Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsMH63_04G0293100 | OGI:04058110 | 16/16 | Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | Chr04:19581994-19605754 | ||||||||
| Gene Symbol | WAK49, OsWAK49, RLCK146, OsRLCK146, WAK60, OsWAK60, WAK48, OsWAK48, WAK59, OsWAK59 | ||||||||||
| DNA seq | 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More
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||||||||||
| Function | Wall-associated receptor kinase 2 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9LMP1] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsMH63_04G0293100 | OsMH63_04T0293100-mRNA-1 | Chr04 | 19581994 | 19605754 | + | maker | ||
| CDS seq | ATTGATGAGTGCAAGGAACCAAATAAGTGCTATGGAAAATGCAGAAATAAAGATGGAGGTTTCGACTGTACTTGCCCCTTCGGTACACGAGGCAATGCATACACCGGACCATGTGACGGAGGGCTAGCTATCGGAATTTGTGCCTCCCTTTTGGTTACTCTAACTATTTTACTTGGGATAGAATGGTTCAGATATAAACAACGAATCATAAGAAAAGACCTCATGAGACAGAGGGAAGAACACATGAGACAGAGGGAAGAGTATTTTCATCTACGTGGAGGCCAATTGTTAAGAAATATGATGAGCAGAGATAACAACATTCCATTTATGTTGTATGACCGAGATCAAATTGAGTCGGCGACAAATGGGTTCGACAACATGTTAGTAATTGGTCAAGGAGGTCAGGGGACTGTTTATAGGGGATGTATTAATCTTCATCCAGACAACCCTGTTGCAATCAAGAAGTGCAAGGGATTTGATGAGGATAGTTGGGCAGAATTTACTGATGAGCTGCTCATACTTTCTCGAGTCAACCATGAAAACATCGTCAAGCTTCTTGGTTGCTGTCTTCAGTTTGATGTTCCAATTCTTGTCTATGAATTTGTCCAAAATAAGACTCTGTACAATCTAATCCACATCCAAAATGATCCATCCATCAGAACACTGGAGATCCGCCTAAAAGTTGCTGCTGAGTCTGCTGAAGCACTTGCATATCTACACTCATCAGTCGACCACCCTATCATCTTACATGGGGATGTCAAGTCCACCAACATACTACTCAACAAAAATTTTATTGCAAAGGTTTCCGATTTTGGGTGCTCTAAAATTAGGACCGCGGATGAGAACTATGATGTGGTGAAGGGGACAATGGGATATCTAGATCCTGAGTATCTTCGGAACTTCCAGCTCACCGATAAGAGTGATGTTTACAGCTTTGGTGTAGTTCTTCTTGAGCTCTTAACCCGGCGAATGCCATTATCCGTGGATAAGGTCAGCCTCGCGTCAATATTTCAAGAGGCCATGAGAGAAGGCCACTTCCTTGAGCTCATAGACGCAGAAATATTGCACGAAGATAACATGGGATTGATAAGTGATCTTGCAACTCTAGCAAACCGGTGCTTAATAATGACTAGCGAGAGCAGACCAACAATGAGCACGGTTGCAGATGAACTGCGCCGGCGAATGGCGGGACAAGTACAACAAGACCAAGGGGTACTTACAGAGATGGCTGTCGGTTGGAAAATCTTCATGTGTGTTGGATTTCCCGGCCAGTACCCTACAGGCGATACTGATGAGGAGAAATCAAAGGGGGAATCTGTGTTCCAGAGGTCATATGTTGTCCGGACGGTGTCGACAGGCCGAACAGGTCAACATCCACTCAACGGCGAAACAAACCCAGAACAACAGCGTAGAAGAATACAAGATTCACAAAAATCATCTGTGCCATTCCACATGCTACCTTCACTACTATGGCTCTGCATAGGGATCGCGGCATATTGTTCGGCCGCCTCTGCAGGCATCTGCGAGAGAAGCTGCGGCGGGGTAGAGATCCCTTACCCGTTCGGCCTGGATCCTGCCTGCGCCCTGCCCGGCTTCAACCTCACCTGCAATGCCACAGGAGATGGCAAGCCGTATTACAAAGACGTGGAGCTGCTTAACATCTCGCTGACGGAAGGTCAGGTACGAATGAGGATGGACATAGCCAACTATTGCTACAATAGTACTTCTGGCGGGATGAACGGTAGGAGTTGGTCACTGAACTTAACGGGCACGCCATATAGATTATCCGACTTCGGCAACAAGTTCACGGCCATCGGGTGTCAAACGCTCGCTTACTTAATAGTAGGCGACGAGTTAACGACCGGGTGTGTGGCCACATGCAAGGAAGACGACCTCGTGAGGCTCACAGACGGTGTCTGCTCTGGGATAGGTTGCTGCCAGACAGCCATCCCCAAAGGGCTACAATACTATGGGGTCACGTTTGAACAAGGCTTCAACACGACGAAGATCTACAACATGAGCCGTTGCAGCTATGCGGCACTCGTGGAGGCATCCAGCTTCAACTTCTCCAAGAACTACTCTACTTCTTCGGCGTTCAATGATCATTACCATGGGCAAGCTCCACTGCTCGTGGATTGGGCCATTGGAAACGAGACATGCAAGGTAGCGCGAGGGAAGTCCAATTTCACGTGCATCAGCAAAAATAGTGAGTGTGTGGACTCGCTCAACGGACCAGGCTATAGATGCAACTGCTCCCAAGGATTTCATGGAAATCCGTACCTGAAACCAGAAGATCTCGACAGTTGCCAAGATATTGATGAGTGCAAGGAACCATATAAGTACCCCTGCCATGGAAAATGCAGAAATAAAGTTGGAGGTTATGATTGTACTTGTCCGTTTGGTACACGAGGCAATGCCTACAATGGACCATGTGACAAAGGGCTAGCTATCGGAATTTGTGCCTCTCTTGTGGTTGCTCTAACGACTTTACTTGGGATAGAATGGATCAAGTACAAACAACGAATCAAAAGGCAAGACATCATGAGAAAGAGGGGCGAGTATTTTCATCTACACGGAGGCCAATTGTTAACAGATATGATGAACATAGAGAACAACATTTCATTTAAGCTGTATGACCGAGATGACATTGAGTTGGCCACCAAAGGCTTTGACAAGACATCAATCATTGGTGAAGGAGGTCAGGGTACTGTTTTTAAAGGGTATAATCTTGATCAACTGAACAACCCTGTTGCGATCAAAAAGTGCAAGGGATTTGATGAGAATAGTAGGACAGAATTTACACAGGAGCTGCTCATACTTTCTAGAGTCAACCATGAAAACATCGTCAAGCTTCTTGGTTGTTGTCTGCAGTTTGAAGTTCCAGTTCTTGTGTATGAATTTGTCCCCAATAAGACTTTGCACTATCTAATCCACAGCCAAAATGATCCATCCATCAGAACACTGGAGATCCGCCTAAAAGTTGCTGCCGAATCTGCTGAAGCATTTTCATATCTACACTCACTGGACCACCCTATCTTACATGGGGATGTCAAGTCGATGAACATATTGCTTAGTAACAATTTTATTGCAAAGATTTCTGATTTTGGGTGCTCCAAAATTAGGGCAGCTGATGGACACGATGACGTGGTGAAAGGTACGATTGGCTATCTAGATCCAGAGTACCTGCTAAAGTTCGAGCTCACTGACAAGAGTGACGTGTACAGCTTTGGTGTCGTTCTTCTTGTGCTTTTAACACGCCGAACACCATTATCTAAGCAGAAGATTAGCCTCGCATCAGTATTTCAAGAGGCCATGAAGGAAGGCCAGTTTCTTGAGCTCATAGACACAGAAATATTACATGAGGATAACATGGGATTGATTGGTGATCTAGCAAGGCTGGCATGCCAGTGTTTAGCAATGACTAGTGAGAGCAGACCAACAATGTGCAGGATTGCAGAGGAATTGCGACGAATAGAAAAACAAGTACGACAACACCGTGGGGTACTTACAACTATTAGTTCATTGTCATTGTTAGCAAGTTCATCTGCAGACACATCATTGCATTTCACAGCACAAAGCTTGCTGCTGATCAGGCGCCCCTCGCGGCGGCTGGGCCAATCGCCCGATCATGCCACGACTGCGGCGGCTGGGCCAATCGCCCGATCAAGCGGCTGCGCCATGGCGCCTAGCTTCGAAGTCGACTGCAACGACACGGGGAACGGCGTCTCCAAGCCGTTCGTTGGAAACATCGAGGTCGTCTCCCTCGGCAATGGTCAGGCCCGGTTCACGGTCATCGGGTGCCGGACGCTGGCCTACATCTTCGACGATTACAACGTGGGCAAGTACATGAGCGGGTGCGTGTCCGTCTGCCGGCGAGGTGACTTGAGCAGCGCCATCAACGGCAGCTGCGTCGGGATAGGCTGCTGCCAGACAAACATCTCGACGGGCCTAAGCTATTACGAGGTCATGTTCGACTACACCCTGAACACATCCGGGATCTACAACCGCACCCCATATATTAATGAATGCCAAGATTCTAATAATTACCCTTGTCACGGAGAATGCCATAACAAACCCGGCTATTTTGATTGTTTCTGCCGTGCGGGTAGCCGAGGAAATGCAACTATTCCTGGAGGATGTCGGAACGACTTCTTACCTCTAAAAGCACAGCTGGCAATTGGAATTGCTGCATGTGTGTTGGCTGGCCTGTTTGCTTTCCTTGGATGGGAAGTGATTCGGCACAAAAGGAGCATTAGAAAACAAGCTTTGTTAAGACAGACTGATGAGTTTTTTCAACAACATGGAGGCCAACTATTGCTAGAAATGATGAAAGCAGAAGGCAATATCGGGTTCACACTCTACAAGAGAAGACCGCAACAAAAAAACTTCAACAAGGCACAAATCATCGGTGAAGGAGGGCAGGGAACAGTCTACAAGGCAGTCTTAGATGGAACTGTTGTTGCGATAAAAAAATGCAAGGAGATTGACGAGAGTAGGAAGATGGACTTCATGCAAGAGTTGGTCATACTTTGTCGTGTCAACCATCCTAACATTGTCAAGCTGCTCGGCTGCTGCCTGCAGTTTGAGGCGCCTATGCTTGTATATGAATTCGTGGAAAATAAAACATTACAGGAGCTGCTTGACCTCCAGAGAAGCAAGAGGTTCCATGTCACGCTGGGAACCCGCCTAAGGATAGCTGCCGAATCAGCTGATGCACTTGGGCATCTCCACTCACTACCACACCCAATACTCCATGGTGATGTAAAGCCAGCCAACATCCTTCTTGCTGAAGGATTGGTAGCAAAGGTATCTAACTTTGGGTGTTCAACTATTGATGAGAAAATACAATCTATGCTTAAAGGCACACCTGGGTATATTGACCCAGAGTACCTGCTTGAGTATCAACTCACAGCCAAGAATGATGTCTACAGTTTTGGTGTCATTCTTCTTGAGCTTGTAATAGGTAAGAGGCCATTGTCAAAAGAAAGTAAGACATTGGC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|||||||
| Protein seq | IDECKEPNKCYGKCRNKDGGFDCTCPFGTRGNAYTGPCDGGLAIGICASLLVTLTILLGIEWFRYKQRIIRKDLMRQREEHMRQREEYFHLRGGQLLRNMMSRDNNIPFMLYDRDQIESATNGFDNMLVIGQGGQGTVYRGCINLHPDNPVAIKKCKGFDEDSWAEFTDELLILSRVNHENIVKLLGCCLQFDVPILVYEFVQNKTLYNLIHIQNDPSIRTLEIRLKVAAESAEALAYLHSSVDHPIILHGDVKSTNILLNKNFIAKVSDFGCSKIRTADENYDVVKGTMGYLDPEYLRNFQLTDKSDVYSFGVVLLELLTRRMPLSVDKVSLASIFQEAMREGHFLELIDAEILHEDNMGLISDLATLANRCLIMTSESRPTMSTVADELRRRMAGQVQQDQGVLTEMAVGWKIFMCVGFPGQYPTGDTDEEKSKGESVFQRSYVVRTVSTGRTGQHPLNGETNPEQQRRRIQDSQKSSVPFHMLPSLLWLCIGIAAYCSAASAGICERSCGGVEIPYPFGLDPACALPGFNLTCNATGDGKPYYKDVELLNISLTEGQVRMRMDIANYCYNSTSGGMNGRSWSLNLTGTPYRLSDFGNKFTAIGCQTLAYLIVGDELTTGCVATCKEDDLVRLTDGVCSGIGCCQTAIPKGLQYYGVTFEQGFNTTKIYNMSRCSYAALVEASSFNFSKNYSTSSAFNDHYHGQAPLLVDWAIGNETCKVARGKSNFTCISKNSECVDSLNGPGYRCNCSQGFHGNPYLKPEDLDSCQDIDECKEPYKYPCHGKCRNKVGGYDCTCPFGTRGNAYNGPCDKGLAIGICASLVVALTTLLGIEWIKYKQRIKRQDIMRKRGEYFHLHGGQLLTDMMNIENNISFKLYDRDDIELATKGFDKTSIIGEGGQGTVFKGYNLDQLNNPVAIKKCKGFDENSRTEFTQELLILSRVNHENIVKLLGCCLQFEVPVLVYEFVPNKTLHYLIHSQNDPSIRTLEIRLKVAAESAEAFSYLHSLDHPILHGDVKSMNILLSNNFIAKISDFGCSKIRAADGHDDVVKGTIGYLDPEYLLKFELTDKSDVYSFGVVLLVLLTRRTPLSKQKISLASVFQEAMKEGQFLELIDTEILHEDNMGLIGDLARLACQCLAMTSESRPTMCRIAEELRRIEKQVRQHRGVLTTISSLSLLASSSADTSLHFTAQSLLLIRRPSRRLGQSPDHATTAAAGPIARSSGCAMAPSFEVDCNDTGNGVSKPFVGNIEVVSLGNGQARFTVIGCRTLAYIFDDYNVGKYMSGCVSVCRRGDLSSAINGSCVGIGCCQTNISTGLSYYEVMFDYTLNTSGIYNRTPYINECQDSNNYPCHGECHNKPGYFDCFCRAGSRGNATIPGGCRNDFLPLKAQLAIGIAACVLAGLFAFLGWEVIRHKRSIRKQALLRQTDEFFQQHGGQLLLEMMKAEGNIGFTLYKRRPQQKNFNKAQIIGEGGQGTVYKAVLDGTVVAIKKCKEIDESRKMDFMQELVILCRVNHPNIVKLLGCCLQFEAPMLVYEFVENKTLQELLDLQRSKRFHVTLGTRLRIAAESADALGHLHSLPHPILHGDVKPANILLAEGLVAKVSNFGCSTIDEKIQSMLKGTPGYIDPEYLLEYQLTAKNDVYSFGVILLELVIGKRPLSKESKTLASMFQEAMMDGTFHELLDSEIIDEASMGVLHQIAVLAIQCLALPGMTRPVMEQVAKELRRLALSDEVQQCPQPPLVLEGLNFAVMGSMCTTSLLYTEGNSTGVYDLEKKTVMSTEFAR
More
|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0 | 0.053278 | 0.0232095 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_04g0371200 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os04g30330 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os04g0371200 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_04g0009990 | RBH | 0.0 | 2.109517 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_04g0010750 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_04g0010580 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_04g0010150 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_04g0010480 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.929804 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_04G0292700 | RBH | 0.6971005 | 0.741871 | 0.0317835 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_04g0009920 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_04G0284500 | RBH | 0 | 1.3356895 | 0 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_04g0010200 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_04g0010110 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_04g0010150 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_04g0010660 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_04g0010310 | SBH | 0.0 | 0.0 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_04G009450 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_04g0009480 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
