Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsPr106_01g0036480 OGI:01103130 | 16/16 PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr01:35541524-35565659
Gene Symbol RLCK46, OsRLCK46
DNA seq

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Function Putative leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At2g19210 [UniProtKB/Swiss-Prot:O65924]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsPr106_01g0036480 OsPr106_01g0036480.01 Chr01 35541524 35565659 - NAM
CDS seq

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Protein seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.628185 2.188874 2.062449

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_01g0810600 RBH 0.000000 0.000000 0.231799
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os01g59550 RBH 0.662675 0.506416 0.291896
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os01g0810500 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_01g0037580 RBH 0.0 0.000000 0.486313
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_01g0037050 RBH 0.0 0.000000 0.168354
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_01g0037460 RBH 0.0 0.0 0.000000
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_01g0036850 RBH 0.0 0.000000 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_05g0020000 SBH 0.0 13.621537 9.968404
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_01G0570000 RBH 0.593437 14.7712325 3.906639
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_01g0036230 SBH 0.020083 2.717001 0.266008
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_01G0566100 RBH 0.9547055 1.559824 2.760558
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_01g0036370 RBH 0.028537 0.015554 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_01g0036510 RBH 0.000000 0.000000 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_01g0036720 RBH 0.0 37.811909 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_01g0036800 RBH 0.076859 0.748156 0.240195
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_01g0036520 RBH 0.101131 0.000000 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_01G037010 RBH 0.147227 0.431405 0.309355
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_01g0036750 RBH 0.0 0.0 0.272363
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