Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsPr106_02g0030120 OGI:02081910 | 16/16 PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr02:31070669-31079334
Gene Symbol -
DNA seq

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Function Dual specificity protein kinase YAK1 homolog [UniProtKB/Swiss-Prot:Q8RWH3]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsPr106_02g0030120 OsPr106_02g0030120.05 Chr02 31070855 31079016 - NAM
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MEVSWEVDAAGPPWRPSESTAFLPFAAAAAAGDRAGASLSGRRNGLAARSSNLSSVRKRPFVARLTTDIVQTFGKCNPEFKYSDSLNPKRFLTNPSVPAHNDGLDNANSDLILYVNLELVNKKSDRRYVIKEMLGQGTFGQVAKCWDGETNSYVAVKVIKNQPAFYQQAIMEVSLLSMLNEKYDPDDQHHIVRMLDFFLYQNHLCIAFEMLGHNLYELLKRNSLRGLQLKYVRTFSRQILDALVVMKDAGIIHCDLKPENILITPNVKTAAGVKVIDFGSACLEGKTIYSYIQSRYYRSPEVLLGYPYTTAIDMWSFGCIVAELYIGLPLFPGASEYDVLCRMIEILGGQPPDDLLREAKNTGRFFKQVGSIYPGIEMQNGPISAYRILTEEEIETRESKKPKVGRWYFPRGRLDKLIYTYPWKNLNGENLPETEKTDRLALVDFLRGLVEFDPNKRWSPLQASYHPFITGEAFTGPYEPIQETPRIPVGRVAAVDHNPGGGHWLAAGLSPQVVGSINRGLPFNNAFAPKIPFSYGSSCGSFGSHGSFNDNVGLASSYGSYDVNSVNMYHSPLGPSGFNLHSQAGGTFLGSSPDIRRRSYLYHGGGIRLSPGCPGPMSLGASPSQFTPPSSQMQIPSTATGKYGSTSPARSSHGSLGKAAAVGQYNRRRNLGHPPISMPPHEYTSQLIQGHHGDGTISNHFDGYARGHSGYPQSALPNPGHFSWRPHTCAGSGLSTDTSNHGSFPPSRYGGFHPSHSSNVSADTLASTSSIPDPADWDPNYSEESLLQEDTSLSDALSDLHLKDASGQTNQSSRLAHIQSHAIANSNSLSMNQRGDHLFHASTLTETSASTGHVTYDGYHNANYSQLNFQSRHGQPFQRYNHMTASYLRPMGNHHNGQPVWPNYGMAEPPPATMADGMPWGGRPGHSFTAGGLPSSFAGKDFGRIF

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsPr106_02g0030120 OsPr106_02g0030120.07 Chr02 31070713 31079298 - IsoSeq
CDS seq

acggagacgagcaaggaaagggaagagagaagagacgaaacagggaggaggggattgggactcgccgcccccctctccaaattccccactcctcctcctccgcctccgcctccgccgccgccgcagcctatcccctcgccaatccggcgaggtagaggagtgggtctcttctcgtgctctccccaaaaccccgcgcgcccaattcaccggggtcccgagctcccggcggaggctcgggagcgggagcgggcaggggcggaggagatcggatcgggggaggggggagcattgggcgatgaccgccgcctaggatgcagctggactccgccggcggcc

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Protein seq

TETSKEREERRDETGRRGLGLAAPLSKFPTPPPPPPPPPPPQPIPSPIRRGRGVGLFSCSPQNPARPIHRGPELPAEARERERAGAEEIGSGEGGALGDDRRLGCSWTPPAA

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
A3 Chr02 31071842 31072491 - OsPr106_02g0030120.02,OsPr106_02g0030120.03,OsPr106_02g0030120.01,OsPr106_02g0030120.04,OsPr106_02g0030120.05,OsPr106_02g0030120.06 OsPr106_02g0030120.05,OsPr106_02g0030120.06,OsPr106_02g0030120.07,OsPr106_02g0030120.04,OsPr106_02g0030120.03,OsPr106_02g0030120.01,OsPr106_02g0030120.02 All
A3 Chr02 31074644 31075170 - OsPr106_02g0030120.02,OsPr106_02g0030120.01,OsPr106_02g0030120.07,OsPr106_02g0030120.04,OsPr106_02g0030120.05,OsPr106_02g0030120.06 OsPr106_02g0030120.05,OsPr106_02g0030120.06,OsPr106_02g0030120.07,OsPr106_02g0030120.04,OsPr106_02g0030120.03,OsPr106_02g0030120.01,OsPr106_02g0030120.02 All
SE Chr02 31075521 31076010 - OsPr106_02g0030120.02,OsPr106_02g0030120.03,OsPr106_02g0030120.01,OsPr106_02g0030120.07,OsPr106_02g0030120.04,OsPr106_02g0030120.05 OsPr106_02g0030120.05,OsPr106_02g0030120.06,OsPr106_02g0030120.07,OsPr106_02g0030120.04,OsPr106_02g0030120.03,OsPr106_02g0030120.01,OsPr106_02g0030120.02 All
A5 Chr02 31073527 31073615 - OsPr106_02g0030120.02,OsPr106_02g0030120.03,OsPr106_02g0030120.05,OsPr106_02g0030120.06 OsPr106_02g0030120.05,OsPr106_02g0030120.06,OsPr106_02g0030120.07,OsPr106_02g0030120.04,OsPr106_02g0030120.03,OsPr106_02g0030120.01,OsPr106_02g0030120.02 All
A5 Chr02 31071098 31071636 - OsPr106_02g0030120.04,OsPr106_02g0030120.05,OsPr106_02g0030120.06 OsPr106_02g0030120.05,OsPr106_02g0030120.06,OsPr106_02g0030120.07,OsPr106_02g0030120.04,OsPr106_02g0030120.03,OsPr106_02g0030120.01,OsPr106_02g0030120.02 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 8.595070 25.236368 35.179688

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_02g0702500 RBH 3.720476 4.216790 13.578030
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os02g47410 RBH 1.581101 2.654486 1.916073
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os02g0702500 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_02g0030360 RBH 1.157928 36.060303 14.000238
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_02g0030450 RBH 0.582832 6.248534 6.404053
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_02g0030340 RBH 2.759409 26.297054 19.480936
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_02g0029900 RBH 0.404250 0.737670 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_04g0026030 RBH 9.364347 38.016792 33.546432
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_02G0472800 RBH 11.6157415 42.0196745 27.314331
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_02g0029900 RBH 0.893826 1.897837 2.846925
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_02G0499900 RBH 13.886797 38.706154 31.935465
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_02g0030210 RBH 0.535488 0.581497 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_02g0029970 RBH 0.830494 20.802877 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_02g0030290 RBH 7.059385 44.276962 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_02g0030140 RBH 1.671715 4.725190 4.294763
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_02g0029790 RBH 0.877277 18.237299 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_02G030380 RBH 0.766617 7.153334 6.368319
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_02g0030140 RBH 3.593999 50.139019 16.074156
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