Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsMH63_11G0212300 | OGI:11040550 | 3/16 | Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | Chr11:16302219-16313954 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
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| Protein seq | MVVLMTIKDRFASYCCETFIVPTTSQRGQRLYLLYSCTRLRSGEKSMGVAGESMHCFKGGDYDPGTVHCGELCYARGIVTTPFRGTVMPRHSPRNLIEVLGFVRELRLMAFEVGYEVAPEYRQISHDPDEEKCRVRVTLASDSKDLPSFKFEAGGRTYCHACQEVALVAIGELRQHFEEELDSSAFRYHPHKPHDQDYGTYTCPDGEESATLMHAVHMLSAMDAVSVERDKAAHDRENWNRGKICKLKSKVHRLQKELAELKGEIPPPTSKLRLTSRKRTCPPPRLQLASKIRVRGEVVPNRAEPVIDIISDEEEEEDPEEREPATPEEEDSSLLQQAQNQQANNQNQNPPPPPQNKLADFLRVRPPTFSSTTNPVEAGDWLHAVEKKLDLIQCTEQEKVSFASHQLHGPAAEWWDHFRQGRAGGEPITWQEFTAAFKKTHIPSGVVALKKREFRALNQGSRSVTEYLHDFNRLARYAPEDVRTDEERQEKFLEGLNDELSYALMSTDFRDFQQLVDKAIRQEDKYNRMEQKKRRAAQFKAQQGSNQRPRLVTGPQVPSYPQGGSSSVVRPQRQFYNNNTGNRGNDNRNMVARPAAAQVQNQPVRKEQGSKPVICFNCGDPGHYADKCPKPRRVKNASAPNNSNVPAPKARVNHVAAAEAQNAPDVVLGTFPVNSIPATVLFDSGATHSFLSKSFASKHGMEVVSLGRPLLVNTPGNQVFSTQYCPSVTIEIEEVPFPSSLILLESKDLDVILGMDWLSRHRGVIDCANRKVTLTSSNGETVSFFASSPKSHGAILNQVALQEIPVVQDYPDVFPEDLPGMPPKRDIEFRIDLVPGTNPIHKRPYRMAANELAEVKKQVDDLLQKGYIRPSTSPWGAPVIFVEKKDHTQRMCVDYRALNEVTIKNKYPLPRIDDLFDQLKGATVFSKIDLRSGYHQLRIREEDIPKTAFTTRYGLFECTVMSFGLTNAPAFFMNLMNKVFMEYLDKFVVVFIDDILIYSKTKEEHEEHFRLALEKLREHQLYAKFSKCEFWLSEVKFLGHVISSGGVAVDPSNVESVLSWKQPKTVSEIHSFLGLAGYYRRFIENFSKIARPMTRLLQKEVKQLRPHENNYPTHDLELAAVVHALKIWRHYLFGNRTEVYTDHKSLKYIFTQPDLNMRQRRWLELIKDYDMEIHYHPGKANVVADALSRKSYCNMSEGRCLPWELCQEFEKLNLEIVSQGFVATLEAKPTLFDQIREAQVNDPDIQEIKKNMRRGKAIGFVEDEQGTVWLGERICVPENKELKDTIMKEAHETLYSIHPGSTKMYQDLKLQFWWASMRREIAEYVALCDVCQRVKAEHQKPAGLLQPLKIPEWKWEEIGMDFITGLPRTSAGHDSIWVVVDRLTKVAHFIPVKTTYTGHKLAELYMARVVCLHGVPKKIVSDRGSQFTSKFWQKLQSELGTRLNFSTAYHPQTDGQTERVNQILEDMLRACVLDFGGSWDKNLPYAEFSYNNSYQASLQMAPYEALYGRKCRTPLLWDQTGERQVFGTDILREAEEKVKIIQERLRVAQSRQKSYADNRRRDLAFEEGDYVYLRVTPLRGVHRFQTKGKLAPRFVGPFKIVSRKGEVAYQLELPTSMAGIHDVFHVSQLKKCLRVPTEEADPGRIELQEDLTYIEKPVRILDFPTFRRRAFPLRKVSKRLWKPKASHTDPKQPFEHVDPVGCEHMVLMVVLMTIKDRFASYCCETFIVPTTSQRGQRLYLLYSCTRLRSGEKSMGVAGESMPCFKGGDYDPVVLMTIKDRFASYCCETLTVPTTSQRGQRLYLLYSMVHCGAPD |
||||||||||
| Function | Transposon Tf2-9 polyprotein [UniProtKB/Swiss-Prot:P0CT40] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsMH63_11G0212300 | OsMH63_11T0212300-mRNA-1 | Chr11 | 16302219 | 16313954 | + | maker | ||
| CDS seq | ATGGTTGTGCTCATGACAATTAAGGACCGGTTCGCGAGCTACTGTTGTGAAACATTTATCGTGCCAACCACAAGCCAGCGTGGGCAACGGCTTTATCTTTTGTATAGCTGCACCAGACTGAGAAGTGGCGAGAAGTCCATGGGGGTCGCTGGGGAGTCCATGCATTGTTTTAAAGGGGGTGATTATGATCCAGGTACGGTGCACTGTGGTGAGTTGTGTTATGCGAGGGGTATTGTCACAACTCCTTTCCGAGGTACCGTGATGCCTCGCCATTCACCGAGAAATTTGATCGAGGTGTTAGGATTTGTCAGGGAGCTGAGGTTGATGGCTTTTGAGGTAGGCTATGAAGTTGCTCCTGAGTATCGCCAAATTTCCCATGACCCCGACGAGGAGAAGTGTCGTGTTCGTGTGACGTTGGCTAGTGATAGTAAAGACCTTCCGTCTTTTAAGTTCGAAGCTGGAGGAAGAACGTACTGCCATGCTTGTCAAGAAGTAGCTTTGGTGGCCATTGGAGAGTTGCGTCAACACTTTGAAGAAGAATTGGATTCATCAGCTTTCCGGTATCATCCCCACAAGCCTCATGACCAAGACTATGGAACCTATACCTGTCCTGATGGTGAAGAGAGTGCCACTCTTATGCATGCGGTGCATATGCTTAGTGCTATGGATGCAGTAAGTGTGGAGCGAGACAAAGCAGCTCATGACAGAGAAAACTGGAATCGAGGCAAGATTTGCAAGTTGAAGAGCAAGGTGCACCGTCTACAGAAGGAATTAGCTGAACTTAAAGGAGAAATACCGCCGCCAACATCCAAGCTTCGCCTCACTTCAAGAAAGAGAACCTGTCCGCCACCTCGTCTCCAGTTAGCTTCGAAGATTCGCGTGAGGGGTGAAGTTGTGCCCAATCGTGCTGAACCTGTCATCGACATCATAAGTGATGAGGAAGAAGAGGAAGACCCTGAAGAAAGAGAGCCAGCTACTCCAGAGGAAGAAGATTCATCGCTTCTGCAGCAGGCACAGAACCAGCAGGCAAATAATCAGAACCAGAATCCACCCCCTCCTCCCCAAAACAAGTTGGCAGATTTCTTACGTGTGAGACCCCCTACCTTTTCAAGCACCACCAATCCAGTAGAAGCAGGAGATTGGTTGCATGCGGTGGAGAAGAAGTTGGACTTGATCCAGTGTACTGAGCAGGAGAAAGTTTCTTTTGCTTCGCATCAGTTGCATGGACCCGCTGCTGAATGGTGGGATCATTTTCGCCAAGGCAGGGCTGGAGGAGAACCTATCACTTGGCAGGAATTCACAGCTGCTTTTAAGAAGACGCATATACCGTCAGGTGTGGTAGCTCTAAAGAAGAGAGAGTTTAGAGCACTCAACCAGGGATCCCGTTCGGTCACCGAGTACCTCCATGATTTTAACCGTTTAGCTCGCTATGCTCCAGAGGATGTTCGCACCGATGAAGAGCGTCAGGAGAAGTTTTTGGAAGGACTGAATGATGAGTTGTCTTATGCTTTGATGTCTACGGATTTCCGGGATTTCCAGCAGTTGGTGGACAAGGCAATTCGTCAGGAAGACAAGTATAATCGTATGGAGCAGAAGAAGCGCAGGGCTGCCCAATTCAAGGCACAACAGGGCAGTAACCAGAGGCCGCGACTCGTTACTGGACCTCAAGTTCCATCGTACCCTCAAGGAGGATCTTCATCAGTTGTCCGTCCCCAACGCCAGTTCTACAACAACAATACTGGTAATCGTGGCAATGACAACCGCAACATGGTTGCTCGTCCTGCAGCAGCTCAAGTTCAGAACCAGCCCGTCAGGAAGGAACAGGGAAGCAAGCCAGTAATATGCTTCAATTGTGGTGATCCGGGACATTATGCTGATAAGTGTCCGAAGCCTCGGCGTGTGAAGAACGCTTCAGCCCCGAACAACTCCAATGTTCCAGCACCGAAGGCACGTGTTAATCATGTTGCAGCCGCAGAAGCTCAGAATGCACCAGATGTTGTTTTGGGTACGTTTCCTGTTAACTCTATACCCGCAACTGTGCTTTTTGATTCCGGTGCTACACATTCCTTTTTGTCTAAAAGTTTTGCAAGCAAACATGGGATGGAAGTTGTTAGTCTTGGGAGACCTTTACTAGTTAATACCCCAGGTAATCAAGTATTTTCGACACAGTATTGTCCTTCCGTTACTATAGAAATAGAAGAAGTTCCTTTCCCATCCTCTCTTATCTTGCTAGAATCCAAAGACCTAGATGTTATCTTAGGGATGGATTGGTTATCTCGTCACAGAGGAGTTATAGATTGTGCCAACCGTAAAGTGACCTTAACCAGTAGCAATGGGGAAACCGTTTCTTTCTTTGCGTCCTCTCCTAAATCTCATGGTGCGATCTTAAACCAAGTTGCTCTACAAGAGATACCGGTGGTACAAGACTACCCAGATGTGTTTCCGGAGGATTTGCCAGGTATGCCACCTAAGAGAGATATAGAGTTTCGGATAGACTTGGTACCGGGAACCAACCCAATCCATAAGAGACCATACAGAATGGCAGCTAACGAGTTAGCTGAGGTGAAGAAACAGGTGGATGATTTGCTTCAGAAAGGATACATCAGACCCAGTACTTCGCCATGGGGAGCACCAGTCATCTTCGTGGAGAAGAAAGATCATACTCAGAGAATGTGCGTGGATTATCGAGCGTTGAATGAGGTTACCATCAAGAATAAGTATCCTTTACCTAGAATTGATGACCTGTTTGATCAGTTGAAAGGTGCTACAGTTTTCTCCAAGATAGATCTCCGTTCTGGATATCATCAACTTCGAATCCGTGAGGAAGATATACCAAAGACCGCCTTCACAACTCGGTATGGTTTGTTCGAGTGTACCGTTATGTCGTTTGGACTCACTAATGCCCCAGCCTTTTTCATGAATCTGATGAACAAGGTGTTTATGGAATATCTGGATAAGTTTGTTGTGGTGTTTATTGATGACATTCTCATTTACTCTAAGACGAAGGAAGAACATGAAGAGCATTTTCGTCTAGCTTTAGAGAAACTACGTGAGCATCAGCTTTATGCCAAGTTCAGTAAATGTGAATTTTGGTTGTCCGAAGTGAAGTTTCTTGGTCATGTCATCTCGTCTGGAGGAGTGGCAGTAGATCCAAGCAATGTGGAGTCAGTGTTAAGTTGGAAGCAACCCAAGACGGTTTCAGAAATTCATAGTTTCCTTGGACTTGCAGGGTATTACCGTAGGTTTATTGAGAACTTTTCAAAGATCGCCAGACCAATGACCCGTCTGCTTCAGAAGGAAGTGAAGCAATTACGTCCTCATGAGAATAACTACCCAACGCATGACCTAGAATTGGCAGCTGTGGTGCATGCATTGAAGATTTGGCGTCATTATCTTTTTGGTAATCGTACGGAGGTGTATACGGATCATAAAAGTTTGAAGTACATTTTCACTCAACCTGATTTGAACATGCGTCAGCGAAGATGGTTAGAGTTGATTAAGGACTATGATATGGAAATCCATTATCACCCGGGGAAAGCAAATGTTGTAGCCGATGCCCTTAGCAGGAAAAGCTACTGTAATATGTCAGAAGGTAGATGTTTACCTTGGGAGTTATGCCAAGAATTTGAAAAGTTGAACTTGGAAATAGTCAGCCAAGGTTTTGTGGCTACTTTGGAAGCTAAACCTACTCTGTTTGATCAAATTAGAGAAGCTCAAGTGAATGATCCTGATATCCAGGAAATAAAGAAGAACATGAGAAGGGGTAAAGCCATCGGTTTTGTAGAAGATGAGCAAGGAACTGTGTGGTTAGGAGAAAGAATTTGTGTCCCAGAAAATAAGGAGTTGAAGGATACTATCATGAAAGAAGCTCATGAAACTTTGTATTCCATTCACCCTGGAAGCACTAAGATGTATCAAGATTTAAAGCTACAATTCTGGTGGGCTAGTATGCGACGTGAGATAGCAGAATATGTGGCTCTATGTGATGTATGTCAGCGGGTCAAAGCAGAACATCAGAAGCCAGCTGGTCTGTTACAACCGTTGAAGATTCCAGAGTGGAAGTGGGAAGAAATAGGAATGGATTTTATAACCGGTCTACCCAGAACGTCGGCAGGACATGATTCTATTTGGGTAGTGGTTGATCGGTTGACAAAAGTCGCTCACTTCATACCTGTCAAAACAACTTATACGGGACATAAGCTTGCAGAGTTATACATGGCCAGAGTGGTATGTTTGCATGGTGTTCCTAAGAAGATAGTGTCAGATAGAGGTAGCCAGTTTACTTCGAAGTTTTGGCAGAAATTACAATCAGAATTGGGTACTCGTTTGAATTTCAGTACCGCTTATCACCCTCAAACAGATGGTCAGACGGAAAGAGTAAACCAAATTTTAGAAGATATGTTGAGAGCCTGTGTTCTAGATTTTGGTGGAAGTTGGGATAAGAATTTGCCGTACGCGGAATTCTCATATAACAATAGTTATCAAGCTAGTTTGCAAATGGCTCCATATGAAGCATTATATGGTAGGAAGTGCCGTACGCCGCTCCTTTGGGATCAAACCGGTGAGCGTCAAGTTTTTGGGACAGACATATTGCGAGAGGCAGAAGAAAAAGTGAAGATTATCCAAGAGAGGTTGCGCGTTGCTCAGTCGCGTCAGAAGAGCTATGCTGACAATCGTCGCAGAGATTTGGCTTTCGAAGAAGGAGATTATGTATACCTTCGGGTTACGCCGTTACGAGGTGTTCATCGTTTCCAAACCAAAGGGAAATTGGCACCGCGTTTTGTGGGACCTTTTAAGATTGTGAGTCGAAAAGGTGAAGTAGCTTATCAGTTAGAGTTGCCTACGTCAATGGCGGGAATACATGACGTGTTCCACGTTTCTCAGCTGAAGAAATGTTTACGTGTACCTACGGAGGAAGCAGATCCTGGTCGTATAGAGCTTCAGGAGGATTTAACTTATATTGAGAAGCCAGTCAGAATTTTGGATTTTCCGACGTTCCGGAGAAGAGCGTTTCCATTGAGGAAGGTTTCCAAGCGTTTGTGGAAGCCCAAGGCAAGTCACACAGATCCCAAACAACCCTTTGAGCATGTTGATCCCGTGGGTTGTGAGCATATGGTTTTGATGGTTGTGCTCATGACAATTAAGGACCGGTTCGCGAGCTACTGTTGTGAAACATTTATCGTGCCAACCACAAGCCAGCGTGGGCAACGGCTTTATCTTTTGTATAGCTGCACCAGACTGAGAAGTGGCGAGAAGTCCATGGGGGTCGCTGGGGAGTCCATGCCTTGTTTTAAAGGGGGTGATTATGATCCAGTCGTGCTCATGACAATTAAGGACCGGTTCGCAAGCTACTGTTGTGAAACATTAACCGTGCCAACCACAAGCCAGCGTGGGCAACGGCTTTACCTTTTGTATAGCATGGTTCATTGCGGAGCACCAGACTGA
More
|
|||||||
| Protein seq | MVVLMTIKDRFASYCCETFIVPTTSQRGQRLYLLYSCTRLRSGEKSMGVAGESMHCFKGGDYDPGTVHCGELCYARGIVTTPFRGTVMPRHSPRNLIEVLGFVRELRLMAFEVGYEVAPEYRQISHDPDEEKCRVRVTLASDSKDLPSFKFEAGGRTYCHACQEVALVAIGELRQHFEEELDSSAFRYHPHKPHDQDYGTYTCPDGEESATLMHAVHMLSAMDAVSVERDKAAHDRENWNRGKICKLKSKVHRLQKELAELKGEIPPPTSKLRLTSRKRTCPPPRLQLASKIRVRGEVVPNRAEPVIDIISDEEEEEDPEEREPATPEEEDSSLLQQAQNQQANNQNQNPPPPPQNKLADFLRVRPPTFSSTTNPVEAGDWLHAVEKKLDLIQCTEQEKVSFASHQLHGPAAEWWDHFRQGRAGGEPITWQEFTAAFKKTHIPSGVVALKKREFRALNQGSRSVTEYLHDFNRLARYAPEDVRTDEERQEKFLEGLNDELSYALMSTDFRDFQQLVDKAIRQEDKYNRMEQKKRRAAQFKAQQGSNQRPRLVTGPQVPSYPQGGSSSVVRPQRQFYNNNTGNRGNDNRNMVARPAAAQVQNQPVRKEQGSKPVICFNCGDPGHYADKCPKPRRVKNASAPNNSNVPAPKARVNHVAAAEAQNAPDVVLGTFPVNSIPATVLFDSGATHSFLSKSFASKHGMEVVSLGRPLLVNTPGNQVFSTQYCPSVTIEIEEVPFPSSLILLESKDLDVILGMDWLSRHRGVIDCANRKVTLTSSNGETVSFFASSPKSHGAILNQVALQEIPVVQDYPDVFPEDLPGMPPKRDIEFRIDLVPGTNPIHKRPYRMAANELAEVKKQVDDLLQKGYIRPSTSPWGAPVIFVEKKDHTQRMCVDYRALNEVTIKNKYPLPRIDDLFDQLKGATVFSKIDLRSGYHQLRIREEDIPKTAFTTRYGLFECTVMSFGLTNAPAFFMNLMNKVFMEYLDKFVVVFIDDILIYSKTKEEHEEHFRLALEKLREHQLYAKFSKCEFWLSEVKFLGHVISSGGVAVDPSNVESVLSWKQPKTVSEIHSFLGLAGYYRRFIENFSKIARPMTRLLQKEVKQLRPHENNYPTHDLELAAVVHALKIWRHYLFGNRTEVYTDHKSLKYIFTQPDLNMRQRRWLELIKDYDMEIHYHPGKANVVADALSRKSYCNMSEGRCLPWELCQEFEKLNLEIVSQGFVATLEAKPTLFDQIREAQVNDPDIQEIKKNMRRGKAIGFVEDEQGTVWLGERICVPENKELKDTIMKEAHETLYSIHPGSTKMYQDLKLQFWWASMRREIAEYVALCDVCQRVKAEHQKPAGLLQPLKIPEWKWEEIGMDFITGLPRTSAGHDSIWVVVDRLTKVAHFIPVKTTYTGHKLAELYMARVVCLHGVPKKIVSDRGSQFTSKFWQKLQSELGTRLNFSTAYHPQTDGQTERVNQILEDMLRACVLDFGGSWDKNLPYAEFSYNNSYQASLQMAPYEALYGRKCRTPLLWDQTGERQVFGTDILREAEEKVKIIQERLRVAQSRQKSYADNRRRDLAFEEGDYVYLRVTPLRGVHRFQTKGKLAPRFVGPFKIVSRKGEVAYQLELPTSMAGIHDVFHVSQLKKCLRVPTEEADPGRIELQEDLTYIEKPVRILDFPTFRRRAFPLRKVSKRLWKPKASHTDPKQPFEHVDPVGCEHMVLMVVLMTIKDRFASYCCETFIVPTTSQRGQRLYLLYSCTRLRSGEKSMGVAGESMPCFKGGDYDPVVLMTIKDRFASYCCETLTVPTTSQRGQRLYLLYSMVHCGAPD
More
|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0 | 0.004284 | 0 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_01g0391600 | SBH | 0.220707 | 0.226790 | 0.000000 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g24270 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os05g0247400 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0012040 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0011970 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0011710 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0012110 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_02G0231700 | RBH | 0 | 0 | 0 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0011930 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0209800 | RBH | 0 | 0 | 0 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0011700 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G011870 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0011860 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
