Basic Info |
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| CDS seq | ATGGACGACGTCACCGCTTCGCTCGCGCCGGAGCTCCTCTCCGAGATCCTCCTCCGCCTCCCTCCGGACGAGCCAGGGCACCTCTTCCGCGCTGCCATCGTCTGCAAGGAGTGGCTCCGCGCCATCTGCGACCCCGGCTTCCTCCGCCGCTACCGCGCCTTCCACGGATCCCCTCCCCTGCTCGGCCTCCTTCACAGGCGCCAAGTCCTACAGGGTGATCCCGTCCGCCACCTCGCCCGCACCACCGCAGTGCCCCTCTTCCCCGATCCCACCTTTCGCCGGGCCCTCGATTGCCACCATGGCCGCGCCCTCCTCCACGCGTCGGACGACGGTTGGTATCTCATTGTCTGGGACCCCGTCACGGGCGAACAGCACCGCGTGCTAGAGCCTGGCATCCCGTGGCTGATGTACACTGCCGCAGTGTTCTGTGCCGTGAGTGGCTGTGCCCACCTCGACTGCCACGGCGGTCCCTTCAGAGTGGTCTTTGTGGCCACGGACGATGAGGACGAACTCGTTAAGGCGAGCGTGTACTCGTCGGAGACGGGTGCATGGAGCAAGCCAGCAATTCTTGATTATGGTTATCAAACCTGGCAAGAGCGTTTGCAAGCCATCACTAGAGGTGAATCATACCGTACACCTTATGTCCAGCCCAGGCGAGGAGCCCTTGTCGGAGATGAAATCTACTTCACACTTCGGAACGAGAATGCAATCATCAAGTACAACTGGGGCATGAACTGCTTTTCTAAGATTGACCCGCCGATACGAGAAGTGTATGACATTGCCCTCATGGAGATGGAGAACGGCTCACTGGGTTATGCCTGCATTCAGGGTTCCAGCCTTTATATGGATCGAATTGAAGTTGATGCTTTAGAAGACTGTAATGTTGATAGTGAATCCAGTAGTGATTCTGAATTGGATGATTTAATCTTAAGAATGCACAGGAAAGAGGTTGTTCATGAGATTAAAAGGCATTTGAAAAAATCTTATGATTTCCATACATCCAAGGCGCTTTATCTTGACCATGTTGATTTTGGCAAGAAGAATCCTGGAAATAGCACTCCTCGCATTGCTGTTTGGACTAAGAACATGATACAAACTTACTCTGATCTTGACAAAGTTGATGATGATAATTTTGGTCTTAGGCCTCTTAGAGATTTTAAATCTGTGTGTTATTATCAGCCTCATCCTACTGCTGAGAGAAGAATTTCATTTAAAGAGAAACTTGATTCTGCTCTAGGTTCTGTGTTGCCTCTTAGTATGAAAGAGAAATTATGTTCTCTGATGGAACATCATTGTTCTGAAGTTCATGCTGCTGGGAGTCATACTTGTGAAGATGTTCTTATTGATGCTCTAGTTCTGGTTGCTGAAGATAGTGTTACACCCTCAGATAAAGTTCAAAATGATGTTGATGATACTAATACTGAAGGTTGTAATGCTGTTCCTTCTAGATTTGATGATAATGCTGGTATTTCTACCCCAATGAATACAAATGTTGATGCTTCAATACCAGATGATGTTGTTGTCTGTACACCCATTGAAAATGATCCATGTGTCAACTCTTTTGTTGCTAATGGTGATGATGTTATTGCATCTGGTCATGCTGCTGCACTTATCTCATCAAGTAACAGAGATTTTGATTATGAGTTGTTGACTCCTAAGAGTGCTTTTGTGAAGAAGTTCAAATATTGTGCTGATCATAATTTGGCTGGTTCTGCTAGTGCAACCATTGCTGCTTCTATTCATAATGTTGCAAAGAAGTTTAAGACAAGATTTCCAGAATTACTAAATCAAAATGCCAGAGACAATATTATTGATTTTTCAAGGCCTTCATTCAAATTGCTTGATTCTGAAGATGATGTTAGTAGTTCTAATGATGATGCCAATAATCAGTTAAATGAAGAGGATAATCAAGCTCATGGAGATATTACTCCTCCTTCATCATTGAACTCTCCAGATGTTGTTTTCTTGGGTGAAAATAAATTTCCACAAACTGTTAAAGAATCTTGTGTTAAAACCGAAGAGATATACAATGCAACCAATAATCTATCACGGTATACACATGGGATGAGCTCTTCAGGCGGAAAATTACCTGCTCATGGTCCTAGAAGAATAATTGTTCCTAGCAGGCATGCTTCTGATCCATTTGTTCCTGCAATGAAATGTCGTTTTCTAGTGTCCGATCAAGAGAACAGATATTACATTGCTCTCTGTCGCTTAGCAGATAGTTCCAAGTGGCAGAGTTATGATGCTGTTGATATCGACAATGTCAGAGCCAAGTTTTCTAGCTTTGGCCATTCTCTCAAAAAGACTAGTGTTGTTTTGCCATTTGTCATTTCAGTTTTCTGCCGCTTTTTGTTTCAAAACAATCATCCATCAAAATCTAAGAAGCATTATTTCTTCCCATCCATTGGTGCACAACTTATTCTTGACCCTGATTTTGTTGATCAAGAAAAAGTGAAAAAATCTTTCCTTGGAGCTGCTAGTGCTCAGCCACTACACCTTTGTGACATGCTTTTTTTCCCTATACTACATGGTCAGCACTGGTTTGTTCTCGTTGTTGATATAAAAGATAGGATGCTGGTGTTTTTAGATTCATTGCATCAACCAGATGATGAGTTTTTTGAACCAATTCTGCCTTTGCTGTTAAAAAATTTGCAAATTGTGTGGGATAAATATGAACGCACTCCAATGAACTTCAGCACTTTTAAATTTAAGTTCCCACCTATTCCATGCCAAGAATACAGTTTTGATTCAGGCATATTCTCAATGAAGTTCATGGAAATTTGGTCTCCAAGAATTATTCTTTCTAATCAATTCACTGGACAAAATATCAACAATATCCGCGTACAGTATGCGAATCAGATGTTTTTTCATCCAAACAACAAGATGTTGCAAACCGAAGTTGAAAATGTTGTTGTCAATTGGTTTGATTCAGCAAGGTTTCCAAGCAATCACCGTGCTATTGATGCTTGA
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| Protein seq | MDDVTASLAPELLSEILLRLPPDEPGHLFRAAIVCKEWLRAICDPGFLRRYRAFHGSPPLLGLLHRRQVLQGDPVRHLARTTAVPLFPDPTFRRALDCHHGRALLHASDDGWYLIVWDPVTGEQHRVLEPGIPWLMYTAAVFCAVSGCAHLDCHGGPFRVVFVATDDEDELVKASVYSSETGAWSKPAILDYGYQTWQERLQAITRGESYRTPYVQPRRGALVGDEIYFTLRNENAIIKYNWGMNCFSKIDPPIREVYDIALMEMENGSLGYACIQGSSLYMDRIEVDALEDCNVDSESSSDSELDDLILRMHRKEVVHEIKRHLKKSYDFHTSKALYLDHVDFGKKNPGNSTPRIAVWTKNMIQTYSDLDKVDDDNFGLRPLRDFKSVCYYQPHPTAERRISFKEKLDSALGSVLPLSMKEKLCSLMEHHCSEVHAAGSHTCEDVLIDALVLVAEDSVTPSDKVQNDVDDTNTEGCNAVPSRFDDNAGISTPMNTNVDASIPDDVVVCTPIENDPCVNSFVANGDDVIASGHAAALISSSNRDFDYELLTPKSAFVKKFKYCADHNLAGSASATIAASIHNVAKKFKTRFPELLNQNARDNIIDFSRPSFKLLDSEDDVSSSNDDANNQLNEEDNQAHGDITPPSSLNSPDVVFLGENKFPQTVKESCVKTEEIYNATNNLSRYTHGMSSSGGKLPAHGPRRIIVPSRHASDPFVPAMKCRFLVSDQENRYYIALCRLADSSKWQSYDAVDIDNVRAKFSSFGHSLKKTSVVLPFVISVFCRFLFQNNHPSKSKKHYFFPSIGAQLILDPDFVDQEKVKKSFLGAASAQPLHLCDMLFFPILHGQHWFVLVVDIKDRMLVFLDSLHQPDDEFFEPILPLLLKNLQIVWDKYERTPMNFSTFKFKFPPIPCQEYSFDSGIFSMKFMEIWSPRIILSNQFTGQNINNIRVQYANQMFFHPNNKMLQTEVENVVVNWFDSARFPSNHRAIDA
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| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0 | 0.0024545 | 0 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_08g0299700 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os08g20480 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os08g0299700 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_08g0010670 | RBH | 0.066239 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_08g0010700 | SBH | 0.218727 | 0.000000 | 0.429709 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_08g0010850 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.096114 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_08g0010730 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_08g0010550 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_05G0270700 | RBH | 0.0110675 | 0 | 0 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_08g0010580 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_08G0191200 | RBH | 0 | 0 | 0 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_08g0010180 | SBH | 0.000000 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_08g0010300 | RBH | 0.0 | 0.000000 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_08g0010160 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_08g0010930 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_08G010400 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_08g0010350 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
