Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsPr106_03g0018540 | OGI:03038210 | 13/16 | PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr03:14991426-15010419 | ||||||||
| Gene Symbol | GELP47, OsGELP47, GELP48, OsGELP48, GELP49, OsGELP49, GELP50, OsGELP50, OsGELP50a, OsGELP50b | ||||||||||
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| CDS seq | atggcttcttctaggtctagctccctctcctcgccgacgatgattcctgtactatttcttctctgcgcgcactccgccaccgctgctgccaactccggtggtggtggtcacctggcgaccggcgccggcggtgacgacggattcagctgcttcacgcgcatgttcagcttcggcgactccatcaccgacacgggtaactccgcgacgatcagccccaacgcctctttcaacaggctcccctacggcgagaccttcttcggccgccccaccggccgctatagcgacggcaggctcatcacggcggcggcggaggacttccggcatggggcgaacttcgcggtgggtggagcgacggcgctgaggcgggagttcttcgaggagatggggcttgacctcaccaacataccgccatactcgctggacgtgcaggtggaatggttcaagagcgtgctccactcgcttgcctccgcagacaaagaacgcaagaaaatcatgtctaaatcgatgtttataatgggggagattggaggaaacgactacaatcagcctttcttccaaaaccgatccttcatcaatgagatcaagccattggtaccaaaagttatatcgaagattgagaacgctatcaaggtcctaatcgacctaggagccaagacgattattgttccaggaaattttcctatagggtgtgttccaggttatctcgggatgtttcgaaacaagttaagtcctaaagactacgattaccacaaccatgcgctcaagcgcatgatgcatcggatccctcacgatcctacaatcactatactctacggtgactactacaataccgctttagagatcacccgtcaccctgccatacacgggttcaagagggagatcgtgtttgtggcatgctacaaggatggcaacttgtcaatgaatctttgccccgacccatcgacacacatatcatgggatgggttgcatctcactgaagccgcttacaagttcgtggcccatcacatgttgcacggaccatatttgttgaaccgtccatatcttctaaatgatttcatgcctttctccctctcgtcgccgatgacgacggtgatgctcctgctctttcttctcctctgcacgacgaattccgccaccgccgCcgccgtcgagtctgctgcaggtggcgatcaccggctggCgcccggcaacaatggcggctgcggcggcttcaagcgcatgttcagcttcggcgactccatcaccgacgccggtaacctcgcgaccatcagccctcccgacgcctctttcaacaggctcccctacggcgagaccttcttcggccaccccaccggccgcttctgcgacggcaggctcatcacaccggaggacttccggcagggggccaacttcgcggtggccggagcgacggcgctgagccaggacttcttcaagaagatggggctcgacctcaccatcataccgccattctcgctggacaactcaatcttaattgtatttacactgtcttgtgtagaacgcaaagaaattatgtctaaatccctatttctaatgggtgaggttggaggcaatgactataatcaccccttcttccagaaccgatcatttaccaatgagatcaagccattggtgccaaaagttatagccaagattgaaaatgccatcaaggtcctgattgatctaggagccaagacgattgtggttcctggaaatttccctatagggtgtgttccaaggtatcttacgatgttccagagcaagtcaagtccgcaagactacgatgaattcggatgcataaagtggttgaatgacttctcggtgtatcacaaccgtgcactaaaacggatgttgcaccagatccaccatgattcaacagttagcatactctatggtgattactacaacaccgctttagaaatcacccatcaccctgctgcctatgggttcaagaaggagaccgccttggttgcttgctgtggggatggtgggccctacaactccaactcattattcggttgcggtggcccgtcaacaaatctttgcactaatccatcgacatacatctcgtgggatgggctgcatcttactgaagccgcttacaaattcgtggcccatcacatgccaccctacggcgagaccttcttcggccaccccaccggccgctacagcgacggcaggctcgtcgtcgacttcctagcggaggcgctggggttgccgtacctgacggcgtacctccgggggaagacggcggaggacttccggcggggggccaacttcgcggtgtccgccgcgacggcgctgaggctggacttcttcagggaaagggggctcgacctcaccatcattccgccatactcgctggacgtgcagctggagtggttcaagggtgtgctccactcgctcgcctctactgaccaagagcgcaaggacattatgacaagatcgttattcctaatgggtgagataggcataaatgattacaaccatcacttcttccagaacagatcctttatagctgaaatcaaacccttagtgccactagtgatttcaaagattgaaaatgccaccaaggttttgatcgaccttggtgccaagaccatactggttccagggatcccgccaatgggctgcattccgaggtttctcaacttgctccctagcaagaaccacaatgactatgacaagcttggatgtctgaagtggctgaacgacttctctcactaccacaatcgtgctctcaaacaaatgttacaaaagattcatcatgattctaccgtcaccctgatctatgcagactactatggagcaatgttgaagatagttcgaagccctcagaacaatgggttcacgaaggagagcgttctgagggcgtgctgtggggtgggtggggcctacaacgccgactcgctggtgtgcaacggcaacgccacgacgtcgaacctgtgcacggagccgtccaggtacatctcctgggacggcctgcatctcaccgaggccgcctaccactacatcgcccgcggcgtgctgcatgggccgtacaccgagcctgccatacccaccagatgcacagcctga
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| Protein seq | MASSRSSSLSSPTMIPVLFLLCAHSATAAANSGGGGHLATGAGGDDGFSCFTRMFSFGDSITDTGNSATISPNASFNRLPYGETFFGRPTGRYSDGRLITAAAEDFRHGANFAVGGATALRREFFEEMGLDLTNIPPYSLDVQVEWFKSVLHSLASADKERKKIMSKSMFIMGEIGGNDYNQPFFQNRSFINEIKPLVPKVISKIENAIKVLIDLGAKTIIVPGNFPIGCVPGYLGMFRNKLSPKDYDYHNHALKRMMHRIPHDPTITILYGDYYNTALEITRHPAIHGFKREIVFVACYKDGNLSMNLCPDPSTHISWDGLHLTEAAYKFVAHHMLHGPYLLNRPYLLNDFMPFSLSSPMTTVMLLLFLLLCTTNSATAAAVESAAGGDHRLAPGNNGGCGGFKRMFSFGDSITDAGNLATISPPDASFNRLPYGETFFGHPTGRFCDGRLITPEDFRQGANFAVAGATALSQDFFKKMGLDLTIIPPFSLDNSILIVFTLSCVERKEIMSKSLFLMGEVGGNDYNHPFFQNRSFTNEIKPLVPKVIAKIENAIKVLIDLGAKTIVVPGNFPIGCVPRYLTMFQSKSSPQDYDEFGCIKWLNDFSVYHNRALKRMLHQIHHDSTVSILYGDYYNTALEITHHPAAYGFKKETALVACCGDGGPYNSNSLFGCGGPSTNLCTNPSTYISWDGLHLTEAAYKFVAHHMPPYGETFFGHPTGRYSDGRLVVDFLAEALGLPYLTAYLRGKTAEDFRRGANFAVSAATALRLDFFRERGLDLTIIPPYSLDVQLEWFKGVLHSLASTDQERKDIMTRSLFLMGEIGINDYNHHFFQNRSFIAEIKPLVPLVISKIENATKVLIDLGAKTILVPGIPPMGCIPRFLNLLPSKNHNDYDKLGCLKWLNDFSHYHNRALKQMLQKIHHDSTVTLIYADYYGAMLKIVRSPQNNGFTKESVLRACCGVGGAYNADSLVCNGNATTSNLCTEPSRYISWDGLHLTEAAYHYIARGVLHGPYTEPAIPTRCTA |
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| Function | GDSL esterase/lipase At1g31550 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9C857] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsPr106_03g0018540 | OsPr106_03g0018540.01 | Chr03 | 14991426 | 15010419 | + | NAM | ||
| CDS seq | atggcttcttctaggtctagctccctctcctcgccgacgatgattcctgtactatttcttctctgcgcgcactccgccaccgctgctgccaactccggtggtggtggtcacctggcgaccggcgccggcggtgacgacggattcagctgcttcacgcgcatgttcagcttcggcgactccatcaccgacacgggtaactccgcgacgatcagccccaacgcctctttcaacaggctcccctacggcgagaccttcttcggccgccccaccggccgctatagcgacggcaggctcatcacggcggcggcggaggacttccggcatggggcgaacttcgcggtgggtggagcgacggcgctgaggcgggagttcttcgaggagatggggcttgacctcaccaacataccgccatactcgctggacgtgcaggtggaatggttcaagagcgtgctccactcgcttgcctccgcagacaaagaacgcaagaaaatcatgtctaaatcgatgtttataatgggggagattggaggaaacgactacaatcagcctttcttccaaaaccgatccttcatcaatgagatcaagccattggtaccaaaagttatatcgaagattgagaacgctatcaaggtcctaatcgacctaggagccaagacgattattgttccaggaaattttcctatagggtgtgttccaggttatctcgggatgtttcgaaacaagttaagtcctaaagactacgattaccacaaccatgcgctcaagcgcatgatgcatcggatccctcacgatcctacaatcactatactctacggtgactactacaataccgctttagagatcacccgtcaccctgccatacacgggttcaagagggagatcgtgtttgtggcatgctacaaggatggcaacttgtcaatgaatctttgccccgacccatcgacacacatatcatgggatgggttgcatctcactgaagccgcttacaagttcgtggcccatcacatgttgcacggaccatatttgttgaaccgtccatatcttctaaatgatttcatgcctttctccctctcgtcgccgatgacgacggtgatgctcctgctctttcttctcctctgcacgacgaattccgccaccgccgCcgccgtcgagtctgctgcaggtggcgatcaccggctggCgcccggcaacaatggcggctgcggcggcttcaagcgcatgttcagcttcggcgactccatcaccgacgccggtaacctcgcgaccatcagccctcccgacgcctctttcaacaggctcccctacggcgagaccttcttcggccaccccaccggccgcttctgcgacggcaggctcatcacaccggaggacttccggcagggggccaacttcgcggtggccggagcgacggcgctgagccaggacttcttcaagaagatggggctcgacctcaccatcataccgccattctcgctggacaactcaatcttaattgtatttacactgtcttgtgtagaacgcaaagaaattatgtctaaatccctatttctaatgggtgaggttggaggcaatgactataatcaccccttcttccagaaccgatcatttaccaatgagatcaagccattggtgccaaaagttatagccaagattgaaaatgccatcaaggtcctgattgatctaggagccaagacgattgtggttcctggaaatttccctatagggtgtgttccaaggtatcttacgatgttccagagcaagtcaagtccgcaagactacgatgaattcggatgcataaagtggttgaatgacttctcggtgtatcacaaccgtgcactaaaacggatgttgcaccagatccaccatgattcaacagttagcatactctatggtgattactacaacaccgctttagaaatcacccatcaccctgctgcctatgggttcaagaaggagaccgccttggttgcttgctgtggggatggtgggccctacaactccaactcattattcggttgcggtggcccgtcaacaaatctttgcactaatccatcgacatacatctcgtgggatgggctgcatcttactgaagccgcttacaaattcgtggcccatcacatgccaccctacggcgagaccttcttcggccaccccaccggccgctacagcgacggcaggctcgtcgtcgacttcctagcggaggcgctggggttgccgtacctgacggcgtacctccgggggaagacggcggaggacttccggcggggggccaacttcgcggtgtccgccgcgacggcgctgaggctggacttcttcagggaaagggggctcgacctcaccatcattccgccatactcgctggacgtgcagctggagtggttcaagggtgtgctccactcgctcgcctctactgaccaagagcgcaaggacattatgacaagatcgttattcctaatgggtgagataggcataaatgattacaaccatcacttcttccagaacagatcctttatagctgaaatcaaacccttagtgccactagtgatttcaaagattgaaaatgccaccaaggttttgatcgaccttggtgccaagaccatactggttccagggatcccgccaatgggctgcattccgaggtttctcaacttgctccctagcaagaaccacaatgactatgacaagcttggatgtctgaagtggctgaacgacttctctcactaccacaatcgtgctctcaaacaaatgttacaaaagattcatcatgattctaccgtcaccctgatctatgcagactactatggagcaatgttgaagatagttcgaagccctcagaacaatgggttcacgaaggagagcgttctgagggcgtgctgtggggtgggtggggcctacaacgccgactcgctggtgtgcaacggcaacgccacgacgtcgaacctgtgcacggagccgtccaggtacatctcctgggacggcctgcatctcaccgaggccgcctaccactacatcgcccgcggcgtgctgcatgggccgtacaccgagcctgccatacccaccagatgcacagcctga
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| Protein seq | MASSRSSSLSSPTMIPVLFLLCAHSATAAANSGGGGHLATGAGGDDGFSCFTRMFSFGDSITDTGNSATISPNASFNRLPYGETFFGRPTGRYSDGRLITAAAEDFRHGANFAVGGATALRREFFEEMGLDLTNIPPYSLDVQVEWFKSVLHSLASADKERKKIMSKSMFIMGEIGGNDYNQPFFQNRSFINEIKPLVPKVISKIENAIKVLIDLGAKTIIVPGNFPIGCVPGYLGMFRNKLSPKDYDYHNHALKRMMHRIPHDPTITILYGDYYNTALEITRHPAIHGFKREIVFVACYKDGNLSMNLCPDPSTHISWDGLHLTEAAYKFVAHHMLHGPYLLNRPYLLNDFMPFSLSSPMTTVMLLLFLLLCTTNSATAAAVESAAGGDHRLAPGNNGGCGGFKRMFSFGDSITDAGNLATISPPDASFNRLPYGETFFGHPTGRFCDGRLITPEDFRQGANFAVAGATALSQDFFKKMGLDLTIIPPFSLDNSILIVFTLSCVERKEIMSKSLFLMGEVGGNDYNHPFFQNRSFTNEIKPLVPKVIAKIENAIKVLIDLGAKTIVVPGNFPIGCVPRYLTMFQSKSSPQDYDEFGCIKWLNDFSVYHNRALKRMLHQIHHDSTVSILYGDYYNTALEITHHPAAYGFKKETALVACCGDGGPYNSNSLFGCGGPSTNLCTNPSTYISWDGLHLTEAAYKFVAHHMPPYGETFFGHPTGRYSDGRLVVDFLAEALGLPYLTAYLRGKTAEDFRRGANFAVSAATALRLDFFRERGLDLTIIPPYSLDVQLEWFKGVLHSLASTDQERKDIMTRSLFLMGEIGINDYNHHFFQNRSFIAEIKPLVPLVISKIENATKVLIDLGAKTILVPGIPPMGCIPRFLNLLPSKNHNDYDKLGCLKWLNDFSHYHNRALKQMLQKIHHDSTVTLIYADYYGAMLKIVRSPQNNGFTKESVLRACCGVGGAYNADSLVCNGNATTSNLCTEPSRYISWDGLHLTEAAYHYIARGVLHGPYTEPAIPTRCTA
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|||||||
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsPr106_03g0018540 | OsPr106_03g0018540.02 | Chr03 | 15005893 | 15006113 | + | IsoSeq | ||
| CDS seq | atgatctacGTgtacaataggcatttaaaaagaacatataatagtgccaacaactttaataaattatatggtgtatcgaaggtgtgtgtgtgcgtctacatgtcttgcaattta |
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| Protein seq | MIYVYNRHLKRTYNSANNFNKLYGVSKVCVCVYMSCNL |
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.0 | 49.711449 | 0.0 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_03g0365800 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os03g25000 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os03g0365900 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_03g0018900 | RBH | 0.0 | 119.863190 | 0.818982 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_03g0018700 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_03g0018730 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_03g0018810 | RBH | 0.0 | 1.533180 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_07g0025060 | RBH | 0.0 | 40.512970 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_03G0236900 | RBH | 0 | 4.73883 | 0 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_03g0018380 | RBH | 0.0 | 6.774908 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_03G0237500 | RBH | 0.0205165 | 5.1271325 | 0.0417685 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_03g0018610 | RBH | 0.0 | 0.242810 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_03g0018640 | RBH | 0.0 | 4.102570 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_03g0018670 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_03g0018540 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_03g0018450 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_03G018490 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_03g0018430 | RBH | 0.0 | 89.777557 | 0.0 |
