Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsN22_12G013020 OGI:12048720 | 16/16 N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) Chr12:17504497-17535483
Gene Symbol -
DNA seq

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Function Putative disease resistance protein RGA3 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q7XA40]

Transcripts

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ATGGAGTTCGCCGTCAGCGCAGCACGGTGGGTGGTGGGCAGGGCGCTGGGCCCCGTCACCGGCGAGCTGCTGGAGGCATGGGCGGCGAGCAAGAAGCTTGGCCCCAACATCCGCGAGCTCAAGCTCCTGCTCCTCCATGCGCAGGCGATGCTCGAAAATGCCGAGGGCCGGGACATCCATAACGTTGCACTGGATCAGCTGATGTCTCAGCTCCGGGACCTGGCGTACGACGCCGACGACGTGCTGGACGAGCTCGATTACTTCCGCATCCAGGATGAGCTCGATGGCACGTACGAGGCGGTCGACGACGCTGAGGAGGAGAGGGGCCTTGTCCGTGGCCTCGCCCTGCACGCTCGCCACACCGCGAGAGCCATCGCCACTGCTGTCGGTAAATTCCTCCCTTTCTGCTCCCCCCCAACTGTGCATAATGGTGATGCCACTGGTGCTAAGGCAAATGAACAGCATCTCCAAGCCCCTAAATTGAAGTTTGTTAGGGTTGAAATGTCCAAAAAAATGTCAGAGATAGTAGAGCAGCTTAAGCCTGTTTGTGACGCTGTTGACAGAATTCTTGGGCCACTACAGCCTTCAGGCCACTCCAAAAATGCCAAAACCCAATGCATTGATTTAGAAAAACGACCTAAAACCACCCCAACAATTATTGAGCCTGAATTATTTGGAAGGAAAGACCTTAAAAGGATCGTGGCAGATGAAATTATGATTGGCAAATACCGTGATAATGACATTACCGTGCTTCCCATTGTTGGTCCGGGTGGTATCGGGAAGACAACTTTCACACAACACATATATGAAGAAGTGAAGAACCACTTTCAGATCTCCGTCTGGATATGTGTTTCTCAAAATTTCAATGCAAATGTATTAGCAAAGGAGATTGTAGAAAAAATGCCTGAGGGAAACAACGAAAAGAAAAATGAAAGTGACCAAGAGAAAATCGAGAAAAGAATACAATCAAAGCAATTCTTGCTTGTCTTGGATGATGTGTGGGAATATCATGAGGACGAGTGGAAAACCTTACTAGCTCCATTTAGAAAAAGTGGAACAAAAGGAAATATGGTAATAGTTACAACTCGAAAGCCAAAGGTAGCAAAAATGGTCGAATCAACCGATTGCTCAATAAAACTGGACCGTTTGGATCATGAAGATTCGATGCGGTTATTCCAGGCATGTGTGTTTGATAACAAGAAGACATGGGAAGATTATCCATCGGGTTTACAGAAAGTTGGGGTAGACATAGTGAAGAGATTGAAGGGTTTCCCTCTTGCTATAAAAACCGTAGGTCGGTTATTAAGGAATAAACTTACTTTGGACCGATGGACTAGAGTATATGAAAGTAAAGAATGGGAACTTCAGTCCAATGATGATGATATTATGCCGGCATTAAAGTTAAGCTATAACTATCTTCCTTTTCATCTACAACAGTGTTTCTCCTATTGTGCTTTGTTTCCTGAAGATTATAGATTTTGTGGACAAGAATTGATTAACTTGTGGATTGGACTGGGTTTACTTGGTACCGGTGATCAAAACAAGACAATGGAGTATTTAGGACTAGAGTATGTAGACCAATTGGTTGACAATGGGTTTTTTGAACAGGTTGGAAAAGAGCATGACAGTCCTTATGTAATGCATGACCTGTTGCATGAGTTGGCAACAAATATTTCGTCACACGAAATTCGTTGTCTAAATAGTTCAACTTTGTGTTCTATCAACGAAATTCCCAAATCTATACGTCACATGTCTATCATAGTAGATAACAGACACGTTGAGAATAGAATCGCCTTTGAAAATCATAAGAAAGACCTGAGTACACTAGGAAACAAATTGAAAGCTGGGAACCTACGCACAATTATGATTTTTGGAGAATATCATGGATGCTTTTACAAGATTTTTGGTGACGTTTTGATAGATGCAAAATCCCTTCGGGTTATTTTTTTGTCAGGGGCATCCTATGATGTTGGAGATGTGTTGTGTAACTTTTCAGAACTTGTACATCTTCGGTACTTAAGGATTAAAGATTCTAGGAGGTGTGTAGCAAGTCTACCCAATAGTATCACAAGATTTTACCACTTATTGGTCCTTGATTTACAAGAGCACTATGGTGAATTGGGTTTTCTAAGGGACATGGGAAACCTTCTAAAACTACGCCATTTTCTTGTCCATGGTGATTATATTCACTCTAGAATTTTTGAGGTGGGAAAACTAAATTTTTTACATGAGTTACGGATGTTTGAGGTCAAAAGAGAAATGAAAGGTTTTGACTTGGAGCAAATTGGGCGACTACTAGTACTCCGTGGGTCACTGGGCATTTATAACCTTGAAAAGGTAGAAGGGATCAAGGAAGCAAATGATGCAAAACTAGCATATCTAAACCATTTGGATAGTTTAGTATTGGGTTGGGACAATGAGCGATGTAATAAGGATCCTATCAGAGAAGGAAATGTTCTTGAAAGTCTTAAACCACATGACAACATTCGAGAGCTGCACATTGCAGGGCATGGAGGCGTATCTTGCCCGAATTGGCTAGGTGGAGACCTCTGCATTAGAAATTTGGAATCACTTCAGATAGAATCTGTAAATTGGGACACATTTCCACTTCCAGGAAAGTTGTACATGACTGAGGGTCAAGAGCGTCAGGGTTCTGTCACAAGCCACGACTTTCATAATCTGAAAAGGTTGGAGCTAGTTAACATACCAAAGCTGAAAAAATGGCATGGGGATGGTACCATTAATTTGCTCCCTCATTTGCAAGATCTCACTGTTATTGATTGCCTTGAATTATTGGAGTTGCCACTGTCACAGTCCACTTCCTCTCAATTTCAACAGAGCGTGGTCTGTTTTCCTGAACTACGGGAAATCACGATTTTAGGATGTCCAAAATTGTTGTCATTCCCCCCTATACCTTGGACTAATTCTCTGTGCTCTGTATCTATTGAAGGTGTGGATTCAGGTTTTGAGATGTTGAATTACAGTAAAGACGAACAATCAAACTCAAGATTGAATATCACGGGAAAAGATGCTCCGGATAGCATGTTTTGGAACGTGCTGGATTTCAATAATCTAACAGAACTGCAATTGTTGCGGATACAAAAGTGTCCTCCTATATCGTTGGATCACCTTAAAATGCTGACATGTCTCAAGACCCTTCAGATAACTAATTCAGGTAGCATATTGTTGCCAGTTGATAGTGAAAACGAAGTTAAGTATAATCTTTTAGTTGAGGAACTCAAGATCATCAATTCATGTGGTGCTAGTGGGAGGGAATTGACACAGGTGCTCTCTCATTTGCCCAAACTATCAATTTTGGTGATACGGGATTGTCAGAAAGTAGAAGGGCTCGGTGTGGCGGAGCAGCGAACAATTCCAACATCTGAATCATCACTGTCACCATCAACTAACGAAGCAGCCAGGGCACCAACCACAAGACTGCAGCAGCAGACAGGAGAAGCAGAAGAGATGGAAACAGCAGTAGCAGCAGACGATGGGTTGCTTCTCCTGCCTTCCAAGATAAAGGAGTTGCAAATCGATGGATGCAGAGAGCTAAGCCTCGACGGAGGCGGAATCCATGGTCTGCTCTCCCTCGAATCGTTGGTGATATCTGATTGCCGCAAGCTCCTCTGCTCCTCTTCATCCTCGTCTTCCCCTTTCCCGACCTCCCTGCAAACACTCTATCTCTTGAATGTGGAGGGCATGGAGACCCTGCCTTCTCCTCTCCCAAACCTCACCTCTTTGTACATTTCCCGTTGCGGCAATCTCAGAGGGGGCGAGGTGCTGTGGGATCTCCTTGCCCAAGGTCACCTCACCTCTCTAACTGTCGACGAAACCCCCAATTTCTTCCTTGGTTCAGAGCAGTCCTGCTCCCAGGTGGATGAACAAGAATACATGCATCGTTCCTGGAGGTTGCAGGAACTCAGGACGGATGACTTTGCAAGGGTTCTTGCTGCTCCCGTTTGCCATCTCCTCTCCTCCTCCCTAACCAAGTTAAGCCTTCGTAGGAACACCGAGGTGGAGTGCTTCACAATGGAGCAGGAGAAGGCCCTTCACATTCTCAAGTCCATTGAGGACCTACAATTTTGGTCCTGCGAAAAACTGCAGTCCCTCCCTACTGGGCTTAGTGAAATCCCCAACATCAAGACATTAGGGATCCGTGATTCTCCAGCCATCACTTCACTTAGAAACCTCCCCAATTCACTGCAACAACTAGTGATTTATGTCTGTCCAGCCATCAGCTCGCTTGGAAACCTCCCCAATTCACTGCAACAACTAGAGATTTCTTCCTGTCCAGCCATCAGCTCGCTTGGAAACCTCCCCAATTCACTACAACAACTAAAGATTTCTTCCTGTCCAGCCATCAGCTCGCTTGGAAACCTCCCCAATTCACTGCAACAACTAGTGATTTCTCTCTGTCCATCCATCAGCTCACTTGATGGCACAACCATCCACTCGCTACCCAAGGACCGCCTACCAACTTCGCTCCGAGAAATAGACGTCCGTGACTGCGGCAACGAGGAGCTAAAAAGGCAGTGCCGCAAGCTTCAAGGAACTATCCCAATTGTACCATGTGGGTTGTTGATCATGACTTCATTCTTTCAAAAAGAAAATGGCATCACCCTTAAAAGCCAGAACCCGACGAAGGCAGAGCAGCTTGGCATGGAGCAAGCATCTGAAAGTTGTCTACCACCTCTGCCAATCTCGCTGGAACCAAAAACCTCCACTGCTTCGAAAGCAACAGAACCTTATAACAAAAGCAACAGCTTGTTTATCAATTCAGGAACTGAGAAGTCTGGTTTCATGAGCTTCTATCGGCGGCGGCGCCAGCTCCCATCGGTGACAGTGGCAGCCATCGGCCGGTGGGCTCCTATCGGATGCAGGTTCCATTGGCTGTGGCATAGAAATCCTATTGGCCCCAAACTACCATCGGCGCCCAAGTTCCCCTCGACTTCCCGTCCACAGCGTGGGGGCAGGAGTGCTTATATTAAAAATAGGAACAAAATGCAAGAGCAGCATTCGAGGTGTTTCATTCAAGGAACAGAAGCAGCAGAGGTGACACCGTTGATGGAGCCATACATGCTGCTATTGTCAGCGAACGCCGAGTCCGGCAACATGACGAGACCCGTTGCAATGCACGGGCATCAGACTAGAATAGCAACAAGAGCACCAGCAACTGAGAAGAACCAGGTGCCGAAGGGCCATTTTTACCCCGTCTACTACCAAGTACTTAGTCATGTAAGTTTCACATATCTATATATATGTTTAGTCTTTTTTTGTGCAGCAATTTTGACAAATTGA

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Protein seq

MEFAVSAARWVVGRALGPVTGELLEAWAASKKLGPNIRELKLLLLHAQAMLENAEGRDIHNVALDQLMSQLRDLAYDADDVLDELDYFRIQDELDGTYEAVDDAEEERGLVRGLALHARHTARAIATAVGKFLPFCSPPTVHNGDATGAKANEQHLQAPKLKFVRVEMSKKMSEIVEQLKPVCDAVDRILGPLQPSGHSKNAKTQCIDLEKRPKTTPTIIEPELFGRKDLKRIVADEIMIGKYRDNDITVLPIVGPGGIGKTTFTQHIYEEVKNHFQISVWICVSQNFNANVLAKEIVEKMPEGNNEKKNESDQEKIEKRIQSKQFLLVLDDVWEYHEDEWKTLLAPFRKSGTKGNMVIVTTRKPKVAKMVESTDCSIKLDRLDHEDSMRLFQACVFDNKKTWEDYPSGLQKVGVDIVKRLKGFPLAIKTVGRLLRNKLTLDRWTRVYESKEWELQSNDDDIMPALKLSYNYLPFHLQQCFSYCALFPEDYRFCGQELINLWIGLGLLGTGDQNKTMEYLGLEYVDQLVDNGFFEQVGKEHDSPYVMHDLLHELATNISSHEIRCLNSSTLCSINEIPKSIRHMSIIVDNRHVENRIAFENHKKDLSTLGNKLKAGNLRTIMIFGEYHGCFYKIFGDVLIDAKSLRVIFLSGASYDVGDVLCNFSELVHLRYLRIKDSRRCVASLPNSITRFYHLLVLDLQEHYGELGFLRDMGNLLKLRHFLVHGDYIHSRIFEVGKLNFLHELRMFEVKREMKGFDLEQIGRLLVLRGSLGIYNLEKVEGIKEANDAKLAYLNHLDSLVLGWDNERCNKDPIREGNVLESLKPHDNIRELHIAGHGGVSCPNWLGGDLCIRNLESLQIESVNWDTFPLPGKLYMTEGQERQGSVTSHDFHNLKRLELVNIPKLKKWHGDGTINLLPHLQDLTVIDCLELLELPLSQSTSSQFQQSVVCFPELREITILGCPKLLSFPPIPWTNSLCSVSIEGVDSGFEMLNYSKDEQSNSRLNITGKDAPDSMFWNVLDFNNLTELQLLRIQKCPPISLDHLKMLTCLKTLQITNSGSILLPVDSENEVKYNLLVEELKIINSCGASGRELTQVLSHLPKLSILVIRDCQKVEGLGVAEQRTIPTSESSLSPSTNEAARAPTTRLQQQTGEAEEMETAVAADDGLLLLPSKIKELQIDGCRELSLDGGGIHGLLSLESLVISDCRKLLCSSSSSSSPFPTSLQTLYLLNVEGMETLPSPLPNLTSLYISRCGNLRGGEVLWDLLAQGHLTSLTVDETPNFFLGSEQSCSQVDEQEYMHRSWRLQELRTDDFARVLAAPVCHLLSSSLTKLSLRRNTEVECFTMEQEKALHILKSIEDLQFWSCEKLQSLPTGLSEIPNIKTLGIRDSPAITSLRNLPNSLQQLVIYVCPAISSLGNLPNSLQQLEISSCPAISSLGNLPNSLQQLKISSCPAISSLGNLPNSLQQLVISLCPSISSLDGTTIHSLPKDRLPTSLREIDVRDCGNEELKRQCRKLQGTIPIVPCGLLIMTSFFQKENGITLKSQNPTKAEQLGMEQASESCLPPLPISLEPKTSTASKATEPYNKSNSLFINSGTEKSGFMSFYRRRRQLPSVTVAAIGRWAPIGCRFHWLWHRNPIGPKLPSAPKFPSTSRPQRGGRSAYIKNRNKMQEQHSRCFIQGTEAAEVTPLMEPYMLLLSANAESGNMTRPVAMHGHQTRIATRAPATEKNQVPKGHFYPVYYQVLSHVSFTYLYICLVFFCAAILTN

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsN22_12G013020 OsN22_12G013020_03 Chr12 17534379 17535483 - IsoSeq
CDS seq

CGCAACTCTACTGCATCTGGGCTCCGGTGTCGTCCGTCCGCCTCACGCCTGCTGGCCCTTTTCGGCTTTTCGTGGATATGGAGTTCGCCGTCAGCGCAGCACGGTGGGTGGTGGGCAGGGCGCTGGGCCCCGTCACCGGCGAGCTGCTGGAGGCATGGGCGGCGAGCAAGAAGCTTGGCCCCAACATCCGCGAGCTCAAGCTCCTGCTCCTCCATGCGCAGGCGATGCTCGAAAATGCCGAGGGCCGGGACATCCATAACGTTGCACTGGATC

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Protein seq

RNSTASGLRCRPSASRLLALFGFSWIWSSPSAQHGGWWAGRWAPSPASCWRHGRRARSLAPTSASSSSCSSMRRRCSKMPRAGTSITLHWI

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.128770 7.711901 0.360691

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_12g0482100 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os12g29690 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os12g0481700 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_12g0013340 RBH 0.184188 1.082872 0.883537
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_12g0013460 RBH 0.0 2.561674 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_12g0013370 RBH 0.0 4.450537 1.150632
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_12g0013160 RBH 0.0 0.150093 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_12g0012870 RBH 1.994427 37.424152 4.356055
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_12G0245700 RBH 2.846766 15.6669405 0.328378
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_12g0013050 RBH 0.000000 0.625657 0.000000
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_12G0266000 RBH 0.1470785 2.616916 0.592985
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_12g0013000 SBH 0.145359 0.271764 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_12g0013330 RBH 0.504766 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_12g0013170 RBH 0.0 15.008129 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_12g0013120 RBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_12g0013300 RBH 0.443981 0.695107 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_12g0012810 RBH 0.182731 0.0 0.442502
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