattttagcccccgcatagttgaatttgtcggccttgctgaaactgctccagtgttgaaatgcatgtttaattttgtatgtaactctgtgatatctctatggatattagtgtgaactagtaatgaataagtgaggggttgtttagatggaatgttatatctgttgcaagctcctttttgtttttgccaatatttgacacaatgctgtatttttctctcatattatttccactgtatttggcatctaccatttgtttttgccgtgttatctgcagtctgcacgatgtgtggattcagctgaggaatacttacacttgcaacctatagtatcttgtcccgtttttataaagttagtagttgagtgagtatgtgcgagaacacccgttttgaaagagttgcaacctatggcacaatgctgcttgagtttcacaataagctacaagtgattttacggttttcgacggacaccatatctcaagaaccataaagtcgccccttcattttgtcttaccaatgactgcataaaataatttggccatgcagtgctctttaatttatttttttttgcggggctctttaatttatttttattgtacagataaaaagtttattaatgcttccatctatatttaggataggaggaaaaacgtgaacttagtttatactaccttcaagcctataaataccacattaatttaaacaatgttgtgtttttttattatagtggatccaaattataattgtgcaaatcagacaatttttgtttggaggaattggattggtcgatacagttatatacaaaatataattggcatttagacttttgtggtcattgtggtgacatttcaaacgcttgtctattctagatgtagtacgtagttagttgaaagcaattagcttattttagttgtagtaacaacaattgaattacctaaaaaacaaaaacttgaattaaatatgaacacacaatcgttttaaattgtccaaccaaatatatcgctgctaaaaaaacgatttttgcaagcaaaCccccctttagcttataggcggcggccattacatcttccgcctgcgaaaatatctgcccgtgaggaggacaaggcccgtatgcaaaaaatcaattttgcatacgaaaataaatctattttaccaggtggcccacaccaggccagctg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CDS seq

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Protein seq

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Function Subtilisin-like protease SBT3.8 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9SZY3]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsPr106_04g0001180 OsPr106_04g0001180.01 Chr04 1603498 1612874 + NAM
CDS seq

atggtcataaaaccaagcagagtgcacccattacatacaactcatagccaggatttccttggattagactacaccaagccaactggtctactccatgatgcaaagtacggagacggcatcatcattggaataattgactcaggtatctggcctgagtctgcaagcttcagcgaccatggcctaagccctattccttccaaatggaaaggccaatgtcaagctggcgaagccttcaggtcaaaccagtgcaaccggaagattattggggctcgatggtatgacaaacatttgagcgcagaggatctgaaaggagagtataggtcggccagggacgcgcatggccatgggacacatgtggcatccactgcagctggtgccctggtaccaaacattagcttccatgggctagctgctggttatgccaggggcgtcgcgccccgcgcacggcttgcagtctacaaggcgtgctggggactgggggcaagctgtcatgatgcgggcatcatcaaagcgtttgatgatgccatacatgatggcgtcgatgtactatccctttctattggtaagagcggcggtgagttctttagcagcttccacgctgtgaggaatggcattactgtcattttcgcggcagggaacgagggccctgctcctcggactgttacaaatgcattaccctgggttataacggttgcatcagccacgatagaccgtgttttccctactgttatcacacttgccaatggcagcagcagcattgtgggtcagtccttgttctatcagccaaaggataacaacaactggtatgagattcatcactctagctgtctaattaggaatggggagaaaattaatgcctcccttgcttctgggaagattgtgttttgctacagtcctctttctgtgagcataacttcaccatttggctatgtgtcccacgctgtgaaagctgccaaggaggctggagcgaaggggatcattattgccacatatggtcttgatattcttgactactttgaaaagtgtggtgccatgccgtgcattttcgtggactttgatgctgtaggacaaataaattcatctggtgatgaaaacactacacctttagttaagattgctccagcgcgtacttgggttggaggtgaagttcttgccccaaaaatctcaacattctcctccagaggacccagcccacttttaccacaattcctcaagcctgatgttgcggcgcctggatctaatatcttggccgctgtgaaagattcgtacaagttccagtcaggcacttctatggcatgcccacatgtgtcaggtgtcgccgcattactcaaagcattgcatccagattggtctcctgctattatcaaatcagcactagtgactacagcaagcaatgacagatatggtcttccaatattggctaatgggctaccgcaaaagatagctgatccgttggactatggtggcggctttattgatccaaataaagctactgatcctggactagcatacgatgttgacccaaaagactatgacttagtcgttaattgtgaatctgccaactcaagctgtgaatctatatttcaaaatctgaatcttccatcaattgcgatcccgaatctgacaatgccaacaacggtgctgagaacagtgacaaatgtaggccaagctaatgccgtttacaaggctgttgtccaatgccctcctggtgtgcagatatccgtggagccatctgttttacaattcaagcaaggaaagaagaagcagagcttcaaggtcaccttcagcatgatacacaagagttga

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.0 0.321753

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_04g0127300 RBH 0.200248 0.359491 0.364703
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os04g03810 RBH 0.110967 0.229411 0.080768
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os04g0127300 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_04g0001110 SBH 0.135130 2.416801 0.651734
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_04g0001140 SBH 0.0 0.0 0.144493
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_04g0001150 SBH 0.121354 0.000000 2.362240
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_04g0001210 SBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_04g0001140 RBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_04G0027900 SBH 1.427744 0.0559445 0.1931925
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_04g0001330 SBH 0.0 0.0 0.000000
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_04G0025200 RBH 1.143466 0.515139 7.02709
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_04g0001150 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_04g0001330 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_04g0001270 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_04g0001120 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_04g0001300 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_04G001270 RBH 0.128141 0.0 0.145248
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_04g0001280 RBH 0.167515 0.0 0.0
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