Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsMH63_09G0334500 | OGI:09058200 | 1/16 | Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | Chr09:21688811-21748842 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | 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Transcripts
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| CDS seq | ATGTGCCATCCCTATACTAACCACCTCGTTGAAAACCAGTTGTGGACCCTCAGATATTCGACGTTTCGTCGAAACAATCGCTGCTTCGTGGCCTATGATATTCGACGTTTCGTCGAAACAACCGCTGCTTCGTGGCCTATGTTGTGGACCCTCAGATATTCGACGTTTCGTCGAAACAACCGCTGCTTCGTGGCCTATGATATTCGACGTTTCGTCGAAACAACCGCTGCTTCGTGGCCTATGTGTCGCGCCCGCCAGCCTACCTTAACGGCGCGGTTAGTCGACGCGCTTGACACCGACATCGTCTAA
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| Protein seq | MCHPYTNHLVENQLWTLRYSTFRRNNRCFVAYDIRRFVETTAASWPMLWTLRYSTFRRNNRCFVAYDIRRFVETTAASWPMCRARQPTLTARLVDALDTDIV |
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsMH63_09G0334500 | OsMH63_09T0334500-mRNA-4 | Chr09 | 21688847 | 21744416 | + | maker | ||
| CDS seq | ATGTGCCATCCCTATACTAACCACCTCGTTGAAAACCAGTTGTGGACCCTCAGATATTCGACGTTTCGTCGAAACAACCGCTGCTTCGTGGCCTATGTAATTTCTAGAAAAATCTCTGGGGTTCCAACTCTCCAAATCCAGTCTCTCTTCGGTGAGGCACGTGATTCTGCAGCCATCAAAAAAAACATAGCTCGATTCCATCACCGGAAGGCAATAATTCACCATCTGCATTCCACACTGTCGCGCCCGCCAGCCTACCTTAACGGCGCGTCGACGCGGGTCGCCGGCGGCGGCCATAGGCACGGCGGAGCGGCGGCCGAGAGAGGGGAAGGGAAGGGGGAAAAGAGGCGGCGGTCCACGGCTCACCCTAGGTCGACGGCGACGACGAAAAAGGCGGCCGGAGCGGAGGAAGGCGGCGGCGCGGCTCGGGTCGACGGGGTCGACGGCGTTCCGGCGGTCGGCGGACTCGGCGAGGGGGTGGATGGGGTCGACGGCTGTGCGGCGAAGCCGGAGGAGGCGACGCTAGGGCGGGAGACGGTCCCGGCGAGCGGAGAAGGCCGGCCGGAGATCGTCGGCGACGGAGGAGAGAGAGGGCGACGGCGCGAGCTCGATTCCGGCGGGGAGACGATGGCCGGTCACCTACCCAACCACCGCGGAGAAGGCATGATCGACTTTGTGGCCGAGTTGGCACGCATGACACTGGTGGTGGGCTACCCCGACGCGCCGGAGTACACGACGATTCCGCCGCTCAGTGGCGAGCTTCCTCACCATGTCCGTTTGGAGGTCCATGGCTACGTGGGGACTTGCCTCGCTAACATGGTGGTCGAGGCGTCAGGAGGCACAGCAGATCACGCCTGTCAGGAGGCAGCCTACTTGATGATGGCCAGACTACGGGAGCGCCACAACTACATCTTCCACGACACGGCGTACCGCTACCACCCCCGTCGAGCCAACGGCGATGGCGTCAGCTCCTTCCGTCCGACAGCTGGCGAGAACGACACCACTTTTGGTCACATGTGTGCTGTGATGAGGGGATTGGACAGGATGCACTCGGACCTACACAAGGCGACCAAGGCCTTGAACGATGGGAAGCTCATGAGGATCGTCGCTCTGAAGGACGAGATAGCGCGCCTGAAGAGGGAGAACGCTCAGCTAAAGGGTCTTCCAGCGCCAGGAGGAGTCCGGATCCGCACTACGCCCCGCAAGACGACGACGGCACCCATGGTCTACACCAGGACTGGCAACCGCACGACAGGCGAGGGCAGCAACGGCGAAGAACGCGTTGATGGTGTGCACCCCAACAGTGATTCCGGCAATGGTCCGCCACCACTTCCCGAGAATCCGACCCTTGCCCAAGTTATGGCGCATCAGACTCAGATGATGGCAGCCATGATGCAGCAGATGCAGCAACAACACCAGCAGATGCACCAGAGGATGATGCAGTACGCCGAACAGCAGCACCAGCAGTTTGGTCCCCCTCCCCCTCAGTCCAAGCTGCCTGAGTTCCTACGTGTCAGGCCACCCACCTTCTCCAGCACCACCAACCCTATGGAGGCAAATGACTGGCTCCATGCAATAGAGAAGAAGCTGAATCTCCTGCAGTGTAATGATCAGGAGAAGGTTGCTTTTGCCACACACCAACTTCAGGGCCCTGCGTCAGCTTGGTGGGACAACCACATGGCCACCCGCCCACCGGGTACTGAAGTCACATGGGCAGAGTTCTGCCGTAGCTTCAGGAAGGCACAAGTGCCAGATGGGGTCGTGGCACAAAAGAAGAGGGAATTCCGTGCACTCCATCAGGGCAACAGGACTGTGACAGAGTACCTTCATGAGTTCAATCGCCTCGCGCGATATGCACCAGAGGATGTCCGTACCGACACCGAGAAGCAAGAAAAGTTCATGGTAGGTCTGGATGACGAGTTGACCAACCAACTGATATCTGGGGACTACGCCGACTTTGAGAGGCTGGTCGACAAGGCAATCCGTCAGGAGGACCAACGCAACAAGATGGACAGGAAGAGGAAGGCCGCTCAGCTCAGGGCACATCAGGGAAATCACCAGAGGCCGCGCTTCACTCCCGGACAGCAGGGTGGACCTACCACCATGATCGTCCGCCAGTACCGCCCGTTCAATTCTAGCAACTTTTCCCAGGGCTCCAGTGGCAGCCAGAACCACCATGGAGGTCAGCCCAACCGCGGTGCAGCTCCACGCCCACCAGTGGCACCGGCACAGTCAAGCCAGCCCGCGCAAGCCAAGAAGGAGACGGGAGCAAAACCAGGGTCCTGCTTCAACTGTGGCGAGCTTGGCCACTTCGCTGACAAATGCCCGAAGCCTAGGCGTGCCGGGCCAAGGTTTATCCAGGCTCGTGTCAACCACGCATCTGCGGAGGAGGCACAAGCAGCACCAGAGGTTGTACTGGGTACGTTTCCTGTTAACTCAATCCCTGCAACAGTACTTTTTGATTCTGGTGCAACGCATTCTTTCATCTCAAAGAAATTTGTCGGGATGCATGGGTTAATAAGAGAGGAACTTAGCACACCGATGCGGGTTCATACCCCAGGGAATAGCTCCACTTCGGTTCAATTCAGCCCTTCTATAACAATAGAAATTCAAAGGTCACCGTTTCTAGCCAACCTCATCCTTCTCGAATCCAAAGACCTAGATGTCATTCTTGGGATGGATTGGCGGACCAAGTTTAAGGGAGTCATCGATTGTGCGAATCGCACAGTCACCCTGACCAACGAGAAGGGAGAAACCGTGGTGTACAAATCTCTAGTCTCGCCAAAGAAAGGAGTCTCGTTGAATCAGATTGAGATGGAAATCCCAGTGGACACCGTAGAGAAGAACTTGAGAAAATTGGAAGATATACCCATAGTCCGCGAGTATCCAGAGGTGTTCCCCGAAGACCTCACTACCATGCCACCCAAGAGAGAGATTGAATTCCGGATTGACTTGGCACCGGGAACTGCTCCAATCTATAAGAGACCGTACAGAATGGCGGCCAACGAATTAGCGGAGGTCAAGAAGCAAGTTGATGAGCAGCTGCAGAAAGGGTACATTCGACCAAGTACTTCACCTTGGGGTGCTCCGGTCATATTTGTGGAGAAAAAGGATAAGACGAAGAGGATGTGCGTTGATTATCGCTCACTCAACGAGGTCACAATCAAGAACAAATATCCTTTGCCGCGAATCGATGATTTGTTTGATCAACTGAAGGGAGCTAAAGTGTTTTCTAAGATAGACCTGCGATCAGGCTACCACCAGTTGAGAATCCGGGAAGAGGATATTCCGAAGACGGCCTTCACCACTCGGTACGGGCTATATGAGTGCATGGTTATGTCCTTCGGACTTACTAACGCACCTGCATTCTTCATGAATCTGATGAACAAAGTGTTCATGGAATTTCTGGACAAGTTTGTTGTGGTATTCATCGACGACATACTTATCTACTCAAAATCCGAAGAAGAACATGAACAACATCTTCGTCTGGTACTCGAGAAGTTGAAGGAGCACCAGCTATACGCCAAGTTCAGCAAGTGTGATTTCTGGTTGACGGAAGTCAAATTTCTGGGTCATGTCATTACAGCTCAGGGTGTGGCAGTCGACCCATCGAACGTGGAGTCAGTTACCAAGTGGACCCCACCGAAGACCGTGTCGCGGATTCGAAGTTTTCTAGGACTGGCAGGTTATTACCGTCGATTCATCGAAAACTTCTCCAGAATCGCCCGACCCATGACTCAGTTGCTTAAGAAGGATGAGAAGTTTAAATGGACAGCTGAGTGCGATAAGAGCTTTGAGGAGCTCAAGAAGAAATTAGTATCCGCACCGGTTTTAATCCTGCCCGACCAGATGAAAGACTTCCAAGTCTATTGCGATGCATCCCGTCACGGACTTGGATGTGTCCTAATGCAAGAGGGCAGAGTGGTTGCGTATGCCTCACGGCAGTTGCGCCCACACGAAGGAAATTATCCAACTCATGACTTGGAATTGGCAGCAGTGGTTCATGCTTTGAAGATTTGGAGGCACTATCTGATTGGCAACCGCTGCGAAGTATATACGGACCATAAGAGTCTGAAATACATCTTCACCCAACCGGACCTAAACCTTCGACAACGAAGATGGTTGGAACTAATCAAAGACTATGACATGAGTATTCACTACCACCCGGGTAAAGCCAATGTGGTGGCAGACGCTTTAAGCCGGAAAAGTTACTGCACTGCCTTATGCATCGAGGGCATGTGTGAGGAATTGCGGCAGGAGTTTGAACATCTCAACATGGGAATTGTTGAACACGGGTTCGTAGCCGCTCTGGAGGCACGGCCTACGCTCGTGGATCAAGTTAGGGCCGCTCAAGTAAATGATCCGGAAATAGCAGAACTGAAAAAGAACATGAGAGTCGGAAAGGCTCGGGATTTCCTTGAGGATGAGCATGGCACAATCTGGATGGGAGAAAGATTGTGTGTACCTGACGACAAGGAATTGAAGGATCTGATACTCACCGAGGCTCATCAGACCCAGTACTCCATTCACCCAGGCAGCACCAAAATGTATCAAGACCTCAAAGAAAAGTTTTAG
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| OsMH63_09G0334500 | OsMH63_09T0334500-mRNA-7 | Chr09 | 21688811 | 21732534 | + | maker | ||
| CDS seq | ATGTGCCATCCCTATACTAACCACCTCGTTGAAAACCAGTTGTGGACCCTCAGATATTCGACGTTTCGTCGAAACAACCGCTGCTTCGTGGCCTATGTTGTGGACCCTCAGATATTCGACGTTTCGTCGAAACAACCGCTGCTTCGTGGCCTATGTTGTGGACCCTTAGATATTCGACGTTTCGCCGAAACAACCGCTGCTTCGTGGCCTATGTGTCGCGCCCGCCAGCCTACCTTAACGGCGCGGTTAGTCGACGCGCTTGACACCGACATCGTCTAA
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| CDS seq | ATGTGCCATCCCTATACTAACCACCTCGTTGAAAACCAGTTGTGGACCCTCAGATATTCGACGTTTCGTCGAAACAATCGCTGCTTCGTGGCCTATGATATTCGACGTTTCGTCGAAACAACCGCTGCTTCGTGGCCTATGTGTCGCGCCCGCCAGCCTACCTTAACGGCGCGGTTAGTCGACGCGCTTGACACCGACATCGTCTAA
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| Protein seq | MCHPYTNHLVENQLWTLRYSTFRRNNRCFVAYDIRRFVETTAASWPMCRARQPTLTARLVDALDTDIV |
|||||||
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsMH63_09G0334500 | OsMH63_09T0334500-mRNA-9 | Chr09 | 21743214 | 21748842 | + | maker | ||
| CDS seq | ATGAGGAGAGAAATAGCTGAATTCGTCGCACTCTGCGATGTTTGCCAACGAGTGAAGGCAGAGCACCAAAGACCCGCAGGTTTACTCCAACCTCTTCAAATCCCGGAATGGAAATGGGAAGAGATTGGAATGGACTTTATAACGGGACTGCCCCGGACATCGTCGGGTCACGATTCGATCTGGGTAGTCGTGGATCGACTCACTAAGGTTGCTCACTTCATACCAGTACATACCACATATACGGGCAAAAGGTTGGCGGAGCTTTACCTTTCGAGAATCATGTGCCTACATGGAGTACCCAAAAAGATTGTATCTGACCGAGGGAGTCAGTTCACCTCAAAATTCTGGCCGAAGCTACAGGAAGAATTGGGGACCCGTTTAAATTTCAGCACGGCCTATCACCCGCAAACTGATGGTCAGACCGAGCGGGTCAATCAAATCTTGGAAGATATGTTGAGAGCTTGCGCTCTTGATTTTGGTGGAGCTTGGGACAAAAGCTTGCCATATGCGGAATTCTCGTACAACAACAGCTACCAAGCCAGTCTACAAATGGCACCGTTTGAAGCTCTATACGGCCGGAAGTGCCGCACACCTCTCTTCTGGGATCAGACAGGCGAGCGTCAGCTGTTCGGAACAGAGGTATTAGCGGAAGCAGAAGAGAAAGTCAGAATCATTAGGGAAAGGTTGAGGATTGCCCAGTCTCGACAGAAGAGCTACGCGGATAACCGTCGGAGGGAGCTCACTTTTGAGGCAGGAGATTACGTGTATCTTCACGTCACTCCGCTCCGGGGAGTACACCGCTTTCAGACAAAAGGCAAGTTGGCACCACGCTTCGTGGGACCATACAAAATCTTGGAACGAAGGGGGGAAGTGGCTTATCAATTAGAACTTCCATCCAATATGATCGGCATCCATGACGTGTTCCACGTGTCCCAATTAAAGAAGTGTTTAAGGGTACCTGAAGAACAGGCTGATTCGGAACACATTGATATCCAGGAGGACCTAACATATGTGGAGAAGCCGGTTCGTATACTTGATACCAGCGAAAGGAGAACCAGAAACAAGGTCACCCGGTTTTGCCGAGTTCAGTGGAGTCATCATTCGGAAGAGGAAGCAACCTGGGAAAGGGAAGATGAGTTGAAGGCCGCCCACCCGCACCTCTTCACCAGCTCCTCCGAATCTCGGGGCCGAGATTCCTCCAAGCGTGAGCAGCGCGGACACTTAGACTGGAGAAAAAACCAGCAAGAGTGCTCAATACGGATGATAGCCCTTTGTGCCGTTGTCGACGTAGCCAAAGTGAAGGGTGCGAGGGATCCGTGGTCGATGAAGCCGTGCGTAGAGTAG
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| Protein seq | MRREIAEFVALCDVCQRVKAEHQRPAGLLQPLQIPEWKWEEIGMDFITGLPRTSSGHDSIWVVVDRLTKVAHFIPVHTTYTGKRLAELYLSRIMCLHGVPKKIVSDRGSQFTSKFWPKLQEELGTRLNFSTAYHPQTDGQTERVNQILEDMLRACALDFGGAWDKSLPYAEFSYNNSYQASLQMAPFEALYGRKCRTPLFWDQTGERQLFGTEVLAEAEEKVRIIRERLRIAQSRQKSYADNRRRELTFEAGDYVYLHVTPLRGVHRFQTKGKLAPRFVGPYKILERRGEVAYQLELPSNMIGIHDVFHVSQLKKCLRVPEEQADSEHIDIQEDLTYVEKPVRILDTSERRTRNKVTRFCRVQWSHHSEEEATWEREDELKAAHPHLFTSSSESRGRDSSKREQRGHLDWRKNQQECSIRMIALCAVVDVAKVKGARDPWSMKPCVE
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0 | 0 | 0 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os09g16350 | SBH | 0.001529 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | NA | NA | NA | NA | NA |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_09G0334300 | RBH | 0 | 0 | 0 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_02G0429600 | SBH | 0.001411 | 0.0192505 | 0.002376 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
