Basic Info |
Gene ID | OGI # | Score | Accession | Assembly | Annotation | Location | Links | |||||||
OsLima_08g0017050 | OGI:08063620 | 16/16 | LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | Chr08:22494171-22499305 | ||||||||
Gene Symbol | PEPR2, OsPEPR2 | ||||||||||
DNA seq | 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Protein seq | MGLHIWCWLVVLFSLAPLCCSLSADGLALLDLAKTLILPSSISSNWSADDATPCTWKGVDCDEMSNVVSLNLSYSGLSGSLGPQIGLMKHLKVIDLSGNGISGPMPSSIGNCTKLEVLHLLRNRLSGILPDTLSNIEALRVFDLSRNSFTGEVNFRFENCKLEEFILSFNYLRGEIPVWIGNCSSLTQLAFVNNSITGQIPSSIGLLRNLSYLVLSQNSLSGTIPPEIGNCQLLIWLHLDANQLEGTIPKELANLRNLQKLYLFENCLTGEFPEDIWGIQSLLSVDIYKNNFTGQLPIVLAEMKQLQQITLFNNSFTGVIPQGLGVNSSLSVIDFINNSFVGTIPPKICSGGRLEVLNLGSNLLNGSIPSGIADCPTLRRVILNQNNLIGSIPQFVNCSSLNYIDLSYNLLSGDIPASLSKCINVTFVNWSWNKLAGLIPSEIGNLGNLSSLNLSGNRLYGELPVEISGCSKLYKLDLSYNSLNGSALTTVSSLKFLSQLRLQENKFSGGIPDSLSQLDMLIELQLGGNILGGSIPSSLGKLVKLGIALNLSRNGLVGDIPPLGNLVELQSLDLSFNNLTGGLASLGNLQFLYFLNVSYNMFSGPVPKNLVRFLNSTPSSFSGNADLCISCHENDSSCTGSNVLRPCGSMSKKSALTPLKVAMIVLGSVFAGAFLILCVLLKYNFKPKINSDLGILFQGSSSKLNEAVEVTENFNNKYIIGSGAHGIVYKAVLRSGEVYAVKKLVHAAHKGSNASMIRELRTLGQIRHRNLIRLNEFLFKHEYGLILYDFMENGSLYDVLHGTEPTPTLDWSIRYSIALGTAHGLAYLHNDCHPAIIHRDIKPKNILLDNDMVPHISDFGIAKLMDQYPAALQTTGIVGTIGYMAPEMAFSTKATTEFDVYSYGVVLLELITRKMAVDSSFPGNMDIVSWVSSKLNETNQIETICDPALITEVYGTHEMEEVRKLLSLALRCTAKEASQRPSMAVVVKELTDARHVAGSYSKQNSGPSNS |
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Function | Receptor-like protein kinase [UniProtKB/Swiss-Prot:P93194] |
Transcripts
Gene | Transcript | Chromosome | Start | End | Strand | Source | ||
OsLima_08g0017050 | OsLima_08g0017050.01 | Chr08 | 22494171 | 22499305 | - | NAM | ||
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Event Type | Chromosome | Start | End | Strand | Alternative mRNAs | Total mRNAs | Source |
Expression
Leaf | Root | Panicle | |
FPKM | 0.000000 | 0.302453 | None |
Homologues
Genome & Annotation | Homologs | Type | Expression(FPKM) | ||
---|---|---|---|---|---|
Leaf | Root | Panicle | |||
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) | OsNip_08g0446400 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.000000 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU | LOC_Os08g34650 | RBH | 0.0 | 0.0 | 0.193996 |
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db | Os08g0446400 | RBH | None | None | None |
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsAzu_08g0017860 | RBH | 0.0 | 22.836742 | 2.040909 |
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKeNa_08g0017720 | RBH | 0.0 | 4.490297 | 1.012971 |
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsCMeo_08g0017650 | RBH | 0.110887 | 11.851155 | 1.939543 |
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsARC_08g0017920 | RBH | 0.0 | 0.310551 | None |
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsPr106_08g0017780 | RBH | 0.000000 | 14.631317 | 5.211847 |
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU | OsMH63_08G0346500 | RBH | 0.9156275 | 11.167162 | 2.963508 |
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsIR64_08g0017690 | RBH | 0.025495 | 0.633333 | 0.283755 |
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU | OsZS97_08G0366200 | RBH | 0.992007 | 19.585635 | 8.313869 |
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) | NA | NA | NA | NA | NA |
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsKYG_08g0017320 | RBH | 0.000000 | 7.153978 | None |
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsGoSa_08g0017150 | RBH | 0.0 | 18.751265 | None |
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLiXu_08g0017960 | RBH | 0.000000 | 0.646292 | 0.090992 |
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsLaMu_08g0017370 | RBH | 0.0 | 16.574574 | None |
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) | OsN22_08G017530 | RBH | 0.0 | 1.406209 | 0.932042 |
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) | OsNaBo_08g0017600 | RBH | 0.125229 | 12.961948 | 4.942124 |