Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsNip_05g0577800 OGI:05077930 | 16/16 Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) Chr05:28767438-28774079
Gene Symbol -
DNA seq

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Function -

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsNip_05g0577800 OsNip_05t0577800-01 Chr05 28767438 28774079 - RAP2018-11-26
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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.431603 0.660510 1.340131

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os05g50200 RBH 0.256238 0.477128 0.314293
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os05g0577800 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_05g0028150 RBH 0.051288 4.980824 3.033618
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_05g0027950 RBH 0.225426 1.318309 0.856119
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_05g0027960 RBH 0.0 1.613798 3.285020
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_05g0028000 RBH 0.042247 0.341877 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_05g0027890 RBH 3.725661 9.758554 5.307539
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_05G0449100 SBH 6.3707445 27.221058 16.567941
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_05g0027590 SBH 0.000000 0.591558 0.866296
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_05G0462300 RBH 1.975236 2.750705 12.8318265
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_05g0027720 RBH 0.000000 0.000000 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_05g0027610 RBH 0.035761 7.262465 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_05g0027840 SBH 0.000000 4.369961 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_05g0027860 RBH 0.066712 0.208805 0.620418
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_05g0027880 RBH 0.0 1.797255 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_05G027400 RBH 0.333673 3.359233 1.529002
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_05g0027860 RBH 0.0 2.607417 2.167947
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