Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsNaBo_10g0000450 OGI:10003080 | 13/16 NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr10:937820-964546
Gene Symbol PTR, PTR, OsNPF8.17
DNA seq

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Protein seq

MSLYEGAGSEGDGSVDIHNQPALERNTANWRACFMILGDVLSECLAFYGISKNLVTCYLAYMEAGAADEETPLIQQLPPEEQCSQYTCDGTVNSDKKPALKQSTGHWRACFFILGAQFAETLCFFMVSKNLVTYLTSALHESNIDAAQSVSIWIGTSFFTPLIGAFLADTYWGRYWTTVISLFIIIIGMLIVTVSSSPLFLNSSYYNWNICRATVYTGLYLTAVGSGCMKPCIPAFGADQFDSADPVERLAKGSFFNWYYFSMNVGSLLSTTLLVWVVANIGWSVGFAIPMLLSGFGIALFFAGRKVYRYKKQGGSPLTRVSQVVVAAVRNHRLKLPDDSSLLHEVSKVTEDDYRTQLTTQFRFFDKAAILSDEISPAQWSPWRLCTVSQVEELKMLLRMFPVWVSMVVFFVVTAQITSTLIEQGMAMDGRVGPFTLPAASIATFDVISVLVWVPVYDTVLVPLARRVTGKDRGISHLQRIGVGLALAAVAMAYSAVVEARRLGTAPAPVSIMWQAPSYLVLGVAEAFSVIGMMEFFYEQSPESMKSLCTALGQLAIAVANYLNSGVLVVVAAATTRGGGAGWIPDNLDEGHLDYFFWMMAVVSVLNLLHFLHCSIRYRANNNTLSSMHIYAFLVYKVGNLREQKAYHMEGADEERPLIHHLPPQEQCSQYTCDGTVDIDRRPALKHSTGNWRACFFILGAEFTQCLCFSAVVKNLVRYLTSVLQESNVNAARSVSTWIGTCFFTPLIGAFLADTFWGRYRTIVICLSVYSIGMLILTTSASLPFLLHDSYNNGDDIRRVVAYLGLYLIALGAGGIKPCMSALGADQFDGADPVERVTKGSFFNYYYFSNNMGTLLSTTVLVWVQDNIGWGIGFATPMLLMGFGLSMFVAGRRVYRYRKLGRSPLTRVSQVVVAAARNHRLKLPDDSSLLHELPSLTEGGYRIQHTTRFRFLDKAAIPSDSDDNSPVQPDPWRLCTVSQVEELKMLLRVFPLWASLLVFFVVTAQMSSTLIEQSAAMDGRIGPFTVPPASLATFNVVAVLIWVPVYDAVLVPLARRATGNDRGLSHLQRIGVGLALSAVAMAYSAQVERRRRRPAAEEEAMSIMWQAPCYLVLGMAEVFTSIGMLEFFYERSPGSMKSLGTSLAHLAVATANYLNSGVLGVVAAATTRGGGAGWIPDNLDEGHLDYFFWMMALVSVLNLLQFLHCSIRDRGQ

Function Protein NRT1/ PTR FAMILY 8.3 [UniProtKB/Swiss-Prot:P46032]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsNaBo_10g0000450 OsNaBo_10g0000450.01 Chr10 961285 964546 - NAM
CDS seq

atggccatggaagcagcagatgaggagagggcgcctctgcttcaacctcaacctcaaccttcacggggggatgcagattcagagtatacaggtgatggatcggtggacgtcaacaaccagcctgctctcaagcgcagcacggggaattggagagcatgcttcatgatcctaggtgtcgaattcagtgagaatttggcttactatgggatctccaagaacctggtgacctacctcaccaagattctccacgagagcaaagtgaacgccgcgaggaattcctctgcttggtcgggcgcctgctacctcacgccactctttggagctttcttggctgacacatattgggggaaataccggactgttcttacttttctcccgatttacatcctgggattgcttactctaatggcgtcgacgtcactcccatccagcatgacgtcctccgacgccggtcaccagcttcacagcgtcgccgtctacctcgggctgtacctcgtcgccttcgggaacggcggcgtgaagccgtgcacgtcggcgttcggggcggaccagttcgacggcggtgacgcggcggagctgaggaggaaggggtccttcttcaactggtacaccttcatgatcaacagcgggtcgctcctggcgtccacggtgctggtctggctgcaggacaatgtgggctgggggatcagcttcgtgatcgtcgtcgtggtcatggccttcttcctcgccgtcttcttcgccggctcgagggtttacaggtacaggccggtcagggggagcccactcaccggtgtctgccaggtggtggtcgccgccgtcaggaaatggcatttggagttgccggatgatagctcgcttctgtatgaggctcaagtcgcagatcaccggattaagcatactgatcaattcaggttcttggacaaggctgcgatagtggtgacaccatcgtcgttaagcggggagaagggtaacgtggcagcggcggcgccggtgagccgatggcggcagtgcacagtgacacaggtggaggaggtgaagatgctggtgcggatgtgccccatctgggcatgcctggtgctcttcttctcggtgagcagccagatgtcgtcgacgctggtggagcaaggcacggccatggacaaccgcgtgggccccttcaccatccctccggcctcgctcgccaccttccactccatcggcgtcctcctctggatccccgtctacgacgtcgcgctggtgcccctggcgcgccgcgccaccggcaagcccaaggggatcacgcagctgcagcgcatcggcgtcggcctcgccgtggccgcgctcatcatggcctactcggcgctggtcgaggagcggcggctggcggcggcgcgcgccggcgccgccaggacgagcatcctgtggcaggtgccggcgcagctgatgcacggcatggcggtggtgttcaccagcatcggcaagtcggagttcttctacgaccaggcgccgcgctccatgaggagcatgtgcaccgcgctcggccagctcgccatcgccgccgggaactacctcagcgcgttcctcctcgccgtcatcgcctccgccaccacgcgcggcggcgaccccggatggatccccgacgacctcaacaagggacacctcgactacttcttctggctcatggctgctctcttgctcctcgacctgctcttctttgtcttctgcgccatgcgatacaaagggagcactgctgcttcttga

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Protein seq

MAMEAADEERAPLLQPQPQPSRGDADSEYTGDGSVDVNNQPALKRSTGNWRACFMILGVEFSENLAYYGISKNLVTYLTKILHESKVNAARNSSAWSGACYLTPLFGAFLADTYWGKYRTVLTFLPIYILGLLTLMASTSLPSSMTSSDAGHQLHSVAVYLGLYLVAFGNGGVKPCTSAFGADQFDGGDAAELRRKGSFFNWYTFMINSGSLLASTVLVWLQDNVGWGISFVIVVVVMAFFLAVFFAGSRVYRYRPVRGSPLTGVCQVVVAAVRKWHLELPDDSSLLYEAQVADHRIKHTDQFRFLDKAAIVVTPSSLSGEKGNVAAAAPVSRWRQCTVTQVEEVKMLVRMCPIWACLVLFFSVSSQMSSTLVEQGTAMDNRVGPFTIPPASLATFHSIGVLLWIPVYDVALVPLARRATGKPKGITQLQRIGVGLAVAALIMAYSALVEERRLAAARAGAARTSILWQVPAQLMHGMAVVFTSIGKSEFFYDQAPRSMRSMCTALGQLAIAAGNYLSAFLLAVIASATTRGGDPGWIPDDLNKGHLDYFFWLMAALLLLDLLFFVFCAMRYKGSTAAS

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsNaBo_10g0000450 OsNaBo_10g0000450.02 Chr10 937820 961417 - NAM
CDS seq

atgtcactctatgagggtgcaggttcagaaggtgatggatcagtggacatacacaaccagcctgctctcgagcgcaacacagcgaattggagagcatgcttcatgatcctaggtgatgtgctcagtgagtgcttggctttctatgggatctccaagaatctagtgacctgctacctggcttacatggaggcaggggcagcagatgaggagacgccactgattcagcagctacctccggaggaacaatgttcacaatacacatgtgatggaacagttaatagtgacaaaaagcctgcactgaagcagagtacagggcattggagagcatgcttcttcattttaggtgctcaattcgctgaaaccttgtgcttcttcatggtttcgaagaacttagtcacgtacctcacgagtgcgctgcacgaaagcaacatcgacgctgcacaaagtgtgtctatttggatcggcacttccttcttcacaccactcattggagccttcttggctgatacatattggggaagatactggacgacagttatttccctctttattatcatcatcggaatgctcattgtgacggtttcatcatcaccattgttcctgaattcttcttactacaattggaacatttgccgtgccacggtctacacagggctctaccttactgccgttggaagtggatgtatgaagccctgcattccagcctttggagccgatcaatttgacagtgctgacccggtggaacggctggcgaagggctcattcttcaactggtattacttctcaatgaacgtcggctcactgctgtcgacgactctgcttgtctgggtggtggccaacatagggtggagtgtcggttttgcgatcccgatgctactctcggggttcggcatcgccctgtttttcgctggtaggaaggtttacaggtacaagaaacagggagggagtccactgacaagggtgtcccaggtggtggttgcagctgtaaggaatcataggctgaaattgcctgatgatagctcactcctgcatgaggtttcaaaagtgactgaagatgattacaggactcaactcaccactcaattcaggttctttgacaaggctgccatcttgtccgacgagatctcgccggcgcagtggagcccgtggaggctgtgcacggtttcgcaggtggaggagctgaagatgctgctgcggatgttcccggtctgggtgtccatggtcgtcttcttcgtggtgaccgcgcagattacgtcgacgctgatcgagcagggcatggccatggacggccgcgtcggcccgttcacccttccggccgcctcaatcgccaccttcgacgtcatcagcgtcctcgtctgggtccccgtctacgacaccgtgctggtgccactggcacggcgcgtcaccggcaaggaccgtggcatctcccacctgcagcgcattggcgtcggcctcgcgctcgccgcggtggccatggcgtactcggcggtggtcgaggcacggcggctggggacggcgccagcgccggtgagcatcatgtggcaggcgccgtcgtacctggtgctgggcgtggcggaggcgttcagcgtgatcggcatgatggagttcttctacgagcagtcgccggagtcgatgaagagcctgtgcacggcgctcgggcagctcgccatcgcggtcgccaactacctcaactccggcgtgctcgtcgtggtggcggcggccaccacgcgcggcggcggagccggctggatcccggacaacctcgacgaggggcacctggactacttcttctggatgatggctgttgttagcgtcctcaacctgctgcacttcttgcattgctcaatcagatatagagccaataacaacacgctgtcttcaatgcatatatatgctttccttgtctacaaagtagggaatctgagggagcaaaaagcttatcacatggagggagcagatgaggagaggccactaattcatcacctgcctccacaggaacaatgttcgcaatacacctgcgatggaacggttgatatcgacagaaggcccgcactgaagcatagcacagggaattggagagcatgcttcttcattttaggtgctgaattcactcaatgcctgtgcttctctgcggtcgtgaagaacttagtcaggtacctgacgagtgtgctccaggaaagcaatgtcaatgctgcccgaagtgtgtcgacttggattggaacttgcttcttcacaccactcattggagccttcttggcggacacattttggggaagatacaggacaattgtaatatgcctctctgtttacagcataggaatgctcattctgacgacttcagcgtcgcttccatttctccttcacgattcctacaacaatggcgacgacattcgtcgtgttgtcgcctacctagggctctacctcattgcacttggagctggaggtatcaagccctgcatgtcggccctcggggctgaccaattcgacggtgccgacccggtagaacgggtgacaaagggctcattcttcaactattactacttctcaaacaacatgggcacgctgctgtccactaccgtgcttgtctgggtgcaggacaacatagggtggggcatcggtttcgcgactccgatgctgctcatgggttttggcctctccatgttcgtcgccggtaggagggtgtacaggtacaggaagctgggaaggagtccattgacaagggtgtcccaggttgtggttgcagctgcgaggaatcacaggctcaagttgcctgatgatagctcactcctgcatgagctgccttcactgaccgaaggtggctataggattcaacataccactcgattcaggttcttggacaaagctgccatcccgtccgactccgacgacaactcgccggtgcaaccggacccatggaggctgtgcacggtgtcgcaggtggaggagctcaagatgctgctccgggtgttcccgctgtgggcttcgctgctcgtcttcttcgtggtgaccgcacagatgtcgtcgacgctgatcgagcagagcgcggccatggacggccgcatcggccccttcaccgtgccgccggcctcgctcgccaccttcaacgtcgtcgccgtcctcatctgggtccccgtctacgacgccgtgctggtgccactggcacggcgcgccaccggcaacgaccggggcctctcgcacctgcagcgcatcggcgtcggcctcgcgctgtccgcggtggccatggcgtactcggcgcaggtggagaggcggcgacggcgaccggcggcggaggaggaggcgatgagcataatgtggcaggcgccgtgctacctggtgctgggcatggcggaggtgttcaccagcatcggcatgctggagttcttctacgagaggtcgccggggtccatgaagagcctcggcacgtcgctcgcgcacctggccgtcgcgacggcgaactacctcaactccggcgtgctcggcgtggtggcggcggccacgacgcgtggcggcggcgctgggtggatcccggacaacctcgatgaggggcaccttgactacttcttctggatgatggctcttgtcagtgtcctcaacctgctgcagttcttgcattgctcaatcagagatagaggccaataa

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Protein seq

MSLYEGAGSEGDGSVDIHNQPALERNTANWRACFMILGDVLSECLAFYGISKNLVTCYLAYMEAGAADEETPLIQQLPPEEQCSQYTCDGTVNSDKKPALKQSTGHWRACFFILGAQFAETLCFFMVSKNLVTYLTSALHESNIDAAQSVSIWIGTSFFTPLIGAFLADTYWGRYWTTVISLFIIIIGMLIVTVSSSPLFLNSSYYNWNICRATVYTGLYLTAVGSGCMKPCIPAFGADQFDSADPVERLAKGSFFNWYYFSMNVGSLLSTTLLVWVVANIGWSVGFAIPMLLSGFGIALFFAGRKVYRYKKQGGSPLTRVSQVVVAAVRNHRLKLPDDSSLLHEVSKVTEDDYRTQLTTQFRFFDKAAILSDEISPAQWSPWRLCTVSQVEELKMLLRMFPVWVSMVVFFVVTAQITSTLIEQGMAMDGRVGPFTLPAASIATFDVISVLVWVPVYDTVLVPLARRVTGKDRGISHLQRIGVGLALAAVAMAYSAVVEARRLGTAPAPVSIMWQAPSYLVLGVAEAFSVIGMMEFFYEQSPESMKSLCTALGQLAIAVANYLNSGVLVVVAAATTRGGGAGWIPDNLDEGHLDYFFWMMAVVSVLNLLHFLHCSIRYRANNNTLSSMHIYAFLVYKVGNLREQKAYHMEGADEERPLIHHLPPQEQCSQYTCDGTVDIDRRPALKHSTGNWRACFFILGAEFTQCLCFSAVVKNLVRYLTSVLQESNVNAARSVSTWIGTCFFTPLIGAFLADTFWGRYRTIVICLSVYSIGMLILTTSASLPFLLHDSYNNGDDIRRVVAYLGLYLIALGAGGIKPCMSALGADQFDGADPVERVTKGSFFNYYYFSNNMGTLLSTTVLVWVQDNIGWGIGFATPMLLMGFGLSMFVAGRRVYRYRKLGRSPLTRVSQVVVAAARNHRLKLPDDSSLLHELPSLTEGGYRIQHTTRFRFLDKAAIPSDSDDNSPVQPDPWRLCTVSQVEELKMLLRVFPLWASLLVFFVVTAQMSSTLIEQSAAMDGRIGPFTVPPASLATFNVVAVLIWVPVYDAVLVPLARRATGNDRGLSHLQRIGVGLALSAVAMAYSAQVERRRRRPAAEEEAMSIMWQAPCYLVLGMAEVFTSIGMLEFFYERSPGSMKSLGTSLAHLAVATANYLNSGVLGVVAAATTRGGGAGWIPDNLDEGHLDYFFWMMALVSVLNLLQFLHCSIRDRGQ

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsNaBo_10g0000450 OsNaBo_10g0000450.03 Chr10 947493 952092 - IsoSeq
CDS seq

atgattacaggactcaactcaccactcaattcaggttctttgacaaggctgccatcttgtccgacgagatctcgccggcgcagtggagcccgtggaggctgtgcacggtttcgcaggtggagg

Protein seq

MITGLNSPLNSGSLTRLPSCPTRSRRRSGARGGCARFRRWR

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 16.847605 9.358546 5.213346

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_10g0110800 RBH 2.853107 2.250106 0.562060
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os10g02210 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os10g0370700 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_10g0000490 RBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_10g0000500 RBH 0.430555 0.0 0.847521
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_10g0000480 RBH 0.0 0.0 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_10g0008670 RBH 0.000000 0.100770 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_10g0000420 RBH 0.0 5.338075 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_10G0013200 RBH 8.519718 0.045973 1.030231
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_10g0000460 RBH 0.0 0.000000 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_10G0013100 RBH 6.9686875 0.0215135 1.0891825
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_10g0000460 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_10g0000510 RBH 1.215366 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_10g0000470 RBH 6.427152 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_10g0000440 RBH 0.000000 0.0 0.000000
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_10g0000460 RBH 0.440640 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_10G000450 RBH 0.384519 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_03g0009670 SBH 0.640637 14.437302 5.806032
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