Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsMH63_06G0332400 OGI:06058620 | 12/16 Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU Chr06:21595593-21607359
Gene Symbol FTL12, OsFTL12, FT-L11, OsSTRL4, STRL4
DNA seq

CTAGTCTTTGAAAATTTCTCGGTCCGCCACTGCAAACCACTATAATTGTGTGCAACACCATAATATCTAGGGTTATATGAAATCTACTCAGAAAATATTGAATATTAAACGACCACGCATATTATTACAATATAGTTTATTTTCCAATGTGTGACAAAATGTCACATCTCTACGTACACTTGATATACTAAACTTTTTTTTTTTTGCGGGGATGATATACTAAACTGCTATTATAACATATAGCATATTCATGATAGCACACTTAGGAGCCGTCATGTACACCAACTGACCAAGTGGGGCGACATTTATTCTATAGCTTTTATAGCTAGGAACTTTATGATACGGCCGGCTATATATGCATTTGTTTAATTATATAAGCACGTAGACATAGTTGCATGCAGCTGGCTAGACACACTGCATATATGCATGAGTGGCCATTATATTGGTCAACACTCAACATGTACAAGAGCTAGAAGATCGAAGATCGATCGATATTGATCAGATCAGGTTGGCCTCCTCCCACCTGTGCCTGTCGGGCGCTGGCAGTTGAAGTACATGGCGGCCACCGGCTTGCCGAGGTTGAAACGGCGCGCGAAGCTGCGCAGGTTGAAGTTCTGACGCACCTGCGGCGCGAACACCGTGCCGCGCCCAAGCTGCTGATACAACACCATCACGATGCGGTGGATGCCCATGGTGGGGCTTGGGCTTTCGTATGTTACGATCTCCCGCCCTGCATTAATTTAATTTATATATGATATGTGCTCAGTAAAATTTTAAAGCCTTGGACATACTTAATTATAGCTAACATTTGCTTATAATGTTCAATTTCAATTTGTTAAATTGCATAGAATTTCAAAAGGATCTTCCACCGATAAGCCCGGGTGACTGCTCGATCTGGTCGCTGGGCGGTGGATCCGCCGGTGTATGTGCTATACCATATGCAGAGATGCAACATAGTATATATTTCTACTGTTTTTATTCATGTTCAGATTATTAATTCGAACTTAGTATGGTATAAGGGGGGAATACAACTAAATACCATATTTATGTTGAACGGTGCTATAAATCATGTTCTTTTTTAAAAATATGAACCAAGCTAGTTTGAGGAGAAAAATAATTCTGTAAGATTTTACGTCCAACTTATTTGACATCAAGTGTGAAAAGAAGGGAGAGAATAAGATTTGTTGTGTCTAGCAAGTTTTTATTTTATTTTTCTTCGATCCTACTGTTTGCAAGAATTTTATTTTGGAGTCATTGAGACGAATTGAACCTGTAGTTGAAATTTTACAGACAGCAGTTTTGTAGAACAATTTTGCACTATTTCAATATCAATAGAAATGCACCTTGCGAGTAACTGGCTTAATTAGATCTACTTTGTAGTTGTACTGCAATTTTTTTTCCAAATATAACAACAAAAGTTACAATCATATACTCCTACTTGATATTTCTGAATTTTGGACCAGCACAAAAGAAACCGGATTTGTGATGTATGAATTTTAAATCAATCACACCAAGCATGCAACATTTTGGTTAAACATACCTACTTAATTATCTATCAACTTAACCATTTTCCAAACTTGTACTGGCCATATGAAGGAACACTCCAATATTGTGACTCCCTCGGGTTTCAAATATATAACTGTTCATTATTTGAAACCAATGAATTTTAACTTTGGACATCAATTTTTTTTTTGTATTGTTGGATCATGATGCACAAAAGTTTCATGACTATATGCATTTAATTAGGATGTATACTTTGTTAATATGAAATATTTTTAAGTATTTATACTTTTTTTTTAAAAAAAGTAATCAAAGTTGAAGGATCGATGATCAGTATTTGCTAGCTAGTGACAAGCATTTGAAGACAGCAAGTAAAAGCTAATGCAGCAGAGTAGTTGTGTATGCTTGAGACCCTGGATACAATATGAATATACTCACCAAAGCTATCGTCCGTCGATGATGGGATATCAGTCACCATCCTGTCATATTGAAAAGTAGGTAGTTAGATCACTAATCAATGTGAGACATATGATAGAAATCACAACAATTGCAAGAGCATAGCTTACCAGTGCAGGTATTCCCTCAAGGTTGGGTTGCTGGGATTAGGAGCATCAGGATCCACCATAACCTAATTTTTATTAACAATTCACACAAACACATGGTCAACATGAAAGGGATTAAAATAAACCTGAGTATTTTTTTGGTCTGGGCTGAAAATGCCTAATTAATTTAGGTTAGTAATATTGCTCAATTAGCTTAACCAGCTGGCAGAGAGCACCATCTAGTTAAGGCAAACACATTGCAACAAGAGCTAGGCCAAGGTTTATCATGGCTAGTGAAGCTGTTGTTTTCTTGGTCTGTCCAACCTCAAGAGCTCCTAAGATTAAGAGAAAAAGTGCATTGCCAACACCATGGACAATGTATATATATGCATGGCCTACCCATGCATCTATCAATATGACTCTTTTGGATCGGGTATGAAGTAATTAATTTAATGGGCTTACTAGGGTATAGGCAAATCGAAAATCATCGCCACCAATCTCAACTCTAGGTTTCATCGAGACTGCCGAGGAACGGAACTCCTTGCCATTAAACACAGGCCTCCCATCATACATCACAGTTAGAGGCACTGAGTTTGAAAATTGGTCTAACACATCTCCAACTATATGGCTCCTTGTCAATGAGTCATTTGCCATGATGTGTTTTGAGAATGTGAGAGCTGATATATGTAGGTGTGAGCTGAAGCTAAGCTAGCTAGCTCTACAAATGCTAACAGGCCTTGCAATGGCTTGGGAAAAACAGACTAGGTTTTGCTGCTATTTATAGTGGTCTACACGACAGGATGCTGTCTCATTGCGCACACATGTGATTCCCGTTTTATCAATTTCAATAGTATTGAATCTACTTTCTACAAGATGCTCTTCTGATTGTTTGACAGGATTATACACATTATTCTTCCATTTGCTATTTCAATTTGCAGCATGGCGGATGTCTGGGAATAAACATATCTGTGCCATATCAGTTATATACAATTAATTTTGTAGCATCTTTAATGCATCATGTTCCATAGTGTCATGGTAATTTGGCTCTTTCCTTTCCCATGGATCGGGGTTGTGGGATTGGCCGATTGGAGGAGTGCGTCGATCGACTGGAATGCTCGATACACTATTTCTACTGGGTGCAAGCATCTAGGCCCCTTTATGGTTATTTTAGCGCTTAATAACAACATAATCATCGGAACTAATCATACACTACTATAAAAAAATACACATAGAAGTCAACACTATAGTTGCCGGAAGTATTAAAACCAGTACCTATCGATTTTTTCCCACCTCTACGATCTGAAAATATATAGAACTAATGCCTTTGAGTAATTATAGGTGCCGGTTGTAAAGAAAAACCGCTACCAATTATATAGGTGTCGATTTTTTTAAAAAAAACCGACACCTGAAAAATCAAGCATAGCCTGACCCGCGCGCTCTCCCCTCGGCCTTAATTATCTCGTCAACACACCCACCCACCTCTCTCTCTCTCCTCCTTATCTCCTCCCTCTATCTCCTCCTCTATCCACTGCTCTCTCTCTCGGTCCCCCTCTCTCTCCACTGCTCCCACCCGGCGGTGGCAGCGACCTCCCCTCCGATAGATCCAGTGGAAGGGGAGGCGGCTATGGCGGCCGACACCCTCCCATCCCCTCCTCTTGCTTGTGTTGTTGATGTTCTTATGTTTTTAGTGTTATTGCCTTTTCTTGGATTAAATGCAACTAAATGTGCAATGAGATCTGATTGGGGTAAAGGGAAGTTGCTCGATGCATCAGCTCGAATTGAGCTGACCTTTGCTTTTCATTCCTTGGACCTTAAAGGTGCCAGTTCTTAAACCGACACCTTTGAGAGAACTCAAAGGTGTTGCCTGCTAGGTGCCGATTGTCAAATCCAGTACTCAAGTGGGGCTAGCAATCAAACCTAAAGGCTAAAGCATTTTCTATAGTAGTGATAGTTGCTAAGTGTGCAAAGATTAGGGTTCTGTTGGACTTTATGGAGTCATGCATGATGCAAAATTGTTTGGTGTATCCCCTTGTGAGTTATGGTGTGGTAAATTAAATCGAATTGTGGAACCTTTGTGTTTGAGTTGGGTGAATGCAATAGTTTTAGAACCAAAAGACCGTACTATAAAGATATGATGAAATTTAAGTAGCCTGGAGTTGCAAGGAGTCTAGGAGTGGTGTACACCAGCTTGCTATATATTTTCAAATCAAATACTAAATGAAGTGGGAGTGTTGGCATATGCTGCAAACAAGGATCTTTGATGTTACCCTGAAAGTTGAACTAGCTGGACAGTCCCAGTAATGGTAGACAGTCCGGCTAAACCATTGGATCGGACATTACGATCAATTCATTGTCCAAATGGGCCATGTGTTGGCCGTATAGTGGAAATAAAATGGATGACAGTCCGATGTGTGTAACTCATATAGTGTGCAATATGTTCGCACTTATTGTGGAGTTGCATTGCTCAGATAGTCCGAGAGCTACAAGACAGTCCAGAATAACGGTGATCCGCAAGGACCGGGTTGTACCGGAGAAACCAGGTCAATACTTCTTCGATTGTTGTCACACTGTGAACTTTGAACTACTGACCAGGCTCAAACGGCTAGTCTGAGTGGTAAACGGCTAGTCTGAGTGGTTGAAGCTATATGTCTGACGCTAGCGAACGGGCCTCTAGCTGAGTTGGTTAGGTGGCTCTAGTAGCACTCTCAAGTCTTGAGTTCGACTCCCCATGTGAGTGAATTTTAGAAAAAATTTGTCGTCTGTCCCACGCGAAAGCACATATCTAAGGCCTGACACATGTTGTGGTCGTTCTCACACAAACTATGTTGCCGTTGTGTAAGGGTGAGGCAAGGGTTCGAGGGTTTTCTCGATCTACGTAAGATGGTTTTCTTTTGTGCAAAATGCGTGGGGCTATCTTACCCCCGCAAATCATTTTTTTAAAAAATATCAGGTGCTATG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Function Protein HEADING DATE 3A [UniProtKB/Swiss-Prot:Q93WI9]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsMH63_06G0332400 OsMH63_06T0332400-mRNA-1 Chr06 21595593 21607359 - maker
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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.111729 0.0102675 0.1239235

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_06g0552900 RBH 0.000000 0.144755 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os06g35950 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os06g0552900 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_06g0019260 RBH 0.116821 0.0 0.0
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_06g0019120 RBH 0.419467 0.0 1.553268
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_06g0019190 RBH 1.980900 0.0 0.0
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_06g0018990 RBH 0.187368 0.0 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_06g0019330 RBH 0.0 0.0 2.779955
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_02G0125000 SBH 0 0 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_06g0018820 RBH 0.105860 0.0 0.0
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_06G0306600 RBH 2.1666825 0.723385 3.1210105
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_06g0019300 RBH 0.341990 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_06g0019240 RBH 0.365338 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_06g0018900 RBH 0.000000 0.0 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_06g0019600 RBH 0.375791 0.0 0.0
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_06g0019040 RBH 0.397722 0.0 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_06G018970 RBH 0.583300 0.0 0.0
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_06g0019150 RBH 3.081898 0.0 0.000000
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