Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsN22_11G019690 | OGI:11019930 | 10/16 | N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:25126919-25163747 | ||||||||
Gene Symbol | RLCK338, OsRLCK338, WRKY125, OsWRKY125, RYMV3, OsRYMV3 | ||||||||||
DNA seq | 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CDS seq | ATGGCTTGTTGCAATTATCAAGCTGAACATATTTTCAAGATGGAACCTCTCAGTAGCGATCTCTCCAAAAAGTTATTTCTCGACGTAGTTCTTGGATCTGGAAAAGAATGTCCTGAACAATTTAACAGTGTTCTGGACGAGATTACAGGAAAATGTGGTGGTTTACCTCTAGCCCTTATCAGCGTAGCCAATATCGTATCAAGTCAACCGGAAACGCTGAAGCACTGGGAGCTTGTGAAGTATTTCATACGTAACAATTTGGGAACAAACCCAACTCCTGAGGAGATACTGAAAGCTGTACTGGAACATTGTTACAGTAGTCTTCCTCATTATTTGAAGACATGTCTGATGTACCTTAGTGTATATCCTGAGAACTATATGATCTTGAAAGATGATTTGGTGAAGCAATGGGCAGCTGAGGGTTTTGTCTCTGCAAAAGAAGGGAAAGATGTTGTGGAAGTTGGCGGGAACTATTTTGATGAACTTGTCAATCTGGGCCTGATCCAACATATGGACCTCGACTATAATGACGAGATGTTGTATGTAGTGCCCCATATGGTACTTGATCTTATTACACGCAAGTCCATAGAAGATAATTTCGTCATTGTCATCAATTATTCTCAAACAAAAGTTCGGTTGTCGGAGAAGGTTCGTCGGCTGTCCCTCCACTTTGGCAGTGCAACAAATGCAACAACACCAACAAGTATCAATCTGTCGCAAGTTCGTTCGCTTAGCTTTGTGGGACTATTCAACCGCATGCCTTCAATTAAGGACTTCAAGTTTCTCCGAGTTGCAATCCTTCATACTTTGGGGGACAATAGAAGCAGGTGTTTCAACCTCACAGCAATTTGTGCACTGTTCCAGCTGATATATTTGCAGATCAGATGTAACGTCGATGTAAAACTGCCACACAAGATGGACCATCTAACACAGTTGGAAACCCTGGAGATAAATGCAGCTGTTCCGTCCGACGTTATGCGTATACCGAGTTTATTGTATCTCCAACCTGAAAGGGAGAAAAAACTGCACACCGTGAATGGTAACACAAAATATCTCACTCTGGGTCCTACTGCTTCGAGCACGGTTAGCGCATACTCTCCTCCCATCTTTCTTCAGAGATTGGAGCTGTTGCCAATTCCAAGACTTCCCCAATGGATTCAACAACCCCAGAAGCTCTCTTGTTTGAAAATTATGGTCGGGGAACTACATAGGAGTGATATTGGTGTCCTTGCAGGATTGCCGGCTCTCACAGTTCTGTGCGTGTATATCCGGCAACCCACTGCAGAAAGCTTCATCATTGAAAGAGGGACTTTCCCTGTTCTCAAGTACTTTGAGTTTATGTGTGATGTAATACTGTTCCTGGAATTTCAGGAAGAAGCAATGCCCAATCTTAGGAGGCTCAAGGTGGGCTTCAACGCTCATAAGGGACAGAAGTATGGCAATATGCTTGCTGGCATTCAGCACCTGTTAAACCTTAAGGAGATTGCTAGAAAAATTGGGGCAGCCACGGATGCTGATGAATCTGACAAGAGAGCTGCGGAGTATGCTTTTCATTGTGCGATCAGCAAACATCCATGTTGTCGAAACTTCGACGTGAGAAGGGTGGATCAAGTTGATGAAGATTATTCTCCTTCAGAGATACAGGAATGGGACCAAGATAAGGACTCTTCCAGCGAGCAACAATGGACTCCAAAGAAACAACCTGAAGAACTGGAAAACGAGTCAAAGGACAGTGGGATCGCTCAGGTTTCCATTCAGCCAGAAATTCATCTTTCACCTCGGTTGAAGTCAGGAAGTACCAGCGCCAGCGGTAACATCATTCAAATCGAATTACACCAGAGAAGTGTGATGCTCGGGGATGTTACAATCCAGTTTTTAGAAAATATTACAGATCATTTTTCAGAGGAGTGCATAGTTGGTATTGGTCGATATGGAAATGTTTACAAGGGAGTACTAGAAAATGGGGAAGAGATTGCTGTGAAGAAGCTCAATCGCAAGCTGTCACTTGATGCTGTGCAGTTTAAGAATGAATTAGTTAACCTTATGAATGTCCAACACCAAAATACTGTACAGTTAATTGGTTACTGCTATGAAACAAGAGACCAAGTGGAGGAAAGAGCTGTCTGTTTCGAATATTTGCCGCGTGGAAGCCTTGACAAGTATCTTTCTGATGAATCCGCTGGGCTTGATTGGTGCACCCGTTACAAAATAATAAAGGGTATTTGCGACGGTGTAAACTACCTTCATAATGGACGGCAAGAGGGTATTTACCATCTTGATTTAAAACCTGGCAATATATTGCTGGACAAGAACTACATACCAAAAATTGCAGATTTTGGTTTGTCGAGACTCTTGGGAATACCATCATTCGATCATATAACAGAAAAGCATATAGGAACAGACGGGTACACGCCACCGGAATACGTTGAGACAGGCCGAATCTCAGAGAAGTTTGATGTATTTAGTTTGGGTCTGATGATCATAGAAATAATGACAGGACATAAGAAACAGTCCAAAAGGGGTGAGATGTCTTCGAAACAGTTCATCGATGTCATACATGAAAACTGGAAAAAAAGATGGCAGCAGGCAACGCCGATGTATACAACAGAAGAGCTAGATCGTCTTCAACTTCAAGTGAAAATATGTATAGAAATGGCGTTACAGTGTGTGGAGCCTGAGCAACTGAAAAGGCCTACCATGCTGGAGGTTGTCAGCAGACTAGATGATATGTTCCAGAACAGGTCATCACCGCCGTTGTTTTCAACTTCTTCAACGATCGATCCAGCGTCACGCCGATCTCAGGTATGA
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Protein seq | MACCNYQAEHIFKMEPLSSDLSKKLFLDVVLGSGKECPEQFNSVLDEITGKCGGLPLALISVANIVSSQPETLKHWELVKYFIRNNLGTNPTPEEILKAVLEHCYSSLPHYLKTCLMYLSVYPENYMILKDDLVKQWAAEGFVSAKEGKDVVEVGGNYFDELVNLGLIQHMDLDYNDEMLYVVPHMVLDLITRKSIEDNFVIVINYSQTKVRLSEKVRRLSLHFGSATNATTPTSINLSQVRSLSFVGLFNRMPSIKDFKFLRVAILHTLGDNRSRCFNLTAICALFQLIYLQIRCNVDVKLPHKMDHLTQLETLEINAAVPSDVMRIPSLLYLQPEREKKLHTVNGNTKYLTLGPTASSTVSAYSPPIFLQRLELLPIPRLPQWIQQPQKLSCLKIMVGELHRSDIGVLAGLPALTVLCVYIRQPTAESFIIERGTFPVLKYFEFMCDVILFLEFQEEAMPNLRRLKVGFNAHKGQKYGNMLAGIQHLLNLKEIARKIGAATDADESDKRAAEYAFHCAISKHPCCRNFDVRRVDQVDEDYSPSEIQEWDQDKDSSSEQQWTPKKQPEELENESKDSGIAQVSIQPEIHLSPRLKSGSTSASGNIIQIELHQRSVMLGDVTIQFLENITDHFSEECIVGIGRYGNVYKGVLENGEEIAVKKLNRKLSLDAVQFKNELVNLMNVQHQNTVQLIGYCYETRDQVEERAVCFEYLPRGSLDKYLSDESAGLDWCTRYKIIKGICDGVNYLHNGRQEGIYHLDLKPGNILLDKNYIPKIADFGLSRLLGIPSFDHITEKHIGTDGYTPPEYVETGRISEKFDVFSLGLMIIEIMTGHKKQSKRGEMSSKQFIDVIHENWKKRWQQATPMYTTEELDRLQLQVKICIEMALQCVEPEQLKRPTMLEVVSRLDDMFQNRSSPPLFSTSSTIDPASRRSQV |
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Function | Disease resistance protein RGA5 [UniProtKB/Swiss-Prot:F7J0N2] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsN22_11G019690 | OsN22_11G019690_01 | Chr11 | 25141317 | 25148942 | + | NAM | ||
CDS seq | ATGGCTTGTTGCAATTATCAAGCTGAACATATTTTCAAGATGGAACCTCTCAGTAGCGATCTCTCCAAAAAGTTATTTCTCGACGTAGTTCTTGGATCTGGAAAAGAATGTCCTGAACAATTTAACAGTGTTCTGGACGAGATTACAGGAAAATGTGGTGGTTTACCTCTAGCCCTTATCAGCGTAGCCAATATCGTATCAAGTCAACCGGAAACGCTGAAGCACTGGGAGCTTGTGAAGTATTTCATACGTAACAATTTGGGAACAAACCCAACTCCTGAGGAGATACTGAAAGCTGTACTGGAACATTGTTACAGTAGTCTTCCTCATTATTTGAAGACATGTCTGATGTACCTTAGTGTATATCCTGAGAACTATATGATCTTGAAAGATGATTTGGTGAAGCAATGGGCAGCTGAGGGTTTTGTCTCTGCAAAAGAAGGGAAAGATGTTGTGGAAGTTGGCGGGAACTATTTTGATGAACTTGTCAATCTGGGCCTGATCCAACATATGGACCTCGACTATAATGACGAGATGTTGTATGTAGTGCCCCATATGGTACTTGATCTTATTACACGCAAGTCCATAGAAGATAATTTCGTCATTGTCATCAATTATTCTCAAACAAAAGTTCGGTTGTCGGAGAAGGTTCGTCGGCTGTCCCTCCACTTTGGCAGTGCAACAAATGCAACAACACCAACAAGTATCAATCTGTCGCAAGTTCGTTCGCTTAGCTTTGTGGGACTATTCAACCGCATGCCTTCAATTAAGGACTTCAAGTTTCTCCGAGTTGCAATCCTTCATACTTTGGGGGACAATAGAAGCAGGTGTTTCAACCTCACAGCAATTTGTGCACTGTTCCAGCTGATATATTTGCAGATCAGATGTAACGTCGATGTAAAACTGCCACACAAGATGGACCATCTAACACAGTTGGAAACCCTGGAGATAAATGCAGCTGTTCCGTCCGACGTTATGCGTATACCGAGTTTATTGTATCTCCAACCTGAAAGGGAGAAAAAACTGCACACCGTGAATGGTAACACAAAATATCTCACTCTGGGTCCTACTGCTTCGAGCACGGTTAGCGCATACTCTCCTCCCATCTTTCTTCAGAGATTGGAGCTGTTGCCAATTCCAAGACTTCCCCAATGGATTCAACAACCCCAGAAGCTCTCTTGTTTGAAAATTATGGTCGGGGAACTACATAGGAGTGATATTGGTGTCCTTGCAGGATTGCCGGCTCTCACAGTTCTGTGCGTGTATATCCGGCAACCCACTGCAGAAAGCTTCATCATTGAAAGAGGGACTTTCCCTGTTCTCAAGTACTTTGAGTTTATGTGTGATGTAATACTGTTCCTGGAATTTCAGGAAGAAGCAATGCCCAATCTTAGGAGGCTCAAGGTGGGCTTCAACGCTCATAAGGGACAGAAGTATGGCAATATGCTTGCTGGCATTCAGCACCTGTTAAACCTTAAGGAGATTGCTAGAAAAATTGGGGCAGCCACGGATGCTGATGAATCTGACAAGAGAGCTGCGGAGTATGCTTTTCATTGTGCGATCAGCAAACATCCATGTTGTCGAAACTTCGACGTGAGAAGGGTGGATCAAGTTGATGAAGATTATTCTCCTTCAGAGATACAGGAATGGGACCAAGATAAGGACTCTTCCAGCGAGCAACAATGGACTCCAAAGAAACAACCTGAAGAACTGGAAAACGAGTCAAAGGACAGTGGGATCGCTCAGGTTTCCATTCAGCCAGAAATTCATCTTTCACCTCGGTTGAAGTCAGGAAGTACCAGCGCCAGCGGTAACATCATTCAAATCGAATTACACCAGAGAAGTGTGATGCTCGGGGATGTTACAATCCAGTTTTTAGAAAATATTACAGATCATTTTTCAGAGGAGTGCATAGTTGGTATTGGTCGATATGGAAATGTTTACAAGGGAGTACTAGAAAATGGGGAAGAGATTGCTGTGAAGAAGCTCAATCGCAAGCTGTCACTTGATGCTGTGCAGTTTAAGAATGAATTAGTTAACCTTATGAATGTCCAACACCAAAATACTGTACAGTTAATTGGTTACTGCTATGAAACAAGAGACCAAGTGGAGGAAAGAGCTGTCTGTTTCGAATATTTGCCGCGTGGAAGCCTTGACAAGTATCTTTCTGATGAATCCGCTGGGCTTGATTGGTGCACCCGTTACAAAATAATAAAGGGTATTTGCGACGGTGTAAACTACCTTCATAATGGACGGCAAGAGGGTATTTACCATCTTGATTTAAAACCTGGCAATATATTGCTGGACAAGAACTACATACCAAAAATTGCAGATTTTGGTTTGTCGAGACTCTTGGGAATACCATCATTCGATCATATAACAGAAAAGCATATAGGAACAGACGGGTACACGCCACCGGAATACGTTGAGACAGGCCGAATCTCAGAGAAGTTTGATGTATTTAGTTTGGGTCTGATGATCATAGAAATAATGACAGGACATAAGAAACAGTCCAAAAGGGGTGAGATGTCTTCGAAACAGTTCATCGATGTCATACATGAAAACTGGAAAAAAAGATGGCAGCAGGCAACGCCGATGTATACAACAGAAGAGCTAGATCGTCTTCAACTTCAAGTGAAAATATGTATAGAAATGGCGTTACAGTGTGTGGAGCCTGAGCAACTGAAAAGGCCTACCATGCTGGAGGTTGTCAGCAGACTAGATGATATGTTCCAGAACAGGTCATCACCGCCGTTGTTTTCAACTTCTTCAACGATCGATCCAGCGTCACGCCGATCTCAGGTATGA
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Protein seq | MACCNYQAEHIFKMEPLSSDLSKKLFLDVVLGSGKECPEQFNSVLDEITGKCGGLPLALISVANIVSSQPETLKHWELVKYFIRNNLGTNPTPEEILKAVLEHCYSSLPHYLKTCLMYLSVYPENYMILKDDLVKQWAAEGFVSAKEGKDVVEVGGNYFDELVNLGLIQHMDLDYNDEMLYVVPHMVLDLITRKSIEDNFVIVINYSQTKVRLSEKVRRLSLHFGSATNATTPTSINLSQVRSLSFVGLFNRMPSIKDFKFLRVAILHTLGDNRSRCFNLTAICALFQLIYLQIRCNVDVKLPHKMDHLTQLETLEINAAVPSDVMRIPSLLYLQPEREKKLHTVNGNTKYLTLGPTASSTVSAYSPPIFLQRLELLPIPRLPQWIQQPQKLSCLKIMVGELHRSDIGVLAGLPALTVLCVYIRQPTAESFIIERGTFPVLKYFEFMCDVILFLEFQEEAMPNLRRLKVGFNAHKGQKYGNMLAGIQHLLNLKEIARKIGAATDADESDKRAAEYAFHCAISKHPCCRNFDVRRVDQVDEDYSPSEIQEWDQDKDSSSEQQWTPKKQPEELENESKDSGIAQVSIQPEIHLSPRLKSGSTSASGNIIQIELHQRSVMLGDVTIQFLENITDHFSEECIVGIGRYGNVYKGVLENGEEIAVKKLNRKLSLDAVQFKNELVNLMNVQHQNTVQLIGYCYETRDQVEERAVCFEYLPRGSLDKYLSDESAGLDWCTRYKIIKGICDGVNYLHNGRQEGIYHLDLKPGNILLDKNYIPKIADFGLSRLLGIPSFDHITEKHIGTDGYTPPEYVETGRISEKFDVFSLGLMIIEIMTGHKKQSKRGEMSSKQFIDVIHENWKKRWQQATPMYTTEELDRLQLQVKICIEMALQCVEPEQLKRPTMLEVVSRLDDMFQNRSSPPLFSTSSTIDPASRRSQV
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Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsN22_11G019690 | OsN22_11G019690_02 | Chr11 | 25126919 | 25163747 | + | IsoSeq | ||
CDS seq | ATGATATGTTCCAGAACAGGTCATCACCGCCGTTGTTTTCAACTTCTTCAACGATCGATCCAGCGTCACGCCGATCTCAGGTTTCCGCTGTTGACTCTGTCCAATGCCGATTTGGCGCCGATATTTCGCGGCCGTGGCTTCAAACTTTCAGTAGCAGAGGTGATTTACCTCTTGCCGATTGCCGTGACTTTTGTCAACGGTGCCTTCCGCACGACAGCGGCAATTGTTTACCTTGGCGGTCGTCTCTCTGCTTGCCTCCTTTTTCTAGTGAACGGGCACGGAATACGT
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Protein seq | MICSRTGHHRRCFQLLQRSIQRHADLRFPLLTLSNADLAPIFRGRGFKLSVAEVIYLLPIAVTFVNGAFRTTAAIVYLGGRLSACLLFLVNGHGIR |
Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.296461 | 0.0 | 6.449069 |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0608700 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g39450 | SBH | 0.132167 | 0.0 | 0.0 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0608700 | SBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0019910 | RBH | 0.539556 | 0.000000 | 4.344735 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0020060 | RBH | 0.403046 | 0.503076 | 7.053586 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0019810 | RBH | 0.0 | 1.277061 | 8.648860 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0019420 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0019910 | RBH | 10.528748 | 10.091044 | 67.766655 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0357900 | SBH | 0.017112 | 0.1586795 | 0.00849 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0020370 | RBH | 0.380389 | 0.037181 | 1.955859 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0373500 | RBH | 5.666233 | 12.9110585 | 0.023048 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0020140 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0020380 | RBH | 0.178934 | 0.0 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0019840 | RBH | 2.318632 | 0.0 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0019630 | SBH | 0.094062 | 0.0 | 0.0 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0019740 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G019670 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.0 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0020080 | RBH | 1.616697 | 12.793002 | 10.449384 |