Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsNaBo_10g0004000 | OGI:10016160 | 5/16 | NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr10:5258020-5305186 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | 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More
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| CDS seq | atgggtcgagacgaagatatatggccagaagctggtaagttcatgccggagagattcctaggaaggacaattgactataaaggtggagatttggagctcatcccatttggtgcaggacgacgaatctgccctggaatgccactagctgttaggatggtgcatgtagtgacacaagttctagcacagtag |
||||||||||
| Protein seq | MGRDEDIWPEAGKFMPERFLGRTIDYKGGDLELIPFGAGRRICPGMPLAVRMVHVVTQVLAQ |
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| Function | (S)-N-methylcoclaurine 3'-hydroxylase isozyme 1 (Fragment) [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9SP06] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsNaBo_10g0004000 | OsNaBo_10g0004000.01 | Chr10 | 5258020 | 5305186 | + | NAM | ||
| CDS seq | atgggtcgagacgaagatatatggccagaagctggtaagttcatgccggagagattcctaggaaggacaattgactataaaggtggagatttggagctcatcccatttggtgcaggacgacgaatctgccctggaatgccactagctgttaggatggtgcatgtagtgacacaagttctagcacagtag |
|||||||
| Protein seq | MGRDEDIWPEAGKFMPERFLGRTIDYKGGDLELIPFGAGRRICPGMPLAVRMVHVVTQVLAQ |
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
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Homologues
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| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_10g0004110 | SBH | 0.538309 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_10g0003890 | SBH | 0.000000 | 0.0 | 0.696678 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_10G0079600 | SBH | 6.2079895 | 0.442675 | 0 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_10g0004020 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.000000 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_10G0088300 | SBH | 2.1685155 | 0.187316 | 0 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_10g0003860 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_10g0003900 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_10g0004020 | SBH | 6.407923 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_10g0003780 | SBH | 1.241023 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_10g0004110 | SBH | 1.008775 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_10G003960 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.000000 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_03g0010500 | RBH | 1.635241 | 2.561093 | 3.423182 |
