Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsPr106_01g0036480 | OGI:01103130 | 16/16 | PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr01:35541524-35565659 | ||||||||
Gene Symbol | RLCK46, OsRLCK46 | ||||||||||
DNA seq | 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Protein seq | MNPSQASLSVYAGFTNIDCGYVDGVSYTDSMTNLTYVTDHEFVAGGINHVVVPKLISGSTDEQEKTLRSFPDGQRNCYTIPSTSGKKYLIRATFTYGNYDGLRSSENGSLFLFGLHVGVNFWTTVNLTNWDSSSTVWKEVITVAPDKSISVCLINLGSGTPFISTLELRKLGDAMYPFVNASTSVSYFSRLRFGSSDEYITRFPTDPSDRFWESWVFYNNTFPWVNMSSNGKVAALPNIDTFGLPQDILGNASTINGNYSWLNITIGASNSLATDLELLPVFHFVELGNNGSKRIFDIYNVDEPKPLFTNFRPPDFLSSMFNNWFLHKGRRATFQLRKTADSQLPPLINAYEVYSRVQVENFTTASSDVDSMKTIKEKYMVIKNWNGDPCSPREYVWNGLTCTYPNGGQNPRIIEINLSGSGLQGELEISFMKMSSLKKLDLSHNNLTGTIPDYQVNSLTVIDLSNNQLNGSIPDSILQRYKAGLLELRLEGNPICTKVRASYCGNKKNTRTRILLISVLVPVTSLLVVLFIFWRLCWKGKSRKSEDDYDMYEEETPLHIDIRRFTYAELKLITNNFQSIIGKGGFGTVYHGILENNDEVAVKVLVETSIAESKDFLPEVQTLSKVHHKNLVALVGYCQNKKCLALVYDFMPRGNLQQLLRGGYDSLNWEERLHIALDAAQGLEYLHESCTPSTVHRDVKTPNILLDKNLVAKISDFGLSRAFNAAHTHISTVAAGTLGYLDPEYHATFQLTVKTDVYSFGIVLLEIVTGQPPVFMDPQTVHLPNWVRQKIANGSVHDVVDKKLLDQYDATHLQTVIDLAMNCLENASIDRPSMTEVVSVLKVCLPISSERQSATSTPRKKNVMDAEIPRQFQLMISGASTTSYEGSSFQSGYTGFLSIDCGYTDSADYVDKNTTLTYVSDKGYVEGGKNFSILAQYMKDATNKQEETLRSFPDGQRNCYTLPTNRSKKYLIRATFTYGNYDGRNSSESGSPFLFGLHIGINFWTMVNLTKLPSSDTVWKELIMVAPDNFISVCLINNGSGIPFISTLDLRPLQDTMYPFVNVSVAVSYFSRLRFGQVNDVITRYPEDVYDRFWEGAFHTRSYPWIDLSTTQEVKRLPGDEKFMVPTTILQKASTIDSKYSWLNITVRGADNLLGSGDLELLPIFHFAEIASTTRLFDIYSDGEELFTSFSPSPFQVDSMYQNGRFLRRVNSTFTLRKQPTSQLPPPLINAFEVYSLVRIATASDDGEQNSGLNSDIFVYTLYSRAKWIEPFVNCDLAGKSKEHDDYDIYEEDTPLHTDTRRFTYTELKTITNNFQSIIGKGGFGMVYHGILDNGEEVAVKVLRETSITLSKDFLPEVQILSKVQHKNLVTFLGYCHNKKCLALVYDFMARGNLQEVLRGGQEYSLSWEERLHIALDAAHGLEYLHESCTPPIVHRDVKTANILLDKNLVAMISDFGLSRSYTPAHTHISTVAAGTVGYLDPEYHATFHLTVKADVYSFGIVLLEIITGQPSVLVDSEPVHLPNWVHQKIAEGSIHDAVDSRLRHQYDATSVQSVIDLAMSCVENTSIDRPSMTDIVIKLKECLPAGTGEMQLVSRSYKQKEAMDADIVRQFQLPISGVSIESIEGNSSGTTELRYPSGRSAMALGLPNNFSHLDDSGFTNIDCGFVDGESYTDSTTNLTYVPDHEFVEGGTHHVVVPKLISGSTDEQEKTLRSFPDGQRNCYTIPSTSGKKYLIRATFTYRNYDGLRSSENGSLFLFGLHVGVNFWTTVNLTKQNSSDTIWKEVLTVAPDEFISVCLVNFGSGTPFISALELRQLDDPMYPFLNLSVSVSYFTRQRFGAVDDFITRYPTDLFDRFWEAAQLYSYPWLNLTTNQTVNKLPGNDNFQVSTLILQKASTINSSFSWLNISVRAGDNLNGQSLELLPIFHFAEIEKNRSKRTFQIYSDGVELHQAFSPSYLQVDSVYPRDRYLHESGTTFTLRKTNSSELPPLINAFEAYSLVRMENLTTDTIDVSSMKQVKMQYNVQRRSWNGDPCSPKEYTWEGVKCNYYDGKQNPRIILVNLSASRLSGWINPSFRNMSLEILDLSHNNLSGTIPYNQVNSLKSLNLSYNQLSGSIPDYLFERYKAGLLELRLEGNPMCSNISESYCATQADKAKKNTSTLGNSPAYTDTRRFTYTELRTITNNFQSIVGKGGFGTVYHGILGNGEEVAVKVQTLSKVHHKNLVTFLGYCQNKKCLALVYDFMSRGNLQEVLRGGQDYSLSWEERLHIALDAAQGLEYLHESCTPAIVHRDVKTANILLDENLVAMISDFGLSRSYTPAHTHISTIAAGTVGYLDPEYHATFQLTVKADIYSFGIVLLEIITGQPSVLVDPEPVHLPNWVRQKIARGSIHDAVDSRLMHQYDATSVQSVIDLAMNCVGNVSIDRPSMTDIVIKLKECLLAGTGEKQLVSGSYKQKGALDADIARQFQLLISGVPIVSNECISSGITELSYYSGRSTVEQVGAGEKQLVSRSYKQKDAMNADMAREFQLLISGVSIESNEGASSGTTKLSYPLGRMKMAVPVLHIEKR |
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Function | Putative leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At2g19210 [UniProtKB/Swiss-Prot:O65924] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsPr106_01g0036480 | OsPr106_01g0036480.01 | Chr01 | 35541524 | 35565659 | - | NAM | ||
CDS seq | atgaatccctcacaagcatctctctctgtatatgcagggttcacaaacatcgactgcggctacgtagacggcgtgagttacacggacagcatgacaaatttaacgtatgtaactgatcatgaattcgttgcaggcggcataaaccatgtagttgtgccgaagctaattagtggatctacggatgagcaagaaaagaccttgagaagcttccctgatggccaacgcaactgttacacaataccgtccactagtggtaagaagtatctcatcagagccaccttcacttacggaaactacgatggactcaggtcgtcagagaacggttctctgtttctttttggactccatgtcggcgtcaacttctggacgacggtaaacttgacaaactgggattcatcgagcacggtctggaaagaggtgatcacggttgctccggacaagtccatatctgtctgtctgataaacttgggatcaggaactcccttcatatctacattggagttgaggaaattgggtgatgcaatgtatcccttcgtgaatgcttctacgtccgtcagttactttagccggttaagatttggatcgagcgatgaatacatcacaagatttccaacagatccttctgatcgcttctgggagagctgggtcttttacaataacacctttccatgggttaatatgagtagcaacggcaaggtggctgcacttcctaatattgacacctttgggcttcctcaagacatcctgggaaacgcttcaaccataaacggaaactactcttggctcaacatcaccattggtgccagtaactctctcgcaacagacctagagcttcttccagtctttcactttgttgaactcggcaataatggttcaaagagaatttttgacatctacaatgttgatgaaccgaaaccgctgttcaccaacttcaggcctccagatttcctaagctccatgttcaacaactggttcttgcacaaaggcaggcgggcaacttttcagcttcggaagaccgcagactcgcagctaccacctcttattaacgcatatgaggtgtactcccgtgtccaggtggagaacttcaccactgcttcaagtgatgttgactccatgaaaacaatcaaagagaagtacatggtaatcaaaaactggaacggggatccatgctcaccaagagagtacgtctggaatggtttgacttgcacctaccctaatggtggccagaacccaaggattattgaaataaatctatctggcagcggtctgcaaggagagttagaaatatcattcatgaaaatgtcatcactgaagaaattggatttatcacacaacaacctgacaggcaccattccggactatcaagtaaattccctcacagttattgacttgtctaataaccagctcaatggatccatccctgattctattcttcaaagatacaaagccggtttgcttgagctaagactagaaggcaatcccatatgcaccaaagtcagagctagctactgtggaaataagaagaacacacgcacacgtattttgctcatcagtgtgttagttcctgtgacatctctcctagtggtgctgttcatattctggaggttatgctggaaagggaagtcaagaaaatcagaagatgattatgatatgtatgaagaggagactcccctacatatcgacatcagacggttcacatatgcagagctgaagctcataactaacaatttccaatcaatcattggaaaaggaggttttggtactgtttatcatggcatactggaaaataatgatgaagtagctgttaaggtgcttgtggagacatccatagcagagtcaaaagactttctccctgaggtacaaaccttgtcaaaagttcatcacaagaatcttgtcgctttggtagggtattgccaaaacaagaagtgccttgcacttgtttatgatttcatgcctagaggaaatcttcaacagcttttaagaggaggatatgacagtttgaattgggaagagcgacttcacattgcacttgacgctgcacaaggtctggaataccttcatgaatcatgcaccccatcaacagttcacagagatgtgaagacacccaacatccttctggacaagaatctggtggccaagatatctgattttgggctttcacgggcttttaatgctgctcacacgcatatatctactgttgctgctggcactcttggttaccttgaccctgagtaccatgccactttccagcttactgttaagacagacgtttacagtttcggaatcgtcctcttggagattgtgactggtcaaccccCggtattcatggaccctcaaaccgtccacctgccaaattgggtgcgacaaaagattgctaatgggagcgttcacgatgttgtggacaagaagctgttggatcagtatgatgccacgcacctgcagactgtgatagacctcgccatgaactgtcttgaaaacgcatcgattgacaggccaagcatgaccgaggttgtttccgtgcttaaggtgtgcttgccgatttcaagcgagagacaatcggcaacttcaacccctcgaaagaagaacgtcatggatgcagagattccaagacagttccagttgatgatttctggagcttcaacaacaagctacgagggcagctcctttcagtctggatataccgggtttttaagcatcgactgcggatatacagatagtgctgactatgtcgacaagaacacaacgttgacatatgtttctgacaaaggatatgtcgagggcggcaagaacttcagtattttggcacagtacatgaaagatgctacaaataagcaagaagaaaccctgaggagcttccctgatggccaacggaactgttatacattaccaaccaaccgtagcaagaagtatctcatcagagccaccttcacttacgggaactacgatggccgcaactcatcagagagtggttcaccgtttctctttggactccatatcggcatcaacttctggacaatggtgaacctgacaaaattgccttcatcggacacagtctggaaagagctgatcatggtcgctccagacaatttcatatctgtttgtctgataaacaatggatcgggaattcccttcatatcaacattggacttgaggcccttgcaagatacaatgtacccctttgtgaatgtttccgtggccgtcagctatttttctcggctaagatttggacaagtcaatgatgtcatcactagatatccagaggatgtttacgaccggttttgggagggagcgttccacaccagatcctatccctggatcgaccttagcacaacacaagaagtgaaaaggctcccaggcgacgaaaagttcatggtgccgactaccatcctccagaaagcttcaaccatagacagcaaatacagttggctcaacatcacagtgaggggcgccgacaacctgcttggctccggggatctggagctgctaccaatctttcactttgctgagatagccagcacgaccaggttgttcgatatctacagcgacggcgaggagctgttcaccagcttctcaccatcccccttccaggtggacagcatgtaccaaaatggccggttcttgcgcagggtgaactcaactttcaccttgcgcaagcagcccacatcgcagctcccaccaccgctcatcaacgcgttcgaggtgtattcacttgtccggatagctactgcttctgatgatggtgaacaaaacagtgggttaaattcagatattttcgtgtatacactatacagtagagcaaagtggattgagccatttgtgaattgtgacttagcaggaaaatcaaaagaacatgatgattatgatatatatgaagaggatactcccctgcatactgacaccagaagattcacatatacagagttgaagactataactaacaacttccagtctatcattggaaaaggaggatttggtatggtttatcatggcatattggacaatggagaggaagtggcagtcaaggtgcttcgggagacatctataacactatcaaaggacttcctccctgaggtgcaaatattgtcaaaagttcaacacaagaatctcgtcacgtttttaggatattgccacaacaagaaatgccttgcccttgtgtacgatttcatggctagaggaaacctacaagaagttttaagaggaggacaagaatacagtttgagctgggaagagcgacttcacattgcacttgatgcagcacacggactggagtatctgcatgaatcatgcaccccgccaatagttcacagagatgtgaaaactgcaaacattctcctggataagaatcttgtggccatgatatctgactttggtctttcacgatcttacactccagcgcacacacacatatcaactgttgctgccggtactgttggctaccttgaccctgagtaccatgctactttccacctcactgtgaaagcagatgtctacagcttcggcattgtcctcttggagatcattactggccaaccttcagtgttagtggactcagaaccagtgcacctaccaaactgggtgcaccaaaagattgctgaagggagcattcatgatgctgtagacagtagactaaggcatcagtatgatgccacttccgtacagagcgtcatagaccttgccatgagctgtgtggaaaacacatccattgataggccgagcatgactgacattgttatcaagctcaaagaatgcctaccggcaggtacaggtgaaatgcaactggtgtctaggtcctataaacagaaggaagccatggacgctgacatagtgaggcaattccagctgccgatttctggagtttcaatagaaagcattgagggcaactcaagtgggaccacagaattaagatatccttcgggaagaagcgcgatggctcttggccttccaaataattttagccacctcgatgattcagggttcacaaacattgactgtggcttcgt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Protein seq | MNPSQASLSVYAGFTNIDCGYVDGVSYTDSMTNLTYVTDHEFVAGGINHVVVPKLISGSTDEQEKTLRSFPDGQRNCYTIPSTSGKKYLIRATFTYGNYDGLRSSENGSLFLFGLHVGVNFWTTVNLTNWDSSSTVWKEVITVAPDKSISVCLINLGSGTPFISTLELRKLGDAMYPFVNASTSVSYFSRLRFGSSDEYITRFPTDPSDRFWESWVFYNNTFPWVNMSSNGKVAALPNIDTFGLPQDILGNASTINGNYSWLNITIGASNSLATDLELLPVFHFVELGNNGSKRIFDIYNVDEPKPLFTNFRPPDFLSSMFNNWFLHKGRRATFQLRKTADSQLPPLINAYEVYSRVQVENFTTASSDVDSMKTIKEKYMVIKNWNGDPCSPREYVWNGLTCTYPNGGQNPRIIEINLSGSGLQGELEISFMKMSSLKKLDLSHNNLTGTIPDYQVNSLTVIDLSNNQLNGSIPDSILQRYKAGLLELRLEGNPICTKVRASYCGNKKNTRTRILLISVLVPVTSLLVVLFIFWRLCWKGKSRKSEDDYDMYEEETPLHIDIRRFTYAELKLITNNFQSIIGKGGFGTVYHGILENNDEVAVKVLVETSIAESKDFLPEVQTLSKVHHKNLVALVGYCQNKKCLALVYDFMPRGNLQQLLRGGYDSLNWEERLHIALDAAQGLEYLHESCTPSTVHRDVKTPNILLDKNLVAKISDFGLSRAFNAAHTHISTVAAGTLGYLDPEYHATFQLTVKTDVYSFGIVLLEIVTGQPPVFMDPQTVHLPNWVRQKIANGSVHDVVDKKLLDQYDATHLQTVIDLAMNCLENASIDRPSMTEVVSVLKVCLPISSERQSATSTPRKKNVMDAEIPRQFQLMISGASTTSYEGSSFQSGYTGFLSIDCGYTDSADYVDKNTTLTYVSDKGYVEGGKNFSILAQYMKDATNKQEETLRSFPDGQRNCYTLPTNRSKKYLIRATFTYGNYDGRNSSESGSPFLFGLHIGINFWTMVNLTKLPSSDTVWKELIMVAPDNFISVCLINNGSGIPFISTLDLRPLQDTMYPFVNVSVAVSYFSRLRFGQVNDVITRYPEDVYDRFWEGAFHTRSYPWIDLSTTQEVKRLPGDEKFMVPTTILQKASTIDSKYSWLNITVRGADNLLGSGDLELLPIFHFAEIASTTRLFDIYSDGEELFTSFSPSPFQVDSMYQNGRFLRRVNSTFTLRKQPTSQLPPPLINAFEVYSLVRIATASDDGEQNSGLNSDIFVYTLYSRAKWIEPFVNCDLAGKSKEHDDYDIYEEDTPLHTDTRRFTYTELKTITNNFQSIIGKGGFGMVYHGILDNGEEVAVKVLRETSITLSKDFLPEVQILSKVQHKNLVTFLGYCHNKKCLALVYDFMARGNLQEVLRGGQEYSLSWEERLHIALDAAHGLEYLHESCTPPIVHRDVKTANILLDKNLVAMISDFGLSRSYTPAHTHISTVAAGTVGYLDPEYHATFHLTVKADVYSFGIVLLEIITGQPSVLVDSEPVHLPNWVHQKIAEGSIHDAVDSRLRHQYDATSVQSVIDLAMSCVENTSIDRPSMTDIVIKLKECLPAGTGEMQLVSRSYKQKEAMDADIVRQFQLPISGVSIESIEGNSSGTTELRYPSGRSAMALGLPNNFSHLDDSGFTNIDCGFVDGESYTDSTTNLTYVPDHEFVEGGTHHVVVPKLISGSTDEQEKTLRSFPDGQRNCYTIPSTSGKKYLIRATFTYRNYDGLRSSENGSLFLFGLHVGVNFWTTVNLTKQNSSDTIWKEVLTVAPDEFISVCLVNFGSGTPFISALELRQLDDPMYPFLNLSVSVSYFTRQRFGAVDDFITRYPTDLFDRFWEAAQLYSYPWLNLTTNQTVNKLPGNDNFQVSTLILQKASTINSSFSWLNISVRAGDNLNGQSLELLPIFHFAEIEKNRSKRTFQIYSDGVELHQAFSPSYLQVDSVYPRDRYLHESGTTFTLRKTNSSELPPLINAFEAYSLVRMENLTTDTIDVSSMKQVKMQYNVQRRSWNGDPCSPKEYTWEGVKCNYYDGKQNPRIILVNLSASRLSGWINPSFRNMSLEILDLSHNNLSGTIPYNQVNSLKSLNLSYNQLSGSIPDYLFERYKAGLLELRLEGNPMCSNISESYCATQADKAKKNTSTLGNSPAYTDTRRFTYTELRTITNNFQSIVGKGGFGTVYHGILGNGEEVAVKVQTLSKVHHKNLVTFLGYCQNKKCLALVYDFMSRGNLQEVLRGGQDYSLSWEERLHIALDAAQGLEYLHESCTPAIVHRDVKTANILLDENLVAMISDFGLSRSYTPAHTHISTIAAGTVGYLDPEYHATFQLTVKADIYSFGIVLLEIITGQPSVLVDPEPVHLPNWVRQKIARGSIHDAVDSRLMHQYDATSVQSVIDLAMNCVGNVSIDRPSMTDIVIKLKECLLAGTGEKQLVSGSYKQKGALDADIARQFQLLISGVPIVSNECISSGITELSYYSGRSTVEQVGAGEKQLVSRSYKQKDAMNADMAREFQLLISGVSIESNEGASSGTTKLSYPLGRMKMAVPVLHIEKR
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|
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.628185 | 2.188874 | 2.062449 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_01g0810600 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.231799 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os01g59550 | RBH | 0.662675 | 0.506416 | 0.291896 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os01g0810500 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_01g0037580 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.486313 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_01g0037050 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.168354 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_01g0037460 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_01g0036850 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_05g0020000 | SBH | 0.0 | 13.621537 | 9.968404 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_01G0570000 | RBH | 0.593437 | 14.7712325 | 3.906639 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_01g0036230 | SBH | 0.020083 | 2.717001 | 0.266008 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_01G0566100 | RBH | 0.9547055 | 1.559824 | 2.760558 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_01g0036370 | RBH | 0.028537 | 0.015554 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_01g0036510 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_01g0036720 | RBH | 0.0 | 37.811909 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_01g0036800 | RBH | 0.076859 | 0.748156 | 0.240195 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_01g0036520 | RBH | 0.101131 | 0.000000 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_01G037010 | RBH | 0.147227 | 0.431405 | 0.309355 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_01g0036750 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.272363 |