Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsLima_10g0000420 OGI:10002990 | 16/16 LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr10:698470-707389
Gene Symbol prx125, PRX125, OsPRX125
DNA seq

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Function Peroxidase 15 [UniProtKB/Swiss-Prot:Q9LEH3]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsLima_10g0000420 OsLima_10g0000420.01 Chr10 698470 707389 - NAM
CDS seq

atggcggcttcttcttcttcttcttcctctctggcggtggtggtggtggcggcggcggtggcgctggtcgccggcggcggcgcggcggtggcgcagctgtgcgaggagtactacgactgcacgtgccccgacgcgtacgacatcgtgcggcggtcaggtgggcccgggtggggagtgctgctggggcggctcgacggcaagacctccgacttcaatggctccctcaacctgccggcccccaccgacaacctcaccgtcctccgccaaaagttcgccgccctcaacctcaacgacgtcgacctcgtcgccctctcaggtactcgtatcacttctccggcgaactcaatttcggttctgccgtcatgcccgccggagctgacgacgacgacaataatgcgaaatgcaggtgggcacacgttcgggagggtgcagtgccagttcgtgacggacaggctgtacaacttcagcaacacggggaggccggaccccaccatggacgccgcctaccggagcttcctgtcgcagcggtgcccgcccaacgggccgccggcggcgctcaacgacctggacccgacgacgccggacaccttcgacaaccactactacaccaacatcgaggtcaaccgcggcttcctccagtcggaccaggagctcaagtcggcgccggaggcgaccgggacgacggcgcccatcgtcgaccgcttcgccaccagccaggccgccttcttccgcagcttcgcgcagtccatgatcaacatgggcaacctctcccctactctgtctgtcttttgggctttctattaa

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.0 0.000000 None

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_10g0109300 RBH 0.168724 0.0 0.412383
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os10g02040 RBH 0.103773 0.0 0.096547
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os10g0109300 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_10g0000450 RBH 0.000000 92.768425 8.409596
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_10g0000450 RBH 0.0 26.456936 0.747481
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_10g0000420 RBH 0.0 160.977249 4.992559
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_10g0000420 RBH 0.0 6.744576 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_10g0000380 RBH 0.0 18.173952 1.509688
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_10G0012600 RBH 18.7787525 3.6038745 7.9411965
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_10g0000420 RBH 0.0 8.253822 0.000000
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_10G0011800 RBH 24.686021 2.201571 7.6903185
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_10g0000330 SBH 0.0 0.0 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_10g0000440 RBH 0.0 0.0 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_10g0000420 RBH 0.0 39.061337 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_10g0000350 RBH 0.524770 0.0 0.000000
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_10g0000400 RBH 0.072017 70.919746 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_10G000410 RBH 0.0 16.397909 4.732575
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_10g0000410 RBH 0.0 357.137909 4.418394
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