Basic Info

Gene ID OGI # | Score   Accession | Assembly | Annotation Location Links
OsCMeo_08g0017650 OGI:08063620 | 16/16 CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) Chr08:21864473-21869610
Gene Symbol PEPR2, OsPEPR2
DNA seq

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CDS seq

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Function Receptor-like protein kinase [UniProtKB/Swiss-Prot:P93194]

Transcripts

Gene Transcript Chromosome Start End Strand Source
OsCMeo_08g0017650 OsCMeo_08g0017650.01 Chr08 21864473 21869610 - NAM
CDS seq

atgggactgcacatatggtgttggttggttgtcttgttcagcttggccccattgtgttgtagtttgagcgcagatggcctggctcttctggatctagccaagactctgatactgcccagctccataagctcgaattggagtgctgatgatgcaactccgtgtacatggaaaggagttgattgtgatgaaatgagcaatgtggtttctcttaacttatcatattctggattgtctggttctctaggtcctcagataggactcatgaagcacctgaaagtcattgatttatcaggtaatggtatatcaggaccaatgcccagttccattggcaactgcaccaaactggaggtgctccatctactacgtaatcgattgagcgggatccttccagatacattgagcaatattgaagcattaagggtttttgatctctcccgcaatagcttcacaggcgaggtcaatttcagatttgagaactgcaagcttgaggagttcatcttgtcattcaattatctcagaggcgaaatcccggtgtggatagggaattgcagcagcttgacacagcttgcatttgtcaacaatagtatcaccggtcaaataccaagttcaatcggtttattgagaaacctttcttaccttgtactttcccagaactccttgtctggcacaatccctcctgagattggtaactgccaattgctgatatggctgcatctagatgcaaaccagctcgagggcactataccaaaagaactagcaaacctgaggaacttgcagaagctctatctttttgagaattgcctcactggggagtttcctgaagatatatggggaatccaaagcctactatctgtcgacatctataaaaacaatttcactgggcagctgcctatagtgttggctgagatgaagcagctccagcaaattacgctattcaataattcattcactggtgtcataccacaggggttgggtgtaaatagcagtttgtccgtaattgatttcataaacaatagttttgttggcacaatccctccaaaaatttgttcagggggaagattggaagttttgaacttgggttcaaatcttctcaatggtagcatcccatctggtatcgctgactgcccaactttgagacgagtaattctcaaccaaaataatctcattggatcaattccacaatttgtaaattgtagcagtcttaattatattgatctcagctataatttattaagtggggacattcctgctagcttgagcaaatgtatcaatgttacatttgtgaactggtcatggaacaagcttgctggtctaataccatcagaaattgggaacttagggaacttaagtagtcttaacctctcaggaaacagactatatggtgaactccctgtggaaatttctggatgctccaagttatataagcttgatttgagctacaactctttgaacggttcggcactcacaactgtaagtagccttaaatttctgtcacagctacggttgcaggagaataaattcagtggaggtatacctgattctttatctcagttggatatgcttattgaactgcaacttggtggcaacattcttgggggtagtatcccttcatcgttaggaaagttagttaaactgggcattgcattaaacctcagtagaaatggactagttggtgacattccaccactaggcaatttggtggagctgcagagtttagatttgtcatttaataacctcaccggaggtcttgcttcattaggaaacctacagtttttgtatttcttgaatgtttcctacaacatgtttagtggaccagtaccaaaaaatcttgtgaggtttctgaattccactccaagttcatttagtggaaatgcagatctatgtatctcttgccatgaaaatgattcatcttgcacaggttctaatgttttgagaccttgtggttcaatgagtaaaaaaagtgcactcacaccactcaaggttgctatgatagttcttggttcggtttttgctggtgcatttctgatactctgtgtccttctaaaatataatttcaagcctaagattaacagtgatttaggtatattatttcaaggatcttcttctaaattaaatgaggctgtagaagtgactgaaaacttcaataacaagtacattatcggttccggggcccatggaattgtctacaaggcagtactgaggtcaggagaagtatatgctgtaaagaagcttgtacatgctgctcacaagggctcaaatgcaagcatgatccgcgagctgcggacgcttggtcaaattaggcacaggaacctgataagacttaatgaattcttgtttaagcatgagtatggtttgatcctatatgattttatggagaatggtagcctgtatgatgtgttgcatgggactgagcccactccaactttggactggagcatccgctacagcatagctcttggaacagcccatggtctagcatatctccataatgactgtcaccctgctatcatacatcgagatattaaaccaaaaaatatattgctggacaacgacatggtaccgcatatctcagattttggcattgcaaagctcatggatcaatatcctgctgctttacagaccacaggaatcgttggtactattggatatatggccccagaaatggccttttcaaccaaggctaccacagaattcgatgtgtacagttacggtgtggtattacttgagttgatcaccagaaagatggctgtggattcctcattccctggcaacatggacatagttagctgggtatcctccaagttgaatgagactaatcagatcgaaactatttgcgacccagctctcattactgaagtatatggaacacatgaaatggaagaagtgcgcaagctgttgtcattagctcttagatgcacagcaaaggaggcaagccaaaggccttccatggccgttgttgtcaaagagctgacagatgcaagacatgttgctggctcatactcgaagcagaattcaggccccagcaattcttga

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Event Type Chromosome Start End Strand Alternative mRNAs Total mRNAs Source

Expression

Leaf Root Panicle
FPKM 0.110887 11.851155 1.939543

Homologues

Genome & Annotation Homologs Type Expression(FPKM)
Leaf Root Panicle
Nipponbare | IRGSP 1.0 | Gramene(+IsoSeq) OsNip_08g0446400 RBH 0.0 0.0 0.000000
Nipponbare | IRGSP 1.0 | MSU LOC_Os08g34650 RBH 0.0 0.0 0.193996
Nipponbare | IRGSP 1.0 | RAP-db Os08g0446301 RBH None None None
Azucena | AzucenaRS1 | Gramene(+IsoSeq) OsAzu_08g0017860 RBH 0.0 22.836742 2.040909
KETAN NANGKA | Os128077RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKeNa_08g0017720 RBH 0.0 4.490297 1.012971
CHAO MEO | Os132278RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsCMeo_08g0017630 RBH 0.0 5.952419 2.256333
ARC 10497 | Os117425RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsARC_08g0017920 RBH 0.0 0.310551 None
PR 106 | Os127742RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsPr106_08g0017780 RBH 0.000000 14.631317 5.211847
Minghui 63 | MH63RS3 | HZAU OsMH63_08G0346500 RBH 0.9156275 11.167162 2.963508
IR 64 | OsIR64RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsIR64_08g0017690 RBH 0.025495 0.633333 0.283755
Zhenshan 97 | ZS97RS3 | HZAU OsZS97_08G0366200 RBH 0.992007 19.585635 8.313869
LIMA | Os127564RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLima_08g0017050 RBH 0.000000 0.302453 None
KHAO YAI GUANG | Os127518RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsKYG_08g0017320 RBH 0.000000 7.153978 None
GOBOL SAIL | Os132424RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsGoSa_08g0017150 RBH 0.0 18.751265 None
LIU XU | Os125827RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLiXu_08g0017960 RBH 0.000000 0.646292 0.090992
LARHA MUGAD | Os125619RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsLaMu_08g0017370 RBH 0.0 16.574574 None
N22 | OsN22RS2 | Gramene(+IsoSeq) OsN22_08G017530 RBH 0.0 1.406209 0.932042
NATEL BORO | Os127652RS1 | Gramene(+IsoSeq) OsNaBo_08g0017600 RBH 0.125229 12.961948 4.942124
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