Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsNaBo_12g0008850 | OGI:12025270 | 16/16 | NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr12:9337889-9356726 | ||||||||
| Gene Symbol | RLCK367, OsRLCK367 | ||||||||||
| DNA seq | 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| CDS seq | atgccgtcctcttctgccgccgctcttctcctccagctccagctgctgctcgtgatatcgctctccactgctcagcctggtttcattagcttggattgcgggggagatggtgatttcacagatgacattgggatccagtggacttccgatgacaagtttgtgtatggtggcaagacggcaaacctctcagtccagaatgatctcccgaagcaactcaaaaccgtacgctattttccagtagacgacaggaagtattgctacaccatgaatgtcagcgaaagaacacggtacctagttagagctactttcctctatggaaacttcgaaaacagcaatatattccctaagtttgatctctccctcggagcaactccatggacaactgttgtagtttatgatgacactaccccagcagtggtggaggcaattatcttggcttctgccccaacactcagcgtctgcctctcaaatgccagtacaggacaggcgccgtttatttccactctcgagcttcggcaattgaatggctccctctatgaaactgattatgagaatcagttctttcttaaactctctgcaaggataaattttggtgcagaaagtaatgcatctgtcaggtaccctgacgatccatttgatagaatatggcgatctgatttagtgaggagagcaaattaccttgttgatgttgctccagggacggaaagaatatcaactaaaaggcacatatccatcagaactgatggtgaagaaccacctgaagaagtcatgcgaactgcagtagttggccaaaatggatccttgacctacaggcttaatttggatgaaaccccaggaaattcatgggcatacgcttattttgcagaaatcgaagatttagccccaaatgaaactagaaaatttaagttagcgattccagaaatgcccgaatacagcacaccgactgttaatgtagaggaaaatgctccgggaaagtatcgggcgtatgaagcaggttacatgaatatgtcacttccatttgttttcaagcctgtgtttcagaagacggatgattcgtcgaagggacctatcttgaatgcagttgaaatttacaaatatatacagctcactatgggatcccaagatgcgaacaatatggctatcttggtatcacggtatcctcaggaaagttgggcgcaagagggtggtgacccatgcttaccagcatcatggtcctggatacaatgcagtacagaaaaagcgcccagggtattatcaatttgttcttcacaacgtttagagttttggaaagacaagaattattttcttttccgcagaatattatcaggaaagaatataacaggaagtatccctgtggaactaacaaagctacctgggctggttgaatttcaccttgaggacaatcaattaactggtgcactgccttcttctttgggtgacctacctaacctgaaacagtttcaatatggatttctgatccttatttatattgaatattccttcctttttccttttattctctcttcttctcatataaatgcaacatttatggtggaaacaatggagttacctttactgattcaagtctttgcagcgccagcaaaacagttaagttcaccattgagtgaagtaaccacggaatcggtgcacagatttgctttatctgaaattgaagatgctactgacagatttggtagaagaataggaggacctgcttatgtaaaagtaactagctgggtcaagcgtctcgagatagctgaagatgccgcaaaaggaatagagtatctccatacaggatgttccccaactatcatccatagagatctcaagagcagtaacattctccttgacaagaacatgagagccaaagttgcagactttggcatatcgaaacctgtggttagtggttcccatgtatcaaccatggttcgaggaacatttggatatctagacccagagtactatggctcacagcagctaacagagaagagtgatatctatagttttggtgtcattttactggagctaatctcaggccaggagccaatctcagatgaccactttgggccccactgtcgtagcattgttgcatgggctacctcacacatcgagagcgggaacatccacgccatcattgatcagtcgttggacactggctacgatctgcagtcagtgtggaaggtcgcggaggtggcaataatgtgcctgaagccgacgggcagacagaggccatccatgtcggaggtgctcaaggagatccaggatgccattgccctcgagcggggaggacgggagcttgtccccagcatccagcaccccgtgtccaagtgctcaccttctgtaaacatggacagtgtggtattggagcagaattcgcggttcgatgagctgcttgagctgccaggtctcaggtag
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| Protein seq | MPSSSAAALLLQLQLLLVISLSTAQPGFISLDCGGDGDFTDDIGIQWTSDDKFVYGGKTANLSVQNDLPKQLKTVRYFPVDDRKYCYTMNVSERTRYLVRATFLYGNFENSNIFPKFDLSLGATPWTTVVVYDDTTPAVVEAIILASAPTLSVCLSNASTGQAPFISTLELRQLNGSLYETDYENQFFLKLSARINFGAESNASVRYPDDPFDRIWRSDLVRRANYLVDVAPGTERISTKRHISIRTDGEEPPEEVMRTAVVGQNGSLTYRLNLDETPGNSWAYAYFAEIEDLAPNETRKFKLAIPEMPEYSTPTVNVEENAPGKYRAYEAGYMNMSLPFVFKPVFQKTDDSSKGPILNAVEIYKYIQLTMGSQDANNMAILVSRYPQESWAQEGGDPCLPASWSWIQCSTEKAPRVLSICSSQRLEFWKDKNYFLFRRILSGKNITGSIPVELTKLPGLVEFHLEDNQLTGALPSSLGDLPNLKQFQYGFLILIYIEYSFLFPFILSSSHINATFMVETMELPLLIQVFAAPAKQLSSPLSEVTTESVHRFALSEIEDATDRFGRRIGGPAYVKVTSWVKRLEIAEDAAKGIEYLHTGCSPTIIHRDLKSSNILLDKNMRAKVADFGISKPVVSGSHVSTMVRGTFGYLDPEYYGSQQLTEKSDIYSFGVILLELISGQEPISDDHFGPHCRSIVAWATSHIESGNIHAIIDQSLDTGYDLQSVWKVAEVAIMCLKPTGRQRPSMSEVLKEIQDAIALERGGRELVPSIQHPVSKCSPSVNMDSVVLEQNSRFDELLELPGLR |
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| Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g67720 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGI2] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsNaBo_12g0008850 | OsNaBo_12g0008850.01 | Chr12 | 9337889 | 9356726 | + | NAM | ||
| CDS seq | atgccgtcctcttctgccgccgctcttctcctccagctccagctgctgctcgtgatatcgctctccactgctcagcctggtttcattagcttggattgcgggggagatggtgatttcacagatgacattgggatccagtggacttccgatgacaagtttgtgtatggtggcaagacggcaaacctctcagtccagaatgatctcccgaagcaactcaaaaccgtacgctattttccagtagacgacaggaagtattgctacaccatgaatgtcagcgaaagaacacggtacctagttagagctactttcctctatggaaacttcgaaaacagcaatatattccctaagtttgatctctccctcggagcaactccatggacaactgttgtagtttatgatgacactaccccagcagtggtggaggcaattatcttggcttctgccccaacactcagcgtctgcctctcaaatgccagtacaggacaggcgccgtttatttccactctcgagcttcggcaattgaatggctccctctatgaaactgattatgagaatcagttctttcttaaactctctgcaaggataaattttggtgcagaaagtaatgcatctgtcaggtaccctgacgatccatttgatagaatatggcgatctgatttagtgaggagagcaaattaccttgttgatgttgctccagggacggaaagaatatcaactaaaaggcacatatccatcagaactgatggtgaagaaccacctgaagaagtcatgcgaactgcagtagttggccaaaatggatccttgacctacaggcttaatttggatgaaaccccaggaaattcatgggcatacgcttattttgcagaaatcgaagatttagccccaaatgaaactagaaaatttaagttagcgattccagaaatgcccgaatacagcacaccgactgttaatgtagaggaaaatgctccgggaaagtatcgggcgtatgaagcaggttacatgaatatgtcacttccatttgttttcaagcctgtgtttcagaagacggatgattcgtcgaagggacctatcttgaatgcagttgaaatttacaaatatatacagctcactatgggatcccaagatgcgaacaatatggctatcttggtatcacggtatcctcaggaaagttgggcgcaagagggtggtgacccatgcttaccagcatcatggtcctggatacaatgcagtacagaaaaagcgcccagggtattatcaatttgttcttcacaacgtttagagttttggaaagacaagaattattttcttttccgcagaatattatcaggaaagaatataacaggaagtatccctgtggaactaacaaagctacctgggctggttgaatttcaccttgaggacaatcaattaactggtgcactgccttcttctttgggtgacctacctaacctgaaacagtttcaatatggatttctgatccttatttatattgaatattccttcctttttccttttattctctcttcttctcatataaatgcaacatttatggtggaaacaatggagttacctttactgattcaagtctttgcagcgccagcaaaacagttaagttcaccattgagtgaagtaaccacggaatcggtgcacagatttgctttatctgaaattgaagatgctactgacagatttggtagaagaataggaggacctgcttatgtaaaagtaactagctgggtcaagcgtctcgagatagctgaagatgccgcaaaaggaatagagtatctccatacaggatgttccccaactatcatccatagagatctcaagagcagtaacattctccttgacaagaacatgagagccaaagttgcagactttggcatatcgaaacctgtggttagtggttcccatgtatcaaccatggttcgaggaacatttggatatctagacccagagtactatggctcacagcagctaacagagaagagtgatatctatagttttggtgtcattttactggagctaatctcaggccaggagccaatctcagatgaccactttgggccccactgtcgtagcattgttgcatgggctacctcacacatcgagagcgggaacatccacgccatcattgatcagtcgttggacactggctacgatctgcagtcagtgtggaaggtcgcggaggtggcaataatgtgcctgaagccgacgggcagacagaggccatccatgtcggaggtgctcaaggagatccaggatgccattgccctcgagcggggaggacgggagcttgtccccagcatccagcaccccgtgtccaagtgctcaccttctgtaaacatggacagtgtggtattggagcagaattcgcggttcgatgagctgcttgagctgccaggtctcaggtag
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| Protein seq | MPSSSAAALLLQLQLLLVISLSTAQPGFISLDCGGDGDFTDDIGIQWTSDDKFVYGGKTANLSVQNDLPKQLKTVRYFPVDDRKYCYTMNVSERTRYLVRATFLYGNFENSNIFPKFDLSLGATPWTTVVVYDDTTPAVVEAIILASAPTLSVCLSNASTGQAPFISTLELRQLNGSLYETDYENQFFLKLSARINFGAESNASVRYPDDPFDRIWRSDLVRRANYLVDVAPGTERISTKRHISIRTDGEEPPEEVMRTAVVGQNGSLTYRLNLDETPGNSWAYAYFAEIEDLAPNETRKFKLAIPEMPEYSTPTVNVEENAPGKYRAYEAGYMNMSLPFVFKPVFQKTDDSSKGPILNAVEIYKYIQLTMGSQDANNMAILVSRYPQESWAQEGGDPCLPASWSWIQCSTEKAPRVLSICSSQRLEFWKDKNYFLFRRILSGKNITGSIPVELTKLPGLVEFHLEDNQLTGALPSSLGDLPNLKQFQYGFLILIYIEYSFLFPFILSSSHINATFMVETMELPLLIQVFAAPAKQLSSPLSEVTTESVHRFALSEIEDATDRFGRRIGGPAYVKVTSWVKRLEIAEDAAKGIEYLHTGCSPTIIHRDLKSSNILLDKNMRAKVADFGISKPVVSGSHVSTMVRGTFGYLDPEYYGSQQLTEKSDIYSFGVILLELISGQEPISDDHFGPHCRSIVAWATSHIESGNIHAIIDQSLDTGYDLQSVWKVAEVAIMCLKPTGRQRPSMSEVLKEIQDAIALERGGRELVPSIQHPVSKCSPSVNMDSVVLEQNSRFDELLELPGLR
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|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.352427 | 1.253745 | 0.871169 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_12g0614851 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os12g16520 | SBH | 0.424893 | 0.194906 | 0.000000 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os12g0614851 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_12g0009130 | RBH | 0.148962 | 1.385725 | 2.113014 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_12g0012270 | SBH | 0.0 | 1.723534 | 0.686837 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_12g0009260 | RBH | 0.156153 | 0.000000 | 2.551201 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_12g0009070 | RBH | 0.039663 | 0.000000 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_12g0008940 | RBH | 0.000000 | 2.769372 | 3.246849 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_12G0119400 | SBH | 0 | 0 | 0.021363 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_12g0008930 | RBH | 0.195685 | 0.178615 | 0.554510 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_12G0153600 | RBH | 2.4349005 | 4.794431 | 11.3645845 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_12g0008880 | RBH | 0.030615 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_12g0009110 | RBH | 0.071868 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_12g0009070 | RBH | 1.746930 | 7.023638 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_12g0009040 | RBH | 0.319545 | 0.0 | 0.085357 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_12g0009190 | RBH | 0.340626 | 0.739103 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_12G008940 | RBH | 0.095251 | 0.208912 | 0.712151 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
