Basic Info |
| Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
| OsLima_11g0004730 | OGI:11010520 | 16/16 | LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr11:3486003-3498447 | ||||||||
| Gene Symbol | RLCK312, OsRLCK312 | ||||||||||
| DNA seq | 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| Protein seq | MKIIIIGLCLLVIMASSVIQTMCNSLYENGTDRLSLLEFKKAISMDPQQALMSWNDSNYFCSWEGVLCRVKTPHRVISLNLTNRGLVGQISPALGNMTFLKFLSLSTNSFTGEIHLSLGHLHRLETLDLSNNTLQGDIPDFTNCSNLKSLWLSRNHLVGQFNSNFPPRLQDLILASNNITGTIPSSLANITSLQRLSITDNNINGNIPHEFAGFPMLQILYADGNKLAGRFPRAILNISTIVGLAFSSNYLNGEIPSNLFDSLPEMQWFEVDYNFFQGGIPSSLANASKLKVFDISRNNFTGVIPCSIGKLTKVYWLNLEKNQLHARNKQDWEFMSCLANCTGLTDFSVSDNCLEGHVPSSLGNLSVQLQQFLLGGNQLSGGFPSGFQYLRNLISISIDSNNFSGVLPEWLGSLQNLQLIGLYNNYFTGIIPSSLSNLSQLGYLYLQSNQFYGHLPPSLGNHKMLQELTIGYNNIQGMIPKEIFKIPSLLQIDLSFNNLDGSIPKEVGDAKQLMYLRLSSNKLSGDIPNTLGNSESLEKIMLDRNIFSGSIPTSLDNILSLKVLNLSQNNLSGSIPPSLGNLHFLEKLDLSFNHLKGEIQVKGIFKNASAIRIDGNEALCGGVPELHLHACSIIPFDSTKHKQSIVLKIVIPLASVLSLATIISILLLLNRKQKRKSVDLPSFGRKFVRVSYNDLAKATEGFSASNLIGKGRYSSVYQGKFTDEKVVAVKVFNLETMGAQKSFIAECNALRKLRHRNIVPILTACASASSNGNDFKALLYEFMPQGDLNKLLHSTGTEEFNGENHGNRITLAQRLSIIVDVADAIEYLHHNNQETIVHCDLKPSNILLDDDMIAHVGDFGLARFKIDFMGSNDSNSIYSTAIKGTIGYVAPGAEVSTYGDVFSFGVVLLEIFLRKKPTDDMFKDGLDIVKFVEMNFPDRLPQIVDPELLQETHVGTKERVLGCLNSVLNIGLCCTNTSPYERMDMREFIEPGQFLLVFLVCSAHVVIHSSSGNEADRLSLLEFKNAITLDPQQALMSWNDSNHVCSWEGVKCRVKASHRVIYLNLGGQGLVGTVSPSLGNLTFLRYLFLQENLLAGQIPLSLGHLHHLKYLYLSNNTLQGEIPDFPNCSNLKMLGLGGNHLVGQVPTDANLPPSLYGLDISNNNLTGTIPSSLFNITTLAELFIQHNQINGEIPREIGKSRFLQEFSASGNKLSGRFQQTILNISSLAIIDLGTNYLHGELPSNLGSSLPNLQMFGLGNNLFGGHIPSSLANASKLFLALRLLAMKFIEPGKFLLVFLVCSAHVVICSSNGNETDRLSLLEFKNAITLDPQQALMSWNDSNHVCSWEGVKCRVKAPHRVIYLNLSGQGLVGTISPSLENLTFLRYISLQENLLAGQIPLSFGHMHHLKVLYLSNNTLKERYLTLQIVLISGRFNQINGEVPKEIGKSRVLQLFAASGNKLLGRFQQTILNISSLADLDLGSNYLHGELPSSLGSSLSNLQGLALGNNFFGGHIPSSLANASKLSMIHLSRNNFIGMVPSSIGKLQELSVLNLEFNQLQSSDKQGLEFMNSLSNCTKLRALSLAKNQLEGEIPSSFGNLSMKLELLYLGGNKLSGRFPAGIANLHSLSGLALNSNRFTGPVPDWLGNLKKLQIIFLAANMFTGFIPSSLSNLSLLENVVLDSNQFYGHIPRGLESLKVLQVLSIPNNNLHGSIPRELFSIPTIREIWLYSNRLDGPLPIEIGNAKQLEHLVLSSNNLSGVIPDTLGNCESIEEIELDQNFLSGSIPTSFGNMESLQVLNMSHNLLSGSIPKSIGSLKYLEQLDLSFNNLEGEVPEIGIFNNTTAIWIAGNRGLCGGATKLHLPVCTYRPPSSTKHLQSVVLKVVIPLACIVSLATGISVLLFWRKKHERKSMSLPSFGRNFPKVSFDDLSRATDGFSISNLIGRGRYSSVYKGRLLQYGDMVAVKVFSLQTRGAQKSFIAECKTLRNVRHRNLVPILTACSSIDSRGNDFKALVYQFMSQGDLHMMLYSNQDDENGSASIHIAFAQRLSIVVDVADAMEYVHHNNQGTIVHCDLKPSNILLDDSLTAHVGDFGLARFKVDCTISSSGDSIISSAINGTIGYVAPEYATGGEVSTFGDVYSFGIVLFEIFLRKRPTHDMFKDGLNIATFVDMNFPDRISEVVDQELLEYQNGLSHDTLVDMKEKEMECLRSVLNIGLCCTKPSPYERMDMREVAARLRKIKEAYLSSN |
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| Function | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 [UniProtKB/Swiss-Prot:C0LGP4] | ||||||||||
Transcripts
| Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
| OsLima_11g0004730 | OsLima_11g0004730.01 | Chr11 | 3486003 | 3498447 | + | NAM | ||
| CDS seq | atgaagatcattataattggactgtgtcttttggtgattatggctagcagtgtaatccaaaccatgtgcaattcattatatgagaacgggacagatcgactctcactgcttgaattcaaaaaggcaatcagtatggatccacagcaagccctgatgtcctggaatgacagcaattacttttgcagttgggaaggtgtcttgtgcagggttaaaactccacatcgtgtcatttctctaaaccttacaaatcgaggtttagtagggcaaatatctcctgcacttggcaacatgacattcctgaaatttctctccctatccaccaattcattcacaggagagatccatttgtcccttggtcatctgcatcgtcttgaaaccctcgacttgagcaacaacacactacaaggagacatacctgactttacaaattgttccaacctcaagtctctttggctcagtcgcaaccacttagttggacaattcaacagtaatttcccccctcggcttcaagatttgattcttgcatctaataatattactgggaccatcccttcctctcttgccaatatcacatcgctacaacggcttagcatcacggataacaatatcaatgggaacatcccacatgagtttgctgggtttcccatgctacagatcctatatgcagatgggaataagttggcaggtaggtttccacgagccatcttgaacatttctactattgtgggtcttgcttttagttctaattatctaaatggagaaataccgtccaatctctttgattctctgcctgaaatgcaatggtttgaagtagactataacttctttcaaggaggtatcccaagttctttggcaaatgcttccaagctgaaggtttttgatatatcgaggaataacttcactggggttataccttgctctattggaaaacttaccaaagtttattggctaaatcttgaaaaaaatcaactccatgcacgcaataagcaagactgggagttcatgagctgcttagcgaactgcaccggcttgacagatttctcagtatctgataactgtctagaaggccatgtaccaagttcattaggtaacctttctgttcagcttcaacaattccttttgggaggaaatcaattatcagggggtttcccttctggtttccaataccttcgcaacctgattagcatatcaatcgatagcaataatttttcaggagtccttccagaatggctcggcagtctacaaaatttgcaattaataggcttatataacaattactttacagggattataccttcatccctttcaaatttatctcaattaggatatctctatctacagtcaaatcagttttatgggcatctaccaccaagcttgggaaatcacaaaatgcttcaagaattgactattggatataacaatattcagggtatgataccaaaggagatattcaaaattccatcattgcttcaaattgatttatctttcaacaacctagatggaagtatcccaaaagaagtaggtgatgccaagcaactcatgtatttgaggctttcgtctaataagctatctggggatattcctaacactttaggtaattctgaaagcttggaaaaaataatgttggatcggaatatatttagtggaagcatccccacttcattagacaacatactcagcctaaaagttctgaacttgtctcagaacaacttgtcaggatctataccaccatctcttggcaacctccactttcttgagaagctagatctttcattcaaccatcttaaaggtgagatccaagtaaaaggaatattcaagaatgcaagtgccattcgaattgatggtaacgaggccctttgtggtggagtgccagagctacatttacatgcatgctctatcatcccttttgattcaactaagcacaagcaatctattgtactaaaaatcgtcatcccattagctagcgtgttgtcacttgctacgatcatatctatcttgttacttctgaacagaaaacagaagagaaaatctgtagatttaccctcatttggtaggaaatttgtcagagtttcctacaatgatcttgccaaagcaacagaggggttttcagcatcaaatttaattggaaaaggaaggtatagttctgtgtatcaagggaaatttacggacgaaaaggtggttgcagtgaaagtgttcaacttagagacaatgggagcacaaaagagcttcatcgcagaatgcaatgcactaagaaaattgcgacaccgcaatatagttcctatcctaactgcatgtgcgagcgctagttccaacggaaatgattttaaagctctattgtatgaattcatgccacaaggggacttgaataaattacttcattcgaccggaactgaagaattcaacggggaaaatcatggtaaccggatcacacttgctcaaagattaagcatcattgtggatgtagctgatgcaattgagtacctccaccataacaaccaagaaactattgtccattgtgatctgaagcctagcaacattcttctggatgacgatatgatagctcatgttggggactttggccttgcaaggttcaaaattgacttcatgggatccaatgactccaactcaatttactcaactgcaataaagggaaccattggatatgttgccccaggtgctgaagtgtcaacctatggagatgtttttagctttggagttgttctactagaaatatttttacgaaagaaaccaaccgacgatatgttcaaggatggtctcgacattgttaagtttgtcgagatgaactttccagataggttaccgcagattgttgacccagaattactacaagaaacacatgtgggtacaaaagaaagggtcttgggttgtctaaattcagtactaaacattggactttgctgcacaaatacatccccttatgaacgcatggatatgcgagaattcattgaacccgggcaatttctcttggtgttcttggtttgcagtgcacatgttgtcatccactcctctagtggaaatgaagcagatcggttatcactgcttgaattcaagaatgctatcactcttgatccacagcaagccctgatgtcctggaatgacagcaaccatgtctgcagttgggaaggtgtcaagtgcagggtgaaggcttcgcatcgtgtcatttatctcaacctcggtggtcaagggttagtagggacagtatctccttctcttgggaacctaacgttcctaagatatctattcctccaagaaaatttactagctggacaaattcccctgtcccttggtcatttgcatcacctcaaatatctctacttgagtaataacacactccaaggggagatacctgattttccaaattgttctaatctcaagatgctaggtctaggtggcaatcacctagttggacaagtacctacagatgccaatttgcctcctagcctttatggtctggatatttcaaataataatctgactggaaccattccctcatctctttttaacattacaacattagcagaactttttatacaacacaatcaaatcaatggcgagatcccaagagaaattggaaaatcacgctttctgcaagaattttctgcttctggaaataagctttcaggaagatttcaacaaaccatccttaatatctcttcccttgctattatagaccttgggaccaattatctacatggagagttgccctccaatcttggtagttcactgcccaatctacaaatgtttggtttgggtaacaacttgttcggtgggcatatccctagttctttggcaaatgcttctaagctatttttggcacttcgtttgctagccatgaagtttattgaacccgggaaatttctcttggtgttcttggtttgcagtgcacatgttgtcatctgctcctctaatggaaatgaaacagatcggttatcactgcttgaattcaagaatgctatcactcttgatccacagcaagccctgatgtcctggaatgacagcaaccatgtctgcagttgggaaggtgtcaagtgcagggtgaaggctccacatcgtgtcatttatctcaaccttagtggtcaaggcttagtagggacaatatctccttctcttgaaaacctaacattcctaagatatataagtctccaagaaaatttactagctggacaaatccccctgtcatttggtcatatgcatcacctcaaagttctctacttgagtaataatacactcaaggagagatacctgactttgcaaattgttctaatctctgggcgatttaatcaaatcaatggtgaggttcccaaagaaattggaaaatcacgcgttctgcaactatttgctgcttctggaaataagcttttaggaagatttcaacaaaccatccttaatatctcttcccttgctgatctagatcttgggtccaattatctacatggagagttgccatccagtcttggtagttcactgtccaatctacaggggttggctttgggcaacaacttcttcggtgggcatatcccaagttccttggcaaatgcttctaagctatccatgattcatctgtcaagaaataatttcatagggatggtgcctagttccattggcaaacttcaggaactctccgtgttgaaccttgaatttaatcaactacaatcaagtgataagcaaggcttggagttcatgaatagtctcagcaattgcaccaaactacgagcattatcacttgcaaaaaatcaactagaaggagagataccaagttcattcggcaacctttctatgaagcttgaactcttataccttggaggcaataaactatcagggcgttttcctgcaggcattgcaaatcttcacagcctgtcaggtctagcactgaattcaaatcgttttacaggtccagttccagattggctaggaaatcttaaaaaattgcaaataatattcctagcggcaaacatgtttacaggatttattccatcatccctctcaaatttatctctactagaaaatgttgtcttggactctaaccagttctatggccatataccccgaggtttggaaagcctcaaagtactacaagtactgagcattccaaacaacaatcttcatggtagcatcccaagagagctcttcagcattcctacaataagggagatttggctatattccaatagattggatggacctcttcctattgaaataggaaatgctaaacaattagaacatcttgtgctttcatcaaataacctatccggtgttattcctgacacacttggtaattgtgagagtattgaagagatcgagttggatcagaattttctcagtgggagcattcctacatcatttggcaacatggaaagcttgcaagtgctcaatatgtctcataacctcttgtcaggatcaataccaaagtctattggtagcttgaagtatcttgaacaactagatctgtcattcaacaatcttgagggtgaagtaccagaaataggtatattcaacaacacaacggccatatggattgctggaaataggggtctttgtggtggggcaacaaagctacacctacctgtgtgcacttatagacctccaagttcaactaaacacttgcaatccgtagtactgaaagttgtgatccccttagcttgcatagtgtcacttgctacgggaatatctgtcttgttgttttggaggaaaaaacatgagagaaaatctatgtctctcccttcattcggtagaaattttcctaaagtttcattcgacgatctttccagagcgacggatgggttctccatatccaatttaattggcaggggaagatacagttctgtgtacaaagggagattgttgcaatatggagatatggttgctgtgaaagttttcagcctacaaactagaggggcacaaaaaagcttcattgcagaatgcaaaactttaagaaatgtgcgacaccgaaatcttgttcccatcctaactgcatgctcaagtattgattctcgagggaatgatttcaaagctctagtatatcaattcatgtcacaaggtgacttgcatatgatgctatactcaaatcaggatgatgaaaacggttcagcttccatccatattgcatttgctcaaaggttaagcattgtagtggatgttgcagatgcaatggagtacgtccaccataacaaccaaggaactattgttcattgtgatctcaagcctagcaacattcttttagatgacagcctaacagcacatgttggagactttggccttgcaaggtttaaagttgattgcactatatcatcttccggtgactcaattatttcaagtgcaattaatggaactattggatatgttgctccagagtatgcaacaggtggtgaagtttcaaccttcggagatgtttatagctttggaatagttctcttcgaaatatttttacgaaagagaccaacacacgatatgttcaaggatggtctgaacattgcaacatttgtcgatatgaactttcctgacaggatatcagaagttgttgaccaagaattgttagaataccagaatggtctatcccatgacactcttgtggacatgaaggaaaaagaaatggagtgtctacgttctgtgttaaacattggactttgctgcacaaagccatccccctatgagcgcatggacatgcgagaagtggctgcaaggctgcgtaaaattaaggaggcctacctcagcagcaactaa
More
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| Protein seq | MKIIIIGLCLLVIMASSVIQTMCNSLYENGTDRLSLLEFKKAISMDPQQALMSWNDSNYFCSWEGVLCRVKTPHRVISLNLTNRGLVGQISPALGNMTFLKFLSLSTNSFTGEIHLSLGHLHRLETLDLSNNTLQGDIPDFTNCSNLKSLWLSRNHLVGQFNSNFPPRLQDLILASNNITGTIPSSLANITSLQRLSITDNNINGNIPHEFAGFPMLQILYADGNKLAGRFPRAILNISTIVGLAFSSNYLNGEIPSNLFDSLPEMQWFEVDYNFFQGGIPSSLANASKLKVFDISRNNFTGVIPCSIGKLTKVYWLNLEKNQLHARNKQDWEFMSCLANCTGLTDFSVSDNCLEGHVPSSLGNLSVQLQQFLLGGNQLSGGFPSGFQYLRNLISISIDSNNFSGVLPEWLGSLQNLQLIGLYNNYFTGIIPSSLSNLSQLGYLYLQSNQFYGHLPPSLGNHKMLQELTIGYNNIQGMIPKEIFKIPSLLQIDLSFNNLDGSIPKEVGDAKQLMYLRLSSNKLSGDIPNTLGNSESLEKIMLDRNIFSGSIPTSLDNILSLKVLNLSQNNLSGSIPPSLGNLHFLEKLDLSFNHLKGEIQVKGIFKNASAIRIDGNEALCGGVPELHLHACSIIPFDSTKHKQSIVLKIVIPLASVLSLATIISILLLLNRKQKRKSVDLPSFGRKFVRVSYNDLAKATEGFSASNLIGKGRYSSVYQGKFTDEKVVAVKVFNLETMGAQKSFIAECNALRKLRHRNIVPILTACASASSNGNDFKALLYEFMPQGDLNKLLHSTGTEEFNGENHGNRITLAQRLSIIVDVADAIEYLHHNNQETIVHCDLKPSNILLDDDMIAHVGDFGLARFKIDFMGSNDSNSIYSTAIKGTIGYVAPGAEVSTYGDVFSFGVVLLEIFLRKKPTDDMFKDGLDIVKFVEMNFPDRLPQIVDPELLQETHVGTKERVLGCLNSVLNIGLCCTNTSPYERMDMREFIEPGQFLLVFLVCSAHVVIHSSSGNEADRLSLLEFKNAITLDPQQALMSWNDSNHVCSWEGVKCRVKASHRVIYLNLGGQGLVGTVSPSLGNLTFLRYLFLQENLLAGQIPLSLGHLHHLKYLYLSNNTLQGEIPDFPNCSNLKMLGLGGNHLVGQVPTDANLPPSLYGLDISNNNLTGTIPSSLFNITTLAELFIQHNQINGEIPREIGKSRFLQEFSASGNKLSGRFQQTILNISSLAIIDLGTNYLHGELPSNLGSSLPNLQMFGLGNNLFGGHIPSSLANASKLFLALRLLAMKFIEPGKFLLVFLVCSAHVVICSSNGNETDRLSLLEFKNAITLDPQQALMSWNDSNHVCSWEGVKCRVKAPHRVIYLNLSGQGLVGTISPSLENLTFLRYISLQENLLAGQIPLSFGHMHHLKVLYLSNNTLKERYLTLQIVLISGRFNQINGEVPKEIGKSRVLQLFAASGNKLLGRFQQTILNISSLADLDLGSNYLHGELPSSLGSSLSNLQGLALGNNFFGGHIPSSLANASKLSMIHLSRNNFIGMVPSSIGKLQELSVLNLEFNQLQSSDKQGLEFMNSLSNCTKLRALSLAKNQLEGEIPSSFGNLSMKLELLYLGGNKLSGRFPAGIANLHSLSGLALNSNRFTGPVPDWLGNLKKLQIIFLAANMFTGFIPSSLSNLSLLENVVLDSNQFYGHIPRGLESLKVLQVLSIPNNNLHGSIPRELFSIPTIREIWLYSNRLDGPLPIEIGNAKQLEHLVLSSNNLSGVIPDTLGNCESIEEIELDQNFLSGSIPTSFGNMESLQVLNMSHNLLSGSIPKSIGSLKYLEQLDLSFNNLEGEVPEIGIFNNTTAIWIAGNRGLCGGATKLHLPVCTYRPPSSTKHLQSVVLKVVIPLACIVSLATGISVLLFWRKKHERKSMSLPSFGRNFPKVSFDDLSRATDGFSISNLIGRGRYSSVYKGRLLQYGDMVAVKVFSLQTRGAQKSFIAECKTLRNVRHRNLVPILTACSSIDSRGNDFKALVYQFMSQGDLHMMLYSNQDDENGSASIHIAFAQRLSIVVDVADAMEYVHHNNQGTIVHCDLKPSNILLDDSLTAHVGDFGLARFKVDCTISSSGDSIISSAINGTIGYVAPEYATGGEVSTFGDVYSFGIVLFEIFLRKRPTHDMFKDGLNIATFVDMNFPDRISEVVDQELLEYQNGLSHDTLVDMKEKEMECLRSVLNIGLCCTKPSPYERMDMREVAARLRKIKEAYLSSN
More
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|||||||
| Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
| Leaf | Root | Panicle | |
| FPKM | 0.000000 | 0.0 | None |
Homologues
| Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Leaf | Root | Panicle | |||
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_11g0172300 | SBH | 0.0 | 0.236650 | 1.571608 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os11g07180 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os11g0172300 | SBH | None | None | None |
| Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_11g0004920 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_11g0004900 | RBH | 0.0 | 0.000000 | 0.052080 |
| CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_11g0004930 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_11g0004820 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_11g0004710 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_11G0061100 | RBH | 0 | 0 | 0 |
| IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_11g0004780 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_11G0061200 | RBH | 0.6244025 | 4.05943 | 3.8513255 |
| LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLima_11g0004660 | SBH | 0.048991 | 0.035928 | None |
| KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_11g0004840 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_11g0004840 | RBH | 0.0 | 0.0 | None |
| LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_11g0004800 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
| LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_11g0004850 | SBH | 0.056974 | 0.000000 | None |
| N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_11G004860 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.106335 |
| NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_11g0004790 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.0 |
