Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsNaBo_02g0006500 | OGI:02014330 | 16/16 | NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr02:4604123-4794555 | ||||||||
Gene Symbol | CYP71X12, OsEnS-26, EnS-26, Os CYP71X12, CYP71D8L, OsCYP71D8L, OsEnS-27 | ||||||||||
DNA seq | 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Function | Cytochrome P450 71D8 [UniProtKB/Swiss-Prot:O81974] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsNaBo_02g0006500 | OsNaBo_02g0006500.02 | Chr02 | 4606447 | 4634636 | + | NAM | ||
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Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsNaBo_02g0006500 | OsNaBo_02g0006500.03 | Chr02 | 4606447 | 4634627 | + | NAM | ||
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Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsNaBo_02g0006500 | OsNaBo_02g0006500.01 | Chr02 | 4604123 | 4606529 | + | NAM | ||
CDS seq | ATGAAGGCAAAGAAGAGAGTTATCAAGACTGATGTTTCCTGCACGTTACTGCCAgtggcgaggaaggcgagcggtaatggcgccggcaagccgaggcttccgccggggccgtggcggctgccggtcatcggcaacctgcaccagatcatggtgggcggaccgctcgtccaccgcaccatggccgacctggcccgccggctcgacgcgccgctcatgtcgctcaggctcggcgagctccgcgtcgtcgtcgcctcgtccgccgacgccgccagggagatcaccaagacgcacgacgtcgcgttcgcgacgcggccgtggagctccaccatccgcgtcctgatgagcgacggcgtcgggctggtgttcgcgccctacggcgcgctgtggcggcagctccgcaagatcgccgtggtGgagctcctcagcgcgcgccgcgtccaGtcgttccgccgcatccgggagGAcgaggtcggccgcctcgtcgccgccgtcgccgccgccgccgccgcctcggcggcgcagcccgtgaacgtcagcgagcggatcgcggcgctcatctccgactcggcggtgcgcaccatcatcggcgaccggttcgagaggcgggacgaattcctggagggcctcgccgaggggatcaagatcacctccgggttcagcctcggcgacctgttcccgtcgtcgaggctggccagcttcgtcggcggcacgacgcggcgggcggaggcgaaccaccgcaagaacttcgagctgatagagtgcgctctgaggcagcacgaggagcggagggccgccggcgccgtggacgacgacgaggacctcgtcgatgtgcttctcaggATGCCTCTCACCATGGGCAATATCAAAGCCGTCGTCCTGGAACTTTTTGGTGCTGGGAGCGAGACATCAGCTAATACACTTCAATGGGCGATGACTGAGCTCATAATGAATCCAAGAGTGATGCTGAAGGCACAAGCTGAGTTAAGTAACGTCATCAAAGGAAAGCAAACGATATCTGAAGATGACTTAGTTGAATTGAAGTACTTAAAACTTATTATCAAAGAGACCTTAAGGTTACATCCTGTAGTGCCACTACTTCTCCCTAGGGAATGTCGGGAGACATGTGAGGTCATGGGTTACGATATCCCCATAGGTATTACTGTGCTCGTTAACGTATGGGCAATAGGTAGAGATCCTAAGTATTGGGAGGATGCTGAGACATTCATACCTGAACGATTTGAGGATGGCCATATAGACTTCAAAGGAACAAACTTTGAATTTATACCGTTTGGAGCTGGACGAAGGATGTGtgccctggcatggcatttgcagaagtaa
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Protein seq | MKAKKRVIKTDVSCTLLPVARKASGNGAGKPRLPPGPWRLPVIGNLHQIMVGGPLVHRTMADLARRLDAPLMSLRLGELRVVVASSADAAREITKTHDVAFATRPWSSTIRVLMSDGVGLVFAPYGALWRQLRKIAVVELLSARRVQSFRRIREDEVGRLVAAVAAAAAASAAQPVNVSERIAALISDSAVRTIIGDRFERRDEFLEGLAEGIKITSGFSLGDLFPSSRLASFVGGTTRRAEANHRKNFELIECALRQHEERRAAGAVDDDEDLVDVLLRMPLTMGNIKAVVLELFGAGSETSANTLQWAMTELIMNPRVMLKAQAELSNVIKGKQTISEDDLVELKYLKLIIKETLRLHPVVPLLLPRECRETCEVMGYDIPIGITVLVNVWAIGRDPKYWEDAETFIPERFEDGHIDFKGTNFEFIPFGAGRRMCALAWHLQK
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Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsNaBo_02g0006500 | OsNaBo_02g0006500.04 | Chr02 | 4633969 | 4645335 | + | NAM | ||
CDS seq | atggctgagctcataatgaatccaagaacaatgctgaaggcacaagcagagttacgtgatgCcctccaaggaaagcAaatagtgtcagAatatgacttggttaaattgaagtatttgaaacttattatcaaggagaccttaaggttacatcctgtggtgccactacttctccctaGggaatgtcaggagacatgtaaggtcatggactacgatatccccataggtactattgtgcttgtgaacgtgtgggtaatcggtagagaccctaagtattgggatgacgccaagacatttagactcgagcgatttgaggatggccatgtagattttaaaggaatgaactttgaatatttaccttttggagcagggcgaaggatgtgccctggtgtggcatttgcagaagcaattatggagctcgctctagCctcattgctctatcactttgattgggagttCcccgatggcatcttgccggccaagatggATatgatggaggtgatgggttctaccGTGGCGTGGTGCGCTTGCTTCCTCTTCCTGGCTCTTATGGTGGTTAGGTTGAGGACGAAGCGGCGTGGCGACAATAATGGCGGGGTGAAGTTGCCGCCTGGGCCGTGGCGGCTGCCGCTCGTCGGCAACCTCCACCAGGTCATGGCGCGCGGCCCGCTCGTGCACCGCACCATGGCCGACCTGGCGCGCCGGCTCGACGCGCCGCTCATGTCGCTCAGGCTCGGCGAGGTCCCCGTCGTCGTCGCCTCGTCCGCCGACGCCGCCAGGGAGATCACCAAGACGCACGACGTCGCGTTCGCGACACGGCCGTGGAGCCCGACCACGCGGCGGCTGCGGTGCGACGGCGAGGGCGTGGTGttcgcgacgtacggcgcgctgtggcgccagctccgcaagctgtgcgtcgtcgagctgctcggcgcgcggcgcgtccggtcgttccgccgcgtccgcgaggaggaggcgcgccgcctcgtcgccgccgtcgccgcgtccccgcgcggcgaggccgtgaacgtcagcgagcggatcacggcggtgatcacggacgcgacgatgcgggccatgatcggggacaggttcgggcggcgcgacgagttcctggagctgctcgccgacatcgtcaagatcggctccgggttcagcctcgacgacctgttcccgtcgtggcgtctcgccggcgccatcggcggcatggcgcgccgcgccgaggcgaaccaccggaggacctacgagctgatggacagcgtgttccagcagcacgaacagcggagggttcacgttgctgcgccggctgacggcgccatggacgacgcggaggaggacctcgttgacgtgctcttcaggatacagaaagatggtggcctcgaggtgcctctcaccattggcaacatcaaagcaatcatcctggacctcttcaatgcagggagtgagacatcagcaaatacgctccagtgggttatgtcagagctaatgaggaacccaaaagtgatgagaaaagcacaagcagagttaaggaacaacctacaagggaagacaacggtaaccgaagacgatctcacaaatctaaagtacctgaagcttgtcatcaaggagacgcttaggttacatcccgtgctgcccttacttctcccaagagagtgccaagaagcatgcaatgtcatcgggtacgacgtccccAaatacactaccgtttttataaacgtgtgggcaatcaacagggaccccaaatattgggacatggccgagatgtttaagccagaacgctttgacaatagcatgattgacttcaaaggtacagacttcgagttcgtgccatttggggctggaagaaggatctgtcctggcatagcatttgcacagtccaatatggagcttgtgcttgctacactcctataccactttgactgggagcttcctagtggtatgtcgcctgaagagttagatatgactgaggacatgggactatctgtccgaaggaagaatgatctttacctacatccaacagtttccgccgccatggagcaggtctcgtgcttcgccgccgccgccgccgtcgtcgtcgtggttctcttgctcgcccgcatgctcctcgcgccgcgcggggagtgggacgggctgaacctgccgcccagcccgccgcggctgccgttcatcggcagcttccacctcctccgccgcagcccgctcgtccaccgcgcgctggccgacgtcgcgcggcagctcggctcgccgccgctcatgtacatgaggatcggcgagctcccggccatcgtcgtgtcgtccgccgacgcggcgcgcgaggtcatgaagacgcacgacatcaagttcgcgtcgcggccgtggccgccgaccatccggaagctgcgcgcgcaggggaagggcatcttcttcgcgccctacggcgcgctgtggcgccagctccgcaagatctgcatcgtcaagctgctcagcgtccgccgcgtcagctcgttccacggcgtccgcgaggaggaggccggccgcctagtcgccgccgtcgccgcgacgccgccgggacaggccgtgaacctgaccgagcggatcgaggtggtcatcgcggacacgacgatgcgccccatgatcggggagaggttcgagaggcgtgaggacttcctcgagctcctcccggaaatcgtcaagatcgcctccGggttcagcctcgacgacctgttcccgtcgtcgtggctcgcctgcgccatcggcggctcgcagcgccgcggcgaggcgagccaccggacatcctacgagctggtggacagcgccttccgccagcggcagcagcaaagggaggccatggccgcgtcgccgcctgacatcgccaaggaggaggaggatgatttgatggatgatctcatcaggatacacaaggaaggtagcctcgaggtgcctcttactgctggcaacttgaaagccgtcatcctagatctctttggtgctggaagcgagacatcctcggatgcgctccaatGggcaatgtcagagctgatgagaaacccaagagtgatggagaaagcacaaaacgaggttcaaagcatcctcaaagggaagccatcggtgaccgaagccgacgtagccaacctaaagtatctgaaaatgattgtcaaggagactcataggctacacccGgtgttaccgttgctcatcccaagggagtgccagcaaacttgccagatcatggggtatgatgtgccccaaggtagtgtcatatttataaactcgtgggcgataatgagggaccccaagcattgggatgatgccgagactttcaaaccagagcggtttgaggatggtgagatcgacctcaagggtacaaactatgagttcacaccatttggggctggacgtaggatctgccctggcttggcattagcccaggccagcatagagttcatgctcgccactctgctctaccacttcaactgggagctccctaacggggctgcaccggaggagctggacatgactgaggagatgggcatcaccatccgaaggaagaaggatctctacttgctcccaactctccgtgtgcctcttaccacatag
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Protein seq | MAELIMNPRTMLKAQAELRDALQGKQIVSEYDLVKLKYLKLIIKETLRLHPVVPLLLPRECQETCKVMDYDIPIGTIVLVNVWVIGRDPKYWDDAKTFRLERFEDGHVDFKGMNFEYLPFGAGRRMCPGVAFAEAIMELALASLLYHFDWEFPDGILPAKMDMMEVMGSTVAWCACFLFLALMVVRLRTKRRGDNNGGVKLPPGPWRLPLVGNLHQVMARGPLVHRTMADLARRLDAPLMSLRLGEVPVVVASSADAAREITKTHDVAFATRPWSPTTRRLRCDGEGVVFATYGALWRQLRKLCVVELLGARRVRSFRRVREEEARRLVAAVAASPRGEAVNVSERITAVITDATMRAMIGDRFGRRDEFLELLADIVKIGSGFSLDDLFPSWRLAGAIGGMARRAEANHRRTYELMDSVFQQHEQRRVHVAAPADGAMDDAEEDLVDVLFRIQKDGGLEVPLTIGNIKAIILDLFNAGSETSANTLQWVMSELMRNPKVMRKAQAELRNNLQGKTTVTEDDLTNLKYLKLVIKETLRLHPVLPLLLPRECQEACNVIGYDVPKYTTVFINVWAINRDPKYWDMAEMFKPERFDNSMIDFKGTDFEFVPFGAGRRICPGIAFAQSNMELVLATLLYHFDWELPSGMSPEELDMTEDMGLSVRRKNDLYLHPTVSAAMEQVSCFAAAAAVVVVVLLLARMLLAPRGEWDGLNLPPSPPRLPFIGSFHLLRRSPLVHRALADVARQLGSPPLMYMRIGELPAIVVSSADAAREVMKTHDIKFASRPWPPTIRKLRAQGKGIFFAPYGALWRQLRKICIVKLLSVRRVSSFHGVREEEAGRLVAAVAATPPGQAVNLTERIEVVIADTTMRPMIGERFERREDFLELLPEIVKIASGFSLDDLFPSSWLACAIGGSQRRGEASHRTSYELVDSAFRQRQQQREAMAASPPDIAKEEEDDLMDDLIRIHKEGSLEVPLTAGNLKAVILDLFGAGSETSSDALQWAMSELMRNPRVMEKAQNEVQSILKGKPSVTEADVANLKYLKMIVKETHRLHPVLPLLIPRECQQTCQIMGYDVPQGSVIFINSWAIMRDPKHWDDAETFKPERFEDGEIDLKGTNYEFTPFGAGRRICPGLALAQASIEFMLATLLYHFNWELPNGAAPEELDMTEEMGITIRRKKDLYLLPTLRVPLTT
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Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsNaBo_02g0006500 | OsNaBo_02g0006500.05 | Chr02 | 4604590 | 4794555 | + | IsoSeq | ||
CDS seq | aactcacacccatggccatggtgcaagacgtcaccggctacctgtgcctctccttgGctctcctcttgctcactctcgtcctccacaaggtggcgaggaaggcgagcggtaatggcgccggcaagccgaggcttccgccggggccgtggcggctgccggtcatcggcaacctgcaccagatcatggtgggcggaccgctcgtccaccgcaccatggccgacctggcccgccggctcgacgcgccgctcatgtcgctcaggctcggcgagctccgcgtcgtcgtcgcctcgtccgccgacgccgccagggagatcaccaagacgcacgacgtcgcgttcgcgacgcggccgtggagctccaccatccgcg
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Protein seq | NSHPWPWCKTSPATCASPWLSSCSLSSSTRWRGRRAVMAPASRGFRRGRGGCRSSATCTRSWWADRSSTAPWPTWPAGSTRRSCRSGSASSASSSPRPPTPPGRSPRRTTSRSRRGRGAPPSA |
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
A3 | Chr02 | 4633294 | 4634336 | + | OsNaBo_02g0006500.03 | OsNaBo_02g0006500.02,OsNaBo_02g0006500.03 | All |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.000000 | 1.786373 | 6.333513 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_02g0185200 | RBH | 0.705721 | 0.299313 | 5.023563 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os02g09200 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.500655 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os02g0185200 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_02g0006490 | RBH | 0.0 | 1.991726 | 1.326611 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_02g0006630 | RBH | 0.000000 | 2.286570 | 1.663732 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_02g0006420 | SBH | 0.0 | 0.901611 | 3.168767 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_02g0006340 | RBH | 0.531868 | 0.742172 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_02g0006390 | SBH | 7.072862 | 40.867245 | 5.219444 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0080500 | RBH | 4.278439 | 3.4071775 | 0.2237345 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_02g0006360 | RBH | 0.309638 | 4.869098 | 0.329344 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0083400 | RBH | 0.260263 | 3.9379715 | 0.036648 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_02g0006760 | RBH | 0.141070 | 0.080576 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_02g0006340 | RBH | 0.000000 | 12.116674 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_02g0006620 | RBH | 11.448141 | 55.997776 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_02g0006630 | SBH | 0.0 | 0.137042 | 0.000000 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_02g0006390 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_02G006500 | SBH | 0.617630 | 5.825593 | 0.997042 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_06g0023710 | SBH | 0.121947 | 28.218290 | 0.000000 |