Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsNip_03g0428200 OGI:03047920 | 16/16 Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) Chr03:17902702-17912534
Gene Symbol OsTPS14
DNA seq

AATAAGATCACATCAAATGCCAAATATTATTTTTAGCAATTCATGCTACAAACACTCCTCTGCATAAGGCAGCAATGTCGAGATTGAAATGAAGAAATACAAACATCACTACAAGGAAAATGACAATAAAGCAGCAATGAGCTGCTTACATAGGATCATCCGAAGCAAGCTTGGATACACGATTATTCATAATAGAGACACTCTGATCAAAATCAAATTAAAGCGAAGTCATATGATGGAAACCTAGAGTGTTATTGGCTGAACAAGCAACAAGGATATCCATTCTTTCAGTATTGCAGAATCAGTATATCCATCAATTTTCTTGTACATTGTTTCCATCATGCGTGCAAGGTTAATAACCTGGATAAGCAAGGAAGACGGAATTGAGGTCAATTTTAGGTACTCCTCGTTCATATCTTTCCATGCATTTTCCACATCATTCCACAGTGCTTTAATGGCCTCCTCCTTTGTGCTGTCATACTCTTTCATATAGCAAGTTACAGCGGTAGCAACATTGTTCCTTTCGGTCTCAAACTACAAGCAAAGTAAAGCATCACATGAAGTTCCAATCTCTAGCACAAAAGCAAGCAAAACCAAACATTGTGAAAAATTTAGTTTTTAGAACATCTAAATAACAATTATGTTTGGTGCATTTGTGGGAGATGCTTTCTCTCCAAAAAAATGAGAAAATGTTTTGTGTATTTTGGAAAATATGTCCTATGCACTAGATGAAAAAGGAAAAAAAGTATTAAACACAATACAGAGTATAAGATTACCGCATGAGCAACAATGTCATCCATTAGTCGAGAAACAATACATGAATCCTTGACAATTTGAGGAAATCCTGACATCCATATCATAACCTCCTCTGTAACACCTTCTTGAAAAACAACAAAAGCAGTGCAGTTTATTGCCCAATAGAAGCACGTAACTAGTGTGATTTGCAAATGCTCCTTTAATGGGGGAATGTATTTACTATCTCTCCAATCGATTTCTGTTACATAGCCTTTGCATACTTCAGTGATCTATAAAATAAAGTAAGTCAAAGCATATGTACATGAGTGGGCTCTTTGCATATGTATTTTCAAAACACTTAATAATAAACTAATTTACTTTAATAAAATAAACATGTCATGCATGAATACACACATATAATTGAATGGATGGAATGGTGTAATTAAAAGGAAAAAATTACAAAAAAAACTGAGAATATACATACTATATCTTTGATAACATTAACATTCTTCCTTGGTGTTCCTTTTGGGAGTGCACCCTCAATCTCATTCATGGTGCCAAACATAAATTGAGCATATTCCTTGTAACATCTTCCAAGTTGCTCAGCACCCTTTTCATCCCACCTATAAGAAATTATCATGGGGAAACATGTACAAGATATTCATAGAGATATCATTGACTTAGTTATGTCAATGCATATGTGTGGACCATGAAAATTACAACTTAAATCAATCCTAACTTTAAATTATATTTGATAAGTATAAAGCTGAAACTTGCTTAATATTATTTTCTCAAAGTGTGATCGGGATGTGGAACAAAACCGTTGCATCACGTCAGCAAATGGTTGAAGCTCTTTCCAGAGTCCATAATTGTCAAAAGTATCATCATATGGTGTAATAGTTGCTATGAATTTCGCTAGCAACTTCCTAGGCTTTGCATATTCTGGTTCATAATACACACCCAACGCCCAAAAATATGCTTCTGCAGGCCTATGCCTTGCATAGAATAGTTCACGTGGGGACTCTAGCCCATGATACCACCTTTAAAACAGAAAACAAAGAACTGAATCATCAATGTCTTATTATATGGTAATGGAAATATTCGTTATAAATTTCCACCAAATTAACTTACTCGCATATTTCTTTGACTTCTTCCCGGTGAAGTCGCTGCAATAAATAAAAGTCAAGTTTTGCTAGCTCAAGTATCATCTCGTTGCACTCCTCCTTATCTTCTTCATACAATGGTATGTAAAGTCTGGCCTCTAACCTCTTCATCCTACGGAAAGATGGTGTCTCAAGAGCATGTCTCACTTTATTAGAGAGTGGTTTCTCAATACAATCCACAATTCTTTTCAATTGATTTGTTGTTTCAACCTGTGCTTCTCGGAGAATTTCTTCATTAGGAGTTCCAAGATGTGCTGCCTCATATAGAGCAAGTAATGCTCTTGTATCACTACATAGGGTTCCGTTTAAGTTTCCTTGTTTATCAATGAATTCTTTAAATGCATCTGATCACGATTGATACAAAAATGTTAGATGAGAATATAACCACCTAACACACAAAATTTCAAGCCAACATTTTATATGTGACATGTAGAACTGCCAGATAGAGTGTTAATTAGACATTTTCATAAATTTCTTCACAAGGTTTAAAGAATAAAGAATTATATATCCATCCAAATAAGCTGCCACAAAATACTCATCGAAATATTTAGATGATGAGTGGAAAACACCTTTACATACAAGTCCTTTTTGCCAAGGAAAAAAAAGTTATGTTACAATTTTATCAACTATTTGAGAGGCTTTATCTTTTAAATTTGTAATTACATACCACGTAAGAACTCAATTTTCTACCTACAAAATGTTGCGTTGAGGATTTGATTCATTATCCACATTAACTAGCTCCCATGTGGAGTGGCACATCGCTTATATTTTTGTTCGCTTTGTTTAAAAGGATTGACTGATTGACTGTACTATGGTTATAGCCGGCTCCCACGGGCTTATAAGCTAAGCCTCACCAATATGAACATCCAAGGTGGTATTAAATCAACCAGTACAACATTTTGTGGCCCACATGGACCTCAGCACCACTACTACAAGCGACAAATGTATTAGGGTTTTACAAGTAGCAGTCTAGTTTTCCAAACAATTAACGTGATCAACCAGTAATTGTGTACATTTTGTAAGATATGAAAATTACATGTCTCTGATAAACTTATGGAAAAACATATATATTCTATCAAAATGATTGATATTTCAACTATGACCTGACATTTTACATGAAATTAACCTACTTCCACTTGAGTTATAGTTAAATAAAATAGTGCAGCAGATTGTTATAGCAGTTAGATGATTTGAAAGAAAATATGTGATTTTGAAAATTTATAGCAATTTAATCTATAATAGAATTTTATAGGTCATATATATGTAACTCTACAATGAATTCAACTTCCTGAAGGTGGTTTTCAAAATTATTGCATCTCAAATAAATAGATATAGGGAAGAAACGATACCGCATGGCATGTAGCGCCGCTGCTGTCTTAGCAACCGGAATTGAAGGGAGATCGCATGGAAATCATCATTCGCAAACTTCACAGAAACTAGACTTTCTAGGGAGTTATCTATTTCTTCTTTAAAATGATAAGATACTCCAAGACGTTGAAGTGCATCGATAAGCTTCATTTTTGCAAATGGATTGAGGATGTCTACAAACATTTCCCTTGTTTCAACTATTAGGTCATCACATCTTTCCGTCATCCACTCCAGTGATTTCTGTACACAGCAAATGGTTACCAATATGAGATACACTATATATTGTGCCGCCATAGAAAGCTGGCTAGCTATGTATTATTAATGCATAACTATGAAATGTGTAAACAATAATATATGCTAAGTAATTACATTTTTGTTGATATTGATTTACAAGATGTATGGAAAAGTAACAGTGGCAGTGGATTATACACTACTAGACAACCGATCTTTGCTCAATCGGCAAAACAACAAATATCTCAGATGTTTAACGGACCAGTGCTAAAGACCTCTTTAGCACCGGTTAAAACACCCAACGACACATTGCTATCTTTAGTCCTGATTCACACTTTGTCAGAGCATATCAAGCCTCCCAGGATATTTAGCACCGGTTTGTGGCAACAACCAGTACTAAAGATCGACATTTTAGTACCGGTTGATGACACAAACGAGTACTAAAGATCATTGCCTTTTTATGCTCTTCTTCCTCCTCCAGCCCGAGCCATTGCTACTAGTGAAAGGAGGAGAAAGAGAGGTGCTGCCAAAATTTTTTGTGAAAATATTTTGATATTATACAAATCAAAGAGATCTAAAGGTTAGCAACGTCATCCTCTATTGATGCATAGTTAACATTTTACATTTCTTGCTATGTTTGTATGCATTATTATCTCAATAACATATATGGAAAAAAGATGAGAGATAAAATTTTCTTTGGGGAAAATTAGTGTACTTCATAAAATTAGAAACATTTGTATAAATTTGTTAAAAAAACAACAAACGAAAAATATAGAAAATGAAGAAAAAAATAATCGAAAACTAAGTCCATTTGAAAATCATTAAAATAGTTAGAAATAAGTAGAATGCATTAAATATATGTCTAGAACTTTAAAAAATAATTAAAATAAGGATAATACATGGAAAAATATATTTACAATTTCTTGAGACAGATAAAATTTATACATAATTAACTATGACTCCAATTAAGTGCACTTAAAACTCGTTAAAATCATTAGAAATAAAAAGAATACATTAAAAATGTGTACCATCAGTTTTCAGTTTAATTATGATGTTTTAATTTATTATATAACTATTTAAGTAGTTTCACTTTCATAGACTTCCTTTGCATTTGGTATTTCCTCATGTAGATGAATCGGTAATGGCGTGCATTATTTTTTGAGCGTGGCCAATACCCACAAGCCTAATGGTTTTATTGATAGCGTGCATTATTTTTTGAGTAAAGTGCATTGGCGGTCCTTAAACTTGTAGGGTTGTGTCATATAGGTCCCTAAACTCTCAAAATGCATTTCCAGGTCTCAGAGCTTGTTAAAATATATCATCTAGGTCCCAAATTGACACATCCCCTCTAGGATCCTACGTGGCGCTGATGTGGCAATGCCACATGGACGTGATGCGTCCTTTTCTTTTTTCTTCTTCTTTTCTTTTTCTTTTTCGTTTTCTTCTCATTCTTCTTTTTTCCCTTTTTTTTTCTGCACGGGTCACAGAGAAAGGAGAAGAAAG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CDS seq

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Protein seq

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Function (S)-beta-bisabolene synthase [UniProtKB/Swiss-Prot:D2YZP9]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsNip_03g0428200 OsNip_03t0428200-01 Chr03 17902702 17912534 - RAP2018-11-26
CDS seq

ATGGCCGGCAGAGTGATCGCACAAGGATATAGGGTGGTGGATGAGGAGCGCCACGCTGTAAACTATAGGTCGAGTGTGTGGGGTGACTACTTCATTAGGAACCCAATACTGCCTCATAACTATCGGAAATCACTGGAGTGGATGACGGAAAGATGTGATGACCTAATAGTTGAAACAAGGGAAATGTTTGTAGACATCCTCAATCCATTTGCAAAAATGAAGCTTATCGATGCACTTCAACGTCTTGGAGTATCTTATCATTTTAAAGAAGAAATAGATAACTCCCTAGAAAGTCTAGTTTCTGTGAAGTTTGCGAATGATGATTTCCATGCGATCTCCCTTCAATTCCGGTTGCTAAGACAGCAGCGGCGCTACATGCCATGCGATGCATTTAAAGAATTCATTGATAAACAAGGAAACTTAAACGGAACCCTATGTAGTGATACAAGAGCATTACTTGCTCTATATGAGGCAGCACATCTTGGAACTCCTAATGAAGAAATTCTCCGAGAAGCACAGGATGAAGAGGTTAGAGGCCAGACTTTACATACCATTGTATGA

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Protein seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.0 0.585891

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os03g31430 RBH 0.0 0.0 0.083664
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os03g0428200 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_03g0022470 RBH 0.0 0.0 14.436510
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_03g0022330 RBH 0.0 0.0 3.128314
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_03g0022400 RBH 0.0 0.0 17.572079
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_03g0022380 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_03g0022180 RBH 0.0 0.0 46.237759
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_03G0294800 RBH 0 0.0129345 0.0453325
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_03g0021920 RBH 0.000000 0.0 1.626449
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_03G0298200 RBH 0.0305495 2.801477 0.044327
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_03g0022220 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_03g0022210 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_03g0022320 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_03g0022160 RBH 0.0 0.0 1.030971
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_03g0022010 RBH 0.000000 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_03G022000 RBH 0.0 0.0 8.216228
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_03g0021910 RBH 0.0 0.0 8.092486
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