Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsN22_02G004230 OGI:02001930 | 10/16 N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) Chr02:2916346-2923729
Gene Symbol -
DNA seq

ATGGCGTACACTGTGTGCTTGTGATCTTTTATCACTTCAAGCAGCTACATTTTGAATCCGTCCCAATTAACTCACTTGTGACTGTTGAGTGTTGACTGCTCTTGGCATGTGATGATCTTTTGCAGAAATCGAAAGATCAACCTGCATTGGTTACATTTGTTCTTCAGTGGAGGTTTTGGTCGTAGATGCGTGGTGTCTGTTATTTTTTTTCTTTTTTTGACTATAGCCTTTTAGTGTCGTAGACTTTAATTTTCTCCTACTATATCATACGAAACGTCGCACTATCTTGCGCATGTTGTTTAAAAAAATACATTGGTTACATTACTTCTTTTTAATCTTTATAAATGGTTTGGCTACACTGCTAAAAATTTAACTGATGCATGTTACATGTTTGTGTGCTGCTGGTGGTGGTGGAATGCGTTTGCGCTTGCATGGTTGAACAAAGTTTGATCAAGCCTAAGTTTCAAGTAAAGATTGTGTTGTTTGTTTGCCAATCTGATGGACCTGCTTTGTGCGGTAAAAGCTTGTACTCATGTACTGCTATAGTGCTGTCCACTAGTAGAATATTGCTTTCATTTCCTTTTTTCAGTTCAAGATGCTTGCGGTTGTTGCTTCTATTAAATTTCGGTAAAGTTTGTGTGAAATTTCTGTGTCACAGTCTCACAGACAGCTCTTGGATTCGCATATTCCAGATTTACCATGTCTAAAGTCTGATATCATCTCAGATCGCTTCGGCTCTCGTTCCGGGCTTGTATTTTATAACGAAAACCGCTATACATACGACATTTTGTTTGCGATTGCTTTACAATCACACGTTCTCTACCCGTGTTTGTTGACTATTGCAAATTTTGGTCCCACACAAAAAACATATGCAGATGGCACTCATTAAATCGTTCTAGGATCGTAATAAAAATCGTATGCATAGTATTTTTTCCATTTTATAACAAAAAAGTAGAGACATGGCAAACTGAATGTAGCTCATGTAGTTATGTTTCTAGTGATAGAATTAGCTTGCTCGGATTTAAGTCTTAGACTTGACATGGATACTTATACTTACCGCTAAATATTCTTTCAGTTGACAAGAGTAAGATGCTCAAGGTTATTTTGCCAGTCTCAAGTTATAATAACTCAGTTTTTCGAAGATGCTCATAGATATTATATGTGTGTATGTATATTTATAGAGGTGAATATGCACATATGATGTGTGTCTATGTTTATATTATTTTTTAAAAAATAGAGGATGAGAAATCTATCGTGTTAATATGCTACCCGGCATAAGGTATATCTCGACGTTTTGATATTCAATTCCTCGATCGGAACTATGATTCTATACTGAAATTATTTTAGGGGTTCTTTTAAACGCATGAATTTCATTTTATTTATAGTGATAAAGTTATGGGGTACTTTCTCCGTTTCACAATGTAAGTCATTCTAACATTTCTCATATTCATATTGATATTTGTGAATCTAGATAGATATATATATGTCTAGATTCATTAATATTATTATAAATGTGGAAAATATTAGAATGACTTACATTGTAAAACGGAGGTAGTATATAACTTCACCTACCAAAATTTAAATAGTGATGTCTAAGAATAATACGCACACACGAATATTGTATTATATTGTCGATGCATCGAAGATTTACAAGTTGCTGTAGTGTTGACCTAGTAGTTGCTTGGTGCTATTCCTAGGGTCTTTCCTCTCTTATTTCCTTTTTGCCGACATGATGTGAGTCTCAGATTGTTTGACATTATCCCCTAATTAAAAAAGAAAGATTGTTTGACATTGACAGTAGAGCTTGCTCTTGAATCGGACCAAGTAAATTTCTTCACCATACACCTGGCCTCTGGAAACACGCTTTTATATTATAATAACACGGCTTAAATTCTGGTTCTTTTACCATGATGGTGACGTACACTGCCGGCCCGCTGCTAATAATCTCATTGCTCTCTCTATCATCTGCATTTTCATAATCCATCCCAAACAATCAATTTGCTCTAATTGCATTACTTTTTTTTCTCGAGAGAGAGAGATGGTTGGTTTGGTTATGAAAGAGTAAACTGGTGCAGGTCTTAGGCTGTGTTTAGTTTACGCTGAAGTTTGTAATTTTGGTTGAAATTGGTATGATATGATAGAAAAGTTACGTGTGTACGAAAGATTTGATGGGATGGAAAGTTGGAAATTTGAAAAAAAAAACTTTGAAACTAAACAGGGCCTAACATGTTTGCATGCATGGTTGGGCTACTGAAATTCGTTTGCGTTTGCATGGTTGAACAAACTTTGTGCCTTCAAGTTTTCATATATCCCTCCGTTGTTGTTTTCTGCGAAATTTCAACAAAAGTTGATGTGAAAATTCTATGTTAATTACTGCATACACATATTTCAAAATTACTCTGTCTAAAGCATGTCAGATTCCGCGCTTTGTTCTGGACTTATATATTTATACCCTTCTTTCAGTCTTTCAGGCCACTACTAAAGAAAGTACTTATATAAGCAGCAGACTTGAAAAATTGTCACATAAAACTTATATTTAGATGGTGAAGAGAATAGAGTGAATAATTAAGGTCACAAAATTTATAGGTAGCTATAGGGGAAGACACTATGTAAATGAGAGATGAATTGGGTATTAATGATGTAGTAGTATAATATATTTATAAGTAACTATTCTAGAGTAAACTATTAGACTCTATTTAGAGGAATATAAGATTTTGATAAGCAACCGGTTAGTATCCAACTTAGAATTTAGATAGCTGAAAAACTCAGTTTTTAACTTTTAATTCATTTTCTAGGTTTTACAATTATAAATTCTTAGAATCTGGCTTAGATTCTACAACTATTAGAGCAAGGTTAATAGTGTCGCCCGTTGCTTACTCTTGTAGTCTTCCACCTCAGTTATAGACGTCAATGCAATAGTTTCTTCATCATCTATTGTACAACACACTCTTCAATACAAAGCATACTTTATTCCCCTTTCTCTCCAAGTTGTTCACCTTTCTCTTTCTTCTTTCACTTGCTAGTGTTTTCACCATGAGCTTAGCTCCTAGCAACAAGTTAAAACATTGCAGTAGAACTCTTTCATACCGAGCATGGTACAGCTAAGCCGAAGAGGACGCGGCCGAGCTCGAGAGCCTCCTTCGACACCGTCGTCGAGCTCGACAGCGAGTGGGCTGAGCTGGTTGTTTCTATGCTCAAGAGCACCTCCTCCAATGTCGTTGCCATGGACCTTCGCGCTTCTCTCCCCTCCATAGTTGGCCTAATCTTCACGTGACTGCGCGCACGTTTGATCGCACAGGACCACGTGGCGTCAGCATGCCTGCTGATGACACCCAAAGTTTTTTTTAGAGCCTGTGTACAGTCGGCGACTATTTAGTTGCTAATTTGCTCTCTCTCATCCCGTCTCTCTCCTCTAGATCATCGAAAAAAATAATGTGGCACACATATTGTTGGCTACTATCGTTCTATTATATTTGCTTAGGAAAAAGCTACATCTGCTAGGTATAACATGCCGATTTTCTGAGCTGGACTCTCTAAACTGTAGTATTGCCAATGCTAACGAAATTGGTATTTTTCATTTTGGCCCTTCTTTCATCATCGCGATTTTTGTTTACGTCCAGGAATTTTTACAACGTAGCCCCTGTATTAGCGTGGCACTCCGTTTCCCTCCCCTCCGCCAAGCCGCCGCCACCTCCTATCCAGCGAAGCGAGAGGGCGGCGCCGCGGCGAGGAGCGGAAACCTCGAGGTGAGGTTAGCCATGTCTCTTTCCCTCCTGATTCGAGCCGCGGCCAGAAGGCGGGAGGAAATCCCCCGAATCAAAACCCCCCGTAGCCGGCCGCTGAACAGCTCGCGTCCAGATGAATCGCGTCGCTGTTCTCTCTGCAGCCGCCTCCTCTTAGATCGATTTGCTGCCTGATTAACTTGTCCTTTGTAGAATTTATGTCAGGAGGTCTAGTTAGAAGGAAGGATTGTGTAGAGTGTAGCTGCTTCATGTCAGATTTGGGATGTGGCGCGGCATGAGTTCTTTTGTCTGCAACGATTTATGACATTTCTCAATTCAGTATTGCTGTTTCACTAGTTGCAGATTGTGATCCCCTCATGGCAAATTGCAGAGATAGTTGTTTAAATATAGTCACAAAATTAATACAAGAATGTTTACATTCATGTGTAATATTGTCAAGACTTATGTACTGGCAGATTTCAGTTTACTTCAGTTCCTTCTTTTTTTTGAGGAGAACAACTTCAGTTCCTTCTGATTTTCTACTTTGGAGCAGACTGTATTAACTGAATTTTACGAGCATATCACCAGCTGGTAAAATCAGCTTTTCCTGGGTATTCAACTATTTATCCTGATGGGGGTGGAACCACTCGAGATCACCACACAGTTAAGACGGTTATAGTAAGTACAAAGTCGCAGCTGTTGCTTTGCTTGTTTTATTTCTATGGCCCATTGCATATCTACAAGCCATTAATCCAGTACATGTTATTGACTTTCTCTATCATAATCGGTTTAACCGAAAATATCTAGATACTACTATCTGATCATATAGCACTCCTATTCCAAAGAATACACAAAAAGCAATCACAGGGACGACCTTGTTGATGTAATCTATTTTTGAGCTTGGGGGAGACAAATCTGCTTCTGCTACATTGCAACGGTGCAAAAGCATCGGGCTGCATAGCTCTGGGTTTCCAGCAAAACTAGAACTTGGAAATGTGCTGAACTGGCCTCCAATTGGTACAGACCCTTTTAGATCATTGTAGGAAACATTGAATTCAGAAAGGAAGTGAAGGTTTACCAGTGCTGGAGGGATTGCACCTGTCAGATGATTGTATGACAGGTCTAGAACCATCAGATTCTTGAGGTTGCTGATCGATTGTGGGATCTCCCTGTTTAGGTTGTTGAAGCTCAAGTTGAGTGAAACGAGTGCTTTCAACTCACCGATCTCATTGGGGATCACACCAGTGAATTTGTTGTTACCTAGATTCAGCATTTTAG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Function -

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsN22_02G004230 OsN22_02G004230_01 Chr02 2916346 2923729 + NAM
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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.000000 0.0 0.000000

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_02g0156300 SBH 0.000000 0.000000 0.796858
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU NA NA NA NA NA
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os02g0156300 SBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_02g0004111 SBH 0.101891 1.419222 2.715559
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_02g0004480 RBH 0.0 0.000000 0.000000
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_02g0004350 SBH 0.000000 0.000000 1.866116
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_02g0004220 RBH 0.000000 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_02g0018600 SBH 0.000000 0.000000 0.000000
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_02G0049900 SBH 0.9587415 4.7533395 3.668093
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_02g0004290 SBH 0.000000 0.314814 0.120547
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU NA NA NA NA NA
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_02g0004640 RBH 0.000000 0.000000 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_02g0004150 RBH 0.000000 0.000000 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_02g0004430 RBH 0.000000 0.000000 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_02g0004380 RBH 0.000000 0.000000 0.147911
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_02g0004300 RBH 0.000000 0.000000 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_02G004081 SBH 0.488124 1.661150 0.094675
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_02g0004160 RBH 0.000000 0.000000 0.000000
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