Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsN22_03G026030 OGI:03076650 | 16/16 N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) Chr03:25973960-25995053
Gene Symbol -
DNA seq

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Protein seq

MYYQYLDESCGKVNDRKAELKSQGGKAVKRNDYLAASKIYSEALELDYFDATLYSNRSLCNLQIGEAQKALLDADRCVELRPKWVKGHYREGAALMVLKEHKKAFEAFLNVLKLDPANAEIEKVIFGFRVGLVFGRALPYLNDGGPQSQFFEAATHGDVSRLRGEHGGWSSLTAAGPVLAFSWACVLAMSAATRLGEVDACRCMVEELGFDINAGRELGHDEVERLLLSRGASVDIAYFHGTPLHIAAAYGKANVMKVLLEHDADPNKVSEELGTPLVATLHATSQGLAESVSLKCKTTRRGADVNFSDRDTPLVVAITNGLTNCIKYLLKAGADPNIPTCHCGALPIQLAASYGRRKDVELLFPLTCPIRAVSNWTVEGILAHAKSKHARSKCSKPKDKQDDHNKKAQFKLRGEKAIKDKHDEQDKKAQLKLQGEKAVKRKDYHGASILYTEAIELDPTDATLYSNRSLCHLQMTEALFDADYCIKSRPEWLKGYYRKGAALMLLKEYEKACDAFLAGLKLDPSNAEMEKISKVLIANTREEKTQQQQQHQQQQPH

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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsN22_03G026030 OsN22_03G026030_01 Chr03 25973960 25981015 + NAM
CDS seq

ATGGGCGTCGCGGGCATCAGGCCGCTCCAGGCGGCGGCGCGCTTGGGGGAAATGGAGTCGTGCAGGTGCATGGTGGAGGAGCTCGGCTTCGACATCAATGCCGGCAGCCAGCTTGGCATAACAGCTTTGGCTGCTGCTGCGTTGGATGGAAGACTGGCTGCTGCAAGAGGAGCTAGCATTGATATAGCTTATTTTCATGGGACACCACTACATATTGCTGCTGCATATGGGAAGGCTGGAGTCATGAAAGTTTTATTGGAGCACCATGCAGATCCAAACAAGGTTTCAGAAGAGTTGGGTACACCGTTGGTTGCAACTCTTCATGCTACTTCTCAAGGACTAGCTGAGTCTGTTTCATTGAAGTGTGTAAAACTACTCGTCGAGGCAGGTGCTGACGTTAACTTCAGTGATCGTGACACTCCGTTGGTGGTAGCAATTACTAATGGCTTGACTAACTGCATTAAATACTTGCTAAAGGCTGGTGCAGACCCTAATATCCCAACTTGTGATTGTGGTGCCTTGCCAATACAACTTGCTGCAAGCTATGGAAGAAGAAAGGACGTGGAGTTACTGTTCCCGTTAACTTCCCCCATTCGAGCTGTGTCAAACTGGACCATTGAAGGAATTCTTGCCCAGGCCAAATCGGAACATGCCAAATCAAAATGTTCAAAGCCCAAGGACAAGCAAGATGGTCAGAATGAAAAGGCTCAGCTCAAACTATGTGGTGACAAAGCTGTTAAGAGAAAGGACTACCGTGGTGCCTCAAATTTCTACAGTCAGGCAATTGAGATGGATCCTACTGATGCAACACTCTATTCGAATAGGAGCCTTTGCCATCTTCAAATGACCGAAGCAGAGGCAGCTTTGTTTGATGCTGAGTTTTGCATACAATCGCGGCCTGAATGGATAAAAGGTTATTACAGGAAAGGAGCTGCTCTCATGTTGCTGAAGAAGCACGAAAAGGCATGCGATGCTTTCATGGCTGGACTGAAGCTGGAACCTGGAAATGCTGAGATGGAGAAAGCATTACGGGAGGCGATTGAGGCGATGAAGAAGCATCATGTCGCTACAAAGAGCTTCAAGCCATCCGATTAG

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Protein seq

MGVAGIRPLQAAARLGEMESCRCMVEELGFDINAGSQLGITALAAAALDGRLAAARGASIDIAYFHGTPLHIAAAYGKAGVMKVLLEHHADPNKVSEELGTPLVATLHATSQGLAESVSLKCVKLLVEAGADVNFSDRDTPLVVAITNGLTNCIKYLLKAGADPNIPTCDCGALPIQLAASYGRRKDVELLFPLTSPIRAVSNWTIEGILAQAKSEHAKSKCSKPKDKQDGQNEKAQLKLCGDKAVKRKDYRGASNFYSQAIEMDPTDATLYSNRSLCHLQMTEAEAALFDAEFCIQSRPEWIKGYYRKGAALMLLKKHEKACDAFMAGLKLEPGNAEMEKALREAIEAMKKHHVATKSFKPSD

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.000000 0.0 0.0

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_03g0680600 SBH 0.0 0.0 0.000000
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os03g47720 SBH 0.0 0.0 0.000000
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os03g0680600 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_03g0030090 SBH 0.0 0.0 0.399815
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_03g0029820 SBH 0.0 0.0 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_03g0029880 SBH 0.0 0.0 0.000000
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_03g0029950 SBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_03g0029690 SBH 0.0 0.000000 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_03G0467600 RBH 0.055224 0.030247 0.7244175
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_03g0029400 SBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_03G0468700 SBH 0.012549 0 2.1404165
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_03g0029720 SBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_03g0029790 SBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_03g0029750 SBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_03g0029570 SBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_03g0029530 SBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_03G026010 RBH 0.000000 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_03g0029480 RBH 0.0 0.0 0.0
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