Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsN22_11G019690 OGI:11019930 | 10/16 N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) Chr11:25126919-25163747
Gene Symbol RLCK338, OsRLCK338, WRKY125, OsWRKY125, RYMV3, OsRYMV3
DNA seq

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Protein seq

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Function Disease resistance protein RGA5 [UniProtKB/Swiss-Prot:F7J0N2]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsN22_11G019690 OsN22_11G019690_01 Chr11 25141317 25148942 + NAM
CDS seq

ATGGCTTGTTGCAATTATCAAGCTGAACATATTTTCAAGATGGAACCTCTCAGTAGCGATCTCTCCAAAAAGTTATTTCTCGACGTAGTTCTTGGATCTGGAAAAGAATGTCCTGAACAATTTAACAGTGTTCTGGACGAGATTACAGGAAAATGTGGTGGTTTACCTCTAGCCCTTATCAGCGTAGCCAATATCGTATCAAGTCAACCGGAAACGCTGAAGCACTGGGAGCTTGTGAAGTATTTCATACGTAACAATTTGGGAACAAACCCAACTCCTGAGGAGATACTGAAAGCTGTACTGGAACATTGTTACAGTAGTCTTCCTCATTATTTGAAGACATGTCTGATGTACCTTAGTGTATATCCTGAGAACTATATGATCTTGAAAGATGATTTGGTGAAGCAATGGGCAGCTGAGGGTTTTGTCTCTGCAAAAGAAGGGAAAGATGTTGTGGAAGTTGGCGGGAACTATTTTGATGAACTTGTCAATCTGGGCCTGATCCAACATATGGACCTCGACTATAATGACGAGATGTTGTATGTAGTGCCCCATATGGTACTTGATCTTATTACACGCAAGTCCATAGAAGATAATTTCGTCATTGTCATCAATTATTCTCAAACAAAAGTTCGGTTGTCGGAGAAGGTTCGTCGGCTGTCCCTCCACTTTGGCAGTGCAACAAATGCAACAACACCAACAAGTATCAATCTGTCGCAAGTTCGTTCGCTTAGCTTTGTGGGACTATTCAACCGCATGCCTTCAATTAAGGACTTCAAGTTTCTCCGAGTTGCAATCCTTCATACTTTGGGGGACAATAGAAGCAGGTGTTTCAACCTCACAGCAATTTGTGCACTGTTCCAGCTGATATATTTGCAGATCAGATGTAACGTCGATGTAAAACTGCCACACAAGATGGACCATCTAACACAGTTGGAAACCCTGGAGATAAATGCAGCTGTTCCGTCCGACGTTATGCGTATACCGAGTTTATTGTATCTCCAACCTGAAAGGGAGAAAAAACTGCACACCGTGAATGGTAACACAAAATATCTCACTCTGGGTCCTACTGCTTCGAGCACGGTTAGCGCATACTCTCCTCCCATCTTTCTTCAGAGATTGGAGCTGTTGCCAATTCCAAGACTTCCCCAATGGATTCAACAACCCCAGAAGCTCTCTTGTTTGAAAATTATGGTCGGGGAACTACATAGGAGTGATATTGGTGTCCTTGCAGGATTGCCGGCTCTCACAGTTCTGTGCGTGTATATCCGGCAACCCACTGCAGAAAGCTTCATCATTGAAAGAGGGACTTTCCCTGTTCTCAAGTACTTTGAGTTTATGTGTGATGTAATACTGTTCCTGGAATTTCAGGAAGAAGCAATGCCCAATCTTAGGAGGCTCAAGGTGGGCTTCAACGCTCATAAGGGACAGAAGTATGGCAATATGCTTGCTGGCATTCAGCACCTGTTAAACCTTAAGGAGATTGCTAGAAAAATTGGGGCAGCCACGGATGCTGATGAATCTGACAAGAGAGCTGCGGAGTATGCTTTTCATTGTGCGATCAGCAAACATCCATGTTGTCGAAACTTCGACGTGAGAAGGGTGGATCAAGTTGATGAAGATTATTCTCCTTCAGAGATACAGGAATGGGACCAAGATAAGGACTCTTCCAGCGAGCAACAATGGACTCCAAAGAAACAACCTGAAGAACTGGAAAACGAGTCAAAGGACAGTGGGATCGCTCAGGTTTCCATTCAGCCAGAAATTCATCTTTCACCTCGGTTGAAGTCAGGAAGTACCAGCGCCAGCGGTAACATCATTCAAATCGAATTACACCAGAGAAGTGTGATGCTCGGGGATGTTACAATCCAGTTTTTAGAAAATATTACAGATCATTTTTCAGAGGAGTGCATAGTTGGTATTGGTCGATATGGAAATGTTTACAAGGGAGTACTAGAAAATGGGGAAGAGATTGCTGTGAAGAAGCTCAATCGCAAGCTGTCACTTGATGCTGTGCAGTTTAAGAATGAATTAGTTAACCTTATGAATGTCCAACACCAAAATACTGTACAGTTAATTGGTTACTGCTATGAAACAAGAGACCAAGTGGAGGAAAGAGCTGTCTGTTTCGAATATTTGCCGCGTGGAAGCCTTGACAAGTATCTTTCTGATGAATCCGCTGGGCTTGATTGGTGCACCCGTTACAAAATAATAAAGGGTATTTGCGACGGTGTAAACTACCTTCATAATGGACGGCAAGAGGGTATTTACCATCTTGATTTAAAACCTGGCAATATATTGCTGGACAAGAACTACATACCAAAAATTGCAGATTTTGGTTTGTCGAGACTCTTGGGAATACCATCATTCGATCATATAACAGAAAAGCATATAGGAACAGACGGGTACACGCCACCGGAATACGTTGAGACAGGCCGAATCTCAGAGAAGTTTGATGTATTTAGTTTGGGTCTGATGATCATAGAAATAATGACAGGACATAAGAAACAGTCCAAAAGGGGTGAGATGTCTTCGAAACAGTTCATCGATGTCATACATGAAAACTGGAAAAAAAGATGGCAGCAGGCAACGCCGATGTATACAACAGAAGAGCTAGATCGTCTTCAACTTCAAGTGAAAATATGTATAGAAATGGCGTTACAGTGTGTGGAGCCTGAGCAACTGAAAAGGCCTACCATGCTGGAGGTTGTCAGCAGACTAGATGATATGTTCCAGAACAGGTCATCACCGCCGTTGTTTTCAACTTCTTCAACGATCGATCCAGCGTCACGCCGATCTCAGGTATGA

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Protein seq

MACCNYQAEHIFKMEPLSSDLSKKLFLDVVLGSGKECPEQFNSVLDEITGKCGGLPLALISVANIVSSQPETLKHWELVKYFIRNNLGTNPTPEEILKAVLEHCYSSLPHYLKTCLMYLSVYPENYMILKDDLVKQWAAEGFVSAKEGKDVVEVGGNYFDELVNLGLIQHMDLDYNDEMLYVVPHMVLDLITRKSIEDNFVIVINYSQTKVRLSEKVRRLSLHFGSATNATTPTSINLSQVRSLSFVGLFNRMPSIKDFKFLRVAILHTLGDNRSRCFNLTAICALFQLIYLQIRCNVDVKLPHKMDHLTQLETLEINAAVPSDVMRIPSLLYLQPEREKKLHTVNGNTKYLTLGPTASSTVSAYSPPIFLQRLELLPIPRLPQWIQQPQKLSCLKIMVGELHRSDIGVLAGLPALTVLCVYIRQPTAESFIIERGTFPVLKYFEFMCDVILFLEFQEEAMPNLRRLKVGFNAHKGQKYGNMLAGIQHLLNLKEIARKIGAATDADESDKRAAEYAFHCAISKHPCCRNFDVRRVDQVDEDYSPSEIQEWDQDKDSSSEQQWTPKKQPEELENESKDSGIAQVSIQPEIHLSPRLKSGSTSASGNIIQIELHQRSVMLGDVTIQFLENITDHFSEECIVGIGRYGNVYKGVLENGEEIAVKKLNRKLSLDAVQFKNELVNLMNVQHQNTVQLIGYCYETRDQVEERAVCFEYLPRGSLDKYLSDESAGLDWCTRYKIIKGICDGVNYLHNGRQEGIYHLDLKPGNILLDKNYIPKIADFGLSRLLGIPSFDHITEKHIGTDGYTPPEYVETGRISEKFDVFSLGLMIIEIMTGHKKQSKRGEMSSKQFIDVIHENWKKRWQQATPMYTTEELDRLQLQVKICIEMALQCVEPEQLKRPTMLEVVSRLDDMFQNRSSPPLFSTSSTIDPASRRSQV

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsN22_11G019690 OsN22_11G019690_02 Chr11 25126919 25163747 + IsoSeq
CDS seq

ATGATATGTTCCAGAACAGGTCATCACCGCCGTTGTTTTCAACTTCTTCAACGATCGATCCAGCGTCACGCCGATCTCAGGTTTCCGCTGTTGACTCTGTCCAATGCCGATTTGGCGCCGATATTTCGCGGCCGTGGCTTCAAACTTTCAGTAGCAGAGGTGATTTACCTCTTGCCGATTGCCGTGACTTTTGTCAACGGTGCCTTCCGCACGACAGCGGCAATTGTTTACCTTGGCGGTCGTCTCTCTGCTTGCCTCCTTTTTCTAGTGAACGGGCACGGAATACGT

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Protein seq

MICSRTGHHRRCFQLLQRSIQRHADLRFPLLTLSNADLAPIFRGRGFKLSVAEVIYLLPIAVTFVNGAFRTTAAIVYLGGRLSACLLFLVNGHGIR

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.296461 0.0 6.449069

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0608700 SBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g39450 SBH 0.132167 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0608700 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0019910 RBH 0.539556 0.000000 4.344735
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0020060 RBH 0.403046 0.503076 7.053586
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0019810 RBH 0.0 1.277061 8.648860
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0019420 SBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0019910 RBH 10.528748 10.091044 67.766655
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0357900 SBH 0.017112 0.1586795 0.00849
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0020370 RBH 0.380389 0.037181 1.955859
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0373500 RBH 5.666233 12.9110585 0.023048
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0020140 SBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0020380 RBH 0.178934 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0019840 RBH 2.318632 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0019630 SBH 0.094062 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0019740 SBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G019670 RBH 0.0 0.000000 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0020080 RBH 1.616697 12.793002 10.449384
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