Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
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Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsMH63_06G0124700 OsMH63_06T0124700.3 Chr06 7290527 7295233 + maker
CDS seq

ATGGATCGAGGTTGGATGAGTGAACCCAGATCAACTGCTTCTTATAAAGACGGTGTTGAACATTTCCTTTGTGTTGCATTTCGTGATGTTCCAGATGGTGGCAAGGTCCTTTGTCCATGTGTGAACTGCAGAAATAGAATAACCCAGGATTATGATGAAGTTAAAACACATTTAAGATGTTTTGGAATTCTCCAAAGTTATACTAAATGGGTTCACCATGGCGAGAAGTATGATGCACCAGACTTAGTATTTGCACCTGTGTCAAGTAACTCTAGGAATATTCCTACTTCTACTGCTCATAGGAGTAATGTGGTAGCAGATGGACCAGGAAGAATGCATGACATGGATGGACTCCTAAAAGCTGTATTTGCCAAGGAAGATAGTTTTGAGTCTCTGTCTACTGCTTCCATTGATGATGAAGATATTCATTTTGACAATGAATCTGCCGAAACTAATATGGCAGTGGATGACAACAATACATTTGGAGATAATCATACCGAGGGGGAACAAAATATGTTTGCAACCTTCTTGAAGGAAGCAAACACAAAACTATATCATGGATGTGATAAATTTTCGAAGTTGTCATTCATAGTCAGTTTGTATCACCAGAAATGCATACATGGATGGACACAAGAATCTTTTACAGCACTACTTGGCTTGTTATCTGATGCACTTCCTCAGGAGGCAGAGTTACCAAAGAATTGTTATGAAGCAAAAAAAATCATCCGCGGTTTAGGACTTGACTATAAAAAAATACATGCTTGTCCAAAAGACTGCATGCTATTTCGAGGTGACAGAGCTAGCCAAGAGTCTTGTCATATATGTGGTACTTCCCGTTGGAAAACAGATAAGAATGGATCTCCGGTTGAATCGAAAGGAAAGAAGAAGCCAGCTAAAGTGTTGCGCTATTTCCCATTAATAACAAGACTACAGAGACTATTTTCCACTAACCAAACATCAGGTGATATGCGCTGGCATGAGGAGGGACGTACAAAGGATGGAATGTTGAGACATCCTGCTGATGGTGAAGCTTGGAAGGATTTTGATACTCGCAATCGTACATTTTGTGCTGATGCTCGAAATGTTCGCCTTGGTCTTGCAAGTGATGGGTTTAACCCTTTCAGGAACATGAGTTCAAAGCACAGTACTTGGCCTGTTATGCTTATTCCATACAACTTGCCACCTTGGATTTGCATGAAGCAAACATCTTTAATTTTATCAATGATCATTTCTGGACCGGATTCACCTGGTAATGATATTGATATATATTTGGAGCCACTTGTTGATGAGCTCCTCCAACTGTGGGATGGTGTGGAAACATATGATGCTTCTTCACAGGAGAAATTTTCTCTTCGAGCTGCGCTATTATGGACGTTGAATGATTTTCCCGCATTAGCTTACCTATATGGTTGGAGCACTGGAGGGAAATATGCGTGCCCATCTTGTGCTGTAAATACAAGATCATTTCGTCTGAAAAAGGGTGGTAAATTTTGTTATATGGGTCATCGCCGATGGTTGCCACTTAACCACAAATATCACAGTTGGACGGATCAGTTTGATGGCACCCAAGAGAATGAACCTGCACCTAATACATTGAATGGAACTGCTGTTTTGAAAATGTTGGAGGGCAAAGTATTTGTATTAGGTAAAAGGGTAAGTGTAGCAAAGAAGGTTAAAAGAAAGAAAGTAGGCAAAAGCAATAGCAAGGATGAAGGGAGCAACCAAGAACTCAAACGTAAAAGGGTGACACGGAAGGAGAAAAGAAGTGATTGCACAAGTAAGTGTGGAAAGAAACCTGAGGATTGGTTGAAAAAGAGGTCAATATTCTTTACACTACCATATTGGAAGGAAAATAAATTAAGACATAACCTAGATGTAATGCATATTGAAAAAAATGTTTCTGATAATTTAATTGGGACATTGTTGGATATCGATTCAAAAACAAAGGATAATCTTAATGCACGACTTGACTTGGTGGAAATTGGCATTCGACCAGAACTTCACCCTACAGTAGATGATAAAGGGAAGAAAATATTACCACCTGCATCCTTTACTATGTCAAGAGAGAAAAAGGAGATTCTTTGTTCATCTATTCAGAAAATTAAGACCCCTGATGGTTATGCATCAAATATTTCTAGGTGTGTCAACATGAAAGAATGTACACTAAGTGGTATGAAAAGTCATGATTGTCATGTTTTACTGGAAGATATTCTTCCCATAGCACTTCGATCCTGTTACCCTAGCAAAGATGTCATGAAAATAGTTATTGAATTGGCTAGGTTCTTCAAGAAGTTGTGCTCTAAGGTTATAGATGTATGTGAGCTTAAACAACTTCAAGACAGTATTGTGATGACACTGTGTGATATGGAAAGATTTTTTCTTCCATCATTTTTTACTATCATGGTGCATTTGCTGGTACACTTGGTTGAGGAAGTTAAACTCGGTGGTCCAGTGCACTACCGCTGGATGTATCCTTTAGAGAGGTATGCAATCTTATTTTCAATCAAAGATGCAATTATTTTTGCTCCCTTATATTTATTAATCATTGGGAAACATATTTTTGTAATTATATACAGATCATTTGTTCGCATAAAGGCACTAGTGCGAAATAAAGCTTACCCAGAAGGTTCAATTGCTGAAGGTTATCTTGCTGAAGAGTGCCTAACATTTTGTTCAAGATTTTTGGATGGAACAACACGCTTTACAAGACCACCTAGAAATCCTGACCCTCCAGATAGTATAAAGGACATGTATATGTTTGGTAGTGCTGGTGAACCACTTGGAAAGGCCATTACCAGCCGATTGGATAATCAGCTTCTTGTTCAGGCACATAGATATGTCTTGCGACACTGCGATGAACTTGATGATTTTCGCAAAGAGTTTATCGATGAAGAGAAAAGGAGGCTACCTCAATCAACTAACTTGACACATTCTGAAGTTGACATATTGATCAATAGAAGCTTTGCTGATTGGTTGGAGCAGAAGGTTTTACAAAATAGTGGAGCATACATAGATGAAAAGATAAGAGCATTGGCTGCAAAACCAAACAAATATGCTGTGTGCTACAGTGGATACATTATTAATGGTTTCAGATTCCACACTATGAGCAGGGAGGCTGGTCGCTCCACTCAAAATAGTGGTGTAGTGAACATCGCCGAGGACGGTGTTAATTATTATGGCAGATTGTCAGATGTTGTAGAATTGTCATATGGAAATTATAAGGTAGTGCTCTTCAGATGTGATTGGTATGATGTCCATCATAAAGCTGGTTTGAAGACGGATGAGTTTGAATTCACCCTTGTGAACTTCACTCGGAAAATACACACCGGAGAGAAACTAGATCATGATCCATTTGTCTTTTCATCCCAAGTGGAGCAGGTGTTTTATTGTGAAGATGAAAAAAATGAAGGGTGGCATGTGGTTACACGATTTAAGCCAAGGGATATTTTTGATATGGGTGTGGAACAACCATCAGATGAAAATGAGTAA

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 7.214553 14.937447 6.799153

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_06g0240700 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os06g13270 RBH 0.0 0.0 0.0
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os06g0240700 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_02G0507400 SBH 0 0 0
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_06G0127500 RBH 6.7100925 10.41945 13.866225
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) NA NA NA NA NA
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