Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsN22_07G008870 | OGI:01102940 | 16/16 | N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | Chr07:8295617-8308727 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
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| Function | Uncharacterized protein KIAA0930 homolog [UniProtKB/Swiss-Prot:Q801S4] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsN22_07G008870 | OsN22_07G008870_01 | Chr07 | 8295617 | 8308727 | - | NAM | ||
| CDS seq | ATGGAAAGGAATGACCAAGGCTTCTTGACAGCCATTATTAAGGTTGAGTCTTATTTTACCACATCGCTTTTGGGTCAAAGGACATATGTTAAGGGAAACAATGTCAAAATTTCTATCGAAAGGGATAGGTATTCGATGCTTGCGCTAGTTGACGATGTAGGGGAAAATTTTAACTGGGGGCCAAATCAATACATCGGCTTTTGGAAATTGGGTGATGTGTCAACTCAGAGTAAAGTAGAGATAACCACAGATTCACAATTGCTAGATTGGTTGGATAAGGGTAATCAGCACGGGGTTGTCAATATTCATGCCATTGTCAATGATTTTGGTGGTCCATTGCAAGTTGAACCTTCACCAACTAAAAGAAGGTGCCACCCATCTGTGAGGTATTCTATTCCATGTACTCCACCACTATTTACTGACCTATTGGTTGATGCTACGCCACTAACACTGCCTGAGAGTTACAACCATCTTGAGAACTCCATCCAACCAGTACCATCCACCCAAAATGAGAGCACCACCCATCCGGAGAGCACTTCACATCCTGATGATGAAGCCACATCCCCTATTAAAAAGAGTGCAAAGAAGGTTGTAAAAAAGTGTGCAAAGAGGAGGAGCCAAGACGATGACGATGATGAAGAGGTTTGGGATGATGAGAAGGAAGAGAACGAAGAGGAGGAGCCCCAGCTATGCCCAAATTGTGACCCACTAGAGGTTGATAGTGATAGCAGCTATGATAGTGATGCAGCAGCCTCCTCTGACTCTGAATATGATTGTGATGATCTTGATGACCAAATACATGATGACGATGACAATGACTCTGACCTTGAGCATGTGTTTGCATATGATTTTGATAACCCATGTATTGATGAAGGAGAGCGCCCACGCAACGGCGGCAATCTCGTTGAGCGCGGATCTAACCGGAGAGGTGGTCCAGGCGGCGTTGTCTCCAAGCCCACGAATGAGCTGCTGACTATGGTGAAAAAACATTCCCATTTGATTGGGTGGACAGTTGTTGATGCTGAAGATGATGCATCAGACGTGGGAATGGATGATCGATTCTGGCATGAAATGCTTGATCTTTTCTTCGTGCGTGGTAGGGTTTCAAAGAGGAGGGAAGAGGATGACCTCGTCTTTTTTGTTAATAATAATATGAAAATGCATGGCCATGGGTTCAACGATAACATGGAAGATCCACCTCCTTTTTTTGTGAGAAGATGGGCTCCTATGCTTGAAAAGATCAGCAATATAAATTCAGCTGGAGTTGATTGGGAGCGTTCATTCTATTTGAATTTAATTGCTCACACATCATACACTGTTACAGTTGCAATATGCAGTGTCAGGGATCTTCGCAGCCGTGTAGAGAAAAGCAAACCATTATCACCAGTTTATAAGGTCACAAAAACTGTGTATGCATCCCCAAGCCGTGTAAATTTTCATCTTGATCGAAGAAAGGCTGTGGAAACTGTACCTGCATATCCCAATATTTGTTTCTCAGTTGATGACTTCGATGATACTTTTGATGCTGTTGTTTTGTCAGACCCCGAACATTGCTATTGTGTGATTCTCAATGCACATGATGGGGCAGCTTTTCCTGAAGACACTGAATCGAAGAATGCCAGCTCAAATCTACTAAACACTGGGAGCAACCAAGAAAAACCACCAAAGAGAACACTCTTCTCAGGCTACGTTAGCTACCAAAATGTTCGAGAAGCCTACAATGCTGGCAGATCACAATTTGGGAGCTTACTCTCACTCGGGCATGACCAAACTAAACTTGATAAACTTTATATGAGGGGCCCTGAAGGACGTGGGGAAGTTGAAGTAGCTGTTTCTGGAATTGCAGATCAGAGCCATGAGAGATCAAAGAAAGATCCAGGAGATAGCTTTCGAGTCTTTGTTCATAGGGCAGCTTCTGCTGCATCAAAGCTGGCAAAGCATGCCTACGAGGCTGCATCTACCAACAAACGATTTGATCATGAGCTTCTGCCTCTGAAATGTTGCTTGATGTCGGTATCTCTTCCTTGGGACTACATTGCACATGACCTGCTACACAAGTCACAGATTACCGAGTATTGGCTGTTGTCAAACAATATAGTCCACGTGTAA
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| Protein seq | MERNDQGFLTAIIKVESYFTTSLLGQRTYVKGNNVKISIERDRYSMLALVDDVGENFNWGPNQYIGFWKLGDVSTQSKVEITTDSQLLDWLDKGNQHGVVNIHAIVNDFGGPLQVEPSPTKRRCHPSVRYSIPCTPPLFTDLLVDATPLTLPESYNHLENSIQPVPSTQNESTTHPESTSHPDDEATSPIKKSAKKVVKKCAKRRSQDDDDDEEVWDDEKEENEEEEPQLCPNCDPLEVDSDSSYDSDAAASSDSEYDCDDLDDQIHDDDDNDSDLEHVFAYDFDNPCIDEGERPRNGGNLVERGSNRRGGPGGVVSKPTNELLTMVKKHSHLIGWTVVDAEDDASDVGMDDRFWHEMLDLFFVRGRVSKRREEDDLVFFVNNNMKMHGHGFNDNMEDPPPFFVRRWAPMLEKISNINSAGVDWERSFYLNLIAHTSYTVTVAICSVRDLRSRVEKSKPLSPVYKVTKTVYASPSRVNFHLDRRKAVETVPAYPNICFSVDDFDDTFDAVVLSDPEHCYCVILNAHDGAAFPEDTESKNASSNLLNTGSNQEKPPKRTLFSGYVSYQNVREAYNAGRSQFGSLLSLGHDQTKLDKLYMRGPEGRGEVEVAVSGIADQSHERSKKDPGDSFRVFVHRAASAASKLAKHAYEAASTNKRFDHELLPLKCCLMSVSLPWDYIAHDLLHKSQITEYWLLSNNIVHV
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_07g0248800 | RBH | 4.174281 | 3.441407 | 6.778121 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os07g14514 | RBH | 3.570382 | 2.342859 | 2.038675 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os07g0248800 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_07g0008960 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_07g0009120 | RBH | 0.784123 | 3.101742 | 4.343029 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_07g0008950 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_07g0008700 | RBH | 0.024185 | 0.257277 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_07g0008880 | RBH | 11.933231 | 6.803971 | 20.153700 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_07G0144500 | RBH | 0.0120695 | 0.2675805 | 0.020899 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_07g0009370 | RBH | 2.008326 | 0.317291 | 2.703401 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_07G0146100 | RBH | 4.7678275 | 10.331994 | 10.7107335 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_07g0008820 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_07g0008850 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_07g0008840 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_Ung0053870 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_07g0008880 | RBH | 1.131242 | 6.666399 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_08G000240 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_07g0008800 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
