Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsPr106_03g0022420 | OGI:03048770 | 16/16 | PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr03:19270616-19281124 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
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| Function | Mechanosensitive ion channel protein 2, chloroplastic [UniProtKB/Swiss-Prot:Q56X46] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsPr106_03g0022420 | OsPr106_03g0022420.03 | Chr03 | 19276602 | 19281124 | + | NAM | ||
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsPr106_03g0022420 | OsPr106_03g0022420.02 | Chr03 | 19273664 | 19281124 | + | NAM | ||
| CDS seq | atggacatgcgtaaccccaatgattcaagacgtatgggatttgacttcgcagtgaaagctgtttacactggtatttggattgctgctatatctctctttatggagttgctgggtttcaatacccaaaagtggattactgctggaggttttgggactgtgttgcttacacttgctggtcgtgagatctttacaaacttcctctcaagtgttatgatcaatgccacacgtccattcgtggtgaatgaatggatcaatacaaagatagatggtgttgaagtctctggtattgttgagcatgttggctggtggtcccctacaatcattagaggtgatgatagagaagctatatacattcctaaccataagttcacagtttctattttgagaaataacactcagaggacccattggcgtattaagacctacctggctttaagccacatggatgctgcgaaaattggtataattgttgcggacatgagaaaagtgttggcaaagaatccacatatagagcaacagaggctgcataggagagtaTtttttgagaaaattgatccaaaaacccaagctcttatgatttacatatcatgctttgtgaagacatctcattttgaggagtatctcaatgtccaggaagctgttatgttggatcttcttagaatagtcggccatcatagggcaaggcttgccacccagattcgaacagttcagaaatcttatggcaatgcagacatcgataacattccttttggagaggagatgtatagtcgtgtacgtggccgtccacttctgattgatacctctgcaaggattagcgatgacaagtctaagcctcgtccagcatcgcgtgaagatcataaagtcaagacagtcacttctgcagaggctaagtcagcttcagctgataatgctagtataagcaactccgagaagcaggaacagAaaaaatcagtaccAGAagatggtcgcatgaagaatagtaaaaatgatcatgcgacaacaacatcgccatcttctccatggtcagaaaatatggatcctattgcatcaacttccaaaactggtaaaggaaaaactcaaggagctgaggccacagaacgagaaggagatggcgctgtctctgttgctaattcaaagaaagaatcgagacccgtctttgaagacaacattgttctgggtttagctcttgagggatccaagaggacattaccaattgatgacggaatgaaccctcatctatcactttctgaaactgagcaagacacagttgaggctgcttcatcaccgaaggataagaaaggtcaagaaaaaggtgaccagaggaatcttgataggtga
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| Protein seq | MDMRNPNDSRRMGFDFAVKAVYTGIWIAAISLFMELLGFNTQKWITAGGFGTVLLTLAGREIFTNFLSSVMINATRPFVVNEWINTKIDGVEVSGIVEHVGWWSPTIIRGDDREAIYIPNHKFTVSILRNNTQRTHWRIKTYLALSHMDAAKIGIIVADMRKVLAKNPHIEQQRLHRRVFFEKIDPKTQALMIYISCFVKTSHFEEYLNVQEAVMLDLLRIVGHHRARLATQIRTVQKSYGNADIDNIPFGEEMYSRVRGRPLLIDTSARISDDKSKPRPASREDHKVKTVTSAEAKSASADNASISNSEKQEQKKSVPEDGRMKNSKNDHATTTSPSSPWSENMDPIASTSKTGKGKTQGAEATEREGDGAVSVANSKKESRPVFEDNIVLGLALEGSKRTLPIDDGMNPHLSLSETEQDTVEAASSPKDKKGQEKGDQRNLDR
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 46.837662 | 13.476806 | 38.538956 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_03g0432900 | RBH | 8.774753 | 6.201795 | 4.626122 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os03g31839 | RBH | 1.895255 | 1.435361 | 0.577113 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os03g0432900 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_03g0022710 | RBH | 4.867748 | 27.008316 | 12.003887 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_03g0022580 | RBH | 2.979053 | 7.960035 | 8.703860 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_03g0022650 | RBH | 5.578968 | 10.914566 | 20.141327 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_03g0022620 | RBH | 0.712566 | 0.524238 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_03G0299500 | RBH | 20.535128 | 35.9924565 | 39.0907345 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_03g0022170 | RBH | 1.664855 | 0.973142 | 4.140374 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_03G0303900 | RBH | 23.651741 | 30.746141 | 15.3583065 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_03g0022470 | RBH | 1.312108 | 0.584831 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_03g0022450 | RBH | 5.165863 | 15.762576 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_03g0022580 | RBH | 77.255836 | 35.093288 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_03g0022400 | RBH | 4.794798 | 2.218075 | 5.923697 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_03g0022250 | RBH | 1.757031 | 12.595103 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_03G022230 | RBH | 2.828985 | 6.213159 | 8.034290 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_03g0022140 | RBH | 17.894648 | 49.345177 | 37.381157 |
