Basic Info |
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|||||||
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsMH63_03G0401500 | OsMH63_03T0401500-mRNA-3 | Chr03 | 25672528 | 25673423 | + | maker | ||
| CDS seq | ATGAAGGAATTTCGGCTGGTTACTTTGAAGCATGTATCTCGAGAACAAAACAGTGAAGCTAATGATTTAGCCCAAGGGGCATCGGGGTACAGGCCGATGATCAGAGATGTAAAGAATCCATCTCAATCGGCTTCTAGGAAGTTAAGATATAAGGCGTTGAAGTACACTTTGCTTGATGATGAACTTTATTATCGGACGATTGATGGGGTGCTGCTTAAGTGTTTGAGTACCGATCAGGCTAAAGTTGCAATCGGTGAAGTTCATGAGGGAATTTGTGGTACTCATCAATCGGCTCGTAAAATAAAGTGGTTAGTTCGGCATGCAGGGTATTTCTGGCCGACGATGCTGGAAGATTGTTTCAGATATTACAAAGGATGTCAAGATTGCCAGAAATTTGGAGCAATTCAGCGAGCGCCAGCATCGGCTATGAATCCTATCGTTAAGCCATGGCCATTTAGAGAGGTGATTCCTTTGAAGAAGGTTGATTCTGGGGATGCAATACAGTTTGTTCAAGAGCGTATAATCTACCAATTTGGCATTCCTCAAACTATTACGACTGATCAAGGTTCAATTTTCACGTCTGATGAGTTTGTTCAGTTTGTCGATAGCATGGGTATCAAATTGTTGAATTCTTCGCCATATTATGCACAAGATAATGGGCAGGCTGAGGCATCTAACAAGAGTTTGACCAAGTTGATTAAGAGAAAGATTTATGATTATCCTCGACAATGGCATACTTAG
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| Protein seq | MKEFRLVTLKHVSREQNSEANDLAQGASGYRPMIRDVKNPSQSASRKLRYKALKYTLLDDELYYRTIDGVLLKCLSTDQAKVAIGEVHEGICGTHQSARKIKWLVRHAGYFWPTMLEDCFRYYKGCQDCQKFGAIQRAPASAMNPIVKPWPFREVIPLKKVDSGDAIQFVQERIIYQFGIPQTITTDQGSIFTSDEFVQFVDSMGIKLLNSSPYYAQDNGQAEASNKSLTKLIKRKIYDYPRQWHT
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|
|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.0092705 | 0.0022605 | 0 |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g08630 | SBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | NA | NA | NA | NA | NA |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_12G0321400 | RBH | 0.003138 | 0.002793 | 0 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_03G0406100 | RBH | 0.056751 | 0.009604 | 0.1327825 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
