Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsN22_10G009380 OGI:10043300 | 16/16 N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) Chr10:14370180-14379847
Gene Symbol -
DNA seq

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Function -

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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Protein seq

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsN22_10G009380 OsN22_10G009380_02 Chr10 14370180 14379698 + IsoSeq
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Protein seq

MISVFSDLDKIDDNTFGLRPLKDFRATCYFQPKPTHSRSNAIRAKLDSAIGSMIPDCLKKKISELLSSHFCSHHVLDSEPCEDILISILALLAESSQFHPLEVPTTHISPQINTEAGPSNREPTSPKARQSDFCVLNDDGVRSPAKHTSLSNVELYEKSVSRSTGKGCTSLDRIADLYGSIANCDDDNMLLNNLSAHPKAVVTPCGNANASSSHEDEPLLTPDVAYLRTRNNILNETNEGPSLAALSLVKNVANKFRSRITHFNSRTPFLGEEMPSFKLLDSDDDISDCDKENEVAEAITPACSQVFFLLSFCFEYFIKQFFLLYHCRIFSLFILLRTLLM

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
RI Chr10 14376170 14376560 + OsN22_10G009380_02 OsN22_10G009380_01,OsN22_10G009380_02 All
SE Chr10 14378503 14378776 + OsN22_10G009380_02 OsN22_10G009380_01,OsN22_10G009380_02 All
SE Chr10 14379102 14379498 + OsN22_10G009380_02 OsN22_10G009380_01,OsN22_10G009380_02 All
A5 Chr10 14374383 14374741 + OsN22_10G009380_02 OsN22_10G009380_01,OsN22_10G009380_02 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.579052 10.434855 5.091031

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU NA NA NA NA NA
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db NA NA NA NA NA
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_10g0009230 RBH 1.089063 22.967749 20.505877
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_10g0009140 RBH 2.097970 20.222458 23.682117
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_10g0009530 RBH 0.449267 0.710699 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_10g0009290 RBH 6.340539 40.158993 40.812637
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_10G0223500 RBH 10.6692925 19.3029355 67.4645425
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_10g0009280 RBH 0.063929 1.721786 2.833768
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_10G0241200 RBH 11.8254855 24.068471 38.9450495
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_10g0009070 RBH 0.296149 0.892168 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_10g0014400 SBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_10g0009450 RBH 8.714168 35.698872 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_10g0009060 RBH 1.178018 0.0 3.951163
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_10g0009560 RBH 0.895590 10.006795 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_10g0009350 RBH 4.153382 18.559391 7.819826
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