Basic Info |
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| OsMH63_09G0196700 | OGI:09033810 | 16/16 | Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | Chr09:12541953-12551297 | ||||||||
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| Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g51860 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGG4] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsMH63_09G0196700 | OsMH63_09T0196700-mRNA-1 | Chr09 | 12541953 | 12551297 | - | maker | ||
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| CDS seq | ATGGCACCCATGCTCCTCTTCGCTGCACTCATGTTAGCCTCACTATCCGAAGCAGCGGCTGACGATGGGATCGGCGGCCAGTCAGGTTTTGTGAGCATCGACTGCGGCAGGGAGGCCAACTACAGCGACTACAAGGACCCCAAGACCGGCATCGTCTACGTCTCCGACGAGCCGTACATCGACGCCGGCGCAGGGGAGAATCACCGGATCTCCGCCACTGCCACGGCCACCGCCGCCGACAGCTACCTCCTCCAGACGCTCCGGAGCTTCCCCTCCGGCCCGCGCAACTGCTACGCGCTCCCCACCGTCGCCGGGACCAAGTACCTGGTCCGGCTGGGGTTCCTGTTCGGCAACTACGACGGCGAGAACAGCTCGTCGTCGTCGGCGTCGTCCCTGCGGTTCGATCTGCATCTCGGTGCGCAACGCTGGGCCACCGTGGACGACGTGGTTGTGCAGACCGGCGGGATTAGCCGGATGTACGAGGTGGTGTTCATGGGGTGGGCGAGGTGGGCGCCGGCGTGCCTGGTGAACGTCGGCGGCGGCACGCCGTTCGTGTCGTCGGTGGAGCTGAGGCCGATCGACGACGAGCTTTACCCGTCCGTCAAGACCAGCGAGTCGCTGTCTTTGTTTAAACGGTCGGATATGGGGGCGGACACTACTACTCTTACCCGGTACCCTGCCGATGAGCACGACCGCATCTGGAAAGGGACTGGAAACCCAGGATCGACAGACATTTCCACCCAAGAAAAAATCCAGTCGGAGAACAGCTTCGAGGTGCCCCTCCCTGTTCTTCAGACAGCGATCACGACGCCCGGTGGCAACGGCACGACGCTCACCGTGGCATGGCAAGACACAAGGTCGTCGAGCGAATACATGGTGTTCCTTCACTTCGCCGACTTTCAGAAGATTCAGCCCAGGCAGTTCAATGTCACACTCAACGACATCCCGATCGGATCCAATGGCCGGTCGCTCATGTTCAGCCCTTCGCCCCTGGACTCTTCCTCTGTATACAGCTCCGATGGGTACAGAGCTGATGATGGCAATTACAACCTCGTCCTCAGGAGAACAGCTGCCTCGGCGCTGCCTCCGATGCTCAATGCGATGGAGATCTATACTGTCATCACACATGATAGTCCAAGGACATTCCACAAAGACTTTGACGCGATCATGGACATTAAATATGAGTATGGGATCAAGAAAAACTGGATGGGTGATCCGTGTTTCCCGTCCGAATTTATTTGGGATGGCATCAAATGCAGCAATGCAGGTGATGATAACACTTCAAGAATAATATCACTTGATCTCTCCCAGAGCAACTTGCAAGGGGTGGTATCTATTAACTTCACTTTTCTCACCGCGCTCAACTATTTAAATTTGTCAGGTAACCAACTGAATGGGCCAGTTCCAGACTCGCTCTGTAAAAATATTGCAGGATTATACATTTTCAGTTACACGTCTGACGGAGATATCTGCAACAATAGAACCTCTTCGTCTCGGTCAACAAACAGATCAACAACTATCTTAGCAATTTCAATAGTTACTCCCGTATTGGCAGTGGCTATACTTCTTGCATTTCTTCTCTGGAGAGCAAAAGGAAAGCACAACGTTTCTACATGTGATCCTCCCAGAGTACCGGATCCCAAGAAAGCTCCAGGAAGTACAACAGATCACTGGAGCCATTTGCCAATAAATGGAAGTCGCCAATTCACATATGAGGAACTGAAGAATTTTACTCTTAACTTTCAACGGTTTATTGGACAAGGAGGTTTTGGACATGTGTATTATGGTTGTTTAGAAGATGGCTCTGAGGTTGCTGTCAAGATGCGATCCGAATCATCATTGCATGGGCTTGATGAGTTTTTAGCTGAGGTCCAGAGCTTGACAAAGGTGCATCACAGAAATCTAGTTTCTTTGGTTGGATACTGCTGGGAAGAGCACTATTTAGCACTGGTCTATGAGTATATGCCTAGTGGCAGTCTATGTGATCATCTGAGAGGTAAACGTGATGTTGGTGAAACCTTGAACTGGGCAAAACGTGTGCGAATCATGCTTGAAGCTGCACAAGGCCTGGAATACCTACACAAGGGTTGCAATTTGCCAATAATTCACGGGGATGTGAAAACCAATAATGTTCTCTTGGGTGAAAATCTGAAAGCTAAACTAGCGGATTTTGGGCTCTCTAAAATGTATATTAGTGACTCGCAGACTCACATATCAGTCACCGCAGCTGGAACAGTGGGTTACATTGACCCAGAGTACTATCAGACCGGACGGCTAACTGAGAGCAGTGATGTTTATAGCTTTGGTGTTGTTCTACTGGAGGTAGTCACCGGTGAGCTTCCGATACTAGCTGGCCATGGTCACATCGTCCAGCGTGTGGAACGTAAGGTTACCTCCGGTAGTATCGGCTTAGTTGCCGATGCACGACTTAATGATTCCTACGACATTAGCTCTATGTGGAAGGTGGTGGATACCGCAATGCTGTGCACAACAGATGTTGCTATTCAAAGGCCAACTATGTCCACCGTTGTTTTACAGTTGAAGGAATGCCTTGCATTGGAAGAAGCTCGTGAGGATAGGAATAGGGCAGGCCCAACAAATGATGCCGTGGATGTGGTATCCACATTTGGTCCATCGGCAAGATGA
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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsMH63_09G0196700 | OsMH63_09T0196700-mRNA-3 | Chr09 | 12541953 | 12551297 | - | maker | ||
| CDS seq | ATGGCACCCATGCTCCTCTTCGCTGCACTCATGTTAGCCTCACTATCCGAAGCAGCGGCTGACGATGGGATCGGCGGCCAGTCAGGTTTTGTGAGCATCGACTGCGGCAGGGAGGCCAACTACAGCGACTACAAGGACCCCAAGACCGGCATCGTCTACGTCTCCGACGAGCCGTACATCGACGCCGGCGCAGGGGAGAATCACCGGATCTCCGCCACTGCCACGGCCACCGCCGCCGACAGCTACCTCCTCCAGACGCTCCGGAGCTTCCCCTCCGGCCCGCGCAACTGCTACGCGCTCCCCACCGTCGCCGGGACCAAGTACCTGGTCCGGCTGGGGTTCCTGTTCGGCAACTACGACGGCGAGAACAGCTCGTCGTCGTCGGCGTCGTCCCTGCGGTTCGATCTGCATCTCGGTGCGCAACGCTGGGCCACCGTGGACGACGTGGTTGTGCAGACCGGCGGGATTAGCCGGATGTACGAGGTGGTGTTCATGGGGTGGGCGAGGTGGGCGCCGGCGTGCCTGGTGAACGTCGGCGGCGGCACGCCGTTCGTGTCGTCGGTGGAGCTGAGGCCGATCGACGACGAGCTTTACCCGTCCGTCAAGACCAGCGAGTCGCTGTCTTTGTTTAAACGGTCGGATATGGGGGCGGACACTACTACTCTTACCCGGTACCCTGCCGATGAGCACGACCGCATCTGGAAAGGGACTGGAAACCCAGGATCGACAGACATTTCCACCCAAGAAAAAATCCAGTCGGAGAACAGCTTCGAGGTGCCCCTCCCTGTTCTTCAGACAGCGATCACGACGCCCGGTGGCAACGGCACGACGCTCACCGTGGCATGGCAAGACACAAGGTCGTCGAGCGAATACATGGTGTTCCTTCACTTCGCCGACTTTCAGAAGATTCAGCCCAGGCAGTTCAATGTCACACTCAACGACATCCCGATCGGATCCAATGGCCGGTCGCTCATGTTCAGCCCTTCGCCCCTGGACTCTTCCTCTGTATACAGCTCCGATGGGTACAGAGCTGATGATGGCAATTACAACCTCGTCCTCAGGAGAACAGCTGCCTCGGCGCTGCCTCCGATGCTCAATGCGATGGAGATCTATACTGTCATCACACATGATAGTCCAAGGACATTCCACAAAGACTTTGACGCGATCATGGACATTAAATATGAGTATGGGATCAAGAAAAACTGGATGGGTGATCCTGATCTCTCCCAGAGCAACTTGCAAGGGGTGGTATCTATTAACTTCACTTTTCTCACCGCGCTCAACTATTTAAATTTGTCAGGTAACCAACTGAATGGGCCAGTTCCAGACTCGCTCTGTAAAAATATTGCAGGATTATACATTTTCAGTAATTCTGAACTAATGGTTTTGGACAATTTTAGTTACACGTCTGACGGAGATATCTGCAACAATAGAACCTCTTCGTCTCGGTCAACAAACAGATCAACAACTATCTTAGCAATTTCAATAGTTACTCCCGTATTGGCAGTGGCTATACTTCTTGCATTTCTTCTCTGGAGAGCAAAAGGAAAGCACAACGTTTCTACATGTGATCCTCCCAGAGTACCGGATCCCAAGAAAGCTCCAGGAAGTACAACAGATCACTGGAGCCATTTGCCAATAAATGGAAGTCGCCAATTCACATATGAGGAACTGAAGAATTTTACTCTTAACTTTCAACGGTTTATTGGACAAGGAGGTTTTGGACATGTGTATTATGGTTGTTTAGAAGATGGCTCTGAGGTTGCTGTCAAGATGCGATCCGAATCATCATTGCATGGGCTTGATGAGTTTTTAGCTGAGGTCCAGAGCTTGACAAAGGTGCATCACAGAAATCTAGTTTCTTTGGTTGGATACTGCTGGGAAGAGCACTATTTAGCACTGGTCTATGAGTATATGCCTAGTGGCAGTCTATGTGATCATCTGAGAGGTAAACGTGATGTTGGTGAAACCTTGAACTGGGCAAAACGTGTGCGAATCATGCTTGAAGCTGCACAAGGCCTGGAATACCTACACAAGGGTTGCAATTTGCCAATAATTCACGGGGATGTGAAAACCAATAATGTTCTCTTGGGTGAAAATCTGAAAGCTAAACTAGCGGATTTTGGGCTCTCTAAAATGTATATTAGTGACTCGCAGACTCACATATCAGTCACCGCAGCTGGAACAGTGGGTTACATTGACCCAGAGTACTATCAGACCGGACGGCTAACTGAGAGCAGTGATGTTTATAGCTTTGGTGTTGTTCTACTGGAGGTAGTCACCGGTGAGCTTCCGATACTAGCTGGCCATGGTCACATCGTCCAGCGTGTGGAACGTAAGGTTACCTCCGGTAGTATCGGCTTAGTTGCCGATGCACGACTTAATGATTCCTACGACATTAGCTCTATGTGGAAGGTGGTGGATACCGCAATGCTGTGCACAACAGATGTTGCTATTCAAAGGCCAACTATGTCCACCGTTGTTTTACAGTTGAAGGAATGCCTTGCATTGGAAGAAGCTCGTGAGGATAGGAATAGGGCAGGCCCAACAAATGATGCCGTGGATGTGGTATCCACATTTGGTCCATCGGCAAGATGA
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| Protein seq | MAPMLLFAALMLASLSEAAADDGIGGQSGFVSIDCGREANYSDYKDPKTGIVYVSDEPYIDAGAGENHRISATATATAADSYLLQTLRSFPSGPRNCYALPTVAGTKYLVRLGFLFGNYDGENSSSSSASSLRFDLHLGAQRWATVDDVVVQTGGISRMYEVVFMGWARWAPACLVNVGGGTPFVSSVELRPIDDELYPSVKTSESLSLFKRSDMGADTTTLTRYPADEHDRIWKGTGNPGSTDISTQEKIQSENSFEVPLPVLQTAITTPGGNGTTLTVAWQDTRSSSEYMVFLHFADFQKIQPRQFNVTLNDIPIGSNGRSLMFSPSPLDSSSVYSSDGYRADDGNYNLVLRRTAASALPPMLNAMEIYTVITHDSPRTFHKDFDAIMDIKYEYGIKKNWMGDPDLSQSNLQGVVSINFTFLTALNYLNLSGNQLNGPVPDSLCKNIAGLYIFSNSELMVLDNFSYTSDGDICNNRTSSSRSTNRSTTILAISIVTPVLAVAILLAFLLWRAKGKHNVSTCDPPRVPDPKKAPGSTTDHWSHLPINGSRQFTYEELKNFTLNFQRFIGQGGFGHVYYGCLEDGSEVAVKMRSESSLHGLDEFLAEVQSLTKVHHRNLVSLVGYCWEEHYLALVYEYMPSGSLCDHLRGKRDVGETLNWAKRVRIMLEAAQGLEYLHKGCNLPIIHGDVKTNNVLLGENLKAKLADFGLSKMYISDSQTHISVTAAGTVGYIDPEYYQTGRLTESSDVYSFGVVLLEVVTGELPILAGHGHIVQRVERKVTSGSIGLVADARLNDSYDISSMWKVVDTAMLCTTDVAIQRPTMSTVVLQLKECLALEEAREDRNRAGPTNDAVDVVSTFGPSAR
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.0777455 | 0.1852965 | 0.0270855 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_09g0353200 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os09g18360 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os09g0353200 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_09g0006960 | RBH | 0.085575 | 0.0 | 0.000000 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_09g0006960 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_09g0007140 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_09g0007020 | RBH | 0.021258 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_09g0007100 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_09G0195100 | SBH | 0.0997285 | 0 | 0.0017045 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_09g0007190 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_09G0174500 | RBH | 0.0504135 | 0.6012575 | 0.024474 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_09g0007040 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_09g0006910 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_09g0006870 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_09g0006800 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_09g0006870 | RBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_09G007410 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_09g0007210 | RBH | 0.000000 | 0.0 | 0.0 |
