Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsMH63_12G0151500 OGI:12029360 | 8/16 Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU Chr12:9930945-9935147
Gene Symbol -
DNA seq

ATGGATATCAACATGGTGTGTATGTTGCCTATGGAGTTTTGTGCTATGGATGAAGCTGAGGTTGCTCAATTCTCATTAGGTCCTAAAGATGCGGTTTTTGAGAAGCCCGATGAGTCAAACCGTCACATGAAGCCTCTTTATCTCAAAGGCCATGTTGATGGAAAACCGGTCTCTAGGATGCTAGTGGATGGAGGTGCCGCCATGAACTTGATGCCGTACTCATTATTCAAGAAGTTGGGGCGTGAGGATGATGAGTTGAAGAAGACCAACATGATTCTCAATGGCTTCAATGGTGAACCAACGGAGGCAAAGGGTATCTTTTCGGCGGAGCTCACCGTGGGAAACAAGACGCTACCAACCGCTTTCTTCATCGTCGATGTGCAAGGTAACTACAATGTTATTTTGGGTCGTTGTTGGATCCATGCCAATTGTTGTGTGCCTTCTATCTTGCATCAATGTTTAGTTCAATGGGACGGCGATGATGTTGAGATTGTTCAAGCGGATACATCGGCCGAGGTTGCAATGGCCGATGCTACTTTCGAGTAGCGTCATGGGAATATCCAATGCTTATCAGGGAGGGATCTTTCTAGTTATGATTTTATTAGTATCTCCAATGGCAAATTTGTACCCATCTCTGTAAAGCCGGCTTGTGTAGCACGGCTAAGCCATATGAATTTGTATAATGAGTAAAGAGGCTAATTTAGAGTGGTTACAAAAGAGGGTGCAAGAATATCGGTCTACAAAGGACGATATTGGCGAAACCGTTGAAGATTTTGATGAAGTAGAGAAGCTTGGGAAATGGTTTACATCGGCCGATCCTTTGGAAGAAGTAGATACAGGTGATGGAACTAAACCAAGGCCGACTTTTGTAAACAAAAATATGAGAGCCGATTATAAGGTTAAGATAATCGAGCTACTTAAAGAGTATGTTGATTGGTTTGCATGGGAGTACCATGAGATGCCGGGTCTTAGCCGTGAGCTTGTTGAGCATCGGCTTCCAATTAAACCGGGTTTTAGGCCTTATAAACAACCACCTCGTCGTTTCAATCCTTTGCTATATGACCGAGTCAAAGAGGAGATTGATCGGTTGTTGAAGGCGGGGTTTATTAGGCCATGTCGTTATGCGGAATGGCTATCTAGCATAGTCCCGGTGGAGAAGAAGGGGAGTGGTAAGATTAGAGTTTGCATAGATTTTAGAGATCTAAATAAAGCTACTCCCAAAGATGAATATCCTATGCCTATAGCCGACATGATGATTAATGATGCCTCGGGTCATAAGGTTATTAGTTTTTTAGATGGCAATGCCGGCTACAATCAAATCTTTATGGCGGAAGAGGATATGTACAAGACGGCTTTTTGGTGCCCGGGATTTGTTGGTTTGTTTGAGTGGGTTATCATGACTTTTGGGTTGAAGAATGCCGGTGCAACATATCAAAGGGCAATGAATTTAATCTTTCATGATTTGCTAGGTATTATCTTAGAAATCTATATTGATGATATTGTTGTCAAATCGGATGGTATGGAAGGACACATAGCCGATTTGAGATTAGCTTTTGAAAGGATGCGCCGGTATGGTTTGAAGATGAACCCACTTAAATGTGCTTTTGGTGTGTCGGTGGGGAAGTTCTTAGGATTCATGGTGCATAAGAGAGGAGTTGAGATTGATCCTAAGAAGATAGAAAAGATTCGTGATTACAAAGCGCCGACATGCAAGAAGGAGGTCCAAAAGTTGCTAGGTAAAGTAAATTATTTGATAAGGTTTATTTCTAACCTAGCGGGTAAAATCAATGCTTTTGTTCCTATACTTCGCTTGAAAAAAGAAGCCGATTTCACTTGGGGGGCAAAACAACAAGAGGCGTTTGAAAAGTTGAAGAGATATTTGTCTACTCCGCCCGTTGTGCGAGTGCCTAAAGCCGGAAAGCCTTTTCGGTTATATATTGCTTCCGAAGACAAAGTCATTGGTGCCGTTTTGACGCAAGAGGAGGATGGCAAGGAGTATATCATTACATATTTGAGCCGCCGTCTTTTGGATGTTGAAACGAGGTATGTTTTTATAGAGAGACTTTGTCTATGTTTGTACTATGCTTGTACCAAATTGAGGCATTATTTGTTATCTAGTACATGCATAGTTACTTGTCAAGCCGATGTTATTAAACACATGTTACAAAGGCCAATTCTAAGTGGGAGAATTGGCAAGTGGGCATATGCTTTGATAGAATATGATTTGCCTTATGAACCATTGAAATCTATGAAGGGCCAAATTGTATGTGATTTTATAGTATACCATCATATAGATATTGCTTATGAAGGAGAGGTTTGCTTAGTTGAAGTTATACCTTGGAGAATTTATTTTGATGGTTCTTCTTGCAAAGAAGGTCAAGGCACAGGGGTAGTTTTGTTTTCACCTAATGGCATGTGTTATGAAGCATCGGTTCGTTTGGAATATTATTGTACAAATAATGAAGCTGAATACAATGCTTTGTTGTTCGGCTTACAAGTTATGGAGATGGTTGGAGCTAAGTACGTGGAGGCTTTTGGTGATTCAGAATTGGTGGTGCAACAAGTCGCCGGAATCTACAAATGCTTGGACGAATCACTAAATAGGTACCTCGATTCTTGTTTGGATATTATTGCCAATTTTGATAATTTTGTTATTAGACATATTGCTAGGCGTGATAATTCTAGAGCAAATGACTTGGCACAACAAGCATCTGGTTATAATGTGAAGAAGGGATTATTTCTGATATTAGAAGAGCCGGTGCTTAATTTTAAATCTTTGTGCGAAATTGGCAAAACTAGAGACCAGGGGCGGTCTGACCGGCGTTGCACGGCCGGTCTGACCGGTGACCAGGGGCGGTCTGACCGGCTGCATGCCGCCGGTCTGACCGGCCACCCCGAGCGGTCTGACCGGCCTTGTGTGGCCGGTCTGACCGGCCTTGTGTGGCCGGTCTGACCGGTTCTGGACAGAGCGCTAGGGGGCACGTTTCAATCAATTTGGAGGCCGAATTAATTGTGAATTCGGACATTTGTGCCCAGGGAACAGAAGAAGATTGGAGAATTCCTTTGATTCAATATTTGAAGGATCCCACACTTAAGGTTGATCGGAAAATTCGGCGGCAAGCGTTCAAATACACATTGCTTGATGGAGACTTATATCGCCGAAATATAGATGGTGTCTTGTTGAAGTGCTTAGATAAAGATCAATCAAAAGTGGTTATGGGAGAGGTGCATGAAGGAATTTGTGGAACACATCAATCGGCCCACAAGATGAATTGGTTGCTTAGAAGAGCGGGATTCTATTGGCCGAAGATGATTGATGATTGCTTTAAATATTATAGGGGATGTGAGGCTTGTCAATGGTTCGGCAATGTTCAATTGGCGCCCGCCGCCGTGTTGAACCCCATAATCAAACCATGGCCGTTCCGAGGATGGGCTTTGGATTTCATTGGTCAAATTTATCCTTCGTCATCAAAGGGGCATAGGTTCGTGCTAGTTGCTACGGATTACTTCACCAAGTGGGCCGAAGCCGTGCCTTTGAAGAATATGACTCATACGGAGCTAATTGACTTTATTTTGAAGCATATTATTCATAGATTCGGTATTCCGCAAACATTAACTACGGACCAAGGTACTTCTTTTATGTCTAAGGAAGTGAAGAGTTTTACCGAATCTTATGGTATTAAATTGTTAAGTTCTTCTCCTTACTACGCTCAGGCCAATGGACAAGCCGAGTCGAGTAATAAGACATTGTTGAAGCTAGTAAAAAAGAAGATTGAGGAACACCCAAAGAGGTGGCATGAGGTGCTTTCCGAAGCATTGTGGGCGCATAGGATATCTAAACATGGTGCCACTAAAGTCACTCCTTTTGAGTTGGTTTATGGTCAAGAAGTCGTTTTACCGGTAGAGGTAAATCTTGGCTCTCTTCGTTATATCAAGCAAGATGATTTGTCAAGTGAAGGTTACAAGACGTTGATGGGAGATAATCTTGATGAAGTCATCGACAAGCGCTTGAAGGCATTGGAGGAGATAGAGAAAGAGAAGAAGAGGGTGGCCAAGGCGTACAACAAAAGGGTGAAAGCAAAGTTGTTTCAAGTTGGAGACTTGGTTTGGAAGACAATTTTGCCTTTGGGTACTCGATCCAAGGAGTTCGGTAAGTGGTCTCCTAGTTGGGAGGGTCCTTATCGAGTATGTGGCATTGTTTGA

More
CDS seq

ATGGATATCAACATGGTGTGTATGTTGCCTATGGAGTTTTGTGCTATGGATGAAGCTGAGGTTGCTCAATTCTCATTAGGTCCTAAAGATGCGGTTTTTGAGAAGCCCGATGAGTCAAACCGTCACATGAAGCCTCTTTATCTCAAAGGCCATGTTGATGGAAAACCGGTCTCTAGGATGCTAGTGGATGGAGGTGCCGCCATGAACTTGATGCCGTACTCATTATTCAAGAAGTTGGGGCGTGAGGATGATGAGTTGAAGAAGACCAACATGATTCTCAATGGCTTCAATGGTGAACCAACGGAGGCAAAGGGTATCTTTTCGGCGGAGCTCACCGTGGGAAACAAGACGCTACCAACCGCTTTCTTCATCGTCGATGTGCAAGAGGCTAATTTAGAGTGGTTACAAAAGAGGGTGCAAGAATATCGGTCTACAAAGGACGATATTGGCGAAACCGTTGAAGATTTTGATGAAGTAGAGAAGCTTGGGAAATGGTTTACATCGGCCGATCCTTTGGAAGAAGTAGATACAGGTGATGGAACTAAACCAAGGCCGACTTTTGTAAACAAAAATATGAGAGCCGATTATAAGGTTAAGATAATCGAGCTACTTAAAGAGTATGTTGATTGGTTTGCATGGGAGTACCATGAGATGCCGGGTCTTAGCCGTGAGCTTGTTGAGCATCGGCTTCCAATTAAACCGGGTTTTAGGCCTTATAAACAACCACCTCGTCGTTTCAATCCTTTGCTATATGACCGAGTCAAAGAGGAGATTGATCGGTTGTTGAAGGCGGGGTTTATTAGGCCATGTCGTTATGCGGAATGGCTATCTAGCATAGTCCCGGTGGAGAAGAAGGGGAGTGGTAAGATTAGAGTTTGCATAGATTTTAGAGATCTAAATAAAGCTACTCCCAAAGATGAATATCCTATGCCTATAGCCGACATGATGATTAATGATGCCTCGGGTCATAAGGTTATTAGTTTTTTAGATGGCAATGCCGGCTACAATCAAATCTTTATGGCGGAAGAGGATATGTACAAGACGGCTTTTTGGTGCCCGGGATTTGTTGGTTTGTTTGAGTGGGTTATCATGACTTTTGGGTTGAAGAATGCCGGTGCAACATATCAAAGGGCAATGAATTTAATCTTTCATGATTTGCTAGGTATTATCTTAGAAATCTATATTGATGATATTGTTGTCAAATCGGATGGTATGGAAGGACACATAGCCGATTTGAGATTAGCTTTTGAAAGGATGCGCCGGTATGGTTTGAAGATGAACCCACTTAAATGTGCTTTTGGTGTGTCGGTGGGGAAGTTCTTAGGATTCATGGTGCATAAGAGAGGAGTTGAGATTGATCCTAAGAAGATAGAAAAGATTCGTGATTACAAAGCGCCGACATGCAAGAAGGAGGTCCAAAAGTTGCTAGGTAAAGTAAATTATTTGATAAGGTTTATTTCTAACCTAGCGGGTAAAATCAATGCTTTTGTTCCTATACTTCGCTTGAAAAAAGAAGCCGATTTCACTTGGGGGGCAAAACAACAAGAGGCGTTTGAAAAGTTGAAGAGATATTTGTCTACTCCGCCCGTTGTGCGAGTGCCTAAAGCCGGAAAGCCTTTTCGGTTATATATTGCTTCCGAAGACAAAGTCATTGGTGCCGTTTTGACGCAAGAGGAGGATGGCAAGGAGTATATCATTACATATTTGAGCCGCCGTCTTTTGGATGTTGAAACGAGGCCAATTCTAAGTGGGAGAATTGGCAAGTGGGCATATGCTTTGATAGAATATGATTTGCCTTATGAACCATTGAAATCTATGAAGGGCCAAATTGTATGTGATTTTATAGTATACCATCATATAGATATTGCTTATGAAGGAGAGGTTTGCTTAGTTGAAGTTATACCTTGGAGAATTTATTTTGATGGTTCTTCTTGCAAAGAAGGTCAAGGCACAGGGGTAGTTTTGTTTTCACCTAATGGCATGTGTTATGAAGCATCGGTTCGTTTGGAATATTATTGTACAAATAATGAAGCTGAATACAATGCTTTGTTGTTCGGCTTACAAGTTATGGAGATGGTTGGAGCTAAGTACGTGGAGGCTTTTGGTGATTCAGAATTGGTGGTGCAACAAGTCGCCGGAATCTACAAATGCTTGGACGAATCACTAAATAGGTACCTCGATTCTTGTTTGGATATTATTGCCAATTTTGATAATTTTGTTATTAGACATATTGCTAGGCGTGATAATTCTAGAGCAAATGACTTGGCACAACAAGCATCTGGTTATAATGTGAAGAAGGGATTATTTCTGATATTAGAAGAGCCGGTGCTTAATTTTAAATCTTTGTGCGAAATTGGCAAAACTAGAGACCAGGGGCGGTCTGACCGGCGTTGCACGGCCGGTCTGACCGGTGACCAGGGGCGGTCTGACCGGCTGCATGCCGCCGGTCTGACCGGCCACCCCGAGCGGTCTGACCGGCCTTGTGTGGCCGGTCTGACCGGCCTTGTGTGGCCGGGAACAGAAGAAGATTGGAGAATTCCTTTGATTCAATATTTGAAGGATCCCACACTTAAGGTTGATCGGAAAATTCGGCGGCAAGCGTTCAAATACACATTGCTTGATGGAGACTTATATCGCCGAAATATAGATGGTGTCTTGTTGAAGTGCTTAGATAAAGATCAATCAAAAGTGGTTATGGGAGAGGTGCATGAAGGAATTTGTGGAACACATCAATCGGCCCACAAGATGAATTGGTTGCTTAGAAGAGCGGGATTCTATTGGCCGAAGATGATTGATGATTGCTTTAAATATTATAGGGGATGTGAGGCTTGTCAATGGTTCGGCAATGTTCAATTGGCGCCCGCCGCCGTGTTGAACCCCATAATCAAACCATGGCCGTTCCGAGGATGGGCTTTGGATTTCATTGGTCAAATTTATCCTTCGTCATCAAAGGGGCATAGGTTCGTGCTAGTTGCTACGGATTACTTCACCAAGTGGGCCGAAGCCGTGCCTTTGAAGAATATGACTCATACGGAGCTAATTGACTTTATTTTGAAGCATATTATTCATAGATTCGGTATTCCGCAAACATTAACTACGGACCAAGGTACTTCTTTTATGTCTAAGGAAGTGAAGAGTTTTACCGAATCTTATGGTATTAAATTGTTAAGTTCTTCTCCTTACTACGCTCAGGCCAATGGACAAGCCGAGTCGAGTAATAAGACATTGTTGAAGCTAGTAAAAAAGAAGATTGAGGAACACCCAAAGAGGTGGCATGAGGTGCTTTCCGAAGCATTGTGGGCGCATAGGATATCTAAACATGGTGCCACTAAAGTCACTCCTTTTGAGTTGGTTTATGGTCAAGAAGTCGTTTTACCGGTAGAGGTAAATCTTGGCTCTCTTCGTTATATCAAGCAAGATGATTTGTCAAGTGAAGGTTACAAGACGTTGATGGGAGATAATCTTGATGAAGTCATCGACAAGCGCTTGAAGGCATTGGAGGAGATAGAGAAAGAGAAGAAGAGGGTGGCCAAGGCGTACAACAAAAGGGTGAAAGCAAAGTTGTTTCAAGTTGGAGACTTGGTTTGGAAGACAATTTTGCCTTTGGGTACTCGATCCAAGGAGTTCGGTAAGTGGTCTCCTAGTTGGGAGGGTCCTTATCGAGTATGTGGCATTGTTTGA

More
Protein seq

MDINMVCMLPMEFCAMDEAEVAQFSLGPKDAVFEKPDESNRHMKPLYLKGHVDGKPVSRMLVDGGAAMNLMPYSLFKKLGREDDELKKTNMILNGFNGEPTEAKGIFSAELTVGNKTLPTAFFIVDVQEANLEWLQKRVQEYRSTKDDIGETVEDFDEVEKLGKWFTSADPLEEVDTGDGTKPRPTFVNKNMRADYKVKIIELLKEYVDWFAWEYHEMPGLSRELVEHRLPIKPGFRPYKQPPRRFNPLLYDRVKEEIDRLLKAGFIRPCRYAEWLSSIVPVEKKGSGKIRVCIDFRDLNKATPKDEYPMPIADMMINDASGHKVISFLDGNAGYNQIFMAEEDMYKTAFWCPGFVGLFEWVIMTFGLKNAGATYQRAMNLIFHDLLGIILEIYIDDIVVKSDGMEGHIADLRLAFERMRRYGLKMNPLKCAFGVSVGKFLGFMVHKRGVEIDPKKIEKIRDYKAPTCKKEVQKLLGKVNYLIRFISNLAGKINAFVPILRLKKEADFTWGAKQQEAFEKLKRYLSTPPVVRVPKAGKPFRLYIASEDKVIGAVLTQEEDGKEYIITYLSRRLLDVETRPILSGRIGKWAYALIEYDLPYEPLKSMKGQIVCDFIVYHHIDIAYEGEVCLVEVIPWRIYFDGSSCKEGQGTGVVLFSPNGMCYEASVRLEYYCTNNEAEYNALLFGLQVMEMVGAKYVEAFGDSELVVQQVAGIYKCLDESLNRYLDSCLDIIANFDNFVIRHIARRDNSRANDLAQQASGYNVKKGLFLILEEPVLNFKSLCEIGKTRDQGRSDRRCTAGLTGDQGRSDRLHAAGLTGHPERSDRPCVAGLTGLVWPGTEEDWRIPLIQYLKDPTLKVDRKIRRQAFKYTLLDGDLYRRNIDGVLLKCLDKDQSKVVMGEVHEGICGTHQSAHKMNWLLRRAGFYWPKMIDDCFKYYRGCEACQWFGNVQLAPAAVLNPIIKPWPFRGWALDFIGQIYPSSSKGHRFVLVATDYFTKWAEAVPLKNMTHTELIDFILKHIIHRFGIPQTLTTDQGTSFMSKEVKSFTESYGIKLLSSSPYYAQANGQAESSNKTLLKLVKKKIEEHPKRWHEVLSEALWAHRISKHGATKVTPFELVYGQEVVLPVEVNLGSLRYIKQDDLSSEGYKTLMGDNLDEVIDKRLKALEEIEKEKKRVAKAYNKRVKAKLFQVGDLVWKTILPLGTRSKEFGKWSPSWEGPYRVCGIV

Function Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.6 [UniProtKB/Swiss-Prot:P04323]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsMH63_12G0151500 OsMH63_12T0151500.1 Chr12 9930945 9935147 + maker
CDS seq

ATGGATATCAACATGGTGTGTATGTTGCCTATGGAGTTTTGTGCTATGGATGAAGCTGAGGTTGCTCAATTCTCATTAGGTCCTAAAGATGCGGTTTTTGAGAAGCCCGATGAGTCAAACCGTCACATGAAGCCTCTTTATCTCAAAGGCCATGTTGATGGAAAACCGGTCTCTAGGATGCTAGTGGATGGAGGTGCCGCCATGAACTTGATGCCGTACTCATTATTCAAGAAGTTGGGGCGTGAGGATGATGAGTTGAAGAAGACCAACATGATTCTCAATGGCTTCAATGGTGAACCAACGGAGGCAAAGGGTATCTTTTCGGCGGAGCTCACCGTGGGAAACAAGACGCTACCAACCGCTTTCTTCATCGTCGATGTGCAAGAGGCTAATTTAGAGTGGTTACAAAAGAGGGTGCAAGAATATCGGTCTACAAAGGACGATATTGGCGAAACCGTTGAAGATTTTGATGAAGTAGAGAAGCTTGGGAAATGGTTTACATCGGCCGATCCTTTGGAAGAAGTAGATACAGGTGATGGAACTAAACCAAGGCCGACTTTTGTAAACAAAAATATGAGAGCCGATTATAAGGTTAAGATAATCGAGCTACTTAAAGAGTATGTTGATTGGTTTGCATGGGAGTACCATGAGATGCCGGGTCTTAGCCGTGAGCTTGTTGAGCATCGGCTTCCAATTAAACCGGGTTTTAGGCCTTATAAACAACCACCTCGTCGTTTCAATCCTTTGCTATATGACCGAGTCAAAGAGGAGATTGATCGGTTGTTGAAGGCGGGGTTTATTAGGCCATGTCGTTATGCGGAATGGCTATCTAGCATAGTCCCGGTGGAGAAGAAGGGGAGTGGTAAGATTAGAGTTTGCATAGATTTTAGAGATCTAAATAAAGCTACTCCCAAAGATGAATATCCTATGCCTATAGCCGACATGATGATTAATGATGCCTCGGGTCATAAGGTTATTAGTTTTTTAGATGGCAATGCCGGCTACAATCAAATCTTTATGGCGGAAGAGGATATGTACAAGACGGCTTTTTGGTGCCCGGGATTTGTTGGTTTGTTTGAGTGGGTTATCATGACTTTTGGGTTGAAGAATGCCGGTGCAACATATCAAAGGGCAATGAATTTAATCTTTCATGATTTGCTAGGTATTATCTTAGAAATCTATATTGATGATATTGTTGTCAAATCGGATGGTATGGAAGGACACATAGCCGATTTGAGATTAGCTTTTGAAAGGATGCGCCGGTATGGTTTGAAGATGAACCCACTTAAATGTGCTTTTGGTGTGTCGGTGGGGAAGTTCTTAGGATTCATGGTGCATAAGAGAGGAGTTGAGATTGATCCTAAGAAGATAGAAAAGATTCGTGATTACAAAGCGCCGACATGCAAGAAGGAGGTCCAAAAGTTGCTAGGTAAAGTAAATTATTTGATAAGGTTTATTTCTAACCTAGCGGGTAAAATCAATGCTTTTGTTCCTATACTTCGCTTGAAAAAAGAAGCCGATTTCACTTGGGGGGCAAAACAACAAGAGGCGTTTGAAAAGTTGAAGAGATATTTGTCTACTCCGCCCGTTGTGCGAGTGCCTAAAGCCGGAAAGCCTTTTCGGTTATATATTGCTTCCGAAGACAAAGTCATTGGTGCCGTTTTGACGCAAGAGGAGGATGGCAAGGAGTATATCATTACATATTTGAGCCGCCGTCTTTTGGATGTTGAAACGAGGCCAATTCTAAGTGGGAGAATTGGCAAGTGGGCATATGCTTTGATAGAATATGATTTGCCTTATGAACCATTGAAATCTATGAAGGGCCAAATTGTATGTGATTTTATAGTATACCATCATATAGATATTGCTTATGAAGGAGAGGTTTGCTTAGTTGAAGTTATACCTTGGAGAATTTATTTTGATGGTTCTTCTTGCAAAGAAGGTCAAGGCACAGGGGTAGTTTTGTTTTCACCTAATGGCATGTGTTATGAAGCATCGGTTCGTTTGGAATATTATTGTACAAATAATGAAGCTGAATACAATGCTTTGTTGTTCGGCTTACAAGTTATGGAGATGGTTGGAGCTAAGTACGTGGAGGCTTTTGGTGATTCAGAATTGGTGGTGCAACAAGTCGCCGGAATCTACAAATGCTTGGACGAATCACTAAATAGGTACCTCGATTCTTGTTTGGATATTATTGCCAATTTTGATAATTTTGTTATTAGACATATTGCTAGGCGTGATAATTCTAGAGCAAATGACTTGGCACAACAAGCATCTGGTTATAATGTGAAGAAGGGATTATTTCTGATATTAGAAGAGCCGGTGCTTAATTTTAAATCTTTGTGCGAAATTGGCAAAACTAGAGACCAGGGGCGGTCTGACCGGCGTTGCACGGCCGGTCTGACCGGTGACCAGGGGCGGTCTGACCGGCTGCATGCCGCCGGTCTGACCGGCCACCCCGAGCGGTCTGACCGGCCTTGTGTGGCCGGTCTGACCGGCCTTGTGTGGCCGGGAACAGAAGAAGATTGGAGAATTCCTTTGATTCAATATTTGAAGGATCCCACACTTAAGGTTGATCGGAAAATTCGGCGGCAAGCGTTCAAATACACATTGCTTGATGGAGACTTATATCGCCGAAATATAGATGGTGTCTTGTTGAAGTGCTTAGATAAAGATCAATCAAAAGTGGTTATGGGAGAGGTGCATGAAGGAATTTGTGGAACACATCAATCGGCCCACAAGATGAATTGGTTGCTTAGAAGAGCGGGATTCTATTGGCCGAAGATGATTGATGATTGCTTTAAATATTATAGGGGATGTGAGGCTTGTCAATGGTTCGGCAATGTTCAATTGGCGCCCGCCGCCGTGTTGAACCCCATAATCAAACCATGGCCGTTCCGAGGATGGGCTTTGGATTTCATTGGTCAAATTTATCCTTCGTCATCAAAGGGGCATAGGTTCGTGCTAGTTGCTACGGATTACTTCACCAAGTGGGCCGAAGCCGTGCCTTTGAAGAATATGACTCATACGGAGCTAATTGACTTTATTTTGAAGCATATTATTCATAGATTCGGTATTCCGCAAACATTAACTACGGACCAAGGTACTTCTTTTATGTCTAAGGAAGTGAAGAGTTTTACCGAATCTTATGGTATTAAATTGTTAAGTTCTTCTCCTTACTACGCTCAGGCCAATGGACAAGCCGAGTCGAGTAATAAGACATTGTTGAAGCTAGTAAAAAAGAAGATTGAGGAACACCCAAAGAGGTGGCATGAGGTGCTTTCCGAAGCATTGTGGGCGCATAGGATATCTAAACATGGTGCCACTAAAGTCACTCCTTTTGAGTTGGTTTATGGTCAAGAAGTCGTTTTACCGGTAGAGGTAAATCTTGGCTCTCTTCGTTATATCAAGCAAGATGATTTGTCAAGTGAAGGTTACAAGACGTTGATGGGAGATAATCTTGATGAAGTCATCGACAAGCGCTTGAAGGCATTGGAGGAGATAGAGAAAGAGAAGAAGAGGGTGGCCAAGGCGTACAACAAAAGGGTGAAAGCAAAGTTGTTTCAAGTTGGAGACTTGGTTTGGAAGACAATTTTGCCTTTGGGTACTCGATCCAAGGAGTTCGGTAAGTGGTCTCCTAGTTGGGAGGGTCCTTATCGAGTATGTGGCATTGTTTGA

More
Protein seq

MDINMVCMLPMEFCAMDEAEVAQFSLGPKDAVFEKPDESNRHMKPLYLKGHVDGKPVSRMLVDGGAAMNLMPYSLFKKLGREDDELKKTNMILNGFNGEPTEAKGIFSAELTVGNKTLPTAFFIVDVQEANLEWLQKRVQEYRSTKDDIGETVEDFDEVEKLGKWFTSADPLEEVDTGDGTKPRPTFVNKNMRADYKVKIIELLKEYVDWFAWEYHEMPGLSRELVEHRLPIKPGFRPYKQPPRRFNPLLYDRVKEEIDRLLKAGFIRPCRYAEWLSSIVPVEKKGSGKIRVCIDFRDLNKATPKDEYPMPIADMMINDASGHKVISFLDGNAGYNQIFMAEEDMYKTAFWCPGFVGLFEWVIMTFGLKNAGATYQRAMNLIFHDLLGIILEIYIDDIVVKSDGMEGHIADLRLAFERMRRYGLKMNPLKCAFGVSVGKFLGFMVHKRGVEIDPKKIEKIRDYKAPTCKKEVQKLLGKVNYLIRFISNLAGKINAFVPILRLKKEADFTWGAKQQEAFEKLKRYLSTPPVVRVPKAGKPFRLYIASEDKVIGAVLTQEEDGKEYIITYLSRRLLDVETRPILSGRIGKWAYALIEYDLPYEPLKSMKGQIVCDFIVYHHIDIAYEGEVCLVEVIPWRIYFDGSSCKEGQGTGVVLFSPNGMCYEASVRLEYYCTNNEAEYNALLFGLQVMEMVGAKYVEAFGDSELVVQQVAGIYKCLDESLNRYLDSCLDIIANFDNFVIRHIARRDNSRANDLAQQASGYNVKKGLFLILEEPVLNFKSLCEIGKTRDQGRSDRRCTAGLTGDQGRSDRLHAAGLTGHPERSDRPCVAGLTGLVWPGTEEDWRIPLIQYLKDPTLKVDRKIRRQAFKYTLLDGDLYRRNIDGVLLKCLDKDQSKVVMGEVHEGICGTHQSAHKMNWLLRRAGFYWPKMIDDCFKYYRGCEACQWFGNVQLAPAAVLNPIIKPWPFRGWALDFIGQIYPSSSKGHRFVLVATDYFTKWAEAVPLKNMTHTELIDFILKHIIHRFGIPQTLTTDQGTSFMSKEVKSFTESYGIKLLSSSPYYAQANGQAESSNKTLLKLVKKKIEEHPKRWHEVLSEALWAHRISKHGATKVTPFELVYGQEVVLPVEVNLGSLRYIKQDDLSSEGYKTLMGDNLDEVIDKRLKALEEIEKEKKRVAKAYNKRVKAKLFQVGDLVWKTILPLGTRSKEFGKWSPSWEGPYRVCGIV

More
Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0 0 0

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os12g18840 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db NA NA NA NA NA
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_12G0188400 RBH 0 0 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_12G0166400 SBH 0.002475 0 0.0056595
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Powered by

© 2021- Rice Gene Index @Zhang Lab. All Rights Reserved.

National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement

Huazhong Agricultural University

Any comments and suggestions, please contact us.