Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsARC_07g0008700 OGI:01102940 | 16/16 ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr07:8131013-8144711
Gene Symbol -
DNA seq

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Function Uncharacterized protein KIAA0930 homolog [UniProtKB/Swiss-Prot:Q801S4]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
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Protein seq

MERNDQGFLTAIIKVESYFTTSLLGQRTYVKGNNVKISIERDRYSMLALVDDVGENFNWGPNQYIGFWKLGDVSTQSKVEITTDSQLLDWLDKGNQHGVVNIHAIVNDFGGPLQVEPSPTKRRCHPSVRYSIPCTPPLFTDLLVDATPLTLPESYNHLENSIQPVPSTQNESTTHPESTSHPDDEATSPIKKSAKKVVKKCAKRRSQDDDDDEEVWDDEKEENEEEEPQLCPNCDPLEVDSDSSYDSDAAASSDSEYDCDDLDDQIHDDDDNDSDLEHVFAYDFDNPCIDEGERPRNGGNLVERGSNRRGGPGGVVSKPTNELLTMVKKHSHLIGWTVVDAEDDASDVGMDDRFWHEMLDLFFVRGRVSKRREEDDLVFFVNNNMKMHGHGFNDNMEDPPPFFVRRWAPMLEKISNINSAGVDWERSFYLNLIAHTSYTVTVAICSVRDLRSRVEKSKPLSPVYKVTKTVYASPSRVNFHLDRRKAVETVPAYPNICFSVDDFDDTFDAVVLSDPEHCYCVILNAHDGAAFPEDTESKNASSNLLNTGSNQEKPPKRTLFSGYVSYQNVREAYNAGRSQFGSLLSLGHDQTKLDKLYMRGPEGRGEVEVAVSGIADQSHERSKKDPGDSFRVFVHRAASAASKLAKHAYEAASTNKRFDHELLPLKCCLMSVSLPWDYIAHDLLHKSQITEYWLLSNNIVHV

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsARC_07g0008700 OsARC_07g0008700.02 Chr07 8131013 8137854 - IsoSeq
CDS seq

CTCATGTCATGTTGCGTTGCGTTGCGGGAGGAAGAAGGGAATCTGATTGCTTCCTTCTTCCTTCTTCGATTCAGAATCACTTTGTTTCTTCTTTCTTCTTCTATCTATCTATCTACCTGTGGAGACGAGAGGAGAGGAAATCTATGGCGTCTCCTCCTTCGCCCTCCGCATCACGCGCAGTCGCAGTCGAGAGATCACCGGGGTTCGGCTTGGAGCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCGTCGTCGTCGGCCCCCTCAAGGAATGAGC

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Protein seq

LMSCCVALREEEGNLIASFFLLRFRITLFLLSSSIYLSTCGDERRGNLWRLLLRPPHHAQSQSRDHRGSAWSPPPPPPPRRRRPPQGMS

Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source
AL Chr07 8131013 8131762 - OsARC_07g0008700.02 OsARC_07g0008700.01,OsARC_07g0008700.02 All

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.024185 0.257277 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_07g0248800 RBH 4.174281 3.441407 6.778121
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os07g14514 RBH 3.570382 2.342859 2.038675
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os07g0248800 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_07g0008960 RBH 0.000000 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_07g0009120 RBH 0.784123 3.101742 4.343029
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_07g0008950 RBH 0.0 0.0 0.000000
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_12g0015800 RBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_07g0008880 RBH 11.933231 6.803971 20.153700
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_07G0144500 RBH 0.0120695 0.2675805 0.020899
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_07g0009370 RBH 2.008326 0.317291 2.703401
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_07G0146100 RBH 4.7678275 10.331994 10.7107335
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_07g0008820 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_07g0008850 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_07g0008840 RBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_Ung0053870 SBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_07g0008880 RBH 1.131242 6.666399 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_07G008870 RBH 0.0 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_07g0008800 RBH 0.0 0.0 0.0
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