Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsMH63_07G0447700 | OGI:07060020 | 16/16 | Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | Chr07:28529182-28561876 | ||||||||
| Gene Symbol | - | ||||||||||
| DNA seq | 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| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsMH63_07G0447700 | OsMH63_07T0447700-mRNA-4 | Chr07 | 28550372 | 28554920 | + | maker | ||
| CDS seq | ATGATGATGGCCGACGGCGCCGAGCACCGGATACAGATGCCAGACGCCGCCGCTACCTCGAAGGCGGCCGCCGCGCCGGAGAAGTGGCTGAATTACTTCGTCCGCTTGCTGGCGGTGATCGAGAGCGTGGGCAACGCCTTCGGCACGCTGGCCTTCACCTGGGCTACAGTCGTCCTCCTCGGCGGCTACCCCACCGTGCTCGGCTCGCACGACGATTTTTGGTTCGCCACAGCCATCGTCTTCCTAGAAGCCGTCAGGATGTTCAGCAGCCGCAACAATAGATCCGATTACCAATTGTTCTTCCGGACAAGAGGTGCTTTCAGATTCCTTGGCGGCAAAGGACTGATCGTGCTCATATGCTTTTGGGATGTAATGGCAACGCTGACGATGACTGTTGCGAACTGGAAACTCAGGCTAGGTATATTAGTTGCAATCACAGTAATGTTAATACTTGCAGCTGGCCAGTTTTTATGTCCTCGAGGAGCTCAAAGACCACGGACCTGTAACTGGCCATACCGTGCGATCTCTCTATGGAGTCCCGTGGTTGCAATCCTATTGCTGGCTTTCCCAATACTTCGATATTACAACCGGCACATGCACAAAATCATTTTCAGAAACTCATTTACCGTGTGGATACCGTACATTCTTCTTTCTGTGACTGTGCTCCTACTGACAATCAGCCGGCTGCAGTTCCCAATTATAGCTAACCTAGTGCACGGTGCTCTGGGCAGCAAGCACGTATTCTGGCGTCAGTTTATTCTGAACTCATGCATGTTTCTTGCACTAGTGATACTGGTTGTCATGTCTGATCCAGGCCTTCGGTCTGCGATGATCTTCATCGATGTATGTGCTGTACTCATACTGTCATTTGGCAACTTACATATTCCAGCAGCGCTCGTGCGTGTCGTACTCGCTTTGATACGCCTTATACCACATAACTATTTTGGTGATGGTAACATGACGAATCTTGGCCCATCTCTGAGTATCTTCTATGGGATGGTGCTTGGCCAAGGAATACTTTACATTGTGGATGGCATACTGGAGGTCTTCTCATTCATCCCTCGGAGATCCCTCATCCGAAATGGTGGATTTGCAGGTCAGTGGGGAGTAGAATCTGTCAATCTGTACTACGTATATGCCTTTGACAAATACATGGAAGGAGGTCTGTTTGCTTCAAAGAGGATCAGCCTCAGTAACTTTGCCATTGATTCTCTGAATTCGGACTTATCCAAGAATCAGCTATACGGGGTACGGATGATGCACACATTTCTGCAAAGTGATCTGACCAGGGCACGGTTGCTGGAGAAACTCACCACTTCAACGCAAACGATGGCCAGGTTAATCAGCATGTTGGACTGGAGTAGTAGGCACCATTGTACAACTATCAGATTATATGCTGCCAAGGTCACTGCTGAGCTCGCAAAGAACCTGCGAGTTGTAACAGTCCCTGGTACATTGCAGCTTGTATCTATGCTTCTGGATGCTGATGGAAAGCCGAAAAGAGGACACCCACTCCTGGATGCAGATGATGATCATTTTGTTGATATATTAGATAGACAAGATAAAAAACATGATATAGCTGGTGACCAAGAGCCGATTGAGGACACCGATAACCTGCTGGAAACACCAACCCGATCAATGCACATCAATGACCAAAGATGCATACCTAGAATTTGGCAGAGGATATTGGCGTACTGGTCGATTCCCAAGGAGCAGCCATTGACAGACGATGATTTCCTCCCTGCACTTGGCATGTCAATCATTTATAGCCTTGCTGGTTGTGATCAAAATAACTGCGTGGAAATCGACAAAGTAACTTACCTGATCCCCAAAATCATTGGATTCACAAGCTACAGAAGTGCAATGGTAAATTCTGAAGCACAACAAAAGGTTCTCTTAAAGTCATCACTGAAGGTGCTGCAGAGACTCACAAGCATTGAAGGGGAAATTGGCATAACACTGCGCTACAAGATATCAAAACATCCCTTCCTGTTGAGAAACCTTGCAGAGATCTTGGGAGACAGCAGCAGTAGCAATCAAGAACTAAGGAGGATCGTGGCAGGAATCCTCAGAAACCTTGCAATTGACAGAGACATGAGGCAGGAGATTGGACGAATGCAAATACTCATTACCACGCTGATGAAGGCATTCCTCGATTTTAAAGGATTATATAGTTCAGATGTTGATTGCTTGCTGCCAAAGGTCGCCGGGCAAGCACTGGTAATGCTGTCATCAGAAAATTCGCATAACTGCTTTGTTATGTTGAAGGAACCAGACTTCATTCATAAACTAAAAAATATGATCCTAATCCATGATGATAAATACACATATGTGGCAGCGAGTCTATTGCGGAATATGTGCCTGCACGCTCAACATGAGCTCACAGAATCAGACCTAAAGGAACTATCTCACACCTTGCGAGAGTTTGTACAACTATATTTATCATGCTACATGAAATTGCTGGTTCCACTACAGGTGTTGGAAAGAACAATGGACGCTGAAGGGGCAGAACTAGAAATCCTCATTGGCCTTAGTTCACAGATATGCAAACTTATTCCTGAAGAATTTTCCCAAGAGCTAGAGCATGGACAGATTAAGCGGAGATTCATTAAGAGGCTAGTGGACACACTGAATGCAAATATGAACCCAACTTCTCAATGCCCTGGGATCAGGAGGGTGGTACTTGAGCAATCCATATACATGATGGAGTACAATTCTCGCTGTGCCAATTGTTTCAATGAATACCAGATGATGGATGCACTGTCGTTTGTAGAATTGACACCCTCAAGGGCTGAGAATTACATGGTTTTCTTGGGTGACGCAGGTTTCATGGAATGTAACACACCTCTCTCTGCCCTAGTGGACAGGGCAAAAGAACTGATGGGTCGTCAGTGGCTGCAAGGTATCAACAGTGCCAACTGA
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| Protein seq | MMMADGAEHRIQMPDAAATSKAAAAPEKWLNYFVRLLAVIESVGNAFGTLAFTWATVVLLGGYPTVLGSHDDFWFATAIVFLEAVRMFSSRNNRSDYQLFFRTRGAFRFLGGKGLIVLICFWDVMATLTMTVANWKLRLGILVAITVMLILAAGQFLCPRGAQRPRTCNWPYRAISLWSPVVAILLLAFPILRYYNRHMHKIIFRNSFTVWIPYILLSVTVLLLTISRLQFPIIANLVHGALGSKHVFWRQFILNSCMFLALVILVVMSDPGLRSAMIFIDVCAVLILSFGNLHIPAALVRVVLALIRLIPHNYFGDGNMTNLGPSLSIFYGMVLGQGILYIVDGILEVFSFIPRRSLIRNGGFAGQWGVESVNLYYVYAFDKYMEGGLFASKRISLSNFAIDSLNSDLSKNQLYGVRMMHTFLQSDLTRARLLEKLTTSTQTMARLISMLDWSSRHHCTTIRLYAAKVTAELAKNLRVVTVPGTLQLVSMLLDADGKPKRGHPLLDADDDHFVDILDRQDKKHDIAGDQEPIEDTDNLLETPTRSMHINDQRCIPRIWQRILAYWSIPKEQPLTDDDFLPALGMSIIYSLAGCDQNNCVEIDKVTYLIPKIIGFTSYRSAMVNSEAQQKVLLKSSLKVLQRLTSIEGEIGITLRYKISKHPFLLRNLAEILGDSSSSNQELRRIVAGILRNLAIDRDMRQEIGRMQILITTLMKAFLDFKGLYSSDVDCLLPKVAGQALVMLSSENSHNCFVMLKEPDFIHKLKNMILIHDDKYTYVAASLLRNMCLHAQHELTESDLKELSHTLREFVQLYLSCYMKLLVPLQVLERTMDAEGAELEILIGLSSQICKLIPEEFSQELEHGQIKRRFIKRLVDTLNANMNPTSQCPGIRRVVLEQSIYMMEYNSRCANCFNEYQMMDALSFVELTPSRAENYMVFLGDAGFMECNTPLSALVDRAKELMGRQWLQGINSAN
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|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 1.501979 | 5.911939 | 2.230384 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_07g0651800 | RBH | 0.000000 | 0.000000 | 0.988870 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os07g45540 | RBH | 0.319966 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os07g0651800 | RBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_07g0025860 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_07g0025800 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_07g0025740 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_07g0025590 | SBH | 0.020997 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_07g0025820 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.673774 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_07G0448400 | RBH | 1.407637 | 4.526718 | 2.4060825 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_07g0026300 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_07G0363400 | RBH | 0 | 0 | 0 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_07g0025590 | RBH | 0.0 | 0.039304 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_07g0025840 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_07g0025650 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_07g0025890 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_07g0025700 | RBH | 0.0 | 2.736874 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_07G025780 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_07g0025520 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
