Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsN22_05G027400 | OGI:05077930 | 16/16 | N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | Chr05:29682118-29694541 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
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| Function | - | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
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| Protein seq | MGIFWSKAEPPPPMVLVPPLFDYPPIAARTRMSVPAYELMFGKLSLQNLFEDYFDHAGNMTSRVMLKPLEDPHVDLIATVRSCAYHPKYRVGAFGTFPLLMGNRVRSEDYGVMGVRYGSENLSFGSSFVPFPGSAELPSGAWLVGRKGSLSAGVQYKPLNWKNWNCAISYGVGLTSPLSPSFIFSLELARSTEFIASFYQHMVVQRRVKNPFEDDQIVGITNYIDFGLELATRIDKDKPSESANNSLFQFAASWQANKNFLFKGKLGPSKSSVALAFKSWWRPSFTFSVTGVYQRADPNYVMLTPSKEHLAPGVLREYGKRPMFQAEVDSGNYDHLPTELKPISKIF
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsN22_05G027400 | OsN22_05G027400_02 | Chr05 | 29682187 | 29688787 | - | IsoSeq | ||
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| Protein seq | RVQSDRLRGGGFRKEGEGEEEAACALGFVRDGDLLEQGGAAAADGARPAALRLPTHRRPHQDVGAS |
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
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Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.333673 | 3.359233 | 1.529002 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_05g0577800 | RBH | 0.431603 | 0.660510 | 1.340131 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os05g50200 | RBH | 0.256238 | 0.477128 | 0.314293 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os05g0577800 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_05g0028150 | RBH | 0.051288 | 4.980824 | 3.033618 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_05g0027950 | RBH | 0.225426 | 1.318309 | 0.856119 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_05g0027960 | RBH | 0.0 | 1.613798 | 3.285020 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_05g0028000 | RBH | 0.042247 | 0.341877 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_05g0027890 | RBH | 3.725661 | 9.758554 | 5.307539 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_05G0449100 | RBH | 6.3707445 | 27.221058 | 16.567941 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_05g0027590 | RBH | 0.000000 | 0.591558 | 0.866296 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_05G0462200 | RBH | 11.1032225 | 28.3792285 | 45.630041 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_05g0027720 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_05g0027610 | RBH | 0.035761 | 7.262465 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_05g0027840 | RBH | 0.000000 | 4.369961 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_05g0027860 | RBH | 0.066712 | 0.208805 | 0.620418 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_05g0027880 | RBH | 0.0 | 1.797255 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_05g0027860 | RBH | 0.0 | 2.607417 | 2.167947 |
