Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsMH63_11G0310100 OGI:11058430 | 12/16 Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU Chr11:22902214-22910783
Gene Symbol -
DNA seq

AAAACATATATATAGTACTATACTCACGCACAAAGCAACTCGTGCGTGCGTCCGTGTCATCCGGTTTCTATGGAACGTCTATCAGTTTCACTAATCCACACCTATCAGTGATCACCAACTGGCTCTCCATCCCCTGGATATTCTTCAGAAAGGCATCGGTGGTATCCGTCAGTACCGCCAAGGGCCAGCTGTCACAGAATATGACGACTCCGATATGCCTTCTGCAGTGGAACTTCACGAGGCAGGAATTGATTTCAAGGTGAGCGAAGTTGCAGGGTTAGGCCTTATCCAGCGGTATGAGCTGGCTGCTAGCTCATACGCGCTCGGCACAGTGCGGCCACTGCCTGGGCGAGTGTGCCTGTGAGAGGGCATCGTCTCAGTGAGGGTGAGAGCTAGCGCTTGAAGAAGAGCTAGCGCGTCCTGTTCATCGATTAAAAAACTCTATGAGCTAGCTAAGAGCTGTCCATTGGAGACGGCCTTAGGAGGAGGGACGGTCAGTTTCAGAGGAGGCGTACTGATCATCATCCCTAAGATCTACTTGTTCGACAACACCGATAGCATGTTGCTCAACCTGATGGTGTTCGAGCGGCTGCAACCCAGGTGCTGGAAACGACATGATGGCGTTTGTGTACTACATGGACAACCTTATTGACACCGCAAAGGACGTGGCACAAGCTGTGGTAAGGGCAATAATGATGAAGTGGCGCGCCTAATAAACGCCACACTAAGCAAGGGACTAGTGATGTAGGAGACAGTAGTATCATATACGTGTTACGAGAGGTGAAGGCGCACCGCAAGAAACTGGAATATGTGGCGGGCTAGCTTTATACCTACTGCAGCAGCCCATGGGTGTTCATCTCCGTCGTCACGGCATTCATCATTCTAGCTGCTACTATCATGCAGACAGTCTATACCATTGTGCCATTCTATAAAAGATAAGGCCTAGAACCGCAGTGCACCATATATATATAATTTTATAACTTATTATTCCTATATGATCTGTCTTGCACCAGCTAGAATGCAGTGTATATGTGCACTATATAGTCCTCTGCTGTTGAACTTGATGTCTAATAATTCTGTAATACAAGCAATGATGCACGTGCGTTGCAACGGGTGAATGTAATTTTAATCAGCATACTGATGGGAAAAAGATAAAGAAATCATAATCATAATAATAATATTAATGAAAGGAAATTGCAGTGACCTTTGGTCAAAAAGATAAAAATATATAATTAATTTTCCGTTAATTCCATTAGCTAAAAATAATATAATATGAAGTAGGAAAAGTTATTCTCAAATTTTAGCAATTTTCAAAAAGCTTAAATAGAGCAAACTAATTATGTAAATGAAAACAAATTTAATCACCTAATAAAACAATTACACATGTAATTGAAAATATGTTGCCAGCCCGTTTAATCATGAGCCTGCGGGTGCGTGCGGTATATATCTCTCACTCGTACATCGTGGTCCTTTTTTTAACATAGAAAAAATGCCCGTGCATTACAACGGGTAAATTAAAGTTATAACAAATATAAAAATATTATATGATTAAGGTTTAGTTTTACATGATATGAGCTCTTTAAGAAAATATATTCATAATGAAATAAAAAAAGTGCAGCTGAAGGGACCTAAAGTGAACTTATTCCATACGGAGTGTACACGCGGTTCATGAGGCGGCCCAATAGTGTGGGCGGCTTGGGAATAGAATTGGGAAAAACAACTTAAGCGACCTAAAGTGAACTTATTTCGTGTGGGCGGCCTGCGAATGGTGTTCGGCCTGACGCAGGAGAAGCCAGAGCTGTCCGATCTGATAGACGGTCCTGATTTATCCCGACCTATATAAAAGTTCGACAGTCCAAACCCTAACCAAAAAATCATTTCCCATCCCCCTCTCTCTCAAAACAACGTGGCGGCGGCCTAGCATACCGACATCCCTGCGACGGCGGTGGCGGTTTGGCAGCGACGGCGACACCCTCCCCTTCCGGTGTCGGCATTTTCTTAGTGTTCTTGAATCTGATCTTGTATTCTTGTAGTAGTGTTTTCTCTAGGATTTAGGTCCAAATTTGATGCACTCTCATTATTGTTTTTTCTTTTTTATTTTTTGCCATCGGAGAGGGATTGAAGTGGGATCGATCGCACGTGTGATGATTTTTTTTTGACGGACGAAAACTATAACCCGGAAGACATACAATTTTTTTTTAATTAGGTATATATAGATAGATTGAATTGGACTTTCTTTTTTTCATGTTTTTTTCGCCCTTTTTTCGTTACTACGGACATCGGAAATATCTTTAATTTTTTTTACCGTGTCACATATAATCGGATTCGAATTTTTTCACCAGAATTCTTTTTCATGCTTCTTTTCACGGACGGACGACGCAAACATCTTTAAAAAATTAAGTAGAGATAGAGACAGAGAAAGAGAAACGGAAAACCTTTTTTCACAACTTTTTTTTTGGAATATGACAGAAAAAATGTTCACTCTTGTTTTTTTGGACGGAAGGCGGGATTTTTTTAATCGGACAGAAAATTTTTTTTGCACTATTTTTTTCTTTTTTAACGGAATACGGAAACCCTTTTGTCACACCTTTTTTATCAGTCAGAACAAAATTTTCATAATTTTTTCCGCGCTTGATTTTTTTCCATACAGAAATCTCTTTCCTTTTTTTAACGGAATATCCAACGGAGTCGGATGTTTTTTTTAATGGGACTCGGACTTCTTTTTTTTCTTTTTTTCTCGGCTGTCTTTGATCTCGCCGGATGCAGATTCAAAGAGGAAGGCTACCCTGTTGTCGACTACGAGTCAGAACTTCAGACCGCCCAGTCGACAACAGTTAGATAGGCTACCCAAAATATTGTACTGGTGTGATTATGATGAATAAGAACAACTACCGGTTTCGGCCAACAGGAGTAGGGTTATTACCTAACAATTCAGGGGCCCGAACCTGTATAAAAATCCTCGTCTCCATCTCTTTTATTACAATCTCGCATATCTCCTAGTACCAACGATCCCCATACTACGCAAATACCGGAATCGCGACATCAAACGTCGACTGTGGTAGCATAAGAAAAATATATTACTTCTGTCGACGTTTGATGTCGCGATTCCGATATTTGCATAGGATGGAGATCGTTAGTACCAGGATATATGCGAGATTGAGATAAAAGAGACGGAGACAAGGATTTTCATACAGGTTCGGACCCCTGAATTGTCAGGTAATAACCCTACTCCTGTTGGCCGAAACCGGTCGTTGCTCTTATTCACCATAATCACACCAGTATAATATTTTGGGTAGCCTATCTAATTGTTGTCGACTTGGCGGTCTGAAGTGTTGACTCGTAGTCGATAACAGGGTAGTCTTCCTCCTCGAGTTCGTGCCCGGCGAGATCAGAGACAACGCTAGTTCCCTACAGCTGGCCTCTGTAAGTACCGGATAGGGTTAGCCCAGGCATATCTCTAATGTCGATATCCGGCGGCTTGTCTTGACGTATGTTGACTTGTATATTGATCTTATGTCTTGATCTATTGTTCCACCTCCTCTCTCCTCCTAGGGGGCCTTGTATTTATACCCATAGATGTCCCCTTGTCCAAGTAGAACTAGGGAAACCAATATGGATATAATCCGAGTAGTCCTTGTCGTTTCCATGTAGAACTCTATTCATCCTTCCTTACGCGGAACTCCTCCTATATCCGAAGGTTGTTTCCGTATAGAACATGGTATGTGGTGGGTCCTGCCAAGATTTAGTGAACTACTATTAGGTATGTGTTATCCATAACCCTGACAACTTCATAAATTAAACATGCACACCCAAAAATAGATCTATAATATAATATAATATATCAAATAAACGTACCATACAATTGTTGATTATAGATATATTTTATTTGCATCAATGGGCCCACATTGATAGTTAAAGATGAAATATTGAGTAATTAAAATATTAATTACTCGGGACATTGTCAGAAACACAAAAAAATATATATTGTTTAAAAATATGTCGCATTATTTTCTCTCTAAAACAAAGTCAGGATTTTAGCCGTTAATAACTCAATCTACGCTTTTGATTTGTACATATTTTTTTAAGTACATAAGTAATAAATTTAATGTTGAGTTCTAAAGTGCTTATCAAATTGGCTCTCCCTCATTTATCTTAAGCGTGTTCTCTGAACAACTAAACTGTGCGTGTTTTGCAAATACTTTGTATACATTCTTTAAAAAAATCTATTTTCATGTTTGTAATATTTAATACTTAATTAATCTTGCGTTGATGACCTACATCATTTTATTTGCCTAGCATAAGCTCAACCAATGAGATCGAATGTAGCCTAAGCAGGAGATATATTAGATTTTTTGCTATAAAATTTAAAATTAAAGAATCAAGTTAATTATATTATTAAAAAATTCATTACTTTGGATCATATATATTCTATGGACTAGCTATTGTTCATTAATCCATACATTTTTAAGAAAAAAAAGAAATAAGTTTTGTTGTCTCCTTGCTATTTCTTAGCTATTAAACTAAAATAGAAACAATCAACAATATTGGATTTTTTTTAGAAACACAGCACGTGCACCCCCTTGCTCCTTTGAGTACCTCCAAAAGACTGAGTCGACGCATTTTGAGATTGACGATGCCACCATGGGCGTCTCGCTGTCAACGGGTACGTCACCAGCACTGAAAGAATAATTAGCCGTAAATACGAGCACCCGTGTCAAGTCTAGGACTTGAACCAGGTGGGCAAGCTCCACCACAAGAAACCTAACCAATTAAGCTGCACCCACTTCGTAATAACATTGGATATTAAAATAACCATAATTTTTAAGCTACATTATTGGAATACTTCTATGTCTTTTAAACCGGTGAACTATTAGGTATAACCGTTAGATATATCTTATATAAAAAAGATAAGCATGTATTCATGGTACATGATATTTCTAAAATATTACTGCGCAATTATATTTCGTCATTATCGTATTCATGTTAGGTTACATGAAGCC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CDS seq

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Function -

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsMH63_11G0310100 OsMH63_11T0310100-mRNA-1 Chr11 22902214 22910783 + maker
CDS seq

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Protein seq

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0068275 0 0

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_11g0506400 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os11g33360 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os11g0506400 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_11g0016460 SBH 0.0 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_11g0016430 SBH 0.0 0.0 0.0
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_11g0016380 SBH 0.0 0.0 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_11g0015950 SBH 0.0 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_11g0016330 RBH 0.0 0.0 0.0
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_11G0310500 SBH 4.088406 0.4175755 0.00837
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_11g0016580 RBH 0.0 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_11G0318500 RBH 0 0 0
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_11g0016530 RBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_11g0016510 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_11g0016130 SBH 0.0 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_11g0015910 SBH 0.0 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_11g0016220 RBH 0.0 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_11G016030 RBH 0.0 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_11g0016460 RBH 0.0 0.0 0.0
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