Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsKeNa_12g0012270 OGI:12042520 | 9/16 KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr12:15390890-15399226
Gene Symbol CRL4, CHARK, S/T kinase, OsCRL4, OsHKL1, OsCDP, -
DNA seq

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CDS seq

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Protein seq

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Function Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g67720 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGI2]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsKeNa_12g0012270 OsKeNa_12g0012270.01 Chr12 15390890 15399226 + NAM
CDS seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 1.723534 0.686837

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_12g0102500 SBH 5.048846 4.051795 4.326017
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU NA NA NA NA NA
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os12g0102500 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_12g0012150 RBH 0.0 10.072243 1.443616
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_12g0000170 SBH 1.529664 16.935455 17.356194
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_12g0011990 RBH 0.0 0.031539 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_12g0008240 SBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_12G0217000 RBH 1.7795755 7.08333 0.6181425
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_12g0008930 RBH 0.195685 0.178615 0.554510
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU NA NA NA NA NA
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_12g0011770 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_12g0012150 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_12g0009070 RBH 1.746930 7.023638 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_12g0011950 RBH 0.0 0.0 0.624246
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_12g0009190 RBH 0.340626 0.739103 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_12G011900 RBH 0.0 0.0 0.000000
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_12g0011720 RBH 0.0 6.215492 3.428627
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